MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae BH8 chromosome

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016800	TAATCC	2	12	12933	12944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016800	TACTGC	2	12	19605	19616	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016800	AAGCTA	2	12	20139	20150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016800	TCTAGC	2	12	27428	27439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016800	TTGACA	2	12	55146	55157	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016800	GTCAGA	2	12	75123	75134	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016800	CACTTC	2	12	167164	167175	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016800	GAGTTC	2	12	169666	169677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016800	ATAAAA	2	12	175507	175518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016800	CACGAA	2	12	200374	200385	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016800	AAAACA	2	12	200524	200535	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016800	ACCTAT	2	12	241407	241418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016800	CTTTGC	2	12	293298	293309	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016800	TTATGG	2	12	337231	337242	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016800	ACAAGG	2	12	418012	418023	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016800	ACGAGG	2	12	449223	449234	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016800	CGCTAT	2	12	475137	475148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016800	GCACCT	2	12	494185	494196	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016800	AAAAAC	2	12	545464	545475	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016800	GGGGCA	2	12	580063	580074	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016800	TAAGCG	2	12	606763	606774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016800	TTGTGG	2	12	717673	717684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016800	GTTTGG	2	12	721266	721277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016800	TGAGGG	2	12	736832	736843	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016800	CATGTG	2	12	740093	740104	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016800	AGCGAA	2	12	740376	740387	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016800	GCGCAT	2	12	743130	743141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016800	AGGTTC	2	12	772816	772827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016800	CTTCCG	2	12	798279	798290	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016800	TCCTTG	2	12	850483	850494	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016800	GAAAAT	2	12	987839	987850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016800	ATGTGG	2	12	995573	995584	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016800	GGTGAA	2	12	1103898	1103909	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016800	ATGGAT	2	12	1127826	1127837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016800	CATGTG	2	12	1174852	1174863	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016800	AGCGAA	2	12	1175135	1175146	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016800	GACAGT	2	12	1205619	1205630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016800	TTGAGG	2	12	1210095	1210106	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016800	AAAAAC	2	12	1261912	1261923	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016800	TGCCAC	2	12	1274561	1274572	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016800	ACCAGC	2	12	1399467	1399478	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016800	AACCGG	2	12	1402540	1402551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016800	ACAGAA	2	12	1407676	1407687	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016800	TCAATG	2	12	1469979	1469990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016800	CTGCAT	2	12	1512338	1512349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016800	TGCAGC	2	12	1519125	1519136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016800	GACGGT	2	12	1564518	1564529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016800	GCTGTG	3	18	1791632	1791649	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016800	CCCGAC	2	12	1859398	1859409	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016800	GCGCTG	2	12	1866642	1866653	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016800	ATGCGC	2	12	1921288	1921299	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016800	TTCGCT	2	12	1924050	1924061	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016800	CACATG	2	12	1924333	1924344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016800	AGTCTG	2	12	1947858	1947869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016800	AAAAGC	2	12	1948753	1948764	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016800	GCAAAG	2	12	2107347	2107358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016800	GTTCGC	2	12	2130831	2130842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016800	CGACTG	2	12	2131597	2131608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016800	CACATT	2	12	2133333	2133344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016800	TTTGCT	2	12	2134700	2134711	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016800	ATCAGT	2	12	2145136	2145147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016800	ATGCGC	2	12	2180783	2180794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016800	TTCGCT	2	12	2183536	2183547	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016800	CACATG	2	12	2183819	2183830	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016800	GGGTTT	2	12	2213803	2213814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016800	AAAGGA	2	12	2276996	2277007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016800	CAGGCG	2	12	2294062	2294073	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016800	CCGTTG	2	12	2337234	2337245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016800	ATGCGC	2	12	2357302	2357313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016800	TTCGCT	2	12	2360055	2360066	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016800	CACATG	2	12	2360338	2360349	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016800	ATTGTT	2	12	2368926	2368937	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016800	GTCACA	2	12	2389300	2389311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016800	GTGTAT	2	12	2393904	2393915	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016800	GGGCTG	2	12	2403043	2403054	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016800	CACCGC	2	12	2433596	2433607	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.