MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae 31A chromosome

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016799	TAATCC	2	12	12724	12735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016799	AAGCTA	2	12	19904	19915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016799	TTGACA	2	12	52616	52627	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016799	GACAGG	2	12	59574	59585	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016799	GTCAGA	2	12	74314	74325	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016799	AACAGG	2	12	141232	141243	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016799	CACTTC	2	12	172085	172096	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016799	GAGTTC	2	12	213227	213238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016799	AAGGGC	2	12	219506	219517	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016799	GGCCTT	2	12	221770	221781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016799	AAAACA	2	12	245989	246000	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016799	ACCTAT	2	12	299164	299175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016799	TTATGG	2	12	401444	401455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016799	ACAAGG	2	12	476782	476793	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016799	CGCTAT	2	12	522779	522790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016799	GGGGTG	2	12	538350	538361	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016799	GCACCT	2	12	541758	541769	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016799	ACCGAC	2	12	581610	581621	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016799	ATCGCC	2	12	583015	583026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016799	AAAAAC	2	12	593042	593053	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016799	CTCAAG	2	12	625042	625053	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016799	TAAGCG	2	12	653230	653241	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016799	AACAAA	2	12	737400	737411	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016799	TTGTGG	2	12	762268	762279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016799	GTTTGG	2	12	764763	764774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016799	AAAGCC	2	12	775819	775830	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016799	TGTTTT	2	12	789447	789458	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016799	AGCGAA	2	12	790482	790493	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016799	GCGTAG	2	12	793193	793204	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016799	TGGGTG	2	12	793387	793398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016799	AGGTTC	2	12	822843	822854	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016799	TCCTTG	2	12	898499	898510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016799	GGTGAA	2	12	1130519	1130530	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016799	ATGGAT	2	12	1153007	1153018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016799	TGTTTT	2	12	1199306	1199317	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016799	AGCGAA	2	12	1200341	1200352	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016799	GACAGT	2	12	1230805	1230816	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016799	TTGAGG	2	12	1235281	1235292	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016799	AAAAAC	2	12	1288796	1288807	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016799	ACCAGC	2	12	1426326	1426337	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016799	ACAGAA	2	12	1433181	1433192	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016799	GTCAAC	2	12	1435256	1435267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016799	TCGCCC	2	12	1492557	1492568	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016799	TCAATG	2	12	1493627	1493638	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016799	CTGCAT	2	12	1535979	1535990	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016799	TGCAGC	2	12	1542767	1542778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016799	GACGGT	2	12	1585270	1585281	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016799	GGCCGA	2	12	1605252	1605263	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016799	CAGCGC	2	12	1606987	1606998	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016799	CTGCCC	2	12	1607004	1607015	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016799	GACTAG	2	12	1737998	1738009	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016799	CCATGA	2	12	1738281	1738292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016799	TTCGCT	2	12	1739084	1739095	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016799	GCTGTG	4	24	1824811	1824834	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016799	GCCTAC	2	12	1952253	1952264	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016799	TTCGCT	2	12	1954966	1954977	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016799	TCATGG	2	12	1969109	1969120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016799	CTAGTC	2	12	1969392	1969403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016799	TCACCA	2	12	2044152	2044163	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016799	TTGTCG	2	12	2060024	2060035	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016799	AAATCT	2	12	2080269	2080280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016799	TGCCTA	2	12	2083014	2083025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016799	GCCTAC	2	12	2231125	2231136	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016799	TTCGCT	2	12	2233839	2233850	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016799	GGGTTT	2	12	2255939	2255950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016799	AGCACC	2	12	2334871	2334882	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016799	AAAGGA	2	12	2338113	2338124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016799	CAGGCG	2	12	2354976	2354987	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016799	ATGCGC	2	12	2417110	2417121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016799	TTCGCT	2	12	2419853	2419864	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016799	ATTGTT	2	12	2428743	2428754	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016799	TCCCTT	2	12	2483175	2483186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016799	CGCCAT	2	12	2483230	2483241	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.