MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Corynebacterium diphtheriae 31A chromosome

Total Repeats: 38976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016799	CGT	2	6	31	36	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283504
2	NC_016799	CAC	2	6	133	138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376283504
3	NC_016799	ACT	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376283504
4	NC_016799	ACA	2	6	212	217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376283504
5	NC_016799	CGA	2	6	228	233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283504
6	NC_016799	CAC	2	6	256	261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376283504
7	NC_016799	CAG	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283504
8	NC_016799	CAA	2	6	307	312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376283504
9	NC_016799	TCG	3	9	333	341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283504
10	NC_016799	AGC	3	9	350	358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283504
11	NC_016799	GAA	2	6	376	381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283504
12	NC_016799	CGC	2	6	397	402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376283504
13	NC_016799	CAA	2	6	489	494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376283504
14	NC_016799	CGG	2	6	506	511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283504
15	NC_016799	TTC	2	6	654	659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376283504
16	NC_016799	TGA	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283504
17	NC_016799	CGA	2	6	753	758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283504
18	NC_016799	TTC	2	6	799	804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376283504
19	NC_016799	GCA	2	6	822	827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283504
20	NC_016799	CCA	2	6	862	867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376283504
21	NC_016799	CCA	2	6	937	942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376283504
22	NC_016799	CGG	2	6	983	988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283504
23	NC_016799	ATG	2	6	1147	1152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283504
24	NC_016799	CGG	2	6	1178	1183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283504
25	NC_016799	CTG	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283504
26	NC_016799	TGG	2	6	1341	1346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283504
27	NC_016799	ACG	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283504
28	NC_016799	CAG	2	6	1429	1434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283504
29	NC_016799	GCA	2	6	1440	1445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283504
30	NC_016799	ACA	2	6	1528	1533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016799	GCC	2	6	1813	1818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016799	AAG	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016799	CTC	2	6	2056	2061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016799	GAG	2	6	2094	2099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016799	GAC	2	6	2145	2150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283505
36	NC_016799	CCA	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376283505
37	NC_016799	TCA	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376283505
38	NC_016799	CCG	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376283505
39	NC_016799	CAT	2	6	2351	2356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376283505
40	NC_016799	TCG	2	6	2389	2394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283505
41	NC_016799	TTC	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376283505
42	NC_016799	CGA	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283505
43	NC_016799	TGC	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283505
44	NC_016799	TGC	2	6	2540	2545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283505
45	NC_016799	ACG	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283505
46	NC_016799	GAA	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283505
47	NC_016799	ACC	2	6	2838	2843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376283505
48	NC_016799	GCT	2	6	2882	2887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283505
49	NC_016799	CCG	2	6	2945	2950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376283505
50	NC_016799	CGA	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283505
51	NC_016799	TGG	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283505
52	NC_016799	TTG	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376283506
53	NC_016799	TTG	2	6	3450	3455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376283506
54	NC_016799	CTG	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283506
55	NC_016799	GCT	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283506
56	NC_016799	GTT	2	6	3665	3670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376283506
57	NC_016799	TGC	2	6	3804	3809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283506
58	NC_016799	TGC	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283506
59	NC_016799	CGT	2	6	3851	3856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283506
60	NC_016799	GAT	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283506
61	NC_016799	TGG	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283506
62	NC_016799	ATG	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283506
63	NC_016799	GAA	2	6	4079	4084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283506
64	NC_016799	TGG	2	6	4152	4157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283506
65	NC_016799	TGA	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283506
66	NC_016799	TGC	2	6	4272	4277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283506
67	NC_016799	ATG	2	6	4281	4286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283506
68	NC_016799	CGT	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283506
69	NC_016799	CGG	2	6	4434	4439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283506
70	NC_016799	CGC	2	6	4498	4503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376283506
71	NC_016799	ATG	2	6	4528	4533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283506
72	NC_016799	CTG	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283507
73	NC_016799	AGG	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376283507
74	NC_016799	ACG	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283507
75	NC_016799	AAC	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376283507
76	NC_016799	GTC	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283507
77	NC_016799	GGC	3	9	4702	4710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283507
78	NC_016799	GAT	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283507
79	NC_016799	TGC	2	6	4835	4840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283507
80	NC_016799	ATG	2	6	4920	4925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283507
81	NC_016799	TAT	2	6	4931	4936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376283507
82	NC_016799	ATC	2	6	4971	4976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376283507
83	NC_016799	GGC	2	6	5014	5019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283507
84	NC_016799	CAC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376283508
85	NC_016799	CGA	2	6	5333	5338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283508
86	NC_016799	CGG	2	6	5387	5392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283508
87	NC_016799	TGG	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283508
88	NC_016799	CGT	2	6	5549	5554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283508
89	NC_016799	ACC	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376283508
90	NC_016799	ACC	2	6	5718	5723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376283508
91	NC_016799	CTT	2	6	5765	5770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376283508
92	NC_016799	GAA	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283508
93	NC_016799	CTG	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283508
94	NC_016799	GAA	3	9	5939	5947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283508
95	NC_016799	TCT	2	6	5953	5958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376283508
96	NC_016799	ATC	2	6	6024	6029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376283508
97	NC_016799	AAC	2	6	6081	6086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376283508
98	NC_016799	TGA	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283508
99	NC_016799	GCT	2	6	6209	6214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283508
100	NC_016799	GAC	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283508
101	NC_016799	CCG	2	6	6265	6270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376283508
102	NC_016799	ATC	2	6	6417	6422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376283508
103	NC_016799	GGC	2	6	6455	6460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283508
