MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A2497

Total Repeats: 12717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016798	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282009
2	NC_016798	GAA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282009
3	NC_016798	GTA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
4	NC_016798	AGT	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
5	NC_016798	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282009
6	NC_016798	CAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282009
7	NC_016798	AGT	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
8	NC_016798	GTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282009
9	NC_016798	CAG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282009
10	NC_016798	GCC	2	6	598	603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376282009
11	NC_016798	TGC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282009
12	NC_016798	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282009
13	NC_016798	CGA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282009
14	NC_016798	TAT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282009
15	NC_016798	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282009
16	NC_016798	AGA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282009
17	NC_016798	AGA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282009
18	NC_016798	CAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282009
19	NC_016798	TTG	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282009
20	NC_016798	CTC	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376282009
21	NC_016798	GAT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
22	NC_016798	GAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
23	NC_016798	ATG	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
24	NC_016798	CCT	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376282009
25	NC_016798	CTT	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282009
26	NC_016798	CAG	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282009
27	NC_016798	TGA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
28	NC_016798	ATG	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282010
29	NC_016798	GTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282010
30	NC_016798	TCC	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376282010
31	NC_016798	AGC	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282010
32	NC_016798	AGC	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282010
33	NC_016798	AAG	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282010
34	NC_016798	TAC	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282010
35	NC_016798	GCT	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282010
36	NC_016798	AAC	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282010
37	NC_016798	AGA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282010
38	NC_016798	AGA	2	6	2411	2416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282011
39	NC_016798	ATC	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282011
40	NC_016798	TGC	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282011
41	NC_016798	CAT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282011
42	NC_016798	AGA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282011
43	NC_016798	AAG	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282011
44	NC_016798	GGA	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282011
45	NC_016798	ATC	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282012
46	NC_016798	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282012
47	NC_016798	AAC	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282012
48	NC_016798	GGT	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282012
49	NC_016798	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282012
50	NC_016798	TTC	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282012
51	NC_016798	GCA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282012
52	NC_016798	GGA	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282012
53	NC_016798	CAG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282012
54	NC_016798	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282012
55	NC_016798	GGT	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282012
56	NC_016798	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282012
57	NC_016798	ATT	2	6	3569	3574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282012
58	NC_016798	TTG	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282012
59	NC_016798	AAG	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282012
60	NC_016798	AAG	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282012
61	NC_016798	CAG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282012
62	NC_016798	GCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282012
63	NC_016798	AAG	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282012
64	NC_016798	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282012
65	NC_016798	GGA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282012
66	NC_016798	AAT	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282012
67	NC_016798	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282013
68	NC_016798	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282013
69	NC_016798	GTA	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282013
70	NC_016798	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282013
71	NC_016798	GAA	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282013
72	NC_016798	CGT	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282013
73	NC_016798	GTT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282013
74	NC_016798	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282013
75	NC_016798	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282013
76	NC_016798	TTC	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282013
77	NC_016798	TCT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282013
78	NC_016798	AGA	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282013
79	NC_016798	GTT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282013
80	NC_016798	GGT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282013
81	NC_016798	CTC	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376282013
82	NC_016798	AGC	2	6	5624	5629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282013
83	NC_016798	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282014
84	NC_016798	TCT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282014
85	NC_016798	GCT	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282014
86	NC_016798	GAT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282014
87	NC_016798	ACG	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282014
88	NC_016798	GAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282014
89	NC_016798	AGA	3	9	5981	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282014
90	NC_016798	GCT	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282014
91	NC_016798	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282014
92	NC_016798	TGG	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282014
93	NC_016798	AGA	3	9	6053	6061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282014
94	NC_016798	GGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282014
95	NC_016798	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282014
96	NC_016798	GGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282014
97	NC_016798	CTT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282014
98	NC_016798	CTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282014
99	NC_016798	CAG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282014
100	NC_016798	AGG	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282015
101	NC_016798	GAA	2	6	7078	7083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282015
102	NC_016798	GCA	2	6	7342	7347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282015
103	NC_016798	AAG	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282015
104	NC_016798	TGC	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282015
105	NC_016798	TCC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376282016
106	NC_016798	GTT	2	6	8061	8066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282016
107	NC_016798	TTA	2	6	8431	8436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282016
108	NC_016798	TTC	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282016
109	NC_016798	GAA	2	6	8898	8903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282017
110	NC_016798	ACC	2	6	9026	9031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376282017
111	NC_016798	CTT	2	6	9079	9084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282017
112	NC_016798	GAG	2	6	9159	9164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282017
113	NC_016798	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282017
114	NC_016798	AGG	2	6	9200	9205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282017
115	NC_016798	GAA	2	6	9380	9385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282017
116	NC_016798	CAG	2	6	9396	9401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282017
117	NC_016798	TGT	2	6	9467	9472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282017
118	NC_016798	GAG	2	6	9482	9487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282017
119	NC_016798	TAC	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282017
120	NC_016798	GTT	2	6	9654	9659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282017
121	NC_016798	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282017
122	NC_016798	GAG	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282017
123	NC_016798	TTA	2	6	9991	9996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282018
124	NC_016798	AGA	2	6	10026	10031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282018
125	NC_016798	TGC	2	6	10256	10261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282018
126	NC_016798	GAA	2	6	10283	10288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282018
127	NC_016798	TCG	2	6	10343	10348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282018
128	NC_016798	TGG	2	6	10366	10371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282018
129	NC_016798	GTA	2	6	10417	10422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282019
130	NC_016798	AGC	2	6	10577	10582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282019
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