MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A2497

Total Repeats: 2382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016798	GA	3	6	206	211	50 %	0 %	50 %	0 %	376282009
2	NC_016798	TC	3	6	819	824	0 %	50 %	0 %	50 %	376282009
3	NC_016798	AG	3	6	841	846	50 %	0 %	50 %	0 %	376282009
4	NC_016798	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016798	AG	3	6	2747	2752	50 %	0 %	50 %	0 %	376282012
6	NC_016798	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	376282012
7	NC_016798	TC	3	6	5858	5863	0 %	50 %	0 %	50 %	376282014
8	NC_016798	GA	3	6	5869	5874	50 %	0 %	50 %	0 %	376282014
9	NC_016798	AT	3	6	5973	5978	50 %	50 %	0 %	0 %	376282014
10	NC_016798	TG	3	6	6126	6131	0 %	50 %	50 %	0 %	376282014
11	NC_016798	AG	3	6	6534	6539	50 %	0 %	50 %	0 %	376282014
12	NC_016798	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016798	AC	3	6	8243	8248	50 %	0 %	0 %	50 %	376282016
14	NC_016798	AG	3	6	8986	8991	50 %	0 %	50 %	0 %	376282017
15	NC_016798	CT	4	8	9105	9112	0 %	50 %	0 %	50 %	376282017
16	NC_016798	GT	3	6	9187	9192	0 %	50 %	50 %	0 %	376282017
17	NC_016798	GT	3	6	9614	9619	0 %	50 %	50 %	0 %	376282017
18	NC_016798	GA	3	6	10460	10465	50 %	0 %	50 %	0 %	376282019
19	NC_016798	AG	3	6	10677	10682	50 %	0 %	50 %	0 %	376282019
20	NC_016798	TA	3	6	11842	11847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016798	AG	3	6	11902	11907	50 %	0 %	50 %	0 %	376282020
22	NC_016798	TA	3	6	12462	12467	50 %	50 %	0 %	0 %	376282020
23	NC_016798	TG	3	6	13365	13370	0 %	50 %	50 %	0 %	376282021
24	NC_016798	AG	3	6	13514	13519	50 %	0 %	50 %	0 %	376282021
25	NC_016798	TC	3	6	13648	13653	0 %	50 %	0 %	50 %	376282021
26	NC_016798	AG	4	8	13670	13677	50 %	0 %	50 %	0 %	376282021
27	NC_016798	TA	3	6	13932	13937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016798	TA	4	8	14156	14163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016798	AC	3	6	14999	15004	50 %	0 %	0 %	50 %	376282022
30	NC_016798	AG	3	6	16338	16343	50 %	0 %	50 %	0 %	376282023
31	NC_016798	TC	3	6	16378	16383	0 %	50 %	0 %	50 %	376282023
32	NC_016798	GA	3	6	16907	16912	50 %	0 %	50 %	0 %	376282024
33	NC_016798	AG	3	6	16978	16983	50 %	0 %	50 %	0 %	376282024
34	NC_016798	GA	3	6	17762	17767	50 %	0 %	50 %	0 %	376282024
35	NC_016798	AG	3	6	18108	18113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016798	GA	3	6	18121	18126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016798	GA	3	6	18365	18370	50 %	0 %	50 %	0 %	376282025
38	NC_016798	TC	3	6	18815	18820	0 %	50 %	0 %	50 %	376282025
39	NC_016798	CT	3	6	19043	19048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016798	TC	3	6	19243	19248	0 %	50 %	0 %	50 %	376282026
41	NC_016798	GA	3	6	19258	19263	50 %	0 %	50 %	0 %	376282026
42	NC_016798	GA	3	6	19357	19362	50 %	0 %	50 %	0 %	376282026
43	NC_016798	AG	3	6	19823	19828	50 %	0 %	50 %	0 %	376282026
44	NC_016798	AG	4	8	20109	20116	50 %	0 %	50 %	0 %	376282026
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47	NC_016798	TG	3	6	20713	20718	0 %	50 %	50 %	0 %	376282027
48	NC_016798	AG	3	6	21109	21114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016798	GA	3	6	21267	21272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016798	AG	3	6	21784	21789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016798	CT	3	6	21853	21858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016798	CT	4	8	22510	22517	0 %	50 %	0 %	50 %	376282028
53	NC_016798	AT	3	6	22780	22785	50 %	50 %	0 %	0 %	376282028
54	NC_016798	AT	3	6	23104	23109	50 %	50 %	0 %	0 %	376282028
55	NC_016798	GA	3	6	24423	24428	50 %	0 %	50 %	0 %	376282028
56	NC_016798	GA	3	6	24515	24520	50 %	0 %	50 %	0 %	376282028
57	NC_016798	AG	3	6	24896	24901	50 %	0 %	50 %	0 %	376282028
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60	NC_016798	TA	3	6	26535	26540	50 %	50 %	0 %	0 %	376282029
61	NC_016798	GA	3	6	26981	26986	50 %	0 %	50 %	0 %	376282029
62	NC_016798	GA	3	6	27105	27110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016798	CT	3	6	27112	27117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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65	NC_016798	GA	3	6	27612	27617	50 %	0 %	50 %	0 %	376282030
66	NC_016798	TC	3	6	28480	28485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016798	AG	3	6	28563	28568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016798	TG	3	6	28986	28991	0 %	50 %	50 %	0 %	376282032
