MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 3050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016791	AATAT	2	10	540	549	60 %	40 %	0 %	0 %	376259381
2	NC_016791	TCAAA	2	10	3671	3680	60 %	20 %	0 %	20 %	376259384
3	NC_016791	AAGGG	2	10	5149	5158	40 %	0 %	60 %	0 %	376259386
4	NC_016791	TGCAA	2	10	5509	5518	40 %	20 %	20 %	20 %	376259386
5	NC_016791	TTTTA	2	10	8782	8791	20 %	80 %	0 %	0 %	376259389
6	NC_016791	ACTGA	2	10	14789	14798	40 %	20 %	20 %	20 %	376259396
7	NC_016791	CTTTA	2	10	14821	14830	20 %	60 %	0 %	20 %	376259396
8	NC_016791	ATGAA	2	10	16941	16950	60 %	20 %	20 %	0 %	376259396
9	NC_016791	ACTTT	2	10	17460	17469	20 %	60 %	0 %	20 %	376259397
10	NC_016791	AATTA	2	10	18707	18716	60 %	40 %	0 %	0 %	376259398
11	NC_016791	TCTTT	2	10	21295	21304	0 %	80 %	0 %	20 %	376259399
12	NC_016791	TGGAA	2	10	27323	27332	40 %	20 %	40 %	0 %	376259405
13	NC_016791	GACCT	2	10	27733	27742	20 %	20 %	20 %	40 %	376259405
14	NC_016791	AAGGC	2	10	28395	28404	40 %	0 %	40 %	20 %	376259406
15	NC_016791	GAGAA	2	10	31635	31644	60 %	0 %	40 %	0 %	376259409
16	NC_016791	TATAA	2	10	33746	33755	60 %	40 %	0 %	0 %	376259410
17	NC_016791	ATTTT	2	10	33789	33798	20 %	80 %	0 %	0 %	376259410
18	NC_016791	GGCAA	2	10	34299	34308	40 %	0 %	40 %	20 %	376259411
19	NC_016791	ACAGA	2	10	36720	36729	60 %	0 %	20 %	20 %	376259413
20	NC_016791	GGAAC	2	10	38089	38098	40 %	0 %	40 %	20 %	376259414
21	NC_016791	GGTTG	2	10	38158	38167	0 %	40 %	60 %	0 %	376259414
22	NC_016791	CTATG	2	10	38314	38323	20 %	40 %	20 %	20 %	376259414
23	NC_016791	TCATA	2	10	39461	39470	40 %	40 %	0 %	20 %	376259415
24	NC_016791	AGAGA	2	10	43195	43204	60 %	0 %	40 %	0 %	376259419
25	NC_016791	GATAT	2	10	46109	46118	40 %	40 %	20 %	0 %	376259424
26	NC_016791	ATTAT	2	10	47428	47437	40 %	60 %	0 %	0 %	376259425
27	NC_016791	AGTAA	2	10	48938	48947	60 %	20 %	20 %	0 %	376259426
28	NC_016791	AAATT	2	10	50859	50868	60 %	40 %	0 %	0 %	376259427
29	NC_016791	CCAAC	2	10	52291	52300	40 %	0 %	0 %	60 %	376259429
30	NC_016791	TAGTA	2	10	53568	53577	40 %	40 %	20 %	0 %	376259429
31	NC_016791	TATCT	2	10	54383	54392	20 %	60 %	0 %	20 %	376259430
32	NC_016791	GGGAA	2	10	60794	60803	40 %	0 %	60 %	0 %	376259435
33	NC_016791	AAAGG	2	10	65645	65654	60 %	0 %	40 %	0 %	376259437
34	NC_016791	CAATT	2	10	69631	69640	40 %	40 %	0 %	20 %	376259440
35	NC_016791	TAAAA	2	10	69960	69969	80 %	20 %	0 %	0 %	376259440
36	NC_016791	TCAGC	2	10	71368	71377	20 %	20 %	20 %	40 %	376259443
37	NC_016791	AAGTT	2	10	73783	73792	40 %	40 %	20 %	0 %	376259447
38	NC_016791	ATTCT	2	10	75557	75566	20 %	60 %	0 %	20 %	376259448
39	NC_016791	GGAAA	2	10	75926	75935	60 %	0 %	40 %	0 %	376259449
40	NC_016791	CAGAT	2	10	79298	79307	40 %	20 %	20 %	20 %	376259452
41	NC_016791	AGCCC	2	10	80241	80250	20 %	0 %	20 %	60 %	376259454
42	NC_016791	AAATA	2	10	82761	82770	80 %	20 %	0 %	0 %	376259455
43	NC_016791	AATTG	2	10	83835	83844	40 %	40 %	20 %	0 %	376259457
44	NC_016791	TGTAT	2	10	84433	84442	20 %	60 %	20 %	0 %	376259457
45	NC_016791	GTATG	2	10	85209	85218	20 %	40 %	40 %	0 %	376259457
