MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC02 chromosome

Total Repeats: 760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016802	ATCA	2	8	2289	2296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016802	GAAT	2	8	11896	11903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016802	CAGG	2	8	14704	14711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016802	CCGG	2	8	14993	15000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016802	GCAC	2	8	20364	20371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016802	TTAA	2	8	25711	25718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016802	CTGG	2	8	26832	26839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016802	AAGG	2	8	27041	27048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016802	CAAT	2	8	27274	27281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016802	CTTG	2	8	27358	27365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016802	CGCA	2	8	27942	27949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016802	TTGA	2	8	28036	28043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016802	GAAT	2	8	28295	28302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016802	ATAA	2	8	29231	29238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016802	AGAT	2	8	29851	29858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016802	AGTG	2	8	30108	30115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016802	GAAG	2	8	30198	30205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016802	CAAC	2	8	33850	33857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016802	CAAT	2	8	36540	36547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016802	TAAT	2	8	36943	36950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016802	GGGT	2	8	36952	36959	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016802	TTAA	2	8	37012	37019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016802	AAAT	2	8	45027	45034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016802	TTGT	2	8	45405	45412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016802	TCGG	2	8	56114	56121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016802	GCCC	2	8	56823	56830	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_016802	CGCT	2	8	57163	57170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016802	CGGC	2	8	57572	57579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016802	CAGC	2	8	57689	57696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016802	CCAG	2	8	57737	57744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016802	TGGC	2	8	58210	58217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016802	CAAC	2	8	63468	63475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016802	TGAT	2	8	63706	63713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016802	CGGC	2	8	63951	63958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016802	GACG	2	8	64004	64011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016802	GGCC	2	8	64962	64969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016802	GTTT	2	8	67245	67252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016802	GATA	2	8	75552	75559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016802	CAGG	2	8	75688	75695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016802	CGGG	2	8	75747	75754	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016802	GCCA	2	8	75863	75870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016802	GTGG	2	8	81190	81197	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016802	CTAA	2	8	81337	81344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016802	CAAT	2	8	81696	81703	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016802	ATGA	2	8	81718	81725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016802	GTAC	2	8	86300	86307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016802	AAAT	2	8	92573	92580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016802	TAAT	2	8	92906	92913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016802	GGTG	2	8	96939	96946	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016802	ATTG	2	8	102559	102566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016802	GGGT	2	8	110720	110727	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016802	TCAA	2	8	113905	113912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016802	GGGA	2	8	114049	114056	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016802	CCAT	2	8	114368	114375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016802	GAAG	2	8	132784	132791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016802	GATG	2	8	133263	133270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016802	CAAC	2	8	133274	133281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016802	TTGA	2	8	137608	137615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016802	CGTG	2	8	139875	139882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016802	AACA	2	8	154812	154819	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016802	ACTA	2	8	165250	165257	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016802	CCCG	2	8	169209	169216	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_016802	GGGT	2	8	169382	169389	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016802	CCGC	2	8	171338	171345	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_016802	GCGG	2	8	176324	176331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016802	TCGT	2	8	176441	176448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016802	GGCG	2	8	177638	177645	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016802	GCTC	2	8	178779	178786	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016802	CAGG	2	8	185893	185900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016802	GCCC	2	8	185979	185986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_016802	GCAA	2	8	186116	186123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016802	CTTG	2	8	187540	187547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016802	GGAG	2	8	190131	190138	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016802	TGGT	2	8	190765	190772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016802	GAAA	2	8	191173	191180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016802	CCGC	2	8	192516	192523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_016802	GTAG	2	8	195012	195019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016802	ATTG	2	8	195174	195181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016802	TTGG	2	8	195239	195246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016802	TGGC	2	8	195250	195257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016802	ATTG	2	8	195401	195408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016802	CATA	2	8	197867	197874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016802	ATTG	2	8	215572	215579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016802	AGGC	2	8	215669	215676	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016802	TTTC	2	8	216024	216031	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016802	