104	NC_016799	CGT	2	6	6483	6488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283508
105	NC_016799	CGG	2	6	6506	6511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283508
106	NC_016799	GGT	2	6	6591	6596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283508
107	NC_016799	TTC	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376283508
108	NC_016799	ATC	2	6	6714	6719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376283508
109	NC_016799	ATG	2	6	6742	6747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283508
110	NC_016799	AAG	2	6	6759	6764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283508
111	NC_016799	TGC	2	6	6829	6834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283508
112	NC_016799	GAA	2	6	6870	6875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283508
113	NC_016799	CAA	2	6	7004	7009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376283508
114	NC_016799	GAC	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283508
115	NC_016799	CGA	2	6	7133	7138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283508
116	NC_016799	TCT	2	6	7141	7146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376283508
117	NC_016799	GAC	2	6	7161	7166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283508
118	NC_016799	TTA	2	6	7186	7191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376283508
119	NC_016799	CCG	2	6	7193	7198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376283508
120	NC_016799	TGC	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283509
121	NC_016799	TGC	2	6	7454	7459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283509
122	NC_016799	AAG	2	6	7500	7505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283509
123	NC_016799	GGC	2	6	7588	7593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283509
124	NC_016799	GCT	2	6	7673	7678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283509
125	NC_016799	TTC	2	6	7890	7895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016799	GTG	2	6	7943	7948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016799	ACA	2	6	7958	7963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016799	GGT	2	6	8135	8140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283510
129	NC_016799	CGG	2	6	8143	8148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283510
130	NC_016799	CTT	2	6	8324	8329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376283511
131	NC_016799	GCT	2	6	8347	8352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283511
132	NC_016799	GCG	2	6	8353	8358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283511
133	NC_016799	TGG	2	6	8369	8374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283511
134	NC_016799	TGC	2	6	8387	8392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283511
135	NC_016799	GAG	2	6	8409	8414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376283511
136	NC_016799	CTG	2	6	8435	8440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283511
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138	NC_016799	TCT	2	6	8584	8589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376283512
139	NC_016799	GGT	2	6	8591	8596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283512
140	NC_016799	GAG	2	6	8633	8638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376283512
141	NC_016799	TCG	2	6	8676	8681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283512
142	NC_016799	CCG	2	6	8725	8730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376283512
143	NC_016799	ACG	2	6	8931	8936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283512
144	NC_016799	ACG	2	6	9036	9041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283512
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149	NC_016799	GCT	2	6	9178	9183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283512
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152	NC_016799	ACC	2	6	9302	9307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376283512
153	NC_016799	GAA	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283512
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157	NC_016799	GTG	2	6	9542	9547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283512
158	NC_016799	CAA	2	6	9550	9555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376283512
159	NC_016799	TGC	2	6	9648	9653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283512
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163	NC_016799	TCG	2	6	9918	9923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283512
164	NC_016799	TCG	2	6	10023	10028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283512
165	NC_016799	CGA	2	6	10039	10044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283512
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172	NC_016799	TTC	2	6	10271	10276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376283512
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174	NC_016799	GAA	2	6	10462	10467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283512
175	NC_016799	CGG	2	6	10501	10506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283512
176	NC_016799	GCA	2	6	10550	10555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283512
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180	NC_016799	ACG	2	6	10623	10628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283512
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186	NC_016799	CGC	2	6	10855	10860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376283512
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200	NC_016799	CAT	2	6	11385	11390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376283513
201	NC_016799	CGG	2	6	11448	11453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283513
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203	NC_016799	GCA	2	6	11534	11539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
204	NC_016799	TAT	2	6	11555	11560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_016799	CCT	2	6	11811	11816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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234	NC_016799	CGA	2	6	13837	13842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283515
235	NC_016799	CGG	2	6	13882	13887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283515
236	NC_016799	GAG	2	6	14036	14041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376283515
237	NC_016799	TCC	2	6	14042	14047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376283515
238	NC_016799	TGC	2	6	14204	14209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283515
239	NC_016799	TAG	2	6	14225	14230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283515
240	NC_016799	GAT	2	6	14270	14275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283515
241	NC_016799	TGA	2	6	14347	14352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376283515
242	NC_016799	CGA	2	6	14365	14370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283515
243	NC_016799	GTG	2	6	14382	14387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283515
244	NC_016799	TGA	2	6	14590	14595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
245	NC_016799	AAT	2	6	14627	14632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_016799	AGC	3	9	14909	14917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_016799	TGC	2	6	14930	14935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_016799	TGC	2	6	14960	14965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283516
249	NC_016799	CAG	2	6	14995	15000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283516
250	NC_016799	AGA	2	6	15020	15025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376283516
251	NC_016799	GTT	2	6	15601	15606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376283517
252	NC_016799	ATT	2	6	15643	15648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376283517
253	NC_016799	ATT	2	6	15661	15666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376283517
254	NC_016799	CGG	2	6	15750	15755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376283517
255	NC_016799	GAG	2	6	15766	15771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376283517
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257	NC_016799	CGT	2	6	15781	15786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376283517
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382	NC_016799	TGG	2	6	23588	23593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376283525
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496	NC_016799	ACT	2	6	30239	30244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376283533
497	NC_016799	TAA	2	6	30274	30279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376283533
498	NC_016799	CAA	2	6	30312	30317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376283533
499	NC_016799	TGT	3	9	30323	30331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376283533
500	NC_016799	GCA	2	6	30336	30341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376283533

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