MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A2497

Total Repeats: 764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016798	TGTGA	2	10	3875	3884	20 %	40 %	40 %	0 %	376282012
2	NC_016798	TTGAA	2	10	4231	4240	40 %	40 %	20 %	0 %	376282013
3	NC_016798	GAGAA	2	10	4525	4534	60 %	0 %	40 %	0 %	376282013
4	NC_016798	GAAAA	2	10	4962	4971	80 %	0 %	20 %	0 %	376282013
5	NC_016798	TTACA	2	10	5117	5126	40 %	40 %	0 %	20 %	376282013
6	NC_016798	GTCTT	2	10	5813	5822	0 %	60 %	20 %	20 %	376282014
7	NC_016798	TATTT	2	10	7628	7637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016798	TGGTA	2	10	8286	8295	20 %	40 %	40 %	0 %	376282016
9	NC_016798	CGAAA	2	10	9694	9703	60 %	0 %	20 %	20 %	376282017
10	NC_016798	GGCTG	2	10	10327	10336	0 %	20 %	60 %	20 %	376282018
11	NC_016798	CCTCT	2	10	11119	11128	0 %	40 %	0 %	60 %	376282019
12	NC_016798	AAAGG	2	10	11278	11287	60 %	0 %	40 %	0 %	376282019
13	NC_016798	AAGAA	2	10	12397	12406	80 %	0 %	20 %	0 %	376282020
14	NC_016798	AAAGA	2	10	13795	13804	80 %	0 %	20 %	0 %	376282021
15	NC_016798	GGTGT	2	10	13899	13908	0 %	40 %	60 %	0 %	376282021
16	NC_016798	GATTT	2	10	15642	15651	20 %	60 %	20 %	0 %	376282023
17	NC_016798	CGTTC	2	10	16753	16762	0 %	40 %	20 %	40 %	376282024
18	NC_016798	GCTTC	2	10	17126	17135	0 %	40 %	20 %	40 %	376282024
19	NC_016798	GAAGG	2	10	17497	17506	40 %	0 %	60 %	0 %	376282024
20	NC_016798	GTTGT	2	10	20923	20932	0 %	60 %	40 %	0 %	376282027
21	NC_016798	AAGAT	2	10	22035	22044	60 %	20 %	20 %	0 %	376282028
22	NC_016798	TTTGC	2	10	22646	22655	0 %	60 %	20 %	20 %	376282028
23	NC_016798	GGAAA	2	10	24400	24409	60 %	0 %	40 %	0 %	376282028
24	NC_016798	AGAGG	2	10	26125	26134	40 %	0 %	60 %	0 %	376282029
25	NC_016798	GGAGA	2	10	27904	27913	40 %	0 %	60 %	0 %	376282030
26	NC_016798	GGATA	2	10	27930	27939	40 %	20 %	40 %	0 %	376282030
27	NC_016798	ATCCG	2	10	28655	28664	20 %	20 %	20 %	40 %	376282032
28	NC_016798	AGGGT	2	10	29173	29182	20 %	20 %	60 %	0 %	376282032
29	NC_016798	CCTAT	2	10	30213	30222	20 %	40 %	0 %	40 %	376282033
30	NC_016798	GAAGG	2	10	31012	31021	40 %	0 %	60 %	0 %	376282034
31	NC_016798	GAGCT	2	10	32052	32061	20 %	20 %	40 %	20 %	376282035
32	NC_016798	AAAGA	2	10	33685	33694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016798	CTATT	2	10	36725	36734	20 %	60 %	0 %	20 %	376282041
34	NC_016798	TCCTA	2	10	36772	36781	20 %	40 %	0 %	40 %	376282041
35	NC_016798	ACGAT	2	10	38688	38697	40 %	20 %	20 %	20 %	376282042
36	NC_016798	TTTGA	2	10	39053	39062	20 %	60 %	20 %	0 %	376282042
37	NC_016798	AGCAA	2	10	42704	42713	60 %	0 %	20 %	20 %	376282045
38	NC_016798	CGATG	2	10	42761	42770	20 %	20 %	40 %	20 %	376282045
39	NC_016798	CAAAA	2	10	43237	43246	80 %	0 %	0 %	20 %	376282046
40	NC_016798	TTTAT	2	10	44834	44843	20 %	80 %	0 %	0 %	376282050
41	NC_016798	CTTTC	2	10	46930	46939	0 %	60 %	0 %	40 %	376282052
42	NC_016798	AGTTT	2	10	47469	47478	20 %	60 %	20 %	0 %	376282052
43	NC_016798	GAAGA	2	10	48602	48611	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016798	CTATT	2	10	50181	50190	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016798	CTTTT	2	10	50632	50641	0 %	80 %	0 %	20 %	376282055
46	NC_016798	CCGTA	2	10	54297	54306	20 %	20 %	20 %	40 %	376282058
