MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A2497

Total Repeats: 2886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016798	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	376282009
2	NC_016798	GTTC	2	8	109	116	0 %	50 %	25 %	25 %	376282009
3	NC_016798	GCGT	2	8	294	301	0 %	25 %	50 %	25 %	376282009
4	NC_016798	AGTG	2	8	541	548	25 %	25 %	50 %	0 %	376282009
5	NC_016798	TGGC	2	8	575	582	0 %	25 %	50 %	25 %	376282009
6	NC_016798	AATG	2	8	1060	1067	50 %	25 %	25 %	0 %	376282009
7	NC_016798	CTAT	2	8	1394	1401	25 %	50 %	0 %	25 %	376282009
8	NC_016798	AAGG	2	8	1903	1910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016798	AGTA	2	8	2083	2090	50 %	25 %	25 %	0 %	376282010
10	NC_016798	ATGA	2	8	2487	2494	50 %	25 %	25 %	0 %	376282011
11	NC_016798	GATA	2	8	2525	2532	50 %	25 %	25 %	0 %	376282011
12	NC_016798	TTTC	2	8	2822	2829	0 %	75 %	0 %	25 %	376282012
13	NC_016798	CATG	2	8	3703	3710	25 %	25 %	25 %	25 %	376282012
14	NC_016798	TTCC	2	8	4008	4015	0 %	50 %	0 %	50 %	376282012
15	NC_016798	TTTA	2	8	4406	4413	25 %	75 %	0 %	0 %	376282013
16	NC_016798	ATCC	2	8	4706	4713	25 %	25 %	0 %	50 %	376282013
17	NC_016798	GACG	2	8	5453	5460	25 %	0 %	50 %	25 %	376282013
18	NC_016798	TTGG	2	8	5556	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	376282013
19	NC_016798	TGGA	2	8	5917	5924	25 %	25 %	50 %	0 %	376282014
20	NC_016798	CTTT	2	8	6294	6301	0 %	75 %	0 %	25 %	376282014
21	NC_016798	GGGA	2	8	6809	6816	25 %	0 %	75 %	0 %	376282014
22	NC_016798	GGAG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016798	GGTG	2	8	7112	7119	0 %	25 %	75 %	0 %	376282015
24	NC_016798	AAAT	2	8	7178	7185	75 %	25 %	0 %	0 %	376282015
25	NC_016798	TATG	2	8	7549	7556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016798	ATTT	2	8	7690	7697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016798	TTTG	2	8	7782	7789	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016798	AAGC	2	8	8416	8423	50 %	0 %	25 %	25 %	376282016
29	NC_016798	ATTG	2	8	8814	8821	25 %	50 %	25 %	0 %	376282017
30	NC_016798	AGCG	2	8	9281	9288	25 %	0 %	50 %	25 %	376282017
31	NC_016798	AAAG	2	8	9302	9309	75 %	0 %	25 %	0 %	376282017
32	NC_016798	CTTT	2	8	9642	9649	0 %	75 %	0 %	25 %	376282017
33	NC_016798	TATT	2	8	9904	9911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016798	TTCG	2	8	10013	10020	0 %	50 %	25 %	25 %	376282018
35	NC_016798	AATT	2	8	10118	10125	50 %	50 %	0 %	0 %	376282018
36	NC_016798	ATGG	2	8	10177	10184	25 %	25 %	50 %	0 %	376282018
37	NC_016798	CTTT	2	8	10802	10809	0 %	75 %	0 %	25 %	376282019
38	NC_016798	GCAA	2	8	11019	11026	50 %	0 %	25 %	25 %	376282019
39	NC_016798	AGCC	2	8	11249	11256	25 %	0 %	25 %	50 %	376282019
40	NC_016798	GAAA	2	8	11392	11399	75 %	0 %	25 %	0 %	376282019
41	NC_016798	AGAA	2	8	11796	11803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016798	AATG	2	8	12134	12141	50 %	25 %	25 %	0 %	376282020
43	NC_016798	GTTT	2	8	13166	13173	0 %	75 %	25 %	0 %	376282021
44	NC_016798	ATGC	2	8	13596	13603	25 %	25 %	25 %	25 %	376282021
45	NC_016798	AAGG	2	8	14031	14038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016798	TTGT	2	8	14632	14639	0 %	75 %	25 %	0 %	376282022
