MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A2497

Total Repeats: 371

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016798	TC	3	6	2264	2269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016798	GA	3	6	7592	7597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016798	TA	3	6	11842	11847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016798	TA	3	6	13932	13937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016798	TA	4	8	14156	14163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016798	AG	3	6	18108	18113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016798	GA	3	6	18121	18126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016798	CT	3	6	19043	19048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016798	AG	3	6	21109	21114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016798	GA	3	6	21267	21272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016798	AG	3	6	21784	21789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016798	CT	3	6	21853	21858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016798	GA	3	6	27105	27110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016798	CT	3	6	27112	27117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016798	TC	3	6	28480	28485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016798	AG	3	6	28563	28568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016798	GA	3	6	36976	36981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016798	AT	3	6	37078	37083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016798	CT	3	6	39345	39350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016798	CT	3	6	40716	40721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016798	AG	3	6	42842	42847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016798	CT	3	6	42908	42913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016798	TC	3	6	44399	44404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016798	AG	3	6	48634	48639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016798	TG	4	8	51981	51988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016798	GA	3	6	56082	56087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016798	GA	3	6	61298	61303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016798	AG	4	8	65317	65324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016798	CT	3	6	68529	68534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016798	TA	3	6	69648	69653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016798	CT	3	6	72384	72389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016798	TA	3	6	85740	85745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016798	GA	3	6	91093	91098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016798	CT	3	6	93443	93448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016798	GA	3	6	93929	93934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016798	GA	3	6	93971	93976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016798	TC	3	6	100467	100472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016798	AT	3	6	100518	100523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016798	TA	3	6	107194	107199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016798	TG	3	6	116436	116441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016798	AG	4	8	119023	119030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016798	GA	3	6	120845	120850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016798	TG	3	6	121104	121109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016798	CT	3	6	121729	121734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016798	TC	3	6	122641	122646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016798	GA	3	6	122971	122976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016798	TA	3	6	123079	123084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016798	GT	3	6	124069	124074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016798	CT	3	6	128603	128608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016798	TC	3	6	130925	130930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016798	AG	3	6	131002	131007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016798	AG	3	6	131027	131032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016798	TG	3	6	133834	133839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016798	AG	3	6	138673	138678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016798	GA	3	6	138736	138741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016798	AT	3	6	142968	142973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016798	AG	3	6	153322	153327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016798	AG	3	6	153754	153759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016798	AG	3	6	157779	157784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016798	TC	3	6	172244	172249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016798	AG	3	6	172376	172381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016798	CT	3	6	172394	172399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016798	TG	3	6	178883	178888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016798	CT	3	6	182177	182182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016798	GA	3	6	182256	182261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016798	CA	3	6	182569	182574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016798	TG	3	6	182968	182973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016798	GA	3	6	183012	183017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016798	CT	3	6	183609	183614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016798	GA	4	8	183651	183658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016798	GA	3	6	183855	183860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016798	TA	3	6	184098	184103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016798	GA	3	6	184211	184216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016798	GA	3	6	184314	184319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016798	TC	3	6	184721	184726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016798	GA	3	6	184953	184958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016798	AT	3	6	194368	194373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016798	TA	3	6	196503	196508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016798	GT	3	6	196578	196583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016798	GA	3	6	196759	196764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016798	AT	3	6	197543	197548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016798	AG	3	6	198838	198843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016798	TC	3	6	201828	201833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016798	AG	3	6	203660	203665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016798	CT	3	6	203672	203677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016798	CT	3	6	205586	205591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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88	NC_016798	CT	4	8	208693	208700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016798	AG	4	8	219963	219970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016798	TA	3	6	221517	221522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016798	CT	3	6	223158	223163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016798	TC	3	6	226159	226164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016798	AG	3	6	226190	226195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016798	TC	3	6	240390	240395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016798	AG	3	6	240416	240421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016798	CA	3	6	245342	245347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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98	NC_016798	GA	3	6	252427	252432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016798	TG	3	6	252537	252542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016798	AG	3	6	253339	253344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016798	TA	3	6	256147	256152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016798	AG	3	6	258428	258433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016798	TC	3	6	258454	258459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016798	AG	3	6	259932	259937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016798	TA	3	6	266295	266300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016798	CA	3	6	268102	268107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016798	TC	3	6	270002	270007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016798	TA	3	6	275555	275560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016798	AT	4	8	286115	286122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016798	CT	3	6	286967	286972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016798	TC	4	8	287058	287065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016798	TC	3	6	288749	288754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016798	TC	3	6	288806	288811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016798	CT	3	6	289279	289284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016798	AT	3	6	301294	301299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016798	CA	3	6	303623	303628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016798	GA	3	6	308354	308359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016798	AG	3	6	317560	317565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016798	CT	3	6	349510	349515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016798	CT	3	6	352581	352586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016798	TC	3	6	356807	356812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016798	TC	3	6	360637	360642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016798	CT	3	6	360723	360728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016798	AC	3	6	364056	364061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016798	GA	3	6	365966	365971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016798	TC	3	6	366044	366049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016798	TA	3	6	366245	366250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016798	GC	3	6	367774	367779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016798	TC	3	6	368078	368083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016798	TA	3	6	368148	368153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016798	AC	3	6	368885	368890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016798	CT	4	8	369057	369064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016798	CT	3	6	369290	369295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016798	CA	3	6	369299	369304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016798	GT	3	6	369617	369622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016798	CT	4	8	383384	383391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016798	GA	3	6	388091	388096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016798	CG	3	6	393222	393227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016798	CA	3	6	394272	394277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016798	TC	3	6	396819	396824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016798	CT	3	6	397309	397314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016798	GA	3	6	397439	397444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016798	GA	3	6	397570	397575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016798	CT	3	6	411667	411672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016798	CT	3	6	412654	412659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016798	TC	3	6	429382	429387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016798	AT	3	6	429434	429439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016798	CT	3	6	429925	429930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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150	NC_016798	CT	3	6	431375	431380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016798	CT	3	6	432398	432403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016798	AG	3	6	432745	432750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016798	GA	3	6	434440	434445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016798	AC	3	6	438438	438443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.