MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 5823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016804	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016804	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016804	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016804	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016804	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016804	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016804	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016804	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016804	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016804	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016804	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016804	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016804	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016804	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016804	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_016804	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016804	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016804	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016804	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016804	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016804	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016804	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016804	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016804	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_016804	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016804	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016804	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016804	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016804	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016804	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016804	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016804	TCG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016804	CAC	2	6	13576	13581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016804	CGG	2	6	13701	13706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016804	GAC	2	6	14031	14036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016804	TCG	2	6	23253	23258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016804	GGT	2	6	23815	23820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016804	TCG	2	6	25457	25462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016804	CCG	2	6	25558	25563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016804	CTA	2	6	25593	25598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016804	TCC	2	6	25610	25615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016804	GTT	2	6	25617	25622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016804	TCG	3	9	25737	25745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016804	GCC	2	6	25751	25756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016804	AAC	2	6	26863	26868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016804	CGT	2	6	26881	26886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016804	CTT	2	6	26932	26937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016804	CCT	2	6	27431	27436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_016804	GTA	2	6	27546	27551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016804	CAA	2	6	31154	31159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016804	GAG	2	6	31160	31165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016804	GGC	2	6	31857	31862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016804	TCG	2	6	31917	31922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016804	TGC	3	9	31926	31934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016804	CAC	2	6	31989	31994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016804	GAT	2	6	32018	32023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016804	TGG	2	6	33183	33188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016804	CGG	2	6	33898	33903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016804	GCG	2	6	33919	33924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016804	TGG	2	6	33980	33985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016804	CGG	2	6	34051	34056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016804	GGT	2	6	34113	34118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016804	CCA	2	6	34135	34140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016804	TCA	2	6	38947	38952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016804	TCC	2	6	39101	39106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016804	CAC	2	6	39813	39818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016804	TCG	2	6	39835	39840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016804	GCC	2	6	41209	41214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016804	GGT	2	6	41270	41275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016804	GAT	2	6	41278	41283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016804	CCG	3	9	41902	41910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016804	AGC	2	6	41921	41926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016804	GCC	2	6	42351	42356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016804	CGT	2	6	43386	43391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016804	GTG	2	6	43463	43468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016804	CGG	2	6	46462	46467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016804	CGC	2	6	46517	46522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016804	CGG	2	6	46529	46534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016804	GCT	2	6	47319	47324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016804	GTG	2	6	49983	49988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016804	CCT	2	6	51718	51723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016804	ACG	2	6	51749	51754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016804	ACA	2	6	51797	51802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016804	TAG	2	6	52689	52694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016804	CCG	2	6	52723	52728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016804	CAA	2	6	52737	52742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016804	GGT	2	6	52761	52766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016804	CGT	2	6	52775	52780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016804	GTC	2	6	53246	53251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016804	GCG	2	6	53254	53259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016804	CGA	2	6	53306	53311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016804	TCC	2	6	53326	53331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016804	CGC	2	6	53419	53424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016804	GAG	2	6	53436	53441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016804	GCC	2	6	53457	53462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016804	CCG	2	6	53475	53480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016804	TGG	2	6	53495	53500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016804	GCC	2	6	53519	53524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016804	TGC	2	6	57391	57396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016804	CGC	2	6	58018	58023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016804	TCG	2	6	58027	58032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016804	GGT	2	6	58055	58060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016804	CCT	2	6	58127	58132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016804	AGG	2	6	58165	58170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016804	TGA	2	6	58171	58176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016804	GAA	3	9	58528	58536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016804	GCC	2	6	58545	58550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016804	AGG	2	6	58567	58572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016804	ATG	2	6	63058	63063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016804	CGG	2	6	63096	63101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016804	CGT	2	6	63125	63130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016804	AGG	3	9	63888	63896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016804	TCG	2	6	64971	64976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016804	GCC	2	6	65525	65530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016804	GGT	2	6	66813	66818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016804	TGC	2	6	66851	66856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016804	CTG	2	6	68458	68463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016804	CTG	2	6	68477	68482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016804	GCC	3	9	68501	68509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016804	GCC	2	6	68524	68529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016804	TCG	2	6	68577	68582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016804	AGG	2	6	68601	68606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016804	CGT	2	6	72279	72284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016804	GCG	2	6	74593	74598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016804	CGA	3	9	74649	74657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016804	GAG	2	6	75319	75324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016804	CGG	2	6	79009	79014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016804	CGA	2	6	79091	79096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016804	GCG	2	6	79156	79161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016804	CAT	2	6	79165	79170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016804	CGG	2	6	79235	79240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016804	GAG	2	6	79271	79276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016804	CGG	2	6	79477	79482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016804	GGC	2	6	79495	79500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016804	ACC	2	6	80268	80273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016804	GGC	2	6	80332	80337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016804	GCA	2	6	80354	80359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016804	CCA	2	6	80420	80425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_016804	CGG	2	6	80444	80449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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