46	NC_016791	TAAAT	2	10	85985	85994	60 %	40 %	0 %	0 %	376259459
47	NC_016791	GAAGA	2	10	87390	87399	60 %	0 %	40 %	0 %	376259460
48	NC_016791	AAGAA	2	10	87442	87451	80 %	0 %	20 %	0 %	376259460
49	NC_016791	GTTAA	2	10	89648	89657	40 %	40 %	20 %	0 %	376259462
50	NC_016791	GCAGA	2	10	90963	90972	40 %	0 %	40 %	20 %	376259463
51	NC_016791	TGGGT	2	10	92950	92959	0 %	40 %	60 %	0 %	376259467
52	NC_016791	AGAGG	2	10	93623	93632	40 %	0 %	60 %	0 %	376259467
53	NC_016791	TATAA	2	10	93785	93794	60 %	40 %	0 %	0 %	376259467
54	NC_016791	TTAAG	2	10	94482	94491	40 %	40 %	20 %	0 %	376259467
55	NC_016791	AGAAT	2	10	97294	97303	60 %	20 %	20 %	0 %	376259469
56	NC_016791	ACAAT	2	10	100315	100324	60 %	20 %	0 %	20 %	376259474
57	NC_016791	CAGAA	2	10	100527	100536	60 %	0 %	20 %	20 %	376259474
58	NC_016791	AAAAT	2	10	100606	100615	80 %	20 %	0 %	0 %	376259474
59	NC_016791	GATAA	2	10	101827	101836	60 %	20 %	20 %	0 %	376259476
60	NC_016791	TAAAA	2	10	102327	102336	80 %	20 %	0 %	0 %	376259476
61	NC_016791	TGGTT	2	10	104158	104167	0 %	60 %	40 %	0 %	376259477
62	NC_016791	AAGGT	2	10	104967	104976	40 %	20 %	40 %	0 %	376259478
63	NC_016791	ATGGG	2	10	107478	107487	20 %	20 %	60 %	0 %	376259480
64	NC_016791	TGGAT	2	10	108456	108465	20 %	40 %	40 %	0 %	376259481
65	NC_016791	GAAAA	2	10	110350	110359	80 %	0 %	20 %	0 %	376259482
66	NC_016791	TTGCA	2	10	115340	115349	20 %	40 %	20 %	20 %	376259487
67	NC_016791	TTCAC	2	10	118743	118752	20 %	40 %	0 %	40 %	376259495
68	NC_016791	ACAGG	2	10	118992	119001	40 %	0 %	40 %	20 %	376259495
69	NC_016791	GGACG	2	10	119109	119118	20 %	0 %	60 %	20 %	376259495
70	NC_016791	AAAGT	2	10	122549	122558	60 %	20 %	20 %	0 %	376259497
71	NC_016791	GCAGG	2	10	126473	126482	20 %	0 %	60 %	20 %	376259501
72	NC_016791	AAAAC	2	10	128378	128387	80 %	0 %	0 %	20 %	376259503
73	NC_016791	TATTT	2	10	128479	128488	20 %	80 %	0 %	0 %	376259503
74	NC_016791	TTATT	2	10	129049	129058	20 %	80 %	0 %	0 %	376259504
75	NC_016791	GATAT	2	10	130076	130085	40 %	40 %	20 %	0 %	376259505
76	NC_016791	AAAAG	2	10	133268	133277	80 %	0 %	20 %	0 %	376259507
77	NC_016791	CGGGG	2	10	134003	134012	0 %	0 %	80 %	20 %	376259508
78	NC_016791	TTGAA	2	10	137031	137040	40 %	40 %	20 %	0 %	376259511
79	NC_016791	CTTCT	2	10	137918	137927	0 %	60 %	0 %	40 %	376259512
80	NC_016791	ATGAA	2	10	138324	138333	60 %	20 %	20 %	0 %	376259512
81	NC_016791	GAAAA	2	10	139142	139151	80 %	0 %	20 %	0 %	376259513
82	NC_016791	ATGAA	2	10	139890	139899	60 %	20 %	20 %	0 %	376259513
83	NC_016791	TAAAA	2	10	140442	140451	80 %	20 %	0 %	0 %	376259513
84	NC_016791	GACAG	2	10	143273	143282	40 %	0 %	40 %	20 %	376259515
85	NC_016791	GGAAC	2	10	143286	143295	40 %	0 %	40 %	20 %	376259515
86	NC_016791	AGTAA	2	10	144953	144962	60 %	20 %	20 %	0 %	376259516
87	NC_016791	AATCA	2	10	145323	145332	60 %	20 %	0 %	20 %	376259517
88	NC_016791	AAATA	2	10	145491	145500	80 %	20 %	0 %	0 %	376259517
89	NC_016791	TTCAT	2	10	147712	147721	20 %	60 %	0 %	20 %	376259518
90	NC_016791	ATCAA	2	10	149795	149804	60 %	20 %	0 %	20 %	376259519