47	NC_016798	TTCT	2	8	14803	14810	0 %	75 %	0 %	25 %	376282022
48	NC_016798	ATTT	2	8	15009	15016	25 %	75 %	0 %	0 %	376282022
49	NC_016798	TTTC	2	8	15671	15678	0 %	75 %	0 %	25 %	376282023
50	NC_016798	AAAT	2	8	16153	16160	75 %	25 %	0 %	0 %	376282023
51	NC_016798	CAAA	2	8	16665	16672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016798	GTAA	2	8	16995	17002	50 %	25 %	25 %	0 %	376282024
53	NC_016798	CTAA	2	8	17188	17195	50 %	25 %	0 %	25 %	376282024
54	NC_016798	AGAA	2	8	17451	17458	75 %	0 %	25 %	0 %	376282024
55	NC_016798	ATTT	2	8	17597	17604	25 %	75 %	0 %	0 %	376282024
56	NC_016798	TGCG	2	8	19119	19126	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016798	GAAG	2	8	20103	20110	50 %	0 %	50 %	0 %	376282026
58	NC_016798	TTTG	2	8	20129	20136	0 %	75 %	25 %	0 %	376282026
59	NC_016798	TGTA	2	8	20821	20828	25 %	50 %	25 %	0 %	376282027
60	NC_016798	CGCT	2	8	21861	21868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016798	TTAA	2	8	21882	21889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016798	GTTA	2	8	21919	21926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016798	GATC	2	8	21974	21981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016798	GATG	2	8	22237	22244	25 %	25 %	50 %	0 %	376282028
65	NC_016798	TTCT	2	8	22935	22942	0 %	75 %	0 %	25 %	376282028
66	NC_016798	CATT	2	8	23296	23303	25 %	50 %	0 %	25 %	376282028
67	NC_016798	GCTT	2	8	23639	23646	0 %	50 %	25 %	25 %	376282028
68	NC_016798	GGTT	2	8	23687	23694	0 %	50 %	50 %	0 %	376282028
69	NC_016798	TTCT	2	8	24057	24064	0 %	75 %	0 %	25 %	376282028
70	NC_016798	TAAC	2	8	24159	24166	50 %	25 %	0 %	25 %	376282028
71	NC_016798	CATT	2	8	24282	24289	25 %	50 %	0 %	25 %	376282028
72	NC_016798	GGTA	2	8	24652	24659	25 %	25 %	50 %	0 %	376282028
73	NC_016798	TTCG	2	8	25792	25799	0 %	50 %	25 %	25 %	376282029
74	NC_016798	TAGG	2	8	25871	25878	25 %	25 %	50 %	0 %	376282029
75	NC_016798	TTCC	2	8	25995	26002	0 %	50 %	0 %	50 %	376282029
76	NC_016798	TAGG	2	8	26109	26116	25 %	25 %	50 %	0 %	376282029
77	NC_016798	GCTT	2	8	26881	26888	0 %	50 %	25 %	25 %	376282029
78	NC_016798	GGAA	2	8	27464	27471	50 %	0 %	50 %	0 %	376282030
79	NC_016798	TTAA	2	8	27537	27544	50 %	50 %	0 %	0 %	376282030
80	NC_016798	AAAG	2	8	27587	27594	75 %	0 %	25 %	0 %	376282030
81	NC_016798	GGGC	2	8	27867	27874	0 %	0 %	75 %	25 %	376282030
82	NC_016798	CAGA	2	8	28172	28179	50 %	0 %	25 %	25 %	376282031
83	NC_016798	ATTG	2	8	28531	28538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016798	CTTT	2	8	30144	30151	0 %	75 %	0 %	25 %	376282033
85	NC_016798	TTTG	2	8	30159	30166	0 %	75 %	25 %	0 %	376282033
86	NC_016798	TTGT	2	8	30194	30201	0 %	75 %	25 %	0 %	376282033
87	NC_016798	TGGC	2	8	30357	30364	0 %	25 %	50 %	25 %	376282033
88	NC_016798	AAAG	2	8	30917	30924	75 %	0 %	25 %	0 %	376282034
89	NC_016798	AAAC	2	8	30987	30994	75 %	0 %	0 %	25 %	376282034
90	NC_016798	GATG	2	8	31130	31137	25 %	25 %	50 %	0 %	376282034
91	NC_016798	GATA	2	8	32239	32246	50 %	25 %	25 %	0 %	376282036
92	NC_016798	TGAT	2	8	34733	34740	25 %	50 %	25 %	0 %	376282039
93	NC_016798	AAGA	3	12	34861	34872	75 %	0 %	25 %	0 %	376282039
94	NC_016798	AAGC	2	8	35081	35088	50 %	0 %	25 %	25 %	376282040
95	NC_016798	GTTC	2	8	35114	35121	0 %	50 %	25 %	25 %	376282040
