MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus cereus F837/76 plasmid pF837_55

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016794	CTCTG	2	10	2194	2203	0 %	40 %	20 %	40 %	376270197
2	NC_016794	AAATC	2	10	2954	2963	60 %	20 %	0 %	20 %	376270198
3	NC_016794	ACATC	2	10	3476	3485	40 %	20 %	0 %	40 %	376270200
4	NC_016794	TTCAT	2	10	3568	3577	20 %	60 %	0 %	20 %	376270200
5	NC_016794	TTCCA	2	10	9802	9811	20 %	40 %	0 %	40 %	376270214
6	NC_016794	GAATC	2	10	9846	9855	40 %	20 %	20 %	20 %	376270214
7	NC_016794	TCTTT	2	10	10028	10037	0 %	80 %	0 %	20 %	376270214
8	NC_016794	TTAAC	2	10	10098	10107	40 %	40 %	0 %	20 %	376270214
9	NC_016794	TCCTT	2	10	10256	10265	0 %	60 %	0 %	40 %	376270215
10	NC_016794	TCCCA	2	10	10635	10644	20 %	20 %	0 %	60 %	376270217
11	NC_016794	GTAAT	2	10	11310	11319	40 %	40 %	20 %	0 %	376270218
12	NC_016794	TTTTG	2	10	12034	12043	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016794	ATCCA	2	10	12296	12305	40 %	20 %	0 %	40 %	376270222
14	NC_016794	CTTTT	2	10	12487	12496	0 %	80 %	0 %	20 %	376270223
15	NC_016794	TTTAT	2	10	15754	15763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016794	TGATT	2	10	16395	16404	20 %	60 %	20 %	0 %	376270229
17	NC_016794	AAATT	2	10	17276	17285	60 %	40 %	0 %	0 %	376270230
18	NC_016794	TCTTT	2	10	18447	18456	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016794	ATTTA	2	10	19466	19475	40 %	60 %	0 %	0 %	376270233
20	NC_016794	AAAAT	2	10	20188	20197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016794	TAAAT	2	10	20951	20960	60 %	40 %	0 %	0 %	376270234
22	NC_016794	TCTTT	2	10	21371	21380	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016794	CAAAA	2	10	23597	23606	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016794	TTTTG	2	10	23919	23928	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016794	TGTTT	2	10	24002	24011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016794	GAAAA	2	10	25437	25446	80 %	0 %	20 %	0 %	376270238
27	NC_016794	GAAAA	2	10	25788	25797	80 %	0 %	20 %	0 %	376270239
28	NC_016794	AGTAA	2	10	26278	26287	60 %	20 %	20 %	0 %	376270240
29	NC_016794	ATTTT	2	10	28789	28798	20 %	80 %	0 %	0 %	376270243
30	NC_016794	TGAAA	2	10	29006	29015	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016794	ATTCA	2	10	29941	29950	40 %	40 %	0 %	20 %	376270245
32	NC_016794	AAACT	2	10	30582	30591	60 %	20 %	0 %	20 %	376270246
33	NC_016794	TCGAA	2	10	31922	31931	40 %	20 %	20 %	20 %	376270248
34	NC_016794	GCATA	2	10	32008	32017	40 %	20 %	20 %	20 %	376270248
35	NC_016794	AAAGA	2	10	32843	32852	80 %	0 %	20 %	0 %	376270249
36	NC_016794	TCAAA	2	10	33264	33273	60 %	20 %	0 %	20 %	376270250
37	NC_016794	TCAAT	2	10	33455	33464	40 %	40 %	0 %	20 %	376270250
38	NC_016794	AGTAA	2	10	33640	33649	60 %	20 %	20 %	0 %	376270250
39	NC_016794	AATAA	2	10	33715	33724	80 %	20 %	0 %	0 %	376270250
40	NC_016794	ATCAA	2	10	34263	34272	60 %	20 %	0 %	20 %	376270250
41	NC_016794	ACTTT	2	10	36101	36110	20 %	60 %	0 %	20 %	376270253
42	NC_016794	TTTAT	2	10	36447	36456	20 %	80 %	0 %	0 %	376270254
43	NC_016794	ATATT	2	10	36843	36852	40 %	60 %	0 %	0 %	376270254
44	NC_016794	TCTCT	2	10	36967	36976	0 %	60 %	0 %	40 %	376270254
45	NC_016794	ATTGT	2	10	38738	38747	20 %	60 %	20 %	0 %	376270256
46	NC_016794	TTGCG	2	10	38814	38823	0 %	40 %	40 %	20 %	376270256
47	NC_016794	TAAAA	2	10	41442	41451	80 %	20 %	0 %	0 %	376270257
48	NC_016794	TGAAT	2	10	41944	41953	40 %	40 %	20 %	0 %	376270258
49	NC_016794	TTTTG	2	10	42305	42314	0 %	80 %	20 %	0 %	376270258
50	NC_016794	CCAAA	2	10	42577	42586	60 %	0 %	0 %	40 %	376270258
51	NC_016794	ATGAT	2	10	43106	43115	40 %	40 %	20 %	0 %	376270258
52	NC_016794	AGTGA	2	10	43144	43153	40 %	20 %	40 %	0 %	376270258
53	NC_016794	GTTCT	2	10	44755	44764	0 %	60 %	20 %	20 %	376270260
54	NC_016794	TTTCT	2	10	45429	45438	0 %	80 %	0 %	20 %	376270261
55	NC_016794	AATGA	2	10	46395	46404	60 %	20 %	20 %	0 %	376270263
56	NC_016794	ATTTT	2	10	46945	46954	20 %	80 %	0 %	0 %	376270265
57	NC_016794	CTTCT	2	10	47402	47411	0 %	60 %	0 %	40 %	376270266
58	NC_016794	AGACG	2	10	49293	49302	40 %	0 %	40 %	20 %	376270269
59	NC_016794	CTTCT	2	10	49547	49556	0 %	60 %	0 %	40 %	376270270
60	NC_016794	TCAAT	2	10	50990	50999	40 %	40 %	0 %	20 %	376270271
61	NC_016794	TCTTT	2	10	51426	51435	0 %	80 %	0 %	20 %	376270271
62	NC_016794	TTCAT	2	10	51724	51733	20 %	60 %	0 %	20 %	376270271
63	NC_016794	TTCTT	2	10	52677	52686	0 %	80 %	0 %	20 %	376270272
64	NC_016794	TACCT	2	10	53283	53292	20 %	40 %	0 %	40 %	376270273
65	NC_016794	TAAAA	2	10	54225	54234	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016794	TAAAA	2	10	54514	54523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016794	TATTT	2	10	55069	55078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016794	ATTCA	2	10	55148	55157	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.