MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Brucella abortus A13334 chromosome 1

Total Repeats: 1593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016795	CCGCC	2	10	2958	2967	0 %	0 %	20 %	80 %	376271798
2	NC_016795	GCTGT	2	10	3038	3047	0 %	40 %	40 %	20 %	376271798
3	NC_016795	TGCCC	2	10	3051	3060	0 %	20 %	20 %	60 %	376271798
4	NC_016795	CCAGC	2	10	6301	6310	20 %	0 %	20 %	60 %	376271802
5	NC_016795	CGCGC	2	10	7019	7028	0 %	0 %	40 %	60 %	376271803
6	NC_016795	CCGTC	2	10	9992	10001	0 %	20 %	20 %	60 %	376271806
7	NC_016795	CAATG	2	10	11810	11819	40 %	20 %	20 %	20 %	376271809
8	NC_016795	TGACC	2	10	11936	11945	20 %	20 %	20 %	40 %	376271809
9	NC_016795	GCCCT	2	10	12710	12719	0 %	20 %	20 %	60 %	376271811
10	NC_016795	CCCTT	2	10	13297	13306	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_016795	GATTT	2	10	13327	13336	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016795	GCGCA	2	10	21527	21536	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016795	AGAAT	2	10	22089	22098	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016795	TGGCG	2	10	25734	25743	0 %	20 %	60 %	20 %	376271828
15	NC_016795	GCCCA	2	10	29246	29255	20 %	0 %	20 %	60 %	376271834
16	NC_016795	TGGGC	2	10	31278	31287	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016795	AGCCA	2	10	36645	36654	40 %	0 %	20 %	40 %	376271842
18	NC_016795	TGGCA	2	10	40111	40120	20 %	20 %	40 %	20 %	376271846
19	NC_016795	CCTTG	2	10	41791	41800	0 %	40 %	20 %	40 %	376271848
20	NC_016795	CGATG	2	10	42842	42851	20 %	20 %	40 %	20 %	376271849
21	NC_016795	CTCCG	2	10	43486	43495	0 %	20 %	20 %	60 %	376271850
22	NC_016795	GCGCC	2	10	43645	43654	0 %	0 %	40 %	60 %	376271850
23	NC_016795	ACCAG	2	10	44772	44781	40 %	0 %	20 %	40 %	376271851
24	NC_016795	GACGT	2	10	48431	48440	20 %	20 %	40 %	20 %	376271855
25	NC_016795	CAGCG	2	10	49893	49902	20 %	0 %	40 %	40 %	376271856
26	NC_016795	GCGCG	2	10	50038	50047	0 %	0 %	60 %	40 %	376271856
27	NC_016795	GCCCC	2	10	50724	50733	0 %	0 %	20 %	80 %	376271856
28	NC_016795	CCGCA	2	10	54653	54662	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_016795	TGCCC	2	10	56686	56695	0 %	20 %	20 %	60 %	376271863
30	NC_016795	TTTCC	2	10	58652	58661	0 %	60 %	0 %	40 %	376271865
31	NC_016795	CCCTG	2	10	59411	59420	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_016795	ATCGG	2	10	60481	60490	20 %	20 %	40 %	20 %	376271867
33	NC_016795	GGCCC	2	10	61736	61745	0 %	0 %	40 %	60 %	376271867
34	NC_016795	GTTCG	2	10	64027	64036	0 %	40 %	40 %	20 %	376271868
35	NC_016795	CTGCG	2	10	67834	67843	0 %	20 %	40 %	40 %	376271874
36	NC_016795	GCCCG	2	10	70105	70114	0 %	0 %	40 %	60 %	376271877
37	NC_016795	TGGCT	2	10	70337	70346	0 %	40 %	40 %	20 %	376271877
38	NC_016795	ATGTC	2	10	72228	72237	20 %	40 %	20 %	20 %	376271878
39	NC_016795	CCTGA	2	10	72635	72644	20 %	20 %	20 %	40 %	376271879
40	NC_016795	TTGCC	2	10	76290	76299	0 %	40 %	20 %	40 %	376271885
41	NC_016795	TGCGA	2	10	79024	79033	20 %	20 %	40 %	20 %	376271887
42	NC_016795	GCCGC	2	10	80334	80343	0 %	0 %	40 %	60 %	376271888
