MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio desulfuricans ND132 chromosome

Total Repeats: 3289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016803	GTCCC	2	10	54	63	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016803	CCTGG	2	10	1159	1168	0 %	20 %	40 %	40 %	376294793
3	NC_016803	GCGAG	2	10	4865	4874	20 %	0 %	60 %	20 %	376294796
4	NC_016803	GCCGG	2	10	8241	8250	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016803	ACCGA	2	10	9322	9331	40 %	0 %	20 %	40 %	376294801
6	NC_016803	GTGCT	2	10	14424	14433	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016803	CCACG	2	10	17916	17925	20 %	0 %	20 %	60 %	376294809
8	NC_016803	TCCTC	2	10	18380	18389	0 %	40 %	0 %	60 %	376294809
9	NC_016803	CGCCC	2	10	19619	19628	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_016803	CGGAT	2	10	20478	20487	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016803	GTCCT	2	10	23299	23308	0 %	40 %	20 %	40 %	376294814
12	NC_016803	GCTCG	2	10	23673	23682	0 %	20 %	40 %	40 %	376294814
13	NC_016803	GTCGC	2	10	26907	26916	0 %	20 %	40 %	40 %	376294818
14	NC_016803	GACCA	2	10	27351	27360	40 %	0 %	20 %	40 %	376294819
15	NC_016803	AAAAG	2	10	31320	31329	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016803	AGGTC	2	10	31633	31642	20 %	20 %	40 %	20 %	376294822
17	NC_016803	GGGGA	2	10	33313	33322	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016803	CGGCC	2	10	34575	34584	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_016803	CCGCC	2	10	34590	34599	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_016803	GCACG	2	10	34671	34680	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016803	GGGCG	2	10	35078	35087	0 %	0 %	80 %	20 %	376294827
22	NC_016803	CGACC	2	10	35630	35639	20 %	0 %	20 %	60 %	376294827
23	NC_016803	CAGGG	2	10	36567	36576	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016803	GGCCG	2	10	36997	37006	0 %	0 %	60 %	40 %	376294828
25	NC_016803	GAAGA	2	10	37515	37524	60 %	0 %	40 %	0 %	376294828
26	NC_016803	AGGCC	2	10	38033	38042	20 %	0 %	40 %	40 %	376294829
27	NC_016803	GCCCG	2	10	38406	38415	0 %	0 %	40 %	60 %	376294829
28	NC_016803	CTGGC	2	10	40534	40543	0 %	20 %	40 %	40 %	376294829
29	NC_016803	GGGCC	2	10	41755	41764	0 %	0 %	60 %	40 %	376294830
30	NC_016803	CCGGC	2	10	41897	41906	0 %	0 %	40 %	60 %	376294830
31	NC_016803	GCGGG	2	10	42638	42647	0 %	0 %	80 %	20 %	376294832
32	NC_016803	ACGGA	2	10	43069	43078	40 %	0 %	40 %	20 %	376294832
33	NC_016803	CCAGG	2	10	44157	44166	20 %	0 %	40 %	40 %	376294832
34	NC_016803	GCGCC	2	10	45730	45739	0 %	0 %	40 %	60 %	376294834
35	NC_016803	CAAAA	2	10	45975	45984	80 %	0 %	0 %	20 %	376294834
36	NC_016803	CGGCG	2	10	47582	47591	0 %	0 %	60 %	40 %	376294836
37	NC_016803	CGGGC	2	10	50365	50374	0 %	0 %	60 %	40 %	376294838
38	NC_016803	CCTGG	2	10	50982	50991	0 %	20 %	40 %	40 %	376294839
39	NC_016803	GTCCG	2	10	51051	51060	0 %	20 %	40 %	40 %	376294839
40	NC_016803	GACCA	2	10	51738	51747	40 %	0 %	20 %	40 %	376294840
41	NC_016803	TGGTC	2	10	52668	52677	0 %	40 %	40 %	20 %	376294841
42	NC_016803	AGGCC	2	10	52989	52998	20 %	0 %	40 %	40 %	376294841
43	NC_016803	CCGGG	2	10	53699	53708	0 %	0 %	60 %	40 %	376294842
44	NC_016803	AGCCG	2	10	56735	56744	20 %	0 %	40 %	40 %	376294845
45	NC_016803	TCGGC	2	10	60262	60271	0 %	20 %	40 %	40 %	376294849
46	NC_016803	GGGAC	2	10	64163	64172	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016803	GCTCC	2	10	64477	64486	0 %	20 %	20 %	60 %	376294854
48	NC_016803	CAGCG	2	10	67096	67105	20 %	0 %	40 %	40 %	376294856
49	NC_016803	CCGTG	2	10	67530	67539	0 %	20 %	40 %	40 %	376294857
50	NC_016803	GGCCC	2	10	67854	67863	0 %	0 %	40 %	60 %	376294857
51	NC_016803	ACCGG	2	10	69874	69883	20 %	0 %	40 %	40 %	376294859