47	NC_016798	AATTT	2	10	54537	54546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016798	TTATC	2	10	55700	55709	20 %	60 %	0 %	20 %	376282059
49	NC_016798	TGAGT	2	10	55721	55730	20 %	40 %	40 %	0 %	376282059
50	NC_016798	GTTGT	2	10	56756	56765	0 %	60 %	40 %	0 %	376282060
51	NC_016798	GAGCA	2	10	60284	60293	40 %	0 %	40 %	20 %	376282062
52	NC_016798	TGTGA	2	10	62733	62742	20 %	40 %	40 %	0 %	376282064
53	NC_016798	AGTGA	2	10	64254	64263	40 %	20 %	40 %	0 %	376282065
54	NC_016798	CCTTC	2	10	64528	64537	0 %	40 %	0 %	60 %	376282065
55	NC_016798	AGGAG	2	10	66756	66765	40 %	0 %	60 %	0 %	376282067
56	NC_016798	GTTAA	2	10	66886	66895	40 %	40 %	20 %	0 %	376282067
57	NC_016798	CAAGC	2	10	69264	69273	40 %	0 %	20 %	40 %	376282068
58	NC_016798	AAAAG	2	10	69512	69521	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016798	GGAGC	2	10	70134	70143	20 %	0 %	60 %	20 %	376282069
60	NC_016798	GCGAT	2	10	70324	70333	20 %	20 %	40 %	20 %	376282069
61	NC_016798	CTCTT	2	10	70678	70687	0 %	60 %	0 %	40 %	376282069
62	NC_016798	AGGGG	2	10	71324	71333	20 %	0 %	80 %	0 %	376282069
63	NC_016798	AAGAA	2	10	71366	71375	80 %	0 %	20 %	0 %	376282069
64	NC_016798	CTTGC	2	10	72455	72464	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016798	ATTGG	2	10	72656	72665	20 %	40 %	40 %	0 %	376282071
66	NC_016798	GAAAA	2	10	73728	73737	80 %	0 %	20 %	0 %	376282071
67	NC_016798	TATTT	2	10	76672	76681	20 %	80 %	0 %	0 %	376282073
68	NC_016798	AAAAG	2	10	77205	77214	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016798	ATCAA	2	10	78897	78906	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016798	CTTTC	2	10	80086	80095	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_016798	TGTCT	2	10	80459	80468	0 %	60 %	20 %	20 %	376282076
72	NC_016798	TTACT	2	10	80966	80975	20 %	60 %	0 %	20 %	376282076
73	NC_016798	AGAAA	2	10	82356	82365	80 %	0 %	20 %	0 %	376282078
74	NC_016798	GGAAG	2	10	82869	82878	40 %	0 %	60 %	0 %	376282078
75	NC_016798	TTTGT	2	10	85634	85643	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016798	GATCC	2	10	86420	86429	20 %	20 %	20 %	40 %	376282081
77	NC_016798	AGAGC	2	10	87755	87764	40 %	0 %	40 %	20 %	376282082
78	NC_016798	AATAA	2	10	88633	88642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016798	TTTTC	2	10	91487	91496	0 %	80 %	0 %	20 %	376282085
80	NC_016798	GGATG	2	10	91747	91756	20 %	20 %	60 %	0 %	376282086
81	NC_016798	CAACA	2	10	93286	93295	60 %	0 %	0 %	40 %	376282087
82	NC_016798	TTTAA	2	10	94169	94178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016798	ACAGC	2	10	94330	94339	40 %	0 %	20 %	40 %	376282089
84	NC_016798	CTTTT	2	10	94704	94713	0 %	80 %	0 %	20 %	376282090
85	NC_016798	GGAAC	2	10	95042	95051	40 %	0 %	40 %	20 %	376282091
86	NC_016798	GGATT	2	10	95942	95951	20 %	40 %	40 %	0 %	376282091
87	NC_016798	CAATC	2	10	97044	97053	40 %	20 %	0 %	40 %	376282093
88	NC_016798	TTTGC	2	10	97178	97187	0 %	60 %	20 %	20 %	376282093
89	NC_016798	ATTCA	2	10	97442	97451	40 %	40 %	0 %	20 %	376282093
90	NC_016798	GATCC	2	10	97701	97710	20 %	20 %	20 %	40 %	376282093
91	NC_016798	GTTTT	2	10	98122	98131	0 %	80 %	20 %	0 %	376282093
92	NC_016798	ACAAA	2	10	98249	98258	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016798	AAGCT	2	10	99325	99334	40 %	20 %	20 %	20 %	376282094
94	NC_016798	AGGGG	2	10	99684	99693	20 %	0 %	80 %	0 %	376282094
