MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016792	AAACGG	2	12	788	799	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	376258300
2	NC_016792	AACAGA	2	12	1194	1205	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	376258301
3	NC_016792	TTCATT	2	12	3195	3206	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	376258304
4	NC_016792	TTCAAT	2	12	3213	3224	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	376258304
5	NC_016792	CTTTTT	2	12	4615	4626	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	376258305
6	NC_016792	TTTTCC	2	12	4782	4793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376258306
7	NC_016792	CTCTTG	2	12	12871	12882	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	376258311
8	NC_016792	ATAAAT	2	12	16986	16997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376258314
9	NC_016792	TCTTGC	2	12	17847	17858	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	376258314
10	NC_016792	ATCTTC	2	12	18584	18595	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	376258314
11	NC_016792	AGCAAA	2	12	22535	22546	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	376258314
12	NC_016792	CCTTCA	2	12	23440	23451	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	376258314
13	NC_016792	GTAATG	2	12	24650	24661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376258315
14	NC_016792	ATTCAT	3	18	25142	25159	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	376258315
15	NC_016792	GTACGA	2	12	30106	30117	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376258315
16	NC_016792	TCCACA	2	12	35421	35432	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	376258317
17	NC_016792	ACGCCA	2	12	38412	38423	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	376258319
18	NC_016792	CAGGTT	2	12	41224	41235	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	376258322
19	NC_016792	ACATCT	2	12	41680	41691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376258323
20	NC_016792	AAAAAT	2	12	45274	45285	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016792	TATAAA	2	12	48118	48129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016792	TCCATA	2	12	49132	49143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376258331
23	NC_016792	TTTAAT	2	12	53157	53168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016792	ATTTTA	2	12	58917	58928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376258338
25	NC_016792	CATATA	2	12	60635	60646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016792	ACTTTA	2	12	64843	64854	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	376258343
27	NC_016792	GAAAAA	2	12	66209	66220	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	376258346
28	NC_016792	TAGGAC	2	12	85397	85408	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376258373
29	NC_016792	GTTCCT	2	12	95417	95428	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	376258378
30	NC_016792	TTGATA	2	12	97702	97713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	376258381
31	NC_016792	TTATTC	2	12	98957	98968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016792	AACAAA	2	12	100719	100730	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	376258382
33	NC_016792	ATTGAT	2	12	102976	102987	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	376258384
34	NC_016792	GATTTC	2	12	104096	104107	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	376258384
35	NC_016792	ACAGCA	2	12	105287	105298	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	376258387
36	NC_016792	AGGAGC	2	12	105325	105336	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	376258387
37	NC_016792	AGATGC	2	12	105532	105543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376258387
38	NC_016792	ATCCAG	2	12	107765	107776	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376258388
39	NC_016792	AAAAAG	2	12	109234	109245	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	376258389
40	NC_016792	ACGTGT	2	12	112089	112100	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	376258393
41	NC_016792	AACAGG	2	12	114031	114042	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	376258395
42	NC_016792	GTTATT	2	12	116476	116487	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	376258397
43	NC_016792	ATAAGA	2	12	117613	117624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	376258401
44	NC_016792	AGAACA	2	12	117633	117644	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	376258401
45	NC_016792	GATTGT	2	12	120634	120645	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	376258404
46	NC_016792	TTTAAT	2	12	122140	122151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016792	CAAAAG	2	12	123454	123465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	376258407
48	NC_016792	GAAATT	2	12	126160	126171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	376258414
49	NC_016792	AATATT	2	12	128522	128533	50 %	50 %	0 %	0 %	376258420
50	NC_016792	GAATAA	2	12	128808	128819	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016792	CGTAGA	2	12	129722	129733	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376258423
52	NC_016792	TGTGAT	2	12	129770	129781	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	376258423
53	NC_016792	GTTCTT	2	12	130603	130614	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	376258425
54	NC_016792	TATGAA	2	12	132030	132041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	376258426
55	NC_016792	ATATTT	2	12	134068	134079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016792	TAAAAA	2	12	138270	138281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016792	GAAAAA	2	12	144748	144759	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	376258438
