MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 3759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016791	AATAT	2	10	540	549	60 %	40 %	0 %	0 %	376259381
2	NC_016791	TCAAA	2	10	3671	3680	60 %	20 %	0 %	20 %	376259384
3	NC_016791	AAGGG	2	10	5149	5158	40 %	0 %	60 %	0 %	376259386
4	NC_016791	TGCAA	2	10	5509	5518	40 %	20 %	20 %	20 %	376259386
5	NC_016791	ATATT	2	10	8607	8616	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016791	TTTTA	2	10	8782	8791	20 %	80 %	0 %	0 %	376259389
7	NC_016791	GATTT	2	10	10582	10591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016791	AAATA	2	10	13492	13501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016791	ACTGA	2	10	14789	14798	40 %	20 %	20 %	20 %	376259396
10	NC_016791	CTTTA	2	10	14821	14830	20 %	60 %	0 %	20 %	376259396
11	NC_016791	ATGAA	2	10	16941	16950	60 %	20 %	20 %	0 %	376259396
12	NC_016791	ACTTT	2	10	17460	17469	20 %	60 %	0 %	20 %	376259397
13	NC_016791	AATTA	2	10	18707	18716	60 %	40 %	0 %	0 %	376259398
14	NC_016791	TCTTT	2	10	21295	21304	0 %	80 %	0 %	20 %	376259399
15	NC_016791	AACAA	2	10	22913	22922	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016791	TTTTA	2	10	24738	24747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016791	TGGAA	2	10	27323	27332	40 %	20 %	40 %	0 %	376259405
18	NC_016791	GACCT	2	10	27733	27742	20 %	20 %	20 %	40 %	376259405
19	NC_016791	AAGGC	2	10	28395	28404	40 %	0 %	40 %	20 %	376259406
20	NC_016791	GAGAA	2	10	31635	31644	60 %	0 %	40 %	0 %	376259409
21	NC_016791	TATAA	2	10	33746	33755	60 %	40 %	0 %	0 %	376259410
22	NC_016791	ATTTT	2	10	33789	33798	20 %	80 %	0 %	0 %	376259410
23	NC_016791	GGCAA	2	10	34299	34308	40 %	0 %	40 %	20 %	376259411
24	NC_016791	ACAGA	2	10	36720	36729	60 %	0 %	20 %	20 %	376259413
25	NC_016791	GGAAC	2	10	38089	38098	40 %	0 %	40 %	20 %	376259414
26	NC_016791	GGTTG	2	10	38158	38167	0 %	40 %	60 %	0 %	376259414
27	NC_016791	CTATG	2	10	38314	38323	20 %	40 %	20 %	20 %	376259414
28	NC_016791	TCATA	2	10	39461	39470	40 %	40 %	0 %	20 %	376259415
29	NC_016791	AGAGA	2	10	43195	43204	60 %	0 %	40 %	0 %	376259419
30	NC_016791	ATATT	2	10	45837	45846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016791	GATAT	2	10	46109	46118	40 %	40 %	20 %	0 %	376259424
32	NC_016791	ATTAT	2	10	47428	47437	40 %	60 %	0 %	0 %	376259425
33	NC_016791	AGTAA	2	10	48938	48947	60 %	20 %	20 %	0 %	376259426
34	NC_016791	ATATT	2	10	49189	49198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016791	AAATT	2	10	50859	50868	60 %	40 %	0 %	0 %	376259427
36	NC_016791	GGTTT	2	10	51243	51252	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016791	ATTTT	2	10	51933	51942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016791	CCAAC	2	10	52291	52300	40 %	0 %	0 %	60 %	376259429
39	NC_016791	TAGTA	2	10	53568	53577	40 %	40 %	20 %	0 %	376259429
40	NC_016791	TTTTA	2	10	53720	53729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016791	TATCT	2	10	54383	54392	20 %	60 %	0 %	20 %	376259430
42	NC_016791	AATAA	2	10	60425	60434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016791	GGGAA	2	10	60794	60803	40 %	0 %	60 %	0 %	376259435
44	NC_016791	AAAGG	2	10	65645	65654	60 %	0 %	40 %	0 %	376259437