52	NC_016803	GGCCA	2	10	70821	70830	20 %	0 %	40 %	40 %	376294859
53	NC_016803	GCGCG	2	10	71296	71305	0 %	0 %	60 %	40 %	376294860
54	NC_016803	ACGGC	2	10	71658	71667	20 %	0 %	40 %	40 %	376294860
55	NC_016803	CGTTT	2	10	72247	72256	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016803	AAGAT	2	10	72353	72362	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016803	GCACG	2	10	74012	74021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_016803	CAGGC	2	10	74353	74362	20 %	0 %	40 %	40 %	376294862
59	NC_016803	GGCCC	2	10	74955	74964	0 %	0 %	40 %	60 %	376294862
60	NC_016803	GTCGC	2	10	76630	76639	0 %	20 %	40 %	40 %	376294864
61	NC_016803	GCCGT	2	10	77314	77323	0 %	20 %	40 %	40 %	376294864
62	NC_016803	CAGGC	2	10	77839	77848	20 %	0 %	40 %	40 %	376294864
63	NC_016803	GTTCT	2	10	78962	78971	0 %	60 %	20 %	20 %	376294865
64	NC_016803	GCGGA	2	10	79387	79396	20 %	0 %	60 %	20 %	376294866
65	NC_016803	CGGGC	2	10	80218	80227	0 %	0 %	60 %	40 %	376294867
66	NC_016803	GACCA	2	10	81178	81187	40 %	0 %	20 %	40 %	376294868
67	NC_016803	GCAGG	2	10	81935	81944	20 %	0 %	60 %	20 %	376294869
68	NC_016803	CAGCC	2	10	82296	82305	20 %	0 %	20 %	60 %	376294869
69	NC_016803	GGTCC	2	10	82769	82778	0 %	20 %	40 %	40 %	376294869
70	NC_016803	CCGGC	2	10	83580	83589	0 %	0 %	40 %	60 %	376294870
71	NC_016803	CCGGC	2	10	84477	84486	0 %	0 %	40 %	60 %	376294871
72	NC_016803	CGGAC	2	10	86368	86377	20 %	0 %	40 %	40 %	376294873
73	NC_016803	GCCGA	2	10	87692	87701	20 %	0 %	40 %	40 %	376294874
74	NC_016803	CGGTC	2	10	88607	88616	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_016803	GCGCC	2	10	88908	88917	0 %	0 %	40 %	60 %	376294875
76	NC_016803	TGGCC	2	10	89953	89962	0 %	20 %	40 %	40 %	376294876
77	NC_016803	CCGGC	2	10	92947	92956	0 %	0 %	40 %	60 %	376294879
78	NC_016803	CGGGG	2	10	95877	95886	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016803	GGCCG	2	10	96692	96701	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016803	GGACC	2	10	98105	98114	20 %	0 %	40 %	40 %	376294882
81	NC_016803	CGGAC	2	10	99384	99393	20 %	0 %	40 %	40 %	376294883
82	NC_016803	CGCGG	2	10	99400	99409	0 %	0 %	60 %	40 %	376294883
83	NC_016803	GCCGG	2	10	100835	100844	0 %	0 %	60 %	40 %	376294885
84	NC_016803	GCAGG	2	10	102460	102469	20 %	0 %	60 %	20 %	376294886
85	NC_016803	CCCGG	2	10	102489	102498	0 %	0 %	40 %	60 %	376294886
86	NC_016803	GGCCC	2	10	106240	106249	0 %	0 %	40 %	60 %	376294888
87	NC_016803	GCCCG	2	10	106342	106351	0 %	0 %	40 %	60 %	376294888
88	NC_016803	CCGGC	2	10	107948	107957	0 %	0 %	40 %	60 %	376294889
89	NC_016803	CCCGG	2	10	108524	108533	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_016803	CAAGA	2	10	109495	109504	60 %	0 %	20 %	20 %	376294891
91	NC_016803	CGGCC	2	10	111592	111601	0 %	0 %	40 %	60 %	376294893
92	NC_016803	TCGCC	2	10	111774	111783	0 %	20 %	20 %	60 %	376294893
93	NC_016803	GCGCC	2	10	113490	113499	0 %	0 %	40 %	60 %	376294894
94	NC_016803	TGGGC	2	10	114281	114290	0 %	20 %	60 %	20 %	376294895
95	NC_016803	CCGAG	2	10	116787	116796	20 %	0 %	40 %	40 %	376294896
96	NC_016803	GGCCC	2	10	116830	116839	0 %	0 %	40 %	60 %	376294896
97	NC_016803	GCAGG	2	10	116971	116980	20 %	0 %	60 %	20 %	376294896
98	NC_016803	CGGGG	2	10	117031	117040	0 %	0 %	80 %	20 %	376294896
99	NC_016803	GGCCG	2	10	117323	117332	0 %	0 %	60 %	40 %	376294897
100	NC_016803	GGCGA	2	10	117671	117680	20 %	0 %	60 %	20 %	376294897
101	NC_016803	GCCGG	2	10	117709	117718	0 %	0 %	60 %	40 %	376294897
102	NC_016803	GTTTC	2	10	120176	120185	0 %	60 %	20 %	20 %	376294901
103	NC_016803	GGCCT	2	10	121382	121391	0 %	20 %	40 %	40 %	376294903
104	NC_016803	CCGGG	2	10	122324	122333	0 %	0 %	60 %	40 %	376294904
105	NC_016803	ACGGC	2	10	122752	122761	20 %	0 %	40 %	40 %	376294904
