MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 1039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016804	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016804	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016804	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_016804	ATTC	2	8	13690	13697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016804	TCAA	2	8	25495	25502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016804	GAGC	2	8	25523	25530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016804	GGCC	2	8	25537	25544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016804	GCTA	2	8	33839	33846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016804	CAGC	2	8	39085	39092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016804	CTAC	2	8	47202	47209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016804	CTGG	2	8	52699	52706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016804	GCCG	2	8	53553	53560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016804	CGGT	2	8	79199	79206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016804	CTGG	2	8	87274	87281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016804	CGCA	2	8	89575	89582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016804	CGCT	2	8	97705	97712	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016804	CCTG	2	8	97752	97759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016804	GCGA	2	8	97796	97803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016804	ACCG	2	8	99519	99526	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016804	ATCC	2	8	125655	125662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016804	GCGA	2	8	130743	130750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016804	CGGG	2	8	130786	130793	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016804	GCTC	2	8	131298	131305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016804	CGGG	2	8	134010	134017	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016804	TTCT	2	8	139927	139934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016804	ACGC	2	8	139999	140006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016804	GGGC	2	8	140091	140098	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016804	AGCA	2	8	141171	141178	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016804	GCCG	2	8	143977	143984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016804	GCGT	2	8	148520	148527	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016804	GCGG	2	8	149586	149593	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016804	GCCG	2	8	152466	152473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016804	CCGG	2	8	155832	155839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016804	GCGT	3	12	155860	155871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016804	GGCT	2	8	158006	158013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016804	CGCA	2	8	158032	158039	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016804	TCGT	2	8	161723	161730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016804	CCGG	2	8	161731	161738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016804	CCCG	2	8	161943	161950	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_016804	GGGT	2	8	162538	162545	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016804	GCTG	2	8	162668	162675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016804	GTGC	2	8	162862	162869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016804	ACTT	2	8	171420	171427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016804	GCCG	2	8	181128	181135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016804	TTGA	2	8	186952	186959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016804	CTGG	2	8	196939	196946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016804	CTGT	2	8	212492	212499	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016804	GGCC	2	8	218580	218587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016804	CGGT	2	8	218916	218923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016804	GATG	2	8	219663	219670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016804	AACT	2	8	230860	230867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016804	GGAA	2	8	231035	231042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016804	ACGT	2	8	231787	231794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016804	ACAT	2	8	231854	231861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016804	GTGC	2	8	241567	241574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016804	GAAC	2	8	249253	249260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016804	CGCA	2	8	253862	253869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016804	GACG	2	8	256271	256278	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016804	GCGG	2	8	271279	271286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016804	CGGC	2	8	272645	272652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016804	TAGA	2	8	286754	286761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016804	ACTT	2	8	290459	290466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016804	TCGT	2	8	292087	292094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016804	AACT	2	8	294137	294144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016804	AACC	2	8	294145	294152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016804	ATGC	2	8	295135	295142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016804	GACG	2	8	300453	300460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016804	TTGC	2	8	308093	308100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016804	GGTC	2	8	308265	308272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016804	GGTA	2	8	334744	334751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016804	GCCG	2	8	334831	334838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016804	TGGC	2	8	334843	334850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016804	GCCG	2	8	337781	337788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016804	TGGC	2	8	337793	337800	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016804	CTGT	2	8	365825	365832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016804	AATC	2	8	377019	377026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016804	GGCC	2	8	387379	387386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016804	AAGG	2	8	388395	388402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016804	TGAC	2	8	397364	397371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016804	GTCA	2	8	397375	397382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016804	ATCG	2	8	418345	418352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016804	GCCA	2	8	418436	418443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016804	GTCC	2	8	418462	418469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016804	ACGG	2	8	418548	418555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016804	CACG	2	8	455537	455544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016804	TGCG	2	8	456649	456656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016804	GCTC	2	8	457029	457036	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016804	GGAT	2	8	469322	469329	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016804	CGAG	2	8	469465	469472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016804	CAAC	2	8	481414	