MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 11244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016804	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	378769744
2	NC_016804	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	378769744
3	NC_016804	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	378769744
4	NC_016804	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	378769744
5	NC_016804	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	378769744
6	NC_016804	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016804	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	378769745
8	NC_016804	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	378769745
9	NC_016804	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	378769745
10	NC_016804	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	378769745
11	NC_016804	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	378769745
12	NC_016804	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	378769745
13	NC_016804	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	378769746
14	NC_016804	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	378769746
15	NC_016804	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	378769746
16	NC_016804	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	378769746
17	NC_016804	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	378769748
18	NC_016804	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	378769748
19	NC_016804	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	378769748
20	NC_016804	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	378769748
21	NC_016804	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	378769748
22	NC_016804	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	378769749
23	NC_016804	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	378769749
24	NC_016804	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	378769749
25	NC_016804	CGTG	2	8	8735	8742	0 %	25 %	50 %	25 %	378769749
26	NC_016804	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	378769749
27	NC_016804	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	378769749
28	NC_016804	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	378769749
29	NC_016804	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	378769750
30	NC_016804	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016804	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	378769751
32	NC_016804	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	378769751
33	NC_016804	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_016804	AACC	2	8	13337	13344	50 %	0 %	0 %	50 %	378769753
35	NC_016804	CCCG	2	8	13446	13453	0 %	0 %	25 %	75 %	378769753
36	NC_016804	ATTC	2	8	13690	13697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016804	ACCC	2	8	14097	14104	25 %	0 %	0 %	75 %	378769755
38	NC_016804	TGAT	2	8	14134	14141	25 %	50 %	25 %	0 %	378769755
39	NC_016804	TGCT	2	8	14181	14188	0 %	50 %	25 %	25 %	378769755
40	NC_016804	GCCC	2	8	14668	14675	0 %	0 %	25 %	75 %	378769755
41	NC_016804	GGGC	2	8	15449	15456	0 %	0 %	75 %	25 %	378769756
42	NC_016804	CTGA	2	8	15904	15911	25 %	25 %	25 %	25 %	378769757