45	NC_016791	TAAAC	2	10	69447	69456	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016791	CAATT	2	10	69631	69640	40 %	40 %	0 %	20 %	376259440
47	NC_016791	TAAAA	2	10	69960	69969	80 %	20 %	0 %	0 %	376259440
48	NC_016791	TCAGC	2	10	71368	71377	20 %	20 %	20 %	40 %	376259443
49	NC_016791	TAAAT	2	10	73293	73302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016791	AAGTT	2	10	73783	73792	40 %	40 %	20 %	0 %	376259447
51	NC_016791	ATTCT	2	10	75557	75566	20 %	60 %	0 %	20 %	376259448
52	NC_016791	ATATT	2	10	75728	75737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016791	GATAA	2	10	75791	75800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016791	GGAAA	2	10	75926	75935	60 %	0 %	40 %	0 %	376259449
55	NC_016791	CAGAT	2	10	79298	79307	40 %	20 %	20 %	20 %	376259452
56	NC_016791	AGCCC	2	10	80241	80250	20 %	0 %	20 %	60 %	376259454
57	NC_016791	AAATA	2	10	82761	82770	80 %	20 %	0 %	0 %	376259455
58	NC_016791	TAATA	2	10	83467	83476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016791	AATAG	2	10	83505	83514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016791	AATTG	2	10	83835	83844	40 %	40 %	20 %	0 %	376259457
61	NC_016791	TGTAT	2	10	84433	84442	20 %	60 %	20 %	0 %	376259457
62	NC_016791	GTATG	2	10	85209	85218	20 %	40 %	40 %	0 %	376259457
63	NC_016791	TAAAT	2	10	85985	85994	60 %	40 %	0 %	0 %	376259459
64	NC_016791	GAAGA	2	10	87390	87399	60 %	0 %	40 %	0 %	376259460
65	NC_016791	AAGAA	2	10	87442	87451	80 %	0 %	20 %	0 %	376259460
66	NC_016791	GTTAA	2	10	89648	89657	40 %	40 %	20 %	0 %	376259462
67	NC_016791	GCAGA	2	10	90963	90972	40 %	0 %	40 %	20 %	376259463
68	NC_016791	TGGGT	2	10	92950	92959	0 %	40 %	60 %	0 %	376259467
69	NC_016791	AGAGG	2	10	93623	93632	40 %	0 %	60 %	0 %	376259467
70	NC_016791	TATAA	2	10	93785	93794	60 %	40 %	0 %	0 %	376259467
71	NC_016791	TTAAG	2	10	94482	94491	40 %	40 %	20 %	0 %	376259467
72	NC_016791	AGAAT	2	10	97294	97303	60 %	20 %	20 %	0 %	376259469
73	NC_016791	ACAAT	2	10	100315	100324	60 %	20 %	0 %	20 %	376259474
74	NC_016791	CAGAA	2	10	100527	100536	60 %	0 %	20 %	20 %	376259474
75	NC_016791	AAAAT	2	10	100606	100615	80 %	20 %	0 %	0 %	376259474
76	NC_016791	GATAA	2	10	101827	101836	60 %	20 %	20 %	0 %	376259476
77	NC_016791	TAAAA	2	10	102327	102336	80 %	20 %	0 %	0 %	376259476
78	NC_016791	TGGTT	2	10	104158	104167	0 %	60 %	40 %	0 %	376259477
79	NC_016791	AAGGT	2	10	104967	104976	40 %	20 %	40 %	0 %	376259478
80	NC_016791	ATGGG	2	10	107478	107487	20 %	20 %	60 %	0 %	376259480
81	NC_016791	TGGAT	2	10	108456	108465	20 %	40 %	40 %	0 %	376259481
82	NC_016791	GAAAA	2	10	110350	110359	80 %	0 %	20 %	0 %	376259482
83	NC_016791	TTGCA	2	10	115340	115349	20 %	40 %	20 %	20 %	376259487
84	NC_016791	CAATT	2	10	117659	117668	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016791	AAATT	2	10	118282	118291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016791	TTCAC	2	10	118743	118752	20 %	40 %	0 %	40 %	376259495
87	NC_016791	ACAGG	2	10	118992	119001	40 %	0 %	40 %	20 %	376259495
88	NC_016791	GGACG	2	10	119109	119118	20 %	0 %	60 %	20 %	376259495
89	NC_016791	AAAGT	2	10	122549	122558	60 %	20 %	20 %	0 %	376259497
90	NC_016791	TTTTA	2	10	123701	123710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016791	GCAGG	2	10	126473	126482	20 %	0 %	60 %	20 %	376259501
