MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 3055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016804	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	378769744
2	NC_016804	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	378769745
3	NC_016804	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	378769745
4	NC_016804	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	378769747
5	NC_016804	ACGGT	2	10	5747	5756	20 %	20 %	40 %	20 %	378769748
6	NC_016804	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	378769749
7	NC_016804	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	378769749
8	NC_016804	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	378769749
9	NC_016804	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	378769750
10	NC_016804	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	378769750
11	NC_016804	GGCGT	2	10	14153	14162	0 %	20 %	60 %	20 %	378769755
12	NC_016804	GGGCC	2	10	14436	14445	0 %	0 %	60 %	40 %	378769755
13	NC_016804	GCGTT	2	10	15181	15190	0 %	40 %	40 %	20 %	378769756
14	NC_016804	CCAGC	2	10	15721	15730	20 %	0 %	20 %	60 %	378769757
15	NC_016804	ACCGA	2	10	16484	16493	40 %	0 %	20 %	40 %	378769757
16	NC_016804	ATCGG	2	10	16876	16885	20 %	20 %	40 %	20 %	378769757
17	NC_016804	CGGCC	2	10	17885	17894	0 %	0 %	40 %	60 %	378769758
18	NC_016804	TTAGC	2	10	19036	19045	20 %	40 %	20 %	20 %	378769759
19	NC_016804	GGTCC	2	10	19108	19117	0 %	20 %	40 %	40 %	378769759
20	NC_016804	GTCGT	2	10	21627	21636	0 %	40 %	40 %	20 %	378769760
21	NC_016804	ATCAC	2	10	23900	23909	40 %	20 %	0 %	40 %	378769763
22	NC_016804	GCCGG	2	10	24587	24596	0 %	0 %	60 %	40 %	378769763
23	NC_016804	GGCAA	2	10	29281	29290	40 %	0 %	40 %	20 %	378769768
24	NC_016804	CGATC	2	10	30107	30116	20 %	20 %	20 %	40 %	378769769
25	NC_016804	CGACG	2	10	32294	32303	20 %	0 %	40 %	40 %	378769772
26	NC_016804	GCGTC	2	10	32349	32358	0 %	20 %	40 %	40 %	378769772
27	NC_016804	GACAC	2	10	32446	32455	40 %	0 %	20 %	40 %	378769772
28	NC_016804	TCCTG	2	10	37451	37460	0 %	40 %	20 %	40 %	378769778
29	NC_016804	CTCGG	2	10	37544	37553	0 %	20 %	40 %	40 %	378769778
30	NC_016804	GGCGC	2	10	38087	38096	0 %	0 %	60 %	40 %	378769778
31	NC_016804	TGGCC	2	10	38235	38244	0 %	20 %	40 %	40 %	378769778
32	NC_016804	CGGCG	2	10	38767	38776	0 %	0 %	60 %	40 %	378769778
33	NC_016804	GTCCA	2	10	39378	39387	20 %	20 %	20 %	40 %	378769779
34	NC_016804	GCCAA	2	10	41512	41521	40 %	0 %	20 %	40 %	378769781
35	NC_016804	GCACA	2	10	42311	42320	40 %	0 %	20 %	40 %	378769782
36	NC_016804	GGTAC	2	10	44845	44854	20 %	20 %	40 %	20 %	378769784
37	NC_016804	TCGAA	2	10	45077	45086	40 %	20 %	20 %	20 %	378769784
38	NC_016804	GCACC	2	10	46007	46016	20 %	0 %	20 %	60 %	378769784
39	NC_016804	CGGTG	2	10	47041	47050	0 %	20 %	60 %	20 %	378769785
40	NC_016804	TCATG	2	10	47187	47196	20 %	40 %	20 %	20 %	378769785
41	NC_016804	GCAGC	2	10	48581	48590	20 %	0 %	40 %	40 %	378769787
42	NC_016804	CCCGA	2	10	48664	48673	20 %	0 %	20 %	60 %	378769787
43	NC_016804	CAGCG	2	10	49789	49798	20 %	0 %	40 %	40 %	378769788
44	NC_016804	CTCCC	2	10	56232	56241	0 %	20 %	0 %	80 %	378769794
45	NC_016804	CGGCG	2	10	56681	56690	0 %	0 %	60 %	40 %	378769794
46	NC_016804	CGACC	2	10	58213	58222	20 %	0 %	20 %	60 %	378769796
