MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella abortus A13334 chromosome 1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016795	CGCGTG	2	12	13384	13395	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016795	GCAGAA	2	12	16210	16221	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016795	AGATGA	2	12	18003	18014	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016795	CGGGAG	2	12	18931	18942	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016795	CCATGC	2	12	19508	19519	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016795	GCCACG	2	12	30992	31003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016795	TTCCCC	2	12	123114	123125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016795	AAAAGC	2	12	189599	189610	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016795	GCAAAA	2	12	198376	198387	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016795	GCCAGG	2	12	211519	211530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016795	CCTCCC	2	12	247918	247929	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
12	NC_016795	CAAAGA	2	12	301814	301825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016795	GTTTCC	2	12	315548	315559	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016795	GCCAGG	2	12	384336	384347	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016795	TCGATA	2	12	477401	477412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016795	TTCCGT	2	12	499843	499854	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016795	TTACGT	2	12	539641	539652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016795	TGAGTT	2	12	543135	543146	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016795	CGGCAG	2	12	605579	605590	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016795	CAAATG	2	12	616300	616311	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016795	TGTTTT	2	12	622704	622715	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016795	TTCGAC	2	12	640641	640652	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016795	CAAGGG	2	12	703187	703198	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016795	GGCATT	2	12	750870	750881	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016795	CGGCAG	2	12	809654	809665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016795	GCTTTT	2	12	856444	856455	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016795	CAGAGC	2	12	928975	928986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016795	TTTCAG	2	12	952402	952413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016795	TGGCAT	2	12	963322	963333	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016795	CCGATG	2	12	965737	965748	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016795	CTTTTA	2	12	997366	997377	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016795	AGTTCC	2	12	1085650	1085661	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016795	GCGGTG	2	12	1106494	1106505	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016795	GAAACG	2	12	1107547	1107558	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016795	TTTTTG	2	12	1219951	1219962	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016795	GGAAAA	2	12	1258420	1258431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016795	ATCAGC	2	12	1400773	1400784	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016795	CCGGCA	2	12	1418881	1418892	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016795	CTGGCG	2	12	1456385	1456396	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016795	CCTGCG	2	12	1482227	1482238	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016795	CAATTT	2	12	1496355	1496366	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016795	GCGCGA	2	12	1588412	1588423	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016795	GAAAAG	2	12	1628248	1628259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016795	TTTCAA	2	12	1644233	1644244	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016795	TGGCGA	2	12	1685588	1685599	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016795	CGACCC	2	12	1688798	1688809	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016795	TTTGGA	2	12	1771668	1771679	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016795	ACGTAA	2	12	1839526	1839537	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016795	GACCGT	2	12	1869629	1869640	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016795	ACAGCA	2	12	1870012	1870023	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016795	GGTCAT	2	12	1880796	1880807	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016795	GTGACG	2	12	1881899	1881910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016795	GAAAAC	2	12	1889709	1889720	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016795	AGCGCG	2	12	1926484	1926495	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016795	AAGTTA	2	12	1963191	1963202	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016795	GTGCAG	2	12	2005989	2006000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016795	TTGCAA	2	12	2019437	2019448	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016795	AAAATC	2	12	2057975	2057986	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016795	GAAAAA	2	12	2057994	2058005	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016795	AGATCG	2	12	2086126	2086137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016795	GGAAGC	2	12	2123679	2123690	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.