43	NC_016804	TGGC	2	8	16047	16054	0 %	25 %	50 %	25 %	378769757
44	NC_016804	GCTT	2	8	16106	16113	0 %	50 %	25 %	25 %	378769757
45	NC_016804	CAGT	2	8	16134	16141	25 %	25 %	25 %	25 %	378769757
46	NC_016804	CGGT	2	8	16505	16512	0 %	25 %	50 %	25 %	378769757
47	NC_016804	GCCG	2	8	16564	16571	0 %	0 %	50 %	50 %	378769757
48	NC_016804	CGGG	2	8	17799	17806	0 %	0 %	75 %	25 %	378769758
49	NC_016804	CTGG	2	8	17907	17914	0 %	25 %	50 %	25 %	378769758
50	NC_016804	GTGC	2	8	18407	18414	0 %	25 %	50 %	25 %	378769758
51	NC_016804	GCCG	2	8	18425	18432	0 %	0 %	50 %	50 %	378769758
52	NC_016804	CCGC	2	8	18790	18797	0 %	0 %	25 %	75 %	378769759
53	NC_016804	GCCG	2	8	20254	20261	0 %	0 %	50 %	50 %	378769760
54	NC_016804	CCAG	2	8	20742	20749	25 %	0 %	25 %	50 %	378769760
55	NC_016804	CACC	2	8	20925	20932	25 %	0 %	0 %	75 %	378769760
56	NC_016804	CGGG	2	8	21881	21888	0 %	0 %	75 %	25 %	378769761
57	NC_016804	GCCG	2	8	21972	21979	0 %	0 %	50 %	50 %	378769761
58	NC_016804	GCTG	2	8	22352	22359	0 %	25 %	50 %	25 %	378769761
59	NC_016804	CGGC	2	8	22372	22379	0 %	0 %	50 %	50 %	378769761
60	NC_016804	GCCG	2	8	23043	23050	0 %	0 %	50 %	50 %	378769761
61	NC_016804	CCCA	2	8	23055	23062	25 %	0 %	0 %	75 %	378769761
62	NC_016804	GCTG	2	8	24194	24201	0 %	25 %	50 %	25 %	378769763
63	NC_016804	CGGC	2	8	24242	24249	0 %	0 %	50 %	50 %	378769763
64	NC_016804	GCCG	2	8	24342	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	378769763
65	NC_016804	CGGG	2	8	24417	24424	0 %	0 %	75 %	25 %	378769763
66	NC_016804	TCAA	2	8	25495	25502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016804	GAGC	2	8	25523	25530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016804	GGCC	2	8	25537	25544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016804	GCTC	2	8	26486	26493	0 %	25 %	25 %	50 %	378769764
70	NC_016804	CCAA	2	8	26703	26710	50 %	0 %	0 %	50 %	378769764
71	NC_016804	CAGC	2	8	26769	26776	25 %	0 %	25 %	50 %	378769764
72	NC_016804	CGGC	2	8	27589	27596	0 %	0 %	50 %	50 %	378769766
73	NC_016804	CCGG	2	8	28075	28082	0 %	0 %	50 %	50 %	378769766
74	NC_016804	GCTC	2	8	28631	28638	0 %	25 %	25 %	50 %	378769767
75	NC_016804	TGCG	2	8	28770	28777	0 %	25 %	50 %	25 %	378769767
76	NC_016804	CCGG	2	8	29034	29041	0 %	0 %	50 %	50 %	378769767
77	NC_016804	CGTC	2	8	29365	29372	0 %	25 %	25 %	50 %	378769768
78	NC_016804	CACG	2	8	29725	29732	25 %	0 %	25 %	50 %	378769769
79	NC_016804	ACCG	2	8	29806	29813	25 %	0 %	25 %	50 %	378769769
80	NC_016804	CCGG	2	8	30125	30132	0 %	0 %	50 %	50 %	378769769
81	NC_016804	GTCG	2	8	30301	30308	0 %	25 %	50 %	25 %	378769769
82	NC_016804	CCCG	2	8	30923	30930	0 %	0 %	25 %	75 %	378769769
83	NC_016804	ACCA	2	8	31108	31115	50 %	0 %	0 %	50 %	378769769
84	NC_016804	CGAG	2	8	31439	31446	25 %	0 %	50 %	25 %	378769770
85	NC_016804	CGAC	2	8	31736	31743	25 %	0 %	25 %	50 %	378769771
86	NC_016804	GCCG	2	8	32463	32470	0 %	0 %	50 %	50 %	378769772
87	NC_016804	CCGA	2	8	33452	33459	25 %	0 %	25 %	50 %	378769773
88	NC_016804	GCTA	2	8	33839	33846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016804	GGCC	2	8	34587	34594	0 %	0 %	50 %	50 %	378769775
90	NC_016804	ATCG	2	8	35080	35087	25 %	25 %	25 %	25 %	378769775
91	NC_016804	GATC	2	8	35418	35425	25 %	25 %	25 %	25 %	378769775
92	NC_016804	CCAC	2	8	36239	36246	25 %	0 %	0 %	75 %	378769775