47	NC_016804	CTTCG	2	10	58900	58909	0 %	40 %	20 %	40 %	378769797
48	NC_016804	CGGTG	2	10	59956	59965	0 %	20 %	60 %	20 %	378769800
49	NC_016804	TCAGG	2	10	62442	62451	20 %	20 %	40 %	20 %	378769801
50	NC_016804	GGCGA	2	10	66405	66414	20 %	0 %	60 %	20 %	378769805
51	NC_016804	GGTGT	2	10	68981	68990	0 %	40 %	60 %	0 %	378769807
52	NC_016804	ATCGG	2	10	69618	69627	20 %	20 %	40 %	20 %	378769807
53	NC_016804	CCGCG	2	10	70155	70164	0 %	0 %	40 %	60 %	378769807
54	NC_016804	GGCAA	2	10	70506	70515	40 %	0 %	40 %	20 %	378769807
55	NC_016804	CGACC	2	10	70795	70804	20 %	0 %	20 %	60 %	378769807
56	NC_016804	CGGGT	2	10	71249	71258	0 %	20 %	60 %	20 %	378769807
57	NC_016804	GGTCG	2	10	71309	71318	0 %	20 %	60 %	20 %	378769807
58	NC_016804	TGCCT	2	10	72050	72059	0 %	40 %	20 %	40 %	378769809
59	NC_016804	GTCCA	2	10	72921	72930	20 %	20 %	20 %	40 %	378769810
60	NC_016804	TGACC	2	10	75545	75554	20 %	20 %	20 %	40 %	378769812
61	NC_016804	GCCAA	2	10	75859	75868	40 %	0 %	20 %	40 %	378769812
62	NC_016804	GTCGC	2	10	75936	75945	0 %	20 %	40 %	40 %	378769812
63	NC_016804	GCGCG	2	10	77024	77033	0 %	0 %	60 %	40 %	378769813
64	NC_016804	CACGA	2	10	79926	79935	40 %	0 %	20 %	40 %	378769815
65	NC_016804	GAGCA	2	10	82464	82473	40 %	0 %	40 %	20 %	378769817
66	NC_016804	GCCGG	2	10	82563	82572	0 %	0 %	60 %	40 %	378769817
67	NC_016804	GCGAC	2	10	82639	82648	20 %	0 %	40 %	40 %	378769817
68	NC_016804	ATCCG	2	10	83409	83418	20 %	20 %	20 %	40 %	378769818
69	NC_016804	CACCG	2	10	84189	84198	20 %	0 %	20 %	60 %	378769819
70	NC_016804	TGGTC	2	10	86324	86333	0 %	40 %	40 %	20 %	378769821
71	NC_016804	GCTGG	2	10	86961	86970	0 %	20 %	60 %	20 %	378769822
72	NC_016804	TGGGT	2	10	89999	90008	0 %	40 %	60 %	0 %	378769828
73	NC_016804	TCGCC	2	10	90206	90215	0 %	20 %	20 %	60 %	378769828
74	NC_016804	GGGCC	2	10	91179	91188	0 %	0 %	60 %	40 %	378769829
75	NC_016804	GGCCG	2	10	92498	92507	0 %	0 %	60 %	40 %	378769830
76	NC_016804	GCGCC	2	10	93150	93159	0 %	0 %	40 %	60 %	378769830
77	NC_016804	GCTTG	2	10	95182	95191	0 %	40 %	40 %	20 %	378769832
78	NC_016804	CGTGT	2	10	95614	95623	0 %	40 %	40 %	20 %	378769833
79	NC_016804	AGATC	2	10	95693	95702	40 %	20 %	20 %	20 %	378769833
80	NC_016804	CGGCG	2	10	99274	99283	0 %	0 %	60 %	40 %	378769836
81	NC_016804	GCGGT	2	10	100350	100359	0 %	20 %	60 %	20 %	378769837
82	NC_016804	GCGCC	2	10	103182	103191	0 %	0 %	40 %	60 %	378769839
83	NC_016804	GGTGG	2	10	103870	103879	0 %	20 %	80 %	0 %	378769840
84	NC_016804	CTGGC	2	10	105606	105615	0 %	20 %	40 %	40 %	378769842
85	NC_016804	GCACA	2	10	106727	106736	40 %	0 %	20 %	40 %	378769842
86	NC_016804	CTGAA	2	10	109057	109066	40 %	20 %	20 %	20 %	378769845
87	NC_016804	ATCGC	2	10	109552	109561	20 %	20 %	20 %	40 %	378769845
88	NC_016804	TCTGA	2	10	110886	110895	20 %	40 %	20 %	20 %	378769847
89	NC_016804	CGGTC	2	10	111161	111170	0 %	20 %	40 %	40 %	378769847
90	NC_016804	GACCA	2	10	112299	112308	40 %	0 %	20 %	40 %	378769847
91	NC_016804	GGCTG	2	10	114863	114872	0 %	20 %	60 %	20 %	378769847
92	NC_016804	CCGCG	2	10	118783	118792	0 %	0 %	40 %	60 %	378769848
93	NC_016804	TCGTG	2	10	122736	122745	0 %	40 %	40 %	20 %	378769850
94	NC_016804	CCGGA	2	10	124517	124526	20 %	0 %	40 %	40 %	378769852