481421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016804	AGAA	2	8	491921	491928	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016804	GCGG	2	8	504297	504304	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016804	ACCG	2	8	506177	506184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016804	CGGG	2	8	506214	506221	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016804	GAGG	2	8	508170	508177	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016804	GCGT	2	8	508256	508263	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016804	ACGG	2	8	511506	511513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016804	GATG	2	8	516480	516487	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016804	CTGA	2	8	517104	517111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016804	GCAA	2	8	519740	519747	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016804	GCTG	2	8	522613	522620	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016804	CCGT	2	8	529658	529665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016804	CGGC	2	8	534970	534977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016804	CGGC	2	8	539713	539720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016804	GACG	2	8	539723	539730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016804	CCGA	2	8	545975	545982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016804	AATC	2	8	546406	546413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016804	GTCT	2	8	547028	547035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016804	CGGC	2	8	561029	561036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016804	CCGG	2	8	561964	561971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016804	AGCA	2	8	566108	566115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016804	CGAC	2	8	566778	566785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016804	CGCC	2	8	578728	578735	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_016804	GCAT	2	8	578811	578818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016804	GTTT	2	8	587468	587475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016804	GCCG	2	8	592482	592489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016804	TGCC	2	8	597538	597545	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016804	TGGC	2	8	597604	597611	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016804	GCTA	2	8	597784	597791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016804	GCGT	2	8	605670	605677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016804	CCGA	2	8	605695	605702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016804	CCGA	2	8	609698	609705	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016804	GTCC	2	8	612253	612260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016804	GCCC	2	8	626763	626770	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_016804	CCGG	2	8	636768	636775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016804	TGCC	2	8	641205	641212	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016804	CGCC	2	8	642149	642156	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_016804	GCCG	2	8	652746	652753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016804	TGGC	2	8	656036	656043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016804	CCAG	2	8	658746	658753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016804	CGGT	2	8	659490	659497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016804	GTGC	2	8	662190	662197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016804	AAGG	2	8	662213	662220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016804	CGGC	2	8	664696	664703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016804	TTGC	2	8	666790	666797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016804	GTCG	2	8	666861	666868	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016804	CGGC	2	8	669690	669697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016804	GTGG	2	8	669707	669714	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016804	GCCG	2	8	673197	673204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016804	CGAA	2	8	677291	677298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016804	CGGC	2	8	678316	678323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016804	CCGG	2	8	680322	680329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016804	TTCA	2	8	685608	685615	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016804	CGGA	2	8	696841	696848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016804	TCCG	2	8	698213	698220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016804	CGGG	2	8	698305	698312	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016804	CCCA	2	8	705440	705447	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_016804	ACCG	2	8	705537	705544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016804	CCGC	2	8	708152	708159	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_016804	GGTC	2	8	715190	715197	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016804	TCGA	2	8	723310	723317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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168	NC_016804	CATG	2	8	769170	769177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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175	NC_016804	AGCC	2	8	784160	784167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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185	NC_016804	GGCG	2	8	812684	812691	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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262	NC_016804	ACGG	2	8	1110978	1110985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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272	NC_016804	GGTC	2	8	1164960	1164967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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275	NC_016804	AGGT	2	8	1165409	1165416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_016804	GCTG	2	8	1189173	1189180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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291	NC_016804	CATT	2	8	1191429	1191436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
292	NC_016804	GGTG	2	8	1198776	1198783	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
293	NC_016804	GCAG	2	8	1204694	1204701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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488	NC_016804	GCCG	2	8	2052918	2052925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
489	NC_016804	TTCG	2	8	2054210	2054217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
490	NC_016804	TGGG	2	8	2059069	2059076	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
491	NC_016804	GCGG	2	8	2065050	2065057	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
492	NC_016804	GCTG	2	8	2067422	2067429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_016804	CTAC	2	8	2084432	2084439	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
497	NC_016804	CGTG	2	8	2093415	2093422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_016804	TCGT	2	8	2095816	2095823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_016804	TGGT	2	8	2105332	2105339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
500	NC_016804	TCGA	2	8	2112193	2112200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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