92	NC_016791	AAAAC	2	10	128378	128387	80 %	0 %	0 %	20 %	376259503
93	NC_016791	TATTT	2	10	128479	128488	20 %	80 %	0 %	0 %	376259503
94	NC_016791	TTATT	2	10	129049	129058	20 %	80 %	0 %	0 %	376259504
95	NC_016791	GATAT	2	10	130076	130085	40 %	40 %	20 %	0 %	376259505
96	NC_016791	AAAAG	2	10	133268	133277	80 %	0 %	20 %	0 %	376259507
97	NC_016791	CGGGG	2	10	134003	134012	0 %	0 %	80 %	20 %	376259508
98	NC_016791	TTGAA	2	10	137031	137040	40 %	40 %	20 %	0 %	376259511
99	NC_016791	CTTCT	2	10	137918	137927	0 %	60 %	0 %	40 %	376259512
100	NC_016791	ATGAA	2	10	138324	138333	60 %	20 %	20 %	0 %	376259512
101	NC_016791	GAAAA	2	10	139142	139151	80 %	0 %	20 %	0 %	376259513
102	NC_016791	ATGAA	2	10	139890	139899	60 %	20 %	20 %	0 %	376259513
103	NC_016791	TAAAA	2	10	140442	140451	80 %	20 %	0 %	0 %	376259513
104	NC_016791	GACAG	2	10	143273	143282	40 %	0 %	40 %	20 %	376259515
105	NC_016791	GGAAC	2	10	143286	143295	40 %	0 %	40 %	20 %	376259515
106	NC_016791	AGTAA	2	10	144953	144962	60 %	20 %	20 %	0 %	376259516
107	NC_016791	AATCA	2	10	145323	145332	60 %	20 %	0 %	20 %	376259517
108	NC_016791	AAATA	2	10	145491	145500	80 %	20 %	0 %	0 %	376259517
109	NC_016791	TTCAT	2	10	147712	147721	20 %	60 %	0 %	20 %	376259518
110	NC_016791	ATCAA	2	10	149795	149804	60 %	20 %	0 %	20 %	376259519
111	NC_016791	ATTGG	2	10	154814	154823	20 %	40 %	40 %	0 %	376259523
112	NC_016791	ACAAA	2	10	156744	156753	80 %	0 %	0 %	20 %	376259524
113	NC_016791	AACAG	2	10	156993	157002	60 %	0 %	20 %	20 %	376259524
114	NC_016791	ACAAG	2	10	157133	157142	60 %	0 %	20 %	20 %	376259524
115	NC_016791	ATTAT	2	10	157863	157872	40 %	60 %	0 %	0 %	376259525
116	NC_016791	TTGAA	2	10	160471	160480	40 %	40 %	20 %	0 %	376259527
117	NC_016791	CAGAT	2	10	165140	165149	40 %	20 %	20 %	20 %	376259530
118	NC_016791	TTTCA	2	10	168682	168691	20 %	60 %	0 %	20 %	376259533
119	NC_016791	TTCAA	2	10	169233	169242	40 %	40 %	0 %	20 %	376259533
120	NC_016791	AAACC	2	10	170891	170900	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016791	TATAA	2	10	171097	171106	60 %	40 %	0 %	0 %	376259535
122	NC_016791	AATAC	2	10	175041	175050	60 %	20 %	0 %	20 %	376259536
123	NC_016791	ACTTG	2	10	177056	177065	20 %	40 %	20 %	20 %	376259539
124	NC_016791	AGAAA	2	10	178329	178338	80 %	0 %	20 %	0 %	376259541
125	NC_016791	TTTTA	2	10	178437	178446	20 %	80 %	0 %	0 %	376259541
126	NC_016791	GAAGA	2	10	180058	180067	60 %	0 %	40 %	0 %	376259543
127	NC_016791	TTAAT	2	10	184813	184822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016791	CTAAA	2	10	185813	185822	60 %	20 %	0 %	20 %	376259551
129	NC_016791	ATTGG	2	10	186917	186926	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016791	ATTAC	2	10	187420	187429	40 %	40 %	0 %	20 %	376259552
131	NC_016791	ACCTG	2	10	188719	188728	20 %	20 %	20 %	40 %	376259553
132	NC_016791	ATTAC	2	10	191803	191812	40 %	40 %	0 %	20 %	376259557
133	NC_016791	TAATA	2	10	193437	193446	60 %	40 %	0 %	0 %	376259557
134	NC_016791	TGAAA	2	10	193530	193539	60 %	20 %	20 %	0 %	376259557
135	NC_016791	GAGAA	2	10	195655	195664	60 %	0 %	40 %	0 %	376259559
136	NC_016791	GGAAG	2	10	195841	195850	40 %	0 %	60 %	0 %	376259559
137	NC_016791	TTACA	2	10	197602	197611	40 %	40 %	0 %	20 %	376259561
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