95	NC_016804	GGCCG	2	10	126878	126887	0 %	0 %	60 %	40 %	378769853
96	NC_016804	TGCGC	2	10	126990	126999	0 %	20 %	40 %	40 %	378769853
97	NC_016804	GCGAG	2	10	127501	127510	20 %	0 %	60 %	20 %	378769853
98	NC_016804	GGGGT	2	10	128510	128519	0 %	20 %	80 %	0 %	378769853
99	NC_016804	CCCAC	2	10	129072	129081	20 %	0 %	0 %	80 %	378769853
100	NC_016804	CCGGC	2	10	129582	129591	0 %	0 %	40 %	60 %	378769853
101	NC_016804	TGCGG	2	10	129992	130001	0 %	20 %	60 %	20 %	378769853
102	NC_016804	ATCAC	2	10	131471	131480	40 %	20 %	0 %	40 %	378769855
103	NC_016804	ATCGG	2	10	131519	131528	20 %	20 %	40 %	20 %	378769855
104	NC_016804	CGGGC	2	10	132610	132619	0 %	0 %	60 %	40 %	378769855
105	NC_016804	GCGAT	2	10	134415	134424	20 %	20 %	40 %	20 %	378769857
106	NC_016804	GTTCG	2	10	134636	134645	0 %	40 %	40 %	20 %	378769857
107	NC_016804	CCTGG	2	10	135028	135037	0 %	20 %	40 %	40 %	378769857
108	NC_016804	GGCCC	2	10	135134	135143	0 %	0 %	40 %	60 %	378769857
109	NC_016804	CGTTG	2	10	135646	135655	0 %	40 %	40 %	20 %	378769857
110	NC_016804	CGACC	2	10	135718	135727	20 %	0 %	20 %	60 %	378769857
111	NC_016804	GAGAT	2	10	138738	138747	40 %	20 %	40 %	0 %	378769861
112	NC_016804	CGGCG	2	10	140893	140902	0 %	0 %	60 %	40 %	378769862
113	NC_016804	TGCGG	2	10	141526	141535	0 %	20 %	60 %	20 %	378769863
114	NC_016804	CGCTG	2	10	142233	142242	0 %	20 %	40 %	40 %	378769864
115	NC_016804	GTTGC	2	10	142779	142788	0 %	40 %	40 %	20 %	378769864
116	NC_016804	CCGAT	2	10	143527	143536	20 %	20 %	20 %	40 %	378769864
117	NC_016804	ATCGC	2	10	144218	144227	20 %	20 %	20 %	40 %	378769865
118	NC_016804	AACCG	2	10	144957	144966	40 %	0 %	20 %	40 %	378769865
119	NC_016804	CCGCC	2	10	145544	145553	0 %	0 %	20 %	80 %	378769865
120	NC_016804	CCGCC	2	10	146187	146196	0 %	0 %	20 %	80 %	378769866
121	NC_016804	ATCGG	2	10	149670	149679	20 %	20 %	40 %	20 %	378769870
122	NC_016804	TCGTC	2	10	154781	154790	0 %	40 %	20 %	40 %	378769873
123	NC_016804	CACGC	2	10	155245	155254	20 %	0 %	20 %	60 %	378769873
124	NC_016804	ATTCT	2	10	156089	156098	20 %	60 %	0 %	20 %	378769874
125	NC_016804	AGGCG	2	10	156617	156626	20 %	0 %	60 %	20 %	378769874
126	NC_016804	TGACC	2	10	159621	159630	20 %	20 %	20 %	40 %	378769877
127	NC_016804	CGGCG	2	10	159867	159876	0 %	0 %	60 %	40 %	378769877
128	NC_016804	GCACC	2	10	160037	160046	20 %	0 %	20 %	60 %	378769878
129	NC_016804	CCGCA	2	10	161215	161224	20 %	0 %	20 %	60 %	378769879
130	NC_016804	CGCGG	2	10	161294	161303	0 %	0 %	60 %	40 %	378769879
131	NC_016804	CTGGG	2	10	164418	164427	0 %	20 %	60 %	20 %	378769881
132	NC_016804	GCCGG	2	10	165011	165020	0 %	0 %	60 %	40 %	378769882
133	NC_016804	GTTGG	2	10	166980	166989	0 %	40 %	60 %	0 %	378769884
134	NC_016804	GCGTG	2	10	168146	168155	0 %	20 %	60 %	20 %	378769887
135	NC_016804	GCCGC	2	10	168819	168828	0 %	0 %	40 %	60 %	378769887
136	NC_016804	CCGCC	2	10	170070	170079	0 %	0 %	20 %	80 %	378769888
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174	NC_016804	CCGTG	2	10	222310	222319	0 %	20 %	40 %	40 %	378769935
175	NC_016804	GCCGC	2	10	222770	222779	0 %	0 %	40 %	60 %	378769936
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263	NC_016804	CCTTC	2	10	367255	367264	0 %	40 %	0 %	60 %	378770051
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