MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium diphtheriae 31A chromosome

Total Repeats: 1495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016799	AGCGA	2	10	1943	1952	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016799	CGGTG	2	10	2156	2165	0 %	20 %	60 %	20 %	376283505
3	NC_016799	CCACC	2	10	6014	6023	20 %	0 %	0 %	80 %	376283508
4	NC_016799	CGCAC	2	10	10331	10340	20 %	0 %	20 %	60 %	376283512
5	NC_016799	CGAGT	2	10	13859	13868	20 %	20 %	40 %	20 %	376283515
6	NC_016799	CCAGG	2	10	16327	16336	20 %	0 %	40 %	40 %	376283517
7	NC_016799	GATTC	2	10	22896	22905	20 %	40 %	20 %	20 %	376283524
8	NC_016799	TGCGC	2	10	23210	23219	0 %	20 %	40 %	40 %	376283525
9	NC_016799	GCGCT	2	10	24237	24246	0 %	20 %	40 %	40 %	376283526
10	NC_016799	GTGAG	2	10	26241	26250	20 %	20 %	60 %	0 %	376283529
11	NC_016799	TGGGG	2	10	31980	31989	0 %	20 %	80 %	0 %	376283536
12	NC_016799	CACCT	2	10	32791	32800	20 %	20 %	0 %	60 %	376283536
13	NC_016799	AATTG	2	10	34860	34869	40 %	40 %	20 %	0 %	376283539
14	NC_016799	AGAAA	2	10	37461	37470	80 %	0 %	20 %	0 %	376283539
15	NC_016799	CATCA	2	10	37929	37938	40 %	20 %	0 %	40 %	376283540
16	NC_016799	CGGCA	2	10	38126	38135	20 %	0 %	40 %	40 %	376283540
17	NC_016799	GGTGT	2	10	38776	38785	0 %	40 %	60 %	0 %	376283541
18	NC_016799	CGGTG	2	10	41870	41879	0 %	20 %	60 %	20 %	376283544
19	NC_016799	GTGCT	2	10	43313	43322	0 %	40 %	40 %	20 %	376283547
20	NC_016799	GTTGC	2	10	43997	44006	0 %	40 %	40 %	20 %	376283547
21	NC_016799	GGGTT	2	10	44061	44070	0 %	40 %	60 %	0 %	376283547
22	NC_016799	TGGCG	2	10	45788	45797	0 %	20 %	60 %	20 %	376283548
23	NC_016799	GCGCA	2	10	46051	46060	20 %	0 %	40 %	40 %	376283548
24	NC_016799	CGCAG	2	10	48568	48577	20 %	0 %	40 %	40 %	376283550
25	NC_016799	GCCAC	2	10	48727	48736	20 %	0 %	20 %	60 %	376283550
26	NC_016799	TGAGG	2	10	51017	51026	20 %	20 %	60 %	0 %	376283551
27	NC_016799	TACGA	2	10	51618	51627	40 %	20 %	20 %	20 %	376283553
28	NC_016799	ACGGC	2	10	53626	53635	20 %	0 %	40 %	40 %	376283556
29	NC_016799	CACCG	2	10	54062	54071	20 %	0 %	20 %	60 %	376283556
30	NC_016799	GACGG	2	10	54866	54875	20 %	0 %	60 %	20 %	376283556
31	NC_016799	GGCGG	2	10	56017	56026	0 %	0 %	80 %	20 %	376283557
32	NC_016799	CACGC	2	10	57300	57309	20 %	0 %	20 %	60 %	376283559
33	NC_016799	GGTGG	2	10	57589	57598	0 %	20 %	80 %	0 %	376283559
34	NC_016799	GACGG	2	10	60183	60192	20 %	0 %	60 %	20 %	376283561
35	NC_016799	GACGG	2	10	60204	60213	20 %	0 %	60 %	20 %	376283561
36	NC_016799	TGGCC	2	10	60242	60251	0 %	20 %	40 %	40 %	376283561
37	NC_016799	TGGCA	2	10	61099	61108	20 %	20 %	40 %	20 %	376283562
38	NC_016799	GATGT	2	10	61483	61492	20 %	40 %	40 %	0 %	376283562
39	NC_016799	CCCAT	2	10	62054	62063	20 %	20 %	0 %	60 %	376283562
40	NC_016799	TCGCT	2	10	62233	62242	0 %	40 %	20 %	40 %	376283562
41	NC_016799	CGGCC	2	10	69579	69588	0 %	0 %	40 %	60 %	376283571
42	NC_016799	CGGTC	2	10	69663	69672	0 %	20 %	40 %	40 %	376283571
43	NC_016799	CACGG	2	10	72096	72105	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016799	GATCA	2	10	74788	74797	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016799	ACTCC	2	10	74883	74892	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_016799	CAGAT	2	10	75141	75150	40 %	20 %	20 %	20 %	376283580
47	NC_016799	CTTGG	2	10	76707	76716	0 %	40 %	40 %	20 %	376283581
48	NC_016799	CCACG	2	10	78641	78650	20 %	0 %	20 %	60 %	376283583
49	NC_016799	TGACC	2	10	78954	78963	20 %	20 %	20 %	40 %	376283583
50	NC_016799	GGTTA	2	10	79714	79723	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016799	GCTCT	2	10	80468	80477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016799	GCTCA	2	10	83792	83801	20 %	20 %	20 %	40 %	376283587