91	NC_016791	ATTGG	2	10	154814	154823	20 %	40 %	40 %	0 %	376259523
92	NC_016791	ACAAA	2	10	156744	156753	80 %	0 %	0 %	20 %	376259524
93	NC_016791	AACAG	2	10	156993	157002	60 %	0 %	20 %	20 %	376259524
94	NC_016791	ACAAG	2	10	157133	157142	60 %	0 %	20 %	20 %	376259524
95	NC_016791	ATTAT	2	10	157863	157872	40 %	60 %	0 %	0 %	376259525
96	NC_016791	TTGAA	2	10	160471	160480	40 %	40 %	20 %	0 %	376259527
97	NC_016791	CAGAT	2	10	165140	165149	40 %	20 %	20 %	20 %	376259530
98	NC_016791	TTTCA	2	10	168682	168691	20 %	60 %	0 %	20 %	376259533
99	NC_016791	TTCAA	2	10	169233	169242	40 %	40 %	0 %	20 %	376259533
100	NC_016791	TATAA	2	10	171097	171106	60 %	40 %	0 %	0 %	376259535
101	NC_016791	AATAC	2	10	175041	175050	60 %	20 %	0 %	20 %	376259536
102	NC_016791	ACTTG	2	10	177056	177065	20 %	40 %	20 %	20 %	376259539
103	NC_016791	AGAAA	2	10	178329	178338	80 %	0 %	20 %	0 %	376259541
104	NC_016791	TTTTA	2	10	178437	178446	20 %	80 %	0 %	0 %	376259541
105	NC_016791	GAAGA	2	10	180058	180067	60 %	0 %	40 %	0 %	376259543
106	NC_016791	CTAAA	2	10	185813	185822	60 %	20 %	0 %	20 %	376259551
107	NC_016791	ATTAC	2	10	187420	187429	40 %	40 %	0 %	20 %	376259552
108	NC_016791	ACCTG	2	10	188719	188728	20 %	20 %	20 %	40 %	376259553
109	NC_016791	ATTAC	2	10	191803	191812	40 %	40 %	0 %	20 %	376259557
110	NC_016791	TAATA	2	10	193437	193446	60 %	40 %	0 %	0 %	376259557
111	NC_016791	TGAAA	2	10	193530	193539	60 %	20 %	20 %	0 %	376259557
112	NC_016791	GAGAA	2	10	195655	195664	60 %	0 %	40 %	0 %	376259559
113	NC_016791	GGAAG	2	10	195841	195850	40 %	0 %	60 %	0 %	376259559
114	NC_016791	TTACA	2	10	197602	197611	40 %	40 %	0 %	20 %	376259561
115	NC_016791	AACAG	2	10	198052	198061	60 %	0 %	20 %	20 %	376259562
116	NC_016791	TAAAA	2	10	200919	200928	80 %	20 %	0 %	0 %	376259564
117	NC_016791	TATGT	2	10	201649	201658	20 %	60 %	20 %	0 %	376259565
118	NC_016791	ATTTA	2	10	203987	203996	40 %	60 %	0 %	0 %	376259568
119	NC_016791	CAAAA	2	10	205168	205177	80 %	0 %	0 %	20 %	376259569
120	NC_016791	CATTC	2	10	207017	207026	20 %	40 %	0 %	40 %	376259573
121	NC_016791	AATTT	2	10	210075	210084	40 %	60 %	0 %	0 %	376259575
122	NC_016791	ATATT	2	10	210820	210829	40 %	60 %	0 %	0 %	376259575
123	NC_016791	CTTTA	2	10	213612	213621	20 %	60 %	0 %	20 %	376259578
124	NC_016791	TCTGT	2	10	213902	213911	0 %	60 %	20 %	20 %	376259578
125	NC_016791	TCCAA	2	10	216353	216362	40 %	20 %	0 %	40 %	376259579
126	NC_016791	GATTT	2	10	217953	217962	20 %	60 %	20 %	0 %	376259580
127	NC_016791	TTTTC	2	10	218125	218134	0 %	80 %	0 %	20 %	376259580
128	NC_016791	AAAGC	2	10	219675	219684	60 %	0 %	20 %	20 %	376259581
129	NC_016791	AATGT	2	10	220606	220615	40 %	40 %	20 %	0 %	376259582
130	NC_016791	CCTTT	2	10	222159	222168	0 %	60 %	0 %	40 %	376259583
131	NC_016791	TTTTC	2	10	223011	223020	0 %	80 %	0 %	20 %	376259584
132	NC_016791	ACCAG	2	10	237656	237665	40 %	0 %	20 %	40 %	376259595
133	NC_016791	GAACA	2	10	237812	237821	60 %	0 %	20 %	20 %	376259595
134	NC_016791	ATGAA	2	10	240404	240413	60 %	20 %	20 %	0 %	376259597
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