95	NC_016798	ATAGC	2	10	100382	100391	40 %	20 %	20 %	20 %	376282095
96	NC_016798	TTCCC	2	10	100986	100995	0 %	40 %	0 %	60 %	376282096
97	NC_016798	AGCGA	2	10	103310	103319	40 %	0 %	40 %	20 %	376282098
98	NC_016798	TTTCT	2	10	103668	103677	0 %	80 %	0 %	20 %	376282098
99	NC_016798	CTTCT	2	10	103722	103731	0 %	60 %	0 %	40 %	376282098
100	NC_016798	ACAGG	2	10	104071	104080	40 %	0 %	40 %	20 %	376282099
101	NC_016798	ATCAT	2	10	104874	104883	40 %	40 %	0 %	20 %	376282099
102	NC_016798	GGCAT	2	10	105582	105591	20 %	20 %	40 %	20 %	376282099
103	NC_016798	AAAGC	2	10	109308	109317	60 %	0 %	20 %	20 %	376282102
104	NC_016798	GCATT	2	10	110468	110477	20 %	40 %	20 %	20 %	376282104
105	NC_016798	GCTCT	2	10	114521	114530	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016798	TGTTT	2	10	115145	115154	0 %	80 %	20 %	0 %	376282107
107	NC_016798	CATGT	2	10	115523	115532	20 %	40 %	20 %	20 %	376282107
108	NC_016798	TATCG	2	10	116227	116236	20 %	40 %	20 %	20 %	376282107
109	NC_016798	TTTCT	2	10	116743	116752	0 %	80 %	0 %	20 %	376282108
110	NC_016798	AAAGA	2	10	118989	118998	80 %	0 %	20 %	0 %	376282111
111	NC_016798	GCTTC	2	10	122979	122988	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016798	TACAA	2	10	126768	126777	60 %	20 %	0 %	20 %	376282117
113	NC_016798	ATCCA	2	10	129173	129182	40 %	20 %	0 %	40 %	376282120
114	NC_016798	GAAGA	2	10	130723	130732	60 %	0 %	40 %	0 %	376282120
115	NC_016798	AAAAG	2	10	132636	132645	80 %	0 %	20 %	0 %	376282121
116	NC_016798	GATTC	2	10	132967	132976	20 %	40 %	20 %	20 %	376282121
117	NC_016798	GGATA	2	10	135573	135582	40 %	20 %	40 %	0 %	376282123
118	NC_016798	ATTGG	2	10	136238	136247	20 %	40 %	40 %	0 %	376282124
119	NC_016798	ATTGT	2	10	136271	136280	20 %	60 %	20 %	0 %	376282124
120	NC_016798	TGTTT	2	10	136697	136706	0 %	80 %	20 %	0 %	376282125
121	NC_016798	TTGCA	2	10	137487	137496	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016798	TCCAG	2	10	140441	140450	20 %	20 %	20 %	40 %	376282130
123	NC_016798	GTACA	2	10	141172	141181	40 %	20 %	20 %	20 %	376282131
124	NC_016798	TAGAT	2	10	141545	141554	40 %	40 %	20 %	0 %	376282131
125	NC_016798	AAAAG	2	10	141957	141966	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016798	AAAAC	2	10	142437	142446	80 %	0 %	0 %	20 %	376282132
127	NC_016798	TGCTA	2	10	143523	143532	20 %	40 %	20 %	20 %	376282134
128	NC_016798	GGAGC	2	10	143570	143579	20 %	0 %	60 %	20 %	376282134
129	NC_016798	CTGGG	2	10	144984	144993	0 %	20 %	60 %	20 %	376282136
130	NC_016798	GTTTT	2	10	145731	145740	0 %	80 %	20 %	0 %	376282137
131	NC_016798	GAACC	2	10	149465	149474	40 %	0 %	20 %	40 %	376282138
132	NC_016798	ATTCT	2	10	152962	152971	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016798	CTGTG	2	10	153166	153175	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016798	TCCGG	2	10	153533	153542	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016798	TTCTT	2	10	155644	155653	0 %	80 %	0 %	20 %	376282144
136	NC_016798	TTCTA	2	10	157749	157758	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016798	AGGAA	2	10	160204	160213	60 %	0 %	40 %	0 %	376282148
138	NC_016798	CAAAA	2	10	162207	162216	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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