MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016792	TAAAA	2	10	707	716	80 %	20 %	0 %	0 %	376258300
2	NC_016792	AAGAA	2	10	1766	1775	80 %	0 %	20 %	0 %	376258302
3	NC_016792	TACAA	2	10	2149	2158	60 %	20 %	0 %	20 %	376258302
4	NC_016792	ATTTG	2	10	3077	3086	20 %	60 %	20 %	0 %	376258304
5	NC_016792	TTCTG	2	10	4248	4257	0 %	60 %	20 %	20 %	376258305
6	NC_016792	ATACG	2	10	5016	5025	40 %	20 %	20 %	20 %	376258306
7	NC_016792	GCATT	2	10	5234	5243	20 %	40 %	20 %	20 %	376258306
8	NC_016792	CATTC	2	10	6194	6203	20 %	40 %	0 %	40 %	376258306
9	NC_016792	TTCCT	2	10	8334	8343	0 %	60 %	0 %	40 %	376258308
10	NC_016792	TTGTT	2	10	10388	10397	0 %	80 %	20 %	0 %	376258309
11	NC_016792	CATTT	2	10	19289	19298	20 %	60 %	0 %	20 %	376258314
12	NC_016792	ATGAT	2	10	19338	19347	40 %	40 %	20 %	0 %	376258314
13	NC_016792	ATTTG	2	10	20246	20255	20 %	60 %	20 %	0 %	376258314
14	NC_016792	TTTCT	2	10	21571	21580	0 %	80 %	0 %	20 %	376258314
15	NC_016792	CGGTA	2	10	23060	23069	20 %	20 %	40 %	20 %	376258314
16	NC_016792	CGAAA	2	10	27267	27276	60 %	0 %	20 %	20 %	376258315
17	NC_016792	TTTCT	2	10	30123	30132	0 %	80 %	0 %	20 %	376258315
18	NC_016792	TCGCA	2	10	31074	31083	20 %	20 %	20 %	40 %	376258315
19	NC_016792	CTTTT	2	10	31884	31893	0 %	80 %	0 %	20 %	376258315
20	NC_016792	TTCAA	2	10	33364	33373	40 %	40 %	0 %	20 %	376258315
21	NC_016792	ATATT	2	10	35107	35116	40 %	60 %	0 %	0 %	376258317
22	NC_016792	AATTA	2	10	36788	36797	60 %	40 %	0 %	0 %	376258318
23	NC_016792	TTAAT	2	10	37327	37336	40 %	60 %	0 %	0 %	376258318
24	NC_016792	CTCTT	2	10	38976	38985	0 %	60 %	0 %	40 %	376258319
25	NC_016792	AGTTG	2	10	39359	39368	20 %	40 %	40 %	0 %	376258320
26	NC_016792	TATTG	2	10	39809	39818	20 %	60 %	20 %	0 %	376258321
27	NC_016792	AAAAT	2	10	41162	41171	80 %	20 %	0 %	0 %	376258322
28	NC_016792	CCATC	2	10	41275	41284	20 %	20 %	0 %	60 %	376258322
29	NC_016792	CTAAA	2	10	46292	46301	60 %	20 %	0 %	20 %	376258326
30	NC_016792	GTAAT	2	10	49872	49881	40 %	40 %	20 %	0 %	376258331
31	NC_016792	CAAGA	2	10	57370	57379	60 %	0 %	20 %	20 %	376258337
32	NC_016792	GTTTT	2	10	58060	58069	0 %	80 %	20 %	0 %	376258338
33	NC_016792	ATTGT	2	10	59047	59056	20 %	60 %	20 %	0 %	376258338
34	NC_016792	AGCCA	2	10	61070	61079	40 %	0 %	20 %	40 %	376258339
35	NC_016792	AAAAT	2	10	62562	62571	80 %	20 %	0 %	0 %	376258339
36	NC_016792	ATTTC	2	10	65447	65456	20 %	60 %	0 %	20 %	376258344
37	NC_016792	CCTTC	2	10	68156	68165	0 %	40 %	0 %	60 %	376258349
38	NC_016792	AAGAA	2	10	70725	70734	80 %	0 %	20 %	0 %	376258353
39	NC_016792	CTTTT	2	10	77292	77301	0 %	80 %	0 %	20 %	376258362
40	NC_016792	ATAAG	2	10	80759	80768	60 %	20 %	20 %	0 %	376258366
41	NC_016792	CACAA	2	10	81894	81903	60 %	0 %	0 %	40 %	376258368
42	NC_016792	TTTGC	2	10	82762	82771	0 %	60 %	20 %	20 %	376258370
43	NC_016792	GAAGC	2	10	86962	86971	40 %	0 %	40 %	20 %	376258374
44	NC_016792	ATGGA	2	10	87550	87559	40 %	20 %	40 %	0 %	376258374
45	NC_016792	GAAGT	2	10	89023	89032	40 %	20 %	40 %	0 %	376258375
46	NC_016792	TACGA	2	10	90161	90170	40 %	20 %	20 %	20 %	376258375
