MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016804	CGTCGG	2	12	66728	66739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016804	CAACGG	2	12	76250	76261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016804	TCACCT	2	12	80470	80481	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016804	CTCGGT	2	12	149451	149462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016804	GCCGCG	2	12	181162	181173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016804	ACAGCC	2	12	218713	218724	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016804	AGATTC	2	12	328728	328739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016804	GGTCGC	2	12	343323	343334	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016804	ATAGTC	2	12	544121	544132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016804	ACCAGT	2	12	592131	592142	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016804	CGCCGT	2	12	721145	721156	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016804	CGCGGG	2	12	831564	831575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016804	CCGGCG	2	12	865219	865230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016804	ACCGGG	2	12	871940	871951	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016804	GCGGCC	2	12	908829	908840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016804	ACAGCA	2	12	910202	910213	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016804	CATCGT	2	12	914022	914033	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016804	CTGGGT	2	12	925040	925051	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016804	CAGTCG	2	12	932851	932862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016804	TCGGGT	2	12	966309	966320	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016804	CAACGG	2	12	1030112	1030123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016804	GATCGA	2	12	1030163	1030174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016804	GACTGC	2	12	1034567	1034578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016804	CGGACT	2	12	1039738	1039749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016804	CGCCGG	2	12	1053433	1053444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016804	GGCGCA	2	12	1095231	1095242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016804	TTGGTG	2	12	1152550	1152561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016804	TTCCGT	2	12	1163243	1163254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016804	TAGCCA	2	12	1197827	1197838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016804	AGTTAC	2	12	1223639	1223650	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016804	AGGACG	2	12	1284631	1284642	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016804	AGGCCA	2	12	1341293	1341304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016804	TCGACA	2	12	1368745	1368756	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016804	CCGAGT	2	12	1416725	1416736	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016804	CACGCG	2	12	1521798	1521809	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016804	ATATTC	2	12	1556829	1556840	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016804	GCCCCT	2	12	1629946	1629957	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016804	GCCCCT	2	12	1633545	1633556	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016804	CGAGTG	2	12	1765633	1765644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016804	GGCGCC	2	12	1811858	1811869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016804	CCGCGG	2	12	1875600	1875611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016804	TAGCGG	2	12	1902649	1902660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016804	ACCGCA	2	12	1904585	1904596	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016804	GGTGAT	2	12	2022110	2022121	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016804	TTCGGC	2	12	2036019	2036030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016804	AGAGGG	2	12	2056153	2056164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016804	ACCGTG	2	12	2122635	2122646	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016804	GCTGGG	2	12	2125266	2125277	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016804	CGCGAG	2	12	2158054	2158065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016804	GCCGCA	2	12	2191869	2191880	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016804	CGGCTC	2	12	2221179	2221190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016804	TGCACT	2	12	2299585	2299596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016804	ATAGAA	2	12	2326463	2326474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016804	CTCAAC	2	12	2368955	2368966	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016804	CCGCTG	2	12	2389436	2389447	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016804	CACCGC	2	12	2397894	2397905	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016804	GCGTCG	2	12	2450379	2450390	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016804	CACGAC	2	12	2468550	2468561	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016804	CACGTG	2	12	2659915	2659926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016804	GAGGTC	2	12	2663530	2663541	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016804	CCGGCA	2	12	2677559	2677570	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016804	CGCCAC	2	12	2735745	2735756	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016804	TCAAAC	2	12	2737498	2737509	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016804	GCACCC	2	12	2765555	2765566	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016804	CGACGG	2	12	2814492	2814503	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016804	GCCCGA	2	12	2821586	2821597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016804	GTATTG	2	12	2860019	2860030	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016804	CCGTTG	2	12	2869964	2869975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016804	GGCGCC	2	12	2889644	2889655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016804	CATATT	2	12	2948129	2948140	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016804	CCGGCA	2	12	3011970	3011981	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016804	CGTTGC	2	12	3032983	3032994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016804	GACATC	2	12	3055019	3055030	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016804	ACGGCG	2	12	3056570	3056581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016804	GTCAAT	2	12	3073147	3073158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016804	TCGCCG	2	12	3224786	3224797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016804	TCGCCG	2	12	3224843	3224854	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016804	TCGCCG	2	12	3224900	3224911	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016804	TCGCCG	2	12	3224957	3224968	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016804	TCGCCG	2	12	3225014	3225025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016804	CGCCAC	2	12	3241036	3241047	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016804	CGCCGG	2	12	3244410	3244421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016804	CGTAGG	2	12	3314954	3314965	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016804	TGTACA	2	12	3364205	3364216	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016804	ACCAAC	2	12	3369554	3369565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016804	CCGTTG	2	12	3391252	3391263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016804	GCTCCT	2	12	3418854	3418865	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016804	CTGTCA	2	12	3433566	3433577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016804	GTCGAC	2	12	3435453	3435464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016804	TCCGCT	2	12	3481567	3481578	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016804	GCCTCC	2	12	3572092	3572103	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_016804	CCCGAA	2	12	3712196	3712207	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016804	AGGTTG	2	12	3712326	3712337	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016804	CGTTGC	2	12	3712357	3712368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016804	TGCCGG	2	12	3713782	3713793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016804	CGCAGC	2	12	3722319	3722330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016804	TGCCGG	2	12	3724303	3724314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016804	GCCCAC	2	12	3724334	3724345	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016804	TGCCGG	2	12	3725968	3725979	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016804	CCCGAT	2	12	3726050	3726061	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016804	TGCCGG	2	12	3726064	3726075	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016804	GCAGCG	2	12	3726747	3726758	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016804	TCCCGG	2	12	3727719	3727730	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016804	CCCGAT	2	12	3727831	3727842	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016804	TGCCGG	2	12	3727845	3727856	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016804	GCTGCC	2	12	3727903	3727914	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016804	GGGGAT	2	12	3729055	3729066	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016804	TGCCGG	2	12	3729516	3729527	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016804	TGCCGG	2	12	3729546	3729557	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016804	CCCGAT	2	12	3729628	3729639	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016804	GCCCAG	2	12	3729829	3729840	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016804	CGGGAT	2	12	3730285	3730296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016804	CCCGAT	2	12	3731389	3731400	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016804	GCCCAG	2	12	3731590	3731601	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016804	CAACGG	2	12	3732157	3732168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016804	GCGCAG	2	12	3745337	3745348	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016804	TGTACA	2	12	3764685	3764696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016804	TCCTCT	2	12	3841013	3841024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016804	TCGGAG	2	12	3864580	3864591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016804	CCGCTC	2	12	3868609	3868620	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016804	CGTTGG	2	12	3881249	3881260	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016804	CGGCCG	2	12	3885389	3885400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016804	CGGCGA	2	12	3966904	3966915	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016804	CGAACA	2	12	3974688	3974699	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016804	GGCGAG	2	12	4063265	4063276	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016804	GCGCCG	2	12	4103557	4103568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016804	CCGACG	2	12	4142397	4142408	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016804	TGGCGG	2	12	4150895	4150906	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_016804	CTCATC	2	12	4218437	4218448	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016804	TCTGGT	2	12	4252544	4252555	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_016804	GGGTTG	2	12	4275048	4275059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.