106	NC_016803	AAGCC	2	10	124039	124048	40 %	0 %	20 %	40 %	376294906
107	NC_016803	CGCCC	2	10	126325	126334	0 %	0 %	20 %	80 %	376294907
108	NC_016803	CCTTT	2	10	131653	131662	0 %	60 %	0 %	40 %	376294912
109	NC_016803	TTTCG	2	10	133633	133642	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016803	GCCCG	2	10	133648	133657	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_016803	AAGGC	2	10	133798	133807	40 %	0 %	40 %	20 %	376294915
112	NC_016803	CCATC	2	10	134398	134407	20 %	20 %	0 %	60 %	376294916
113	NC_016803	CGGGG	2	10	136716	136725	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016803	TGGAT	2	10	137281	137290	20 %	40 %	40 %	0 %	376294919
115	NC_016803	GTCCG	2	10	137890	137899	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_016803	CCTGG	2	10	138115	138124	0 %	20 %	40 %	40 %	376294920
117	NC_016803	GGGTC	2	10	139147	139156	0 %	20 %	60 %	20 %	376294921
118	NC_016803	CGGCC	2	10	140258	140267	0 %	0 %	40 %	60 %	376294922
119	NC_016803	GGCCT	2	10	141128	141137	0 %	20 %	40 %	40 %	376294923
120	NC_016803	GTCCA	2	10	142405	142414	20 %	20 %	20 %	40 %	376294925
121	NC_016803	CTGGC	2	10	142828	142837	0 %	20 %	40 %	40 %	376294925
122	NC_016803	GCAAC	2	10	143012	143021	40 %	0 %	20 %	40 %	376294925
123	NC_016803	GCACG	2	10	144974	144983	20 %	0 %	40 %	40 %	376294926
124	NC_016803	GCCGG	2	10	145179	145188	0 %	0 %	60 %	40 %	376294926
125	NC_016803	CCTGG	2	10	146183	146192	0 %	20 %	40 %	40 %	376294928
126	NC_016803	CGGGC	2	10	147773	147782	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016803	TACCG	2	10	148313	148322	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016803	CCCGT	2	10	149078	149087	0 %	20 %	20 %	60 %	376294932
129	NC_016803	GGTCC	2	10	149942	149951	0 %	20 %	40 %	40 %	376294933
130	NC_016803	CGGCG	2	10	151073	151082	0 %	0 %	60 %	40 %	376294933
131	NC_016803	GCGCG	2	10	151274	151283	0 %	0 %	60 %	40 %	376294933
132	NC_016803	GGCCG	2	10	154290	154299	0 %	0 %	60 %	40 %	376294934
133	NC_016803	CCAGG	2	10	154304	154313	20 %	0 %	40 %	40 %	376294934
134	NC_016803	CGGGC	2	10	157246	157255	0 %	0 %	60 %	40 %	376294938
135	NC_016803	GCGAC	2	10	157537	157546	20 %	0 %	40 %	40 %	376294939
136	NC_016803	GGCTG	2	10	158188	158197	0 %	20 %	60 %	20 %	376294939
137	NC_016803	GCAGG	2	10	162144	162153	20 %	0 %	60 %	20 %	376294943
138	NC_016803	TGGGC	2	10	163931	163940	0 %	20 %	60 %	20 %	376294944
139	NC_016803	CGAGC	2	10	166089	166098	20 %	0 %	40 %	40 %	376294945
140	NC_016803	GGGCC	2	10	166532	166541	0 %	0 %	60 %	40 %	376294945
141	NC_016803	CCGGG	2	10	166736	166745	0 %	0 %	60 %	40 %	376294945
142	NC_016803	CCGCG	2	10	168198	168207	0 %	0 %	40 %	60 %	376294946
143	NC_016803	CTTTT	2	10	169845	169854	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016803	GGCCC	2	10	170922	170931	0 %	0 %	40 %	60 %	376294948
145	NC_016803	AGGGC	2	10	172595	172604	20 %	0 %	60 %	20 %	376294949
146	NC_016803	TCGGT	2	10	176245	176254	0 %	40 %	40 %	20 %	376294953
147	NC_016803	CAGGC	2	10	176874	176883	20 %	0 %	40 %	40 %	376294953
148	NC_016803	CCGGC	2	10	177383	177392	0 %	0 %	40 %	60 %	376294953
149	NC_016803	GTTCC	2	10	179632	179641	0 %	40 %	20 %	40 %	376294955
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151	NC_016803	GCTTC	2	10	180442	180451	0 %	40 %	20 %	40 %	376294955
152	NC_016803	GAAGC	2	10	182432	182441	40 %	0 %	40 %	20 %	376294958
153	NC_016803	AACAA	2	10	182486	182495	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_016803	CGCGT	2	10	184208	184217	0 %	20 %	40 %	40 %	376294960
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156	NC_016803	CGGCC	2	10	185285	185294	0 %	0 %	40 %	60 %	376294961
157	NC_016803	GGGTC	2	10	185959	185968	0 %	20 %	60 %	20 %	376294961