47	NC_016792	AGTAA	2	10	90402	90411	60 %	20 %	20 %	0 %	376258375
48	NC_016792	AAAGA	2	10	91992	92001	80 %	0 %	20 %	0 %	376258375
49	NC_016792	CTTCT	2	10	92966	92975	0 %	60 %	0 %	40 %	376258377
50	NC_016792	CTCTT	2	10	94930	94939	0 %	60 %	0 %	40 %	376258378
51	NC_016792	TTGAT	2	10	95017	95026	20 %	60 %	20 %	0 %	376258378
52	NC_016792	AACAA	2	10	97143	97152	80 %	0 %	0 %	20 %	376258380
53	NC_016792	GTGAT	2	10	102719	102728	20 %	40 %	40 %	0 %	376258384
54	NC_016792	ATTTT	2	10	103736	103745	20 %	80 %	0 %	0 %	376258384
55	NC_016792	AAAAG	2	10	104072	104081	80 %	0 %	20 %	0 %	376258384
56	NC_016792	AGTCT	2	10	107990	107999	20 %	40 %	20 %	20 %	376258388
57	NC_016792	TAGAT	2	10	108087	108096	40 %	40 %	20 %	0 %	376258388
58	NC_016792	GAAAA	2	10	108265	108274	80 %	0 %	20 %	0 %	376258388
59	NC_016792	AGAAA	2	10	112143	112152	80 %	0 %	20 %	0 %	376258393
60	NC_016792	AAGAA	2	10	112663	112672	80 %	0 %	20 %	0 %	376258394
61	NC_016792	TAGTA	2	10	114764	114773	40 %	40 %	20 %	0 %	376258396
62	NC_016792	ATTGC	2	10	116296	116305	20 %	40 %	20 %	20 %	376258397
63	NC_016792	GAATG	2	10	118164	118173	40 %	20 %	40 %	0 %	376258401
64	NC_016792	ATGAA	2	10	118259	118268	60 %	20 %	20 %	0 %	376258401
65	NC_016792	AAACC	2	10	118397	118406	60 %	0 %	0 %	40 %	376258401
66	NC_016792	ATTTG	2	10	126973	126982	20 %	60 %	20 %	0 %	376258416
67	NC_016792	ATTTG	2	10	131869	131878	20 %	60 %	20 %	0 %	376258426
68	NC_016792	CAGTA	2	10	134615	134624	40 %	20 %	20 %	20 %	376258430
69	NC_016792	AAATG	2	10	138214	138223	60 %	20 %	20 %	0 %	376258431
70	NC_016792	ATGGA	2	10	140558	140567	40 %	20 %	40 %	0 %	376258435
71	NC_016792	ATGAA	2	10	142389	142398	60 %	20 %	20 %	0 %	376258436
72	NC_016792	ATTCC	2	10	142448	142457	20 %	40 %	0 %	40 %	376258436
73	NC_016792	ACAAA	2	10	142818	142827	80 %	0 %	0 %	20 %	376258436
74	NC_016792	GAAAT	2	10	144928	144937	60 %	20 %	20 %	0 %	376258438
75	NC_016792	ATTTA	2	10	146477	146486	40 %	60 %	0 %	0 %	376258441
76	NC_016792	GTATG	2	10	148081	148090	20 %	40 %	40 %	0 %	376258443
77	NC_016792	ACTAA	2	10	148537	148546	60 %	20 %	0 %	20 %	376258444
78	NC_016792	ATTAG	2	10	148657	148666	40 %	40 %	20 %	0 %	376258444
79	NC_016792	TGAAG	2	10	150842	150851	40 %	20 %	40 %	0 %	376258445
80	NC_016792	TAACT	2	10	151421	151430	40 %	40 %	0 %	20 %	376258445
81	NC_016792	GATAA	2	10	151653	151662	60 %	20 %	20 %	0 %	376258446
82	NC_016792	AAACT	2	10	151770	151779	60 %	20 %	0 %	20 %	376258446
83	NC_016792	TAAAA	2	10	161386	161395	80 %	20 %	0 %	0 %	376258452
84	NC_016792	GTTTT	2	10	162464	162473	0 %	80 %	20 %	0 %	376258454
85	NC_016792	CCATA	2	10	164833	164842	40 %	20 %	0 %	40 %	376258456
86	NC_016792	TAAAG	2	10	165612	165621	60 %	20 %	20 %	0 %	376258457
87	NC_016792	ACCTG	2	10	167035	167044	20 %	20 %	20 %	40 %	376258458
88	NC_016792	ATTAT	2	10	167262	167271	40 %	60 %	0 %	0 %	376258458
89	NC_016792	TAATT	2	10	168810	168819	40 %	60 %	0 %	0 %	376258461
90	NC_016792	ATTCT	2	10	174985	174994	20 %	60 %	0 %	20 %	376258472
91	NC_016792	TCCTT	2	10	176089	176098	0 %	60 %	0 %	40 %	376258472
