MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016792	ATGAT	2	10	1108	1117	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016792	TAAAA	2	10	8040	8049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016792	TTTTC	2	10	9529	9538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016792	CGTTC	2	10	11780	11789	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016792	CACAA	2	10	13191	13200	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016792	TAACT	2	10	46762	46771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016792	CATAT	2	10	50453	50462	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016792	ATTTT	2	10	52342	52351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016792	GATTA	2	10	53195	53204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016792	AGAGC	2	10	55143	55152	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016792	AAAAG	2	10	55384	55393	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016792	CAATC	2	10	56877	56886	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016792	CAATC	2	10	57180	57189	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016792	ATTTA	2	10	59757	59766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016792	GCTTT	2	10	59875	59884	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016792	GCTTT	2	10	59955	59964	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016792	GCTTT	2	10	60036	60045	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016792	GCTTT	2	10	60117	60126	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016792	CACAA	2	10	80145	80154	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016792	CATTC	2	10	80982	80991	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016792	ACAAA	2	10	84962	84971	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016792	AAAAT	2	10	85107	85116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016792	TTATT	2	10	88588	88597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016792	ATTTA	2	10	88646	88655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016792	TGATT	2	10	92665	92674	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016792	AGTTC	2	10	96494	96503	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016792	TTATT	2	10	97653	97662	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016792	ATAAA	2	10	111234	111243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016792	GAAAG	2	10	111247	111256	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016792	AAATC	2	10	111467	111476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016792	AATTC	2	10	117398	117407	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016792	AAAAG	2	10	125881	125890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016792	TAATT	2	10	126995	127004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016792	AAACA	2	10	127053	127062	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016792	CTTAC	2	10	127129	127138	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016792	AAATG	2	10	127681	127690	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016792	AAACA	2	10	129478	129487	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016792	AAGCT	2	10	130991	131000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016792	GGAGC	2	10	133003	133012	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016792	TTTTA	2	10	134080	134089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016792	TAAAT	2	10	139045	139054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016792	TTGTG	2	10	139235	139244	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016792	TTTTA	2	10	140080	140089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016792	TATAA	2	10	145010	145019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016792	AATAA	2	10	145037	145046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016792	GAACT	2	10	147934	147943	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016792	GTTAT	2	10	159767	159776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016792	AAATT	2	10	168063	168072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016792	TAAGT	2	10	170269	170278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016792	CATTT	2	10	170492	170501	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016792	TATTG	2	10	173326	173335	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016792	TCTAA	2	10	180976	180985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016792	ACTAC	2	10	181110	181119	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016792	CTAAA	2	10	182692	182701	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016792	TAAAT	2	10	199391	199400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016792	TTTTA	2	10	199439	199448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016792	AAAAG	2	10	205794	205803	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016792	TTCTT	2	10	208792	208801	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016792	TTAAT	2	10	224949	224958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016792	AAGAT	2	10	226046	226055	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016792	GTTAA	2	10	228624	228633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016792	TTTTC	2	10	230264	230273	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016792	CTAAA	2	10	248519	248528	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016792	TCTTT	2	10	252909	252918	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016792	CTAAA	2	10	253044	253053	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016792	TTATT	2	10	253196	253205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016792	ATTTT	2	10	254715	254724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016792	GTACA	2	10	255497	255506	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016792	TAAGA	2	10	255508	255517	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016792	TGTTA	2	10	255589	255598	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016792	CTTCA	2	10	261077	261086	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016792	AAATA	2	10	261651	261660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016792	TTATT	2	10	261684	261693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016792	TTTTA	2	10	262048	262057	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016792	AATTT	2	10	269871	269880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.