69	NC_016798	TC	3	6	29039	29044	0 %	50 %	0 %	50 %	376282032
70	NC_016798	GC	4	8	29453	29460	0 %	0 %	50 %	50 %	376282032
71	NC_016798	TA	3	6	29575	29580	50 %	50 %	0 %	0 %	376282032
72	NC_016798	GA	3	6	30526	30531	50 %	0 %	50 %	0 %	376282033
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74	NC_016798	TC	3	6	30733	30738	0 %	50 %	0 %	50 %	376282034
75	NC_016798	GA	3	6	31354	31359	50 %	0 %	50 %	0 %	376282034
76	NC_016798	GA	3	6	31822	31827	50 %	0 %	50 %	0 %	376282034
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83	NC_016798	AG	3	6	34369	34374	50 %	0 %	50 %	0 %	376282038
84	NC_016798	AG	3	6	34507	34512	50 %	0 %	50 %	0 %	376282039
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89	NC_016798	GA	3	6	37126	37131	50 %	0 %	50 %	0 %	376282042
90	NC_016798	CT	3	6	37610	37615	0 %	50 %	0 %	50 %	376282042
91	NC_016798	AG	3	6	38121	38126	50 %	0 %	50 %	0 %	376282042
92	NC_016798	AG	3	6	38667	38672	50 %	0 %	50 %	0 %	376282042
93	NC_016798	AG	3	6	39194	39199	50 %	0 %	50 %	0 %	376282042
94	NC_016798	CT	3	6	39345	39350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016798	GA	3	6	39978	39983	50 %	0 %	50 %	0 %	376282043
96	NC_016798	AG	3	6	40115	40120	50 %	0 %	50 %	0 %	376282043
97	NC_016798	AG	3	6	40215	40220	50 %	0 %	50 %	0 %	376282043
98	NC_016798	CT	3	6	40716	40721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016798	AG	3	6	41192	41197	50 %	0 %	50 %	0 %	376282044
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102	NC_016798	TC	3	6	41415	41420	0 %	50 %	0 %	50 %	376282044
103	NC_016798	GC	3	6	41480	41485	0 %	0 %	50 %	50 %	376282044
104	NC_016798	GA	3	6	41620	41625	50 %	0 %	50 %	0 %	376282044
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107	NC_016798	GA	4	8	42606	42613	50 %	0 %	50 %	0 %	376282045
108	NC_016798	AG	3	6	42842	42847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016798	CT	3	6	42908	42913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016798	GA	5	10	43183	43192	50 %	0 %	50 %	0 %	376282046
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112	NC_016798	TC	3	6	44234	44239	0 %	50 %	0 %	50 %	376282048
113	NC_016798	TC	3	6	44399	44404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016798	TA	3	6	44552	44557	50 %	50 %	0 %	0 %	376282049
115	NC_016798	TC	3	6	45464	45469	0 %	50 %	0 %	50 %	376282050
116	NC_016798	GA	3	6	45947	45952	50 %	0 %	50 %	0 %	376282051
117	NC_016798	TG	3	6	46165	46170	0 %	50 %	50 %	0 %	376282051
118	NC_016798	AG	3	6	46176	46181	50 %	0 %	50 %	0 %	376282051
119	NC_016798	AG	4	8	46617	46624	50 %	0 %	50 %	0 %	376282052
120	NC_016798	CT	3	6	46808	46813	0 %	50 %	0 %	50 %	376282052
121	NC_016798	TG	3	6	47009	47014	0 %	50 %	50 %	0 %	376282052
122	NC_016798	AG	3	6	47062	47067	50 %	0 %	50 %	0 %	376282052
123	NC_016798	AG	3	6	48634	48639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016798	AG	3	6	49986	49991	50 %	0 %	50 %	0 %	376282054
125	NC_016798	CA	3	6	50652	50657	50 %	0 %	0 %	50 %	376282055
126	NC_016798	TG	4	8	51981	51988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016798	TC	3	6	53385	53390	0 %	50 %	0 %	50 %	376282057
128	NC_016798	CA	3	6	53436	53441	50 %	0 %	0 %	50 %	376282057
129	NC_016798	GA	3	6	53857	53862	50 %	0 %	50 %	0 %	376282058
130	NC_016798	CT	3	6	54174	54179	0 %	50 %	0 %	50 %	376282058
131	NC_016798	CT	3	6	54837	54842	0 %	50 %	0 %	50 %	376282059
132	NC_016798	AT	3	6	56045	56050	50 %	50 %	0 %	0 %	376282059
133	NC_016798	GA	3	6	56082	56087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016798	AG	3	6	56506	56511	50 %	0 %	50 %	0 %	376282060
135	NC_016798	CT	3	6	56968	56973	0 %	50 %	0 %	50 %	376282060
136	NC_016798	GT	3	6	57018	57023	0 %	50 %	50 %	0 %	376282060
137	NC_016798	TG	3	6	57737	57742	0 %	50 %	50 %	0 %	376282060
138	NC_016798	CT	3	6	58624	58629	0 %	50 %	0 %	50 %	376282061
139	NC_016798	GA	3	6	60184	60189	50 %	0 %	50 %	0 %	376282062
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141	NC_016798	TC	3	6	61070	61075	0 %	50 %	0 %	50 %	376282063
142	NC_016798	GA	3	6	61298	61303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016798	CA	3	6	61696	61701	50 %	0 %	0 %	50 %	376282064
144	NC_016798	AT	3	6	61946	61951	50 %	50 %	0 %	0 %	376282064
145	NC_016798	GA	3	6	61969	61974	50 %	0 %	50 %	0 %	376282064
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