53	NC_016799	CCGCT	2	10	84347	84356	0 %	20 %	20 %	60 %	376283587
54	NC_016799	GATCT	2	10	84432	84441	20 %	40 %	20 %	20 %	376283587
55	NC_016799	GCTCA	2	10	84590	84599	20 %	20 %	20 %	40 %	376283587
56	NC_016799	GGCCT	2	10	85849	85858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016799	CGTGG	2	10	89506	89515	0 %	20 %	60 %	20 %	376283593
58	NC_016799	CGGCG	2	10	89989	89998	0 %	0 %	60 %	40 %	376283593
59	NC_016799	CTCGA	2	10	90545	90554	20 %	20 %	20 %	40 %	376283593
60	NC_016799	TCGTG	2	10	91972	91981	0 %	40 %	40 %	20 %	376283594
61	NC_016799	TTTGA	2	10	93593	93602	20 %	60 %	20 %	0 %	376283596
62	NC_016799	TTGTT	2	10	94064	94073	0 %	80 %	20 %	0 %	376283598
63	NC_016799	AAAAG	2	10	94387	94396	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016799	TCAAG	2	10	94480	94489	40 %	20 %	20 %	20 %	376283599
65	NC_016799	TCACC	2	10	96850	96859	20 %	20 %	0 %	60 %	376283601
66	NC_016799	AAATT	2	10	98945	98954	60 %	40 %	0 %	0 %	376283603
67	NC_016799	AGGAG	2	10	100235	100244	40 %	0 %	60 %	0 %	376283606
68	NC_016799	ACCAA	2	10	100248	100257	60 %	0 %	0 %	40 %	376283606
69	NC_016799	CGGTG	2	10	101452	101461	0 %	20 %	60 %	20 %	376283608
70	NC_016799	GACTG	2	10	104073	104082	20 %	20 %	40 %	20 %	376283612
71	NC_016799	TGCGG	2	10	104193	104202	0 %	20 %	60 %	20 %	376283612
72	NC_016799	GCCTA	2	10	108334	108343	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_016799	GCGCT	2	10	109822	109831	0 %	20 %	40 %	40 %	376283618
74	NC_016799	CGTTC	2	10	110573	110582	0 %	40 %	20 %	40 %	376283618
75	NC_016799	CCAAG	2	10	112526	112535	40 %	0 %	20 %	40 %	376283620
76	NC_016799	GCGTG	2	10	113625	113634	0 %	20 %	60 %	20 %	376283622
77	NC_016799	CTCAA	2	10	114882	114891	40 %	20 %	0 %	40 %	376283623
78	NC_016799	GCCCA	2	10	115083	115092	20 %	0 %	20 %	60 %	376283623
79	NC_016799	GAGCT	2	10	118974	118983	20 %	20 %	40 %	20 %	376283628
80	NC_016799	CATGA	2	10	120509	120518	40 %	20 %	20 %	20 %	376283628
81	NC_016799	CCGCA	2	10	120908	120917	20 %	0 %	20 %	60 %	376283629
82	NC_016799	AGCCA	2	10	121487	121496	40 %	0 %	20 %	40 %	376283630
83	NC_016799	CATCG	2	10	123868	123877	20 %	20 %	20 %	40 %	376283633
84	NC_016799	GCGAT	2	10	126743	126752	20 %	20 %	40 %	20 %	376283635
85	NC_016799	GGCCA	2	10	127823	127832	20 %	0 %	40 %	40 %	376283635
86	NC_016799	TCCAC	2	10	127993	128002	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_016799	TCCGC	2	10	130598	130607	0 %	20 %	20 %	60 %	376283639
88	NC_016799	GTGGG	2	10	133828	133837	0 %	20 %	80 %	0 %	376283642
89	NC_016799	GGCAC	2	10	134189	134198	20 %	0 %	40 %	40 %	376283642
90	NC_016799	TGCAC	2	10	135834	135843	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016799	ACACC	2	10	135902	135911	40 %	0 %	0 %	60 %	376283645
92	NC_016799	GAGCG	2	10	136988	136997	20 %	0 %	60 %	20 %	376283646
93	NC_016799	GAAAC	2	10	137480	137489	60 %	0 %	20 %	20 %	376283648
94	NC_016799	TCGAA	2	10	139406	139415	40 %	20 %	20 %	20 %	376283650
95	NC_016799	GATCT	2	10	139667	139676	20 %	40 %	20 %	20 %	376283650
96	NC_016799	GAGGC	2	10	141158	141167	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016799	CTGTT	2	10	141303	141312	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016799	TGACC	2	10	141940	141949	20 %	20 %	20 %	40 %	376283655
99	NC_016799	CTGGG	2	10	141992	142001	0 %	20 %	60 %	20 %	376283655
100	NC_016799	GGCGG	2	10	143620	143629	0 %	0 %	80 %	20 %	376283656
101	NC_016799	GAGCT	2	10	144707	144716	20 %	20 %	40 %	20 %	376283657