58	NC_016792	TCAAAT	2	12	144883	144894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	376258438
59	NC_016792	CAAAAG	2	12	147169	147180	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	376258442
60	NC_016792	TTAGTC	2	12	151854	151865	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	376258446
61	NC_016792	AAGAGA	2	12	153289	153300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376258446
62	NC_016792	ACGCAA	2	12	154353	154364	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	376258446
63	NC_016792	AAATCA	2	12	155171	155182	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	376258446
64	NC_016792	TGGAGA	2	12	156967	156978	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	376258447
65	NC_016792	CAAAAA	2	12	158065	158076	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	376258448
66	NC_016792	AATTAG	2	12	159411	159422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016792	AAAAGA	2	12	160918	160929	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	376258452
68	NC_016792	TTTAAG	2	12	163234	163245	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016792	TTTAAT	2	12	163910	163921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016792	TTTGCA	2	12	171545	171556	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	376258466
71	NC_016792	AAAAGA	2	12	174273	174284	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	376258471
72	NC_016792	ATTTTT	2	12	174440	174451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016792	AGATGA	2	12	175656	175667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	376258472
74	NC_016792	TAAGAT	2	12	177269	177280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	376258473
75	NC_016792	CAATTT	2	12	179328	179339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	376258476
76	NC_016792	TGGGAA	2	12	179721	179732	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	376258476
77	NC_016792	TTCATA	2	12	182033	182044	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	376258479
78	NC_016792	TTCATA	2	12	182225	182236	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	376258479
79	NC_016792	TCATTT	2	12	195741	195752	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	376258495
80	NC_016792	CATATT	2	12	198527	198538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	376258495
81	NC_016792	CCAAGT	2	12	202068	202079	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376258502
82	NC_016792	GAGAAA	2	12	205411	205422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376258508
83	NC_016792	GAAATC	2	12	209405	209416	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	376258514
84	NC_016792	TTTTTA	2	12	211255	211266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	376258517
85	NC_016792	GTTTTA	2	12	211857	211868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	376258518
86	NC_016792	TTATTT	2	12	214231	214242	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	376258519
87	NC_016792	CTCCAT	2	12	215327	215338	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	376258520
88	NC_016792	GGAATG	2	12	217636	217647	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	376258521
89	NC_016792	CTTAAT	2	12	219673	219684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	376258523
90	NC_016792	CAAAAG	2	12	219993	220004	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	376258524
91	NC_016792	AAGCAA	2	12	220542	220553	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	376258524
92	NC_016792	GCTGGT	2	12	220787	220798	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	376258524
93	NC_016792	GACTGT	2	12	226398	226409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	376258529
94	NC_016792	GAAGGA	2	12	226900	226911	50 %	0 %	50 %	0 %	376258529
95	NC_016792	AGTTAA	2	12	228017	228028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	376258530
96	NC_016792	ATGTTC	2	12	230013	230024	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	376258532
97	NC_016792	TGTAAT	2	12	231350	231361	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	376258534
98	NC_016792	TTGTAA	2	12	236761	236772	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	376258534
99	NC_016792	TTTGGA	2	12	242523	242534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	376258534
100	NC_016792	AGAATT	2	12	242828	242839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	376258534
101	NC_016792	TACCTG	2	12	243505	243516	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	376258534
102	NC_016792	GGATTT	2	12	244098	244109	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	376258534
103	NC_016792	AAAGAA	2	12	250495	250506	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	376258540
104	NC_016792	ATTTCA	2	12	251409	251420	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	376258540
105	NC_016792	ATTATA	2	12	252432	252443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016792	AGTTAT	2	12	253472	253483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016792	GAAAAA	2	12	256737	256748	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	376258546
108	NC_016792	ATAAAA	2	12	256771	256782	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	376258546
109	NC_016792	TTAGTA	2	12	259638	259649	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016792	TTTTAT	2	12	261097	261108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016792	TATAAA	2	12	261419	261430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376258551
112	NC_016792	ATATTA	2	12	267665	267676	50 %	50 %	0 %	0 %	376258559

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.