MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 76716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016804	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769744
2	NC_016804	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769744
3	NC_016804	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
4	NC_016804	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
5	NC_016804	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769744
6	NC_016804	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
7	NC_016804	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769744
8	NC_016804	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769744
9	NC_016804	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
10	NC_016804	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769744
11	NC_016804	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
12	NC_016804	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769744
13	NC_016804	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769744
14	NC_016804	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769744
15	NC_016804	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
16	NC_016804	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769744
17	NC_016804	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769744
18	NC_016804	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
19	NC_016804	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769744
20	NC_016804	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
21	NC_016804	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
22	NC_016804	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769744
23	NC_016804	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769744
24	NC_016804	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769744
25	NC_016804	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769745
26	NC_016804	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769745
27	NC_016804	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769745
28	NC_016804	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769745
29	NC_016804	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769745
30	NC_016804	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769745
31	NC_016804	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769745
32	NC_016804	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769745
33	NC_016804	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769745
34	NC_016804	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769745
35	NC_016804	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769745
36	NC_016804	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769745
37	NC_016804	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769745
38	NC_016804	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769745
39	NC_016804	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769745
40	NC_016804	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769745
41	NC_016804	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769745
42	NC_016804	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769745
43	NC_016804	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769746
44	NC_016804	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769746
45	NC_016804	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769746
46	NC_016804	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769746
47	NC_016804	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769746
48	NC_016804	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769746
49	NC_016804	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769746
50	NC_016804	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769746
51	NC_016804	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769746
52	NC_016804	GTG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769746
53	NC_016804	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769746
54	NC_016804	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769746
55	NC_016804	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769746
56	NC_016804	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769746
57	NC_016804	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769746
58	NC_016804	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769746
59	NC_016804	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769746
60	NC_016804	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769746
61	NC_016804	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769746
62	NC_016804	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769746
63	NC_016804	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769746
64	NC_016804	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769746
65	NC_016804	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769746
66	NC_016804	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769746
67	NC_016804	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769747
68	NC_016804	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769747
69	NC_016804	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769747
70	NC_016804	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769747
71	NC_016804	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769747
72	NC_016804	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769747
73	NC_016804	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769747
74	NC_016804	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769748
75	NC_016804	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
76	NC_016804	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769748
77	NC_016804	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378769748
78	NC_016804	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769748
79	NC_016804	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
80	NC_016804	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
81	NC_016804	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769748
82	NC_016804	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
83	NC_016804	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
84	NC_016804	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769748
85	NC_016804	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
86	NC_016804	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
87	NC_016804	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769748
88	NC_016804	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769748
89	NC_016804	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
90	NC_016804	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769748
91	NC_016804	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
92	NC_016804	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
93	NC_016804	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769748
94	NC_016804	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
95	NC_016804	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769748
96	NC_016804	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769748
97	NC_016804	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769748
98	NC_016804	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
99	NC_016804	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769748
100	NC_016804	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769748
101	NC_016804	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769748
102	NC_016804	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769748
103	NC_016804	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769748
104	NC_016804	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769748
105	NC_016804	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769748
106	NC_016804	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
107	NC_016804	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769748
108	NC_016804	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769748
109	NC_016804	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769749
110	NC_016804	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769749
111	NC_016804	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769749
112	NC_016804	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769749
113	NC_016804	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769749
114	NC_016804	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769749
115	NC_016804	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769749
116	NC_016804	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769749
117	NC_016804	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769749
118	NC_016804	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769749
119	NC_016804	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769749
120	NC_016804	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769749
121	NC_016804	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769749
122	NC_016804	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769749
123	NC_016804	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769749
124	NC_016804	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769749
125	NC_016804	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769749
126	NC_016804	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769749
127	NC_016804	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769749
128	NC_016804	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769749
129	NC_016804	TAA	2	6	8285	8290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378769749
130	NC_016804	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769749
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249	NC_016804	CCG	2	6	16668	16673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769757
250	NC_016804	ACG	2	6	16718	16723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769757
251	NC_016804	CGG	2	6	16734	16739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769757
252	NC_016804	CTG	2	6	16944	16949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769757
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