MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC02 chromosome

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016802	TAATCC	2	12	12947	12958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016802	TACTGC	2	12	19589	19600	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016802	AAGCTA	2	12	20123	20134	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016802	CGGGGA	2	12	20143	20154	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016802	TCTAGC	2	12	27481	27492	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016802	TTGACA	2	12	55252	55263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016802	GCGGCC	2	12	56932	56943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016802	GGCCTC	2	12	65077	65088	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016802	GGCCTC	2	12	65091	65102	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016802	GTCAGA	2	12	75249	75260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016802	CACTTC	2	12	169018	169029	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016802	GAGTTC	2	12	171436	171447	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016802	AAAACA	2	12	201731	201742	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016802	TGGTGA	2	12	215958	215969	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016802	ACCTAT	2	12	253183	253194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016802	TTATGG	2	12	349253	349264	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016802	GACTAG	2	12	400651	400662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016802	ACAAGG	2	12	426474	426485	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016802	CGCTAT	2	12	477140	477151	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016802	GCACCT	2	12	496200	496211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016802	AAAAAC	2	12	546505	546516	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016802	GGGGCA	2	12	583387	583398	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016802	TTGTGG	2	12	694981	694992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016802	GTTTGG	2	12	697569	697580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016802	CAAGCG	2	12	721191	721202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016802	TGTTTT	2	12	728949	728960	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016802	AGCGAA	2	12	729991	730002	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016802	AGGTTC	2	12	763262	763273	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016802	CTTCCG	2	12	788745	788756	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016802	CAAACC	2	12	858334	858345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016802	CTTTTT	2	12	1072314	1072325	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016802	ATGGAT	2	12	1097034	1097045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016802	TGTTTT	2	12	1143325	1143336	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016802	AGCGAA	2	12	1144367	1144378	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016802	GACAGT	2	12	1174842	1174853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016802	TTGAGG	2	12	1179318	1179329	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016802	AAAAAC	2	12	1232816	1232827	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016802	TGCCAC	2	12	1245465	1245476	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016802	TCGCCC	2	12	1425540	1425551	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016802	TCAATG	2	12	1426609	1426620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016802	CTGCAT	2	12	1468860	1468871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016802	TGCAGC	2	12	1475647	1475658	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016802	GACGGT	2	12	1518318	1518329	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016802	CCAGCC	2	12	1523873	1523884	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016802	GCTGTG	4	24	1749357	1749380	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016802	AAGCAG	2	12	1829798	1829809	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016802	GAAGTG	2	12	1909055	1909066	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016802	CCGCAG	2	12	1909195	1909206	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016802	TTCGCT	2	12	1924237	1924248	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016802	TAACCC	2	12	1940360	1940371	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016802	ACATTT	2	12	2047760	2047771	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016802	TAGTTT	2	12	2049037	2049048	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016802	GTTCGC	2	12	2137988	2137999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016802	ATCAGT	2	12	2153028	2153039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016802	TTCGCT	2	12	2187558	2187569	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016802	AAACCA	2	12	2274148	2274159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016802	AAAGGA	2	12	2285368	2285379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016802	TTCGCT	2	12	2345287	2345298	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016802	ATTGTT	2	12	2354185	2354196	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016802	CTTGTC	2	12	2391857	2391868	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016802	CATCGA	2	12	2398820	2398831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.