102	NC_016799	CCACG	2	10	146603	146612	20 %	0 %	20 %	60 %	376283658
103	NC_016799	TGGGA	2	10	147708	147717	20 %	20 %	60 %	0 %	376283660
104	NC_016799	CCAGT	2	10	150266	150275	20 %	20 %	20 %	40 %	376283663
105	NC_016799	TGCCT	2	10	150494	150503	0 %	40 %	20 %	40 %	376283663
106	NC_016799	ACCAG	2	10	152557	152566	40 %	0 %	20 %	40 %	376283663
107	NC_016799	ACCTG	2	10	155707	155716	20 %	20 %	20 %	40 %	376283665
108	NC_016799	GCTGT	2	10	159395	159404	0 %	40 %	40 %	20 %	376283669
109	NC_016799	TCTGG	2	10	159467	159476	0 %	40 %	40 %	20 %	376283669
110	NC_016799	TAATT	2	10	159661	159670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016799	ATGCG	2	10	160025	160034	20 %	20 %	40 %	20 %	376283670
112	NC_016799	GTCGC	2	10	160763	160772	0 %	20 %	40 %	40 %	376283671
113	NC_016799	TTAGC	2	10	161714	161723	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016799	TGGTC	2	10	162073	162082	0 %	40 %	40 %	20 %	376283672
115	NC_016799	GTTTG	2	10	163562	163571	0 %	60 %	40 %	0 %	376283673
116	NC_016799	GTGAT	2	10	163704	163713	20 %	40 %	40 %	0 %	376283674
117	NC_016799	GTTCG	2	10	168807	168816	0 %	40 %	40 %	20 %	376283679
118	NC_016799	GCGTG	2	10	169628	169637	0 %	20 %	60 %	20 %	376283680
119	NC_016799	GATTC	2	10	173489	173498	20 %	40 %	20 %	20 %	376283682
120	NC_016799	TTTTG	2	10	177781	177790	0 %	80 %	20 %	0 %	376283684
121	NC_016799	ATTTC	2	10	178213	178222	20 %	60 %	0 %	20 %	376283684
122	NC_016799	ACGGA	2	10	180556	180565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016799	GAACA	2	10	183750	183759	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016799	CATGG	2	10	184896	184905	20 %	20 %	40 %	20 %	376283697
125	NC_016799	GGGAC	3	15	186004	186018	20 %	0 %	60 %	20 %	376283697
126	NC_016799	GTGGG	2	10	188969	188978	0 %	20 %	80 %	0 %	376283700
127	NC_016799	AACTC	2	10	190051	190060	40 %	20 %	0 %	40 %	376283701
128	NC_016799	ATGCA	2	10	190578	190587	40 %	20 %	20 %	20 %	376283701
129	NC_016799	CAAAA	2	10	191457	191466	80 %	0 %	0 %	20 %	376283702
130	NC_016799	AATGG	2	10	195043	195052	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016799	CTTTC	2	10	197530	197539	0 %	60 %	0 %	40 %	376283711
132	NC_016799	GCAGC	2	10	198976	198985	20 %	0 %	40 %	40 %	376283713
133	NC_016799	CGAAA	2	10	200004	200013	60 %	0 %	20 %	20 %	376283713
134	NC_016799	GGGTC	2	10	201545	201554	0 %	20 %	60 %	20 %	376283713
135	NC_016799	ACTGC	2	10	201955	201964	20 %	20 %	20 %	40 %	376283713
136	NC_016799	CGCAG	2	10	203979	203988	20 %	0 %	40 %	40 %	376283713
137	NC_016799	AGACG	2	10	204036	204045	40 %	0 %	40 %	20 %	376283713
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142	NC_016799	CGGAA	2	10	211672	211681	40 %	0 %	40 %	20 %	376283722
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240	NC_016799	ATGTT	2	10	345961	345970	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_016799	TCCTT	2	10	367830	367839	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
250	NC_016799	TGATG	2	10	369413	369422	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
251	NC_016799	TTGAG	2	10	371509	371518	20 %	40 %	40 %	0 %	376283872
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259	NC_016799	CGTGG	2	10	385528	385537	0 %	20 %	60 %	20 %	376283887
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261	NC_016799	CGCAG	2	10	390112	390121	20 %	0 %	40 %	40 %	376283890
262	NC_016799	CATGG	2	10	391354	391363	20 %	20 %	40 %	20 %	376283891
263	NC_016799	CCGTG	2	10	393266	393275	0 %	20 %	40 %	40 %	376283893
264	NC_016799	GCCCA	2	10	397709	397718	20 %	0 %	20 %	60 %	376283899
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