CGGG	2	8	216051	216058	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016802	TGGA	2	8	216253	216260	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016802	CATT	2	8	216332	216339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016802	TGGA	2	8	216401	216408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016802	GCCA	2	8	216653	216660	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016802	CGAG	2	8	216849	216856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016802	CCAC	2	8	218952	218959	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_016802	CTGG	2	8	228408	228415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016802	GAAA	2	8	228519	228526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016802	CAAC	2	8	230141	230148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016802	CAAG	2	8	230289	230296	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016802	GTTT	2	8	231073	231080	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016802	TTGG	2	8	260958	260965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016802	ATCC	2	8	262964	262971	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016802	GGTC	2	8	267863	267870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016802	ACCC	2	8	269564	269571	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_016802	GCCC	2	8	269663	269670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_016802	TTTG	2	8	276562	276569	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016802	GCTA	2	8	276985	276992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016802	ATTG	2	8	277014	277021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016802	GTAC	2	8	284437	284444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016802	CTAA	2	8	293645	293652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016802	CATG	2	8	296790	296797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016802	GACA	2	8	296814	296821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016802	AGCT	2	8	296926	296933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016802	TGCT	2	8	298422	298429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016802	TGAT	2	8	299747	299754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016802	GATT	2	8	300476	300483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016802	GACT	2	8	304107	304114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016802	GCTA	2	8	304261	304268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016802	GCTG	2	8	304368	304375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016802	TTTA	2	8	304446	304453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016802	AGGC	2	8	306117	306124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016802	TCAA	2	8	311244	311251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016802	TAGG	2	8	320655	320662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016802	CAGG	2	8	328639	328646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016802	TTGG	2	8	337462	337469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016802	TGCG	2	8	342343	342350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016802	CTTT	2	8	343939	343946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016802	CGTG	2	8	344114	344121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016802	GCGG	2	8	344467	344474	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016802	GTAC	2	8	344522	344529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016802	ATCA	2	8	346983	346990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016802	AGCG	2	8	347020	347027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016802	ATGT	2	8	375901	375908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016802	AGGA	2	8	380512	380519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016802	GCCG	2	8	418636	418643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016802	ACTA	2	8	420672	420679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016802	GATT	2	8	426445	426452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016802	TCGT	2	8	430273	430280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016802	AATT	2	8	431865	431872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016802	TAAA	2	8	431948	431955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016802	CGCT	2	8	432108	432115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016802	GATG	2	8	438281	438288	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016802	CCTG	2	8	456309	456316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016802	ATTT	2	8	456575	456582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016802	GTTT	2	8	456817	456824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016802	AGGC	2	8	459184	459191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016802	TTAA	2	8	472774	472781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016802	AGTT	2	8	474030	474037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016802	CTTT	2	8	474113	474120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016802	GGTT	2	8	477126	477133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016802	AGGA	2	8	483761	483768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016802	TCAT	2	8	489550	489557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016802	TGGG	2	8	489615	489622	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016802	GGGT	2	8	489692	489699	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016802	GAAA	2	8	491822	491829	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_016802	ATCC	2	8	498154	498161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_016802	ATTG	2	8	511158	511165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016802	CTGG	2	8	511380	511387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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164	NC_016802	AAGG	2	8	540280	540287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_016802	TTTA	2	8	596732	596739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_016802	ATTT	2	8	727275	727282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_016802	GTTG	2	8	727332	727339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
233	NC_016802	GTTG	2	8	727360	727367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
234	NC_016802	TGGT	2	8	729191	729198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_016802	TACC	2	8	826987	826994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
278	NC_016802	TGAT	2	8	830072	830079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_016802	TCCA	2	8	832552	832559	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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477	NC_016802	GGAT	2	8	1463309	1463316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_016802	TTCG	2	8	1585395	1585402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_016802	ATCT	2	8	1590160	1590167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_016802	TTCT	2	8	1597720	1597727	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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