MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld

Total Repeats: 206

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016792	AAAT	2	8	1057	1064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016792	TGCT	2	8	11832	11839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016792	TTAG	2	8	12030	12037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016792	TTAC	2	8	12286	12293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016792	TACT	2	8	13368	13375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016792	AATA	2	8	13376	13383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016792	TTTA	2	8	13822	13829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016792	TCAG	2	8	13870	13877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016792	ATCT	2	8	34741	34748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016792	CATT	2	8	35803	35810	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016792	TTAA	2	8	35846	35853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016792	TATT	2	8	35929	35936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016792	TGAA	2	8	36560	36567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016792	TTAA	2	8	36673	36680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016792	TTTA	2	8	37601	37608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016792	TCAT	2	8	39558	39565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016792	AGGA	2	8	40695	40702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016792	TTAG	2	8	40875	40882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016792	AGTA	2	8	40988	40995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016792	TTTC	2	8	42514	42521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016792	TAAA	2	8	42629	42636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016792	TGAA	2	8	42826	42833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016792	AAAT	2	8	45255	45262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016792	ATTT	2	8	45305	45312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016792	TGTT	2	8	45318	45325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016792	TAAA	2	8	45372	45379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016792	ACAT	2	8	45472	45479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016792	TTTA	2	8	45599	45606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016792	TCAT	2	8	45684	45691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016792	TATG	2	8	45765	45772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016792	CTTT	2	8	46739	46746	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016792	TTAT	2	8	46783	46790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016792	ATAA	2	8	50002	50009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016792	AAAC	2	8	50027	50034	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016792	TGAT	2	8	50160	50167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016792	TCTA	2	8	50174	50181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016792	GCTA	2	8	50239	50246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016792	ACTT	2	8	53291	53298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016792	TAAA	2	8	53658	53665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016792	TTTG	2	8	53704	53711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016792	AAAT	2	8	54508	54515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016792	TAGA	2	8	54683	54690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016792	AATT	2	8	54710	54717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016792	TTCT	2	8	54746	54753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016792	ATTA	2	8	54821	54828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016792	ATCC	2	8	54836	54843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016792	TTAT	2	8	54847	54854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016792	TAAA	2	8	55239	55246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016792	ATAA	2	8	55657	55664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016792	AGTA	2	8	56363	56370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016792	TTTC	2	8	57082	57089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016792	CATT	2	8	57129	57136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016792	AACT	2	8	57167	57174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016792	ACAT	2	8	57928	57935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016792	ATGT	2	8	57937	57944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016792	TCTT	2	8	59795	59802	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016792	CTTT	2	8	59916	59923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016792	CTTT	2	8	60077	60084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016792	TTTC	2	8	60172	60179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016792	ATTT	2	8	60196	60203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016792	TACA	2	8	60259	60266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016792	ACTT	2	8	60358	60365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016792	TTCT	2	8	63099	63106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016792	ATAA	2	8	65202	65209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016792	TAGA	2	8	67676	67683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016792	ATTC	2	8	78897	78904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016792	ACTT	2	8	79072	79079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016792	TAAT	2	8	79960	79967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016792	AATA	2	8	80189	80196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016792	CTTA	2	8	80946	80953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016792	AACA	2	8	82559	82566	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016792	TTTA	2	8	84611	84618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016792	AATA	2	8	94085	94092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016792	CGGA	2	8	94272	94279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016792	ATTT	2	8	94350	94357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016792	TGTA	2	8	96298	96305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016792	TAAT	2	8	96384	96391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016792	TAAA	2	8	96599	96606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016792	TGAT	2	8	96746	96753	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016792	ATTC	2	8	97432	97439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016792	TCAT	2	8	99009	99016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016792	CTTA	2	8	99268	99275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016792	TTAT	2	8	99328	99335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016792	TGTA	2	8	101228	101235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016792	TAAT	2	8	101322	101329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016792	AGAA	2	8	101433	101440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016792	AATA	2	8	101443	101450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016792	TAAT	2	8	101467	101474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016792	AAAT	2	8	105071	105078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016792	TAAA	2	8	105084	105091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016792	ATTT	2	8	106670	106677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016792	GTTA	2	8	111012	111019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016792	ATTA	2	8	111291	111298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016792	AAAT	2	8	116806	116813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016792	CTCC	2	8	117355	117362	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_016792	GATA	2	8	117435	117442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016792	AAAT	2	8	119371	119378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016792	CTAT	2	8	121720	121727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016792	ATTA	2	8	121743	121750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016792	AATT	2	8	121971	121978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016792	GTAT	2	8	124120	124127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016792	CGAA	2	8	124243	124250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016792	AAAG	2	8	124987	124994	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016792	GGAG	2	8	125186	125193	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016792	CGGA	2	8	125777	125784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016792	TAAC	2	8	125981	125988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016792	ATAA	2	8	126485	126492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016792	ATTT	2	8	127892	127899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016792	GAAA	2	8	128258	128265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016792	TTGT	2	8	129164	129171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016792	CAAA	2	8	129573	129580	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016792	ACGA	2	8	129955	129962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016792	TGGT	2	8	132412	132419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016792	TTAG	2	8	132809	132816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016792	AATT	2	8	134408	134415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016792	TTTC	2	8	138328	138335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016792	ACAT	2	8	138386	138393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016792	GAAG	2	8	138711	138718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016792	ACAG	2	8	138814	138821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016792	GGAG	2	8	139063	139070	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016792	TATT	2	8	139195	139202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016792	ACAG	2	8	140025	140032	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016792	AAAG	2	8	143227	143234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016792	CTTT	2	8	143274	143281	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016792	AAAG	2	8	143322	143329	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016792	AAGA	2	8	143395	143402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016792	GTAA	2	8	143496	143503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016792	AAGT	2	8	144603	144610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016792	GAAG	2	8	144621	144628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016792	GGTG	2	8	148009	148016	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016792	GCTT	2	8	148306	148313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016792	ACTG	2	8	148441	148448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016792	AAGA	2	8	150621	150628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016792	AAGG	2	8	151632	151639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016792	ATTT	2	8	159283	159290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016792	AACA	2	8	159474	159481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016792	TAAA	2	8	160532	160539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016792	GATG	2	8	163267	163274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016792	GGAA	2	8	163459	163466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016792	TGTT	2	8	163843	163850	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016792	TCTA	2	8	165796	165803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016792	GAAA	2	8	165846	165853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016792	GAAA	2	8	167918	167925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016792	AGAA	2	8	168541	168548	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016792	TTAT	2	8	168967	168974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016792	CATT	2	8	170156	170163	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016792	ATAA	2	8	170169	170176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016792	ATAA	2	8	170215	170222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016792	AACG	2	8	170235	170242	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016792	AATT	2	8	170357	170364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016792	AATA	2	8	172202	172209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016792	AGAA	2	8	173244	173251	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016792	ATAA	2	8	173884	173891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016792	AATG	2	8	173997	174004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.