43	NC_016795	AAGGA	2	10	80881	80890	60 %	0 %	40 %	0 %	376271889
44	NC_016795	GCCCC	2	10	82045	82054	0 %	0 %	20 %	80 %	376271889
45	NC_016795	AAGCG	2	10	82720	82729	40 %	0 %	40 %	20 %	376271890
46	NC_016795	CGCGC	2	10	84695	84704	0 %	0 %	40 %	60 %	376271893
47	NC_016795	GATCG	2	10	86912	86921	20 %	20 %	40 %	20 %	376271895
48	NC_016795	CAACC	2	10	88669	88678	40 %	0 %	0 %	60 %	376271896
49	NC_016795	GCCGG	2	10	91214	91223	0 %	0 %	60 %	40 %	376271898
50	NC_016795	GACAT	2	10	91496	91505	40 %	20 %	20 %	20 %	376271898
51	NC_016795	GCGGT	2	10	95254	95263	0 %	20 %	60 %	20 %	376271899
52	NC_016795	GCTTT	2	10	96451	96460	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016795	TGCGC	2	10	99612	99621	0 %	20 %	40 %	40 %	376271906
54	NC_016795	CGGAT	2	10	101011	101020	20 %	20 %	40 %	20 %	376271907
55	NC_016795	GTCAT	2	10	101577	101586	20 %	40 %	20 %	20 %	376271908
56	NC_016795	GACGC	2	10	101610	101619	20 %	0 %	40 %	40 %	376271908
57	NC_016795	CGCCT	2	10	103357	103366	0 %	20 %	20 %	60 %	376271911
58	NC_016795	GCGTC	2	10	103659	103668	0 %	20 %	40 %	40 %	376271911
59	NC_016795	GCCGC	2	10	104460	104469	0 %	0 %	40 %	60 %	376271912
60	NC_016795	CGATG	2	10	105102	105111	20 %	20 %	40 %	20 %	376271912
61	NC_016795	AGGCA	2	10	105673	105682	40 %	0 %	40 %	20 %	376271913
62	NC_016795	GGCCC	2	10	106257	106266	0 %	0 %	40 %	60 %	376271914
63	NC_016795	ATTCA	2	10	107569	107578	40 %	40 %	0 %	20 %	376271917
64	NC_016795	TCGCT	2	10	111891	111900	0 %	40 %	20 %	40 %	376271923
65	NC_016795	CGCGG	2	10	112949	112958	0 %	0 %	60 %	40 %	376271924
66	NC_016795	GATTT	2	10	112993	113002	20 %	60 %	20 %	0 %	376271924
67	NC_016795	GGTCA	2	10	115439	115448	20 %	20 %	40 %	20 %	376271929
68	NC_016795	AAGCG	2	10	116890	116899	40 %	0 %	40 %	20 %	376271931
69	NC_016795	TAAAA	2	10	118338	118347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016795	ACGTC	2	10	118969	118978	20 %	20 %	20 %	40 %	376271932
71	NC_016795	TTTCA	2	10	121043	121052	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016795	TTTGT	2	10	126979	126988	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016795	CTCCG	2	10	127046	127055	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_016795	CCGGC	2	10	129849	129858	0 %	0 %	40 %	60 %	376271942
75	NC_016795	AAGGC	2	10	130373	130382	40 %	0 %	40 %	20 %	376271943
76	NC_016795	CGAAC	2	10	133194	133203	40 %	0 %	20 %	40 %	376271945
77	NC_016795	GCGGT	2	10	133360	133369	0 %	20 %	60 %	20 %	376271945
78	NC_016795	TGCCC	2	10	134565	134574	0 %	20 %	20 %	60 %	376271945
79	NC_016795	TGCCG	2	10	138862	138871	0 %	20 %	40 %	40 %	376271949
80	NC_016795	AAATC	2	10	140470	140479	60 %	20 %	0 %	20 %	376271951
81	NC_016795	GCGCG	2	10	140777	140786	0 %	0 %	60 %	40 %	376271952
82	NC_016795	TCGCA	2	10	142001	142010	20 %	20 %	20 %	40 %	376271953
83	NC_016795	CAAGG	2	10	143611	143620	40 %	0 %	40 %	20 %	376271955
84	NC_016795	GGCGC	2	10	144169	144178	0 %	0 %	60 %	40 %	376271956
85	NC_016795	GCATT	2	10	144183	144192	20 %	40 %	20 %	20 %	376271956
86	NC_016795	CTTCG	2	10	145424	145433	0 %	40 %	20 %	40 %	376271957