96	NC_016798	GGCA	2	8	35493	35500	25 %	0 %	50 %	25 %	376282041
97	NC_016798	TCGA	2	8	35750	35757	25 %	25 %	25 %	25 %	376282041
98	NC_016798	TGCT	2	8	35903	35910	0 %	50 %	25 %	25 %	376282041
99	NC_016798	TATG	2	8	36046	36053	25 %	50 %	25 %	0 %	376282041
100	NC_016798	TTGG	2	8	36135	36142	0 %	50 %	50 %	0 %	376282041
101	NC_016798	AGAT	2	8	36855	36862	50 %	25 %	25 %	0 %	376282041
102	NC_016798	CTTT	2	8	37228	37235	0 %	75 %	0 %	25 %	376282042
103	NC_016798	ATGA	2	8	37718	37725	50 %	25 %	25 %	0 %	376282042
104	NC_016798	TAGG	2	8	37877	37884	25 %	25 %	50 %	0 %	376282042
105	NC_016798	CAAT	2	8	38061	38068	50 %	25 %	0 %	25 %	376282042
106	NC_016798	AATG	2	8	38848	38855	50 %	25 %	25 %	0 %	376282042
107	NC_016798	AGAA	2	8	39685	39692	75 %	0 %	25 %	0 %	376282043
108	NC_016798	AAGA	2	8	39737	39744	75 %	0 %	25 %	0 %	376282043
109	NC_016798	ATCC	2	8	39745	39752	25 %	25 %	0 %	50 %	376282043
110	NC_016798	TAAT	2	8	39956	39963	50 %	50 %	0 %	0 %	376282043
111	NC_016798	GTGC	2	8	42045	42052	0 %	25 %	50 %	25 %	376282045
112	NC_016798	AGAA	2	8	42464	42471	75 %	0 %	25 %	0 %	376282045
113	NC_016798	GGAT	2	8	42616	42623	25 %	25 %	50 %	0 %	376282045
114	NC_016798	AAAC	2	8	43824	43831	75 %	0 %	0 %	25 %	376282048
115	NC_016798	CAAT	2	8	44028	44035	50 %	25 %	0 %	25 %	376282048
116	NC_016798	TGTT	2	8	44408	44415	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016798	AATA	2	8	44647	44654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016798	ATTT	2	8	44785	44792	25 %	75 %	0 %	0 %	376282050
119	NC_016798	GCTC	2	8	45093	45100	0 %	25 %	25 %	50 %	376282050
120	NC_016798	TTCT	2	8	45235	45242	0 %	75 %	0 %	25 %	376282050
121	NC_016798	TTGA	2	8	45835	45842	25 %	50 %	25 %	0 %	376282051
122	NC_016798	TGTT	2	8	46007	46014	0 %	75 %	25 %	0 %	376282051
123	NC_016798	CTAT	2	8	46037	46044	25 %	50 %	0 %	25 %	376282051
124	NC_016798	TGTT	2	8	46066	46073	0 %	75 %	25 %	0 %	376282051
125	NC_016798	CTAT	2	8	46362	46369	25 %	50 %	0 %	25 %	376282051
126	NC_016798	AAGA	2	8	46857	46864	75 %	0 %	25 %	0 %	376282052
127	NC_016798	AAGA	2	8	46914	46921	75 %	0 %	25 %	0 %	376282052
128	NC_016798	AAAG	2	8	46954	46961	75 %	0 %	25 %	0 %	376282052
129	NC_016798	AAGA	2	8	47069	47076	75 %	0 %	25 %	0 %	376282052
130	NC_016798	ACTT	2	8	47330	47337	25 %	50 %	0 %	25 %	376282052
131	NC_016798	ATGG	2	8	47956	47963	25 %	25 %	50 %	0 %	376282052
132	NC_016798	AGGA	2	8	47987	47994	50 %	0 %	50 %	0 %	376282052
133	NC_016798	GAAC	2	8	48534	48541	50 %	0 %	25 %	25 %	376282052
134	NC_016798	AAGT	2	8	48569	48576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016798	AACA	2	8	48778	48785	75 %	0 %	0 %	25 %	376282053
136	NC_016798	CTTT	2	8	48974	48981	0 %	75 %	0 %	25 %	376282053
137	NC_016798	CTTT	2	8	49859	49866	0 %	75 %	0 %	25 %	376282054
138	NC_016798	GTAG	2	8	49877	49884	25 %	25 %	50 %	0 %	376282054
139	NC_016798	GAAG	2	8	51305	51312	50 %	0 %	50 %	0 %	376282055
140	NC_016798	TTCA	2	8	51727	51734	25 %	50 %	0 %	25 %	376282055
141	NC_016798	TATT	2	8	52661	52668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_016798	TTAA	2	8	53633	53640	50 %	50 %	0 %	0 %	376282057
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