92	NC_016792	GGAGC	2	10	176540	176549	20 %	0 %	60 %	20 %	376258473
93	NC_016792	TTAAA	2	10	177368	177377	60 %	40 %	0 %	0 %	376258473
94	NC_016792	TTGGA	2	10	177669	177678	20 %	40 %	40 %	0 %	376258474
95	NC_016792	ATACT	2	10	179614	179623	40 %	40 %	0 %	20 %	376258476
96	NC_016792	GAAAA	2	10	182422	182431	80 %	0 %	20 %	0 %	376258479
97	NC_016792	ATTCC	2	10	185211	185220	20 %	40 %	0 %	40 %	376258482
98	NC_016792	CCAAT	2	10	185293	185302	40 %	20 %	0 %	40 %	376258482
99	NC_016792	TTCAC	2	10	192551	192560	20 %	40 %	0 %	40 %	376258490
100	NC_016792	ATTAA	2	10	194751	194760	60 %	40 %	0 %	0 %	376258493
101	NC_016792	GCTTA	2	10	195947	195956	20 %	40 %	20 %	20 %	376258495
102	NC_016792	GTTGT	2	10	196242	196251	0 %	60 %	40 %	0 %	376258495
103	NC_016792	CCTGT	2	10	198001	198010	0 %	40 %	20 %	40 %	376258495
104	NC_016792	CGTTT	2	10	198868	198877	0 %	60 %	20 %	20 %	376258496
105	NC_016792	GATGT	2	10	200058	200067	20 %	40 %	40 %	0 %	376258498
106	NC_016792	CGATT	2	10	200161	200170	20 %	40 %	20 %	20 %	376258498
107	NC_016792	CCCAA	2	10	200756	200765	40 %	0 %	0 %	60 %	376258499
108	NC_016792	AAGAA	2	10	201176	201185	80 %	0 %	20 %	0 %	376258501
109	NC_016792	TCAAA	2	10	201344	201353	60 %	20 %	0 %	20 %	376258501
110	NC_016792	TCAAT	2	10	202610	202619	40 %	40 %	0 %	20 %	376258502
111	NC_016792	GCAGA	2	10	202622	202631	40 %	0 %	40 %	20 %	376258502
112	NC_016792	TATGA	2	10	203074	203083	40 %	40 %	20 %	0 %	376258502
113	NC_016792	TTATT	2	10	206215	206224	20 %	80 %	0 %	0 %	376258509
114	NC_016792	AGGTA	2	10	211116	211125	40 %	20 %	40 %	0 %	376258517
115	NC_016792	TGAAA	2	10	211711	211720	60 %	20 %	20 %	0 %	376258518
116	NC_016792	TAGAG	2	10	213548	213557	40 %	20 %	40 %	0 %	376258519
117	NC_016792	TCTTT	2	10	215731	215740	0 %	80 %	0 %	20 %	376258520
118	NC_016792	GGAAT	2	10	216493	216502	40 %	20 %	40 %	0 %	376258521
119	NC_016792	AAAGA	2	10	221157	221166	80 %	0 %	20 %	0 %	376258525
120	NC_016792	TTGAT	2	10	224479	224488	20 %	60 %	20 %	0 %	376258528
121	NC_016792	TTGTT	2	10	226454	226463	0 %	80 %	20 %	0 %	376258529
122	NC_016792	AAAGG	2	10	227408	227417	60 %	0 %	40 %	0 %	376258530
123	NC_016792	TTTCT	2	10	228335	228344	0 %	80 %	0 %	20 %	376258531
124	NC_016792	AAATT	2	10	228486	228495	60 %	40 %	0 %	0 %	376258531
125	NC_016792	AAATG	2	10	228912	228921	60 %	20 %	20 %	0 %	376258532
126	NC_016792	AGCTG	2	10	230876	230885	20 %	20 %	40 %	20 %	376258534
127	NC_016792	GAATA	2	10	232244	232253	60 %	20 %	20 %	0 %	376258534
128	NC_016792	ATTGT	2	10	233427	233436	20 %	60 %	20 %	0 %	376258534
129	NC_016792	GAATC	2	10	234331	234340	40 %	20 %	20 %	20 %	376258534
130	NC_016792	ATTGG	2	10	234426	234435	20 %	40 %	40 %	0 %	376258534
131	NC_016792	AAGGT	2	10	237201	237210	40 %	20 %	40 %	0 %	376258534
132	NC_016792	CCGTT	2	10	238966	238975	0 %	40 %	20 %	40 %	376258534
133	NC_016792	GGATT	2	10	240139	240148	20 %	40 %	40 %	0 %	376258534
134	NC_016792	GGATT	2	10	240931	240940	20 %	40 %	40 %	0 %	376258534
135	NC_016792	GGAAT	2	10	240948	240957	40 %	20 %	40 %	0 %	376258534
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.