93	NC_016804	ACCG	2	8	36633	36640	25 %	0 %	25 %	50 %	378769776
94	NC_016804	CTGG	2	8	36977	36984	0 %	25 %	50 %	25 %	378769777
95	NC_016804	GCAT	2	8	37372	37379	25 %	25 %	25 %	25 %	378769778
96	NC_016804	GCTG	2	8	37886	37893	0 %	25 %	50 %	25 %	378769778
97	NC_016804	AACG	2	8	38641	38648	50 %	0 %	25 %	25 %	378769778
98	NC_016804	CCGA	2	8	38702	38709	25 %	0 %	25 %	50 %	378769778
99	NC_016804	CCAC	2	8	38858	38865	25 %	0 %	0 %	75 %	378769778
100	NC_016804	CAGC	2	8	39085	39092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016804	CCGG	2	8	39580	39587	0 %	0 %	50 %	50 %	378769779
102	NC_016804	GGCC	2	8	40111	40118	0 %	0 %	50 %	50 %	378769780
103	NC_016804	CGAT	2	8	40561	40568	25 %	25 %	25 %	25 %	378769780
104	NC_016804	GCCG	2	8	40861	40868	0 %	0 %	50 %	50 %	378769780
105	NC_016804	CACC	2	8	40886	40893	25 %	0 %	0 %	75 %	378769780
106	NC_016804	ACCG	2	8	41109	41116	25 %	0 %	25 %	50 %	378769780
107	NC_016804	GCGT	2	8	41135	41142	0 %	25 %	50 %	25 %	378769780
108	NC_016804	CCAC	2	8	41864	41871	25 %	0 %	0 %	75 %	378769781
109	NC_016804	CGAT	2	8	41873	41880	25 %	25 %	25 %	25 %	378769781
110	NC_016804	GGCC	2	8	42569	42576	0 %	0 %	50 %	50 %	378769783
111	NC_016804	CCCG	2	8	43160	43167	0 %	0 %	25 %	75 %	378769783
112	NC_016804	CGGG	2	8	43189	43196	0 %	0 %	75 %	25 %	378769783
113	NC_016804	CGAC	2	8	43828	43835	25 %	0 %	25 %	50 %	378769784
114	NC_016804	GAGC	2	8	44208	44215	25 %	0 %	50 %	25 %	378769784
115	NC_016804	GGGC	2	8	45367	45374	0 %	0 %	75 %	25 %	378769784
116	NC_016804	CGGC	2	8	45462	45469	0 %	0 %	50 %	50 %	378769784
117	NC_016804	GCCG	2	8	46425	46432	0 %	0 %	50 %	50 %	378769784
118	NC_016804	TTGC	2	8	46589	46596	0 %	50 %	25 %	25 %	378769785
119	NC_016804	CCGC	2	8	46737	46744	0 %	0 %	25 %	75 %	378769785
120	NC_016804	CCGC	2	8	46770	46777	0 %	0 %	25 %	75 %	378769785
121	NC_016804	GGTC	2	8	46878	46885	0 %	25 %	50 %	25 %	378769785
122	NC_016804	CTAC	2	8	47202	47209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016804	CGGG	2	8	47429	47436	0 %	0 %	75 %	25 %	378769786
124	NC_016804	GCAG	2	8	47502	47509	25 %	0 %	50 %	25 %	378769786
125	NC_016804	GTGC	2	8	48402	48409	0 %	25 %	50 %	25 %	378769787
126	NC_016804	GCCG	2	8	48686	48693	0 %	0 %	50 %	50 %	378769787
127	NC_016804	CAGC	2	8	49871	49878	25 %	0 %	25 %	50 %	378769788
128	NC_016804	CGGG	2	8	50060	50067	0 %	0 %	75 %	25 %	378769789
129	NC_016804	GCCG	2	8	50160	50167	0 %	0 %	50 %	50 %	378769789
130	NC_016804	GGTG	2	8	50483	50490	0 %	25 %	75 %	0 %	378769789
131	NC_016804	CTCA	2	8	51099	51106	25 %	25 %	0 %	50 %	378769789
132	NC_016804	CGCT	2	8	51238	51245	0 %	25 %	25 %	50 %	378769790
133	NC_016804	GGTA	2	8	52104	52111	25 %	25 %	50 %	0 %	378769791
134	NC_016804	CTGG	2	8	52699	52706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016804	GCCG	2	8	53553	53560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016804	ACCA	2	8	53724	53731	50 %	0 %	0 %	50 %	378769793
137	NC_016804	GTGC	2	8	54609	54616	0 %	25 %	50 %	25 %	378769793
138	NC_016804	ACCG	2	8	55487	55494	25 %	0 %	25 %	50 %	378769793
139	NC_016804	CCCG	2	8	55658	55665	0 %	0 %	25 %	75 %	378769793
140	NC_016804	GGCC	2	8	56332	56339	0 %	0 %	50 %	50 %	378769794
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