158	NC_016803	CCCGG	2	10	187483	187492	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
159	NC_016803	ACATA	2	10	188927	188936	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_016803	GGGCC	2	10	192871	192880	0 %	0 %	60 %	40 %	376294968
161	NC_016803	GCGCG	2	10	194509	194518	0 %	0 %	60 %	40 %	376294970
162	NC_016803	CTGCA	2	10	194687	194696	20 %	20 %	20 %	40 %	376294970
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165	NC_016803	TCCGC	2	10	199990	199999	0 %	20 %	20 %	60 %	376294973
166	NC_016803	CGGCG	2	10	201005	201014	0 %	0 %	60 %	40 %	376294973
167	NC_016803	TTTGC	2	10	202156	202165	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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169	NC_016803	ACCGG	2	10	204284	204293	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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173	NC_016803	CTCGT	2	10	208696	208705	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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177	NC_016803	CGTGT	2	10	212952	212961	0 %	40 %	40 %	20 %	376294986
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181	NC_016803	GCATC	2	10	214540	214549	20 %	20 %	20 %	40 %	376294987
182	NC_016803	GAAGA	2	10	216426	216435	60 %	0 %	40 %	0 %	376294988
183	NC_016803	CCGGC	2	10	218814	218823	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
184	NC_016803	TGATG	2	10	219410	219419	20 %	40 %	40 %	0 %	376294990
185	NC_016803	GAAGT	2	10	219492	219501	40 %	20 %	40 %	0 %	376294990
186	NC_016803	ATCCC	2	10	220209	220218	20 %	20 %	0 %	60 %	376294991
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189	NC_016803	GCCCG	2	10	225377	225386	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
190	NC_016803	CCCCG	2	10	227304	227313	0 %	0 %	20 %	80 %	376294996
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199	NC_016803	ACGGA	2	10	235805	235814	40 %	0 %	40 %	20 %	376295004
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201	NC_016803	AGGCA	2	10	237215	237224	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
202	NC_016803	CCGGC	2	10	238095	238104	0 %	0 %	40 %	60 %	376295005
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207	NC_016803	AGGCC	2	10	245501	245510	20 %	0 %	40 %	40 %	376295010
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224	NC_016803	AGGGC	2	10	265123	265132	20 %	0 %	60 %	20 %	376295025
225	NC_016803	GTTGA	2	10	266701	266710	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
226	NC_016803	GCCGT	2	10	270159	270168	0 %	20 %	40 %	40 %	376295030
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240	NC_016803	GGCGC	2	10	293104	293113	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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242	NC_016803	TCGGC	2	10	296641	296650	0 %	20 %	40 %	40 %	376295048
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259	NC_016803	CCCGG	2	10	316198	316207	0 %	0 %	40 %	60 %	376295068
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264	NC_016803	CAGTT	2	10	325130	325139	20 %	40 %	20 %	20 %	376295075
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266	NC_016803	GGCCG	2	10	325891	325900	0 %	0 %	60 %	40 %	376295075
267	NC_016803	CGGCC	2	10	326049	326058	0 %	0 %	40 %	60 %	376295075
268	NC_016803	GCGCG	2	10	327080	327089	0 %	0 %	60 %	40 %	376295076
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399	NC_016803	CGGGG	2	10	493274	493283	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
400	NC_016803	CCGGC	2	10	493478	493487	0 %	0 %	40 %	60 %	376295237
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402	NC_016803	CGGGC	2	10	496020	496029	0 %	0 %	60 %	40 %	376295240
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