87	NC_016795	GAAGC	2	10	145561	145570	40 %	0 %	40 %	20 %	376271957
88	NC_016795	GTTCG	2	10	145609	145618	0 %	40 %	40 %	20 %	376271957
89	NC_016795	GCCGT	2	10	145903	145912	0 %	20 %	40 %	40 %	376271957
90	NC_016795	GGCGG	2	10	147816	147825	0 %	0 %	80 %	20 %	376271959
91	NC_016795	GTGCT	2	10	151279	151288	0 %	40 %	40 %	20 %	376271965
92	NC_016795	GCTCG	2	10	152517	152526	0 %	20 %	40 %	40 %	376271965
93	NC_016795	ATCGT	2	10	156478	156487	20 %	40 %	20 %	20 %	376271967
94	NC_016795	CATGG	2	10	157025	157034	20 %	20 %	40 %	20 %	376271967
95	NC_016795	GCGGT	2	10	157678	157687	0 %	20 %	60 %	20 %	376271967
96	NC_016795	TTCCA	2	10	159379	159388	20 %	40 %	0 %	40 %	376271968
97	NC_016795	CTATC	2	10	165716	165725	20 %	40 %	0 %	40 %	376271973
98	NC_016795	ACGAA	2	10	166897	166906	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016795	CCGCG	2	10	168173	168182	0 %	0 %	40 %	60 %	376271976
100	NC_016795	CGCGC	2	10	169963	169972	0 %	0 %	40 %	60 %	376271977
101	NC_016795	TCCAT	2	10	169998	170007	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016795	CGAGC	2	10	170788	170797	20 %	0 %	40 %	40 %	376271978
103	NC_016795	AGCCA	2	10	170967	170976	40 %	0 %	20 %	40 %	376271978
104	NC_016795	TCGCC	2	10	172242	172251	0 %	20 %	20 %	60 %	376271978
105	NC_016795	CGAGC	2	10	174583	174592	20 %	0 %	40 %	40 %	376271978
106	NC_016795	CACGG	2	10	175126	175135	20 %	0 %	40 %	40 %	376271978
107	NC_016795	TGCGC	2	10	175548	175557	0 %	20 %	40 %	40 %	376271978
108	NC_016795	TGCGC	2	10	176404	176413	0 %	20 %	40 %	40 %	376271978
109	NC_016795	GCCAG	2	10	178251	178260	20 %	0 %	40 %	40 %	376271978
110	NC_016795	GAAAG	2	10	180630	180639	60 %	0 %	40 %	0 %	376271980
111	NC_016795	CGGCA	2	10	180669	180678	20 %	0 %	40 %	40 %	376271980
112	NC_016795	CGGCA	2	10	180876	180885	20 %	0 %	40 %	40 %	376271980
113	NC_016795	CAGGC	2	10	181360	181369	20 %	0 %	40 %	40 %	376271981
114	NC_016795	CAGCG	2	10	181723	181732	20 %	0 %	40 %	40 %	376271981
115	NC_016795	ATGGC	2	10	184801	184810	20 %	20 %	40 %	20 %	376271984
116	NC_016795	ACAAA	2	10	185546	185555	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016795	GGTGC	2	10	186039	186048	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016795	CTCCC	2	10	188030	188039	0 %	20 %	0 %	80 %	376271993
119	NC_016795	CGATG	2	10	188089	188098	20 %	20 %	40 %	20 %	376271993
120	NC_016795	CCGGC	2	10	189096	189105	0 %	0 %	40 %	60 %	376271993
121	NC_016795	GGCCG	2	10	191972	191981	0 %	0 %	60 %	40 %	376271997
122	NC_016795	CGGTC	2	10	192661	192670	0 %	20 %	40 %	40 %	376271998
123	NC_016795	CTGGG	2	10	193787	193796	0 %	20 %	60 %	20 %	376272000
124	NC_016795	CTTTT	2	10	195845	195854	0 %	80 %	0 %	20 %	376272001
125	NC_016795	GTTCT	2	10	196538	196547	0 %	60 %	20 %	20 %	376272002
126	NC_016795	GGTTC	2	10	196922	196931	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016795	GAACC	2	10	196973	196982	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016795	TGGAA	2	10	197346	197355	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016795	TGCCC	2	10	198032	198041	0 %	20 %	20 %	60 %	376272005
130	NC_016795	TGCCG	2	10	198878	198887	0 %	20 %	40 %	40 %	376272006
131	NC_016795	CAGCG	2	10	198954	198963	20 %	0 %	40 %	40 %	376272006
132	NC_016795	GCGTT	2	10	200166	200175	0 %	40 %	40 %	20 %	376272007
133	NC_016795	TGCGC	2	10	203203	203212	0 %	20 %	40 %	40 %	376272009
134	NC_016795	ATCGA	2	10	203620	203629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016795	ACCTC	2	10	207505	207514	20 %	20 %	0 %	60 %	376272014
136	NC_016795	TCGAT	2	10	208405	208414	20 %	40 %	20 %	20 %	376272015
137	NC_016795	CCAGA	2	10	209172	209181	40 %	0 %	20 %	40 %	376272016
138	NC_016795	CGCCA	2	10	211824	211833	20 %	0 %	20 %	60 %	376272019
139	NC_016795	TTATT	2	10	215307	215316	20 %	80 %	0 %	0 %	376272019
140	NC_016795	TAAAA	2	10	215512	215521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016795	ATGGA	2	10	216540	216549	40 %	20 %	40 %	0 %	376272020
142	NC_016795	TGCGC	2	10	216708	216717	0 %	20 %	40 %	40 %	376272021
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149	NC_016795	AAGAT	2	10	224168	224177	60 %	20 %	20 %	0 %	376272028
150	NC_016795	GATGC	2	10	225115	225124	20 %	20 %	40 %	20 %	376272029
151	NC_016795	GATGG	2	10	226441	226450	20 %	20 %	60 %	0 %	376272030
152	NC_016795	CTTCG	2	10	226474	226483	0 %	40 %	20 %	40 %	376272030
153	NC_016795	TTTCT	2	10	230552	230561	0 %	80 %	0 %	20 %	376272033
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161	NC_016795	CTTTA	2	10	243205	243214	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_016795	ATGCC	2	10	245022	245031	20 %	20 %	20 %	40 %	376272047
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182	NC_016795	GCATG	2	10	267095	267104	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
183	NC_016795	GCATC	2	10	267274	267283	20 %	20 %	20 %	40 %	376272069
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192	NC_016795	ACTGG	2	10	278352	278361	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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201	NC_016795	GATGC	2	10	295029	295038	20 %	20 %	40 %	20 %	376272094
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241	NC_016795	GCCCG	2	10	347104	347113	0 %	0 %	40 %	60 %	376272150
242	NC_016795	ACAAA	2	10	348180	348189	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
243	NC_016795	GCGCC	2	10	348704	348713	0 %	0 %	40 %	60 %	376272152
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248	NC_016795	TTCCC	2	10	353461	353470	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
249	NC_016795	AAGCG	2	10	353667	353676	40 %	0 %	40 %	20 %	376272157
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259	NC_016795	GAGAG	2	10	366879	366888	40 %	0 %	60 %	0 %	376272174
260	NC_016795	TTTGT	2	10	370732	370741	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_016795	TCACC	2	10	374590	374599	20 %	20 %	0 %	60 %	376272180
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267	NC_016795	GCGCA	2	10	377312	377321	20 %	0 %	40 %	40 %	376272180
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