MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 1849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016791	TTAT	2	8	253	260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016791	AATA	2	8	4377	4384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016791	AAAT	2	8	6800	6807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016791	ATAG	2	8	10055	10062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016791	TGCC	2	8	10510	10517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016791	TAAT	2	8	11358	11365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016791	TAAT	2	8	11385	11392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016791	GGAT	2	8	11463	11470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016791	TAAA	2	8	19679	19686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016791	TTAT	2	8	22169	22176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016791	TATT	2	8	24765	24772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016791	TAAA	2	8	24859	24866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016791	TTTA	2	8	28221	28228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016791	TTAT	2	8	48989	48996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016791	TACT	2	8	49121	49128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016791	TAAT	2	8	49283	49290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016791	TTTA	2	8	49340	49347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016791	CTTT	2	8	51231	51238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016791	TTAA	2	8	51294	51301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016791	CAAT	2	8	57979	57986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016791	ATTA	2	8	58253	58260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016791	ACAA	2	8	60292	60299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016791	GGGA	2	8	61692	61699	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016791	ATTT	2	8	69611	69618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016791	AAAT	2	8	71194	71201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016791	GAAA	2	8	73303	73310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016791	TTTA	2	8	74923	74930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016791	TAAA	2	8	86041	86048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016791	TAAT	2	8	86233	86240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016791	TTTA	2	8	86245	86252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016791	GGGA	2	8	91286	91293	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016791	AACT	2	8	91714	91721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016791	ATTT	2	8	91775	91782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016791	TAAA	2	8	91820	91827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016791	TCTA	2	8	92192	92199	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016791	CAGA	2	8	92733	92740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016791	CCGG	2	8	98953	98960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016791	ATAC	2	8	101243	101250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016791	TATT	2	8	104530	104537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016791	AATA	2	8	105106	105113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016791	TTTA	2	8	107728	107735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016791	GGAA	2	8	107783	107790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016791	AAAT	2	8	119311	119318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016791	TATT	2	8	127425	127432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016791	TTAA	2	8	138585	138592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016791	ATTG	2	8	138621	138628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016791	TGGT	2	8	143684	143691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016791	TGGA	2	8	143742	143749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016791	CAAT	2	8	149058	149065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016791	ATTA	2	8	149089	149096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016791	GAAA	2	8	159685	159692	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016791	ATAA	2	8	160547	160554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016791	ATTA	2	8	167463	167470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016791	AAAG	2	8	173990	173997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016791	TTCT	2	8	180954	180961	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016791	GTTT	2	8	181431	181438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016791	TAAA	2	8	183801	183808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016791	ATTT	2	8	189900	189907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016791	TAAA	2	8	196400	196407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016791	AGTT	2	8	196854	196861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016791	AGTA	2	8	196878	196885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016791	GGGA	2	8	200955	200962	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016791	GGCT	2	8	205749	205756	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016791	TCCT	2	8	206487	206494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016791	GACT	2	8	211173	211180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016791	CACC	2	8	215642	215649	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_016791	GTAT	2	8	216038	216045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016791	TTTG	2	8	225755	225762	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016791	GAAG	2	8	225831	225838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016791	TAAT	2	8	230047	230054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016791	TGTA	2	8	237285	237292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016791	TATG	2	8	237367	237374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016791	ATTT	2	8	239480	239487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016791	AAAT	2	8	240134	240141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016791	CATT	2	8	247152	247159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016791	TTTG	2	8	247234	247241	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016791	ATTT	2	8	249614	249621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016791	AAAT	2	8	254565	254572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016791	AATA	2	8	254577	254584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016791	AATA	2	8	256940	256947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016791	GTGC	2	8	260388	260395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016791	GAAT	2	8	262036	262043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016791	ACTC	2	8	268133	268140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016791	ATTA	2	8	268183	268190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016791	CCTT	2	8	275064	275071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016791	TTAC	2	8	275093	275100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016791	ATGA	2	8	275111	275118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016791	AATA	2	8	279177	279184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016791	TGCC	2	8	279389	279396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016791	GGAA	2	8	279460	279467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016791	GTAG	2	8	279622	279629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016791	AAAT	2	8	282447	282454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016791	TTAC	2	8	282793	282800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016791	TAAA	2	8	292445	292452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016791	TTAA	2	8	293992	293999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016791	TTAA	2	8	294043	294050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016791	TAAA	2	8	297018	297025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016791	CCTC	2	8	301195	301202	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_016791	TGCA	2	8	305401	305408	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016791	TACT	2	8	305600	305607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016791	TAAA	2	8	312480	312487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016791	ACAG	2	8	321416	321423	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016791	TGAC	2	8	321666	321673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016791	ATTA	2	8	321791	321798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016791	ATGG	2	8	322234	322241	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016791	ATAC	2	8	322644	322651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016791	AATA	2	8	323786	323793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016791	ATAA	2	8	323899	323906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016791	TGTA	2	8	328991	328998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016791	TTGA	2	8	333938	333945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016791	TGTA	2	8	344714	344721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016791	TAAT	2	8	344905	344912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016791	ACTT	2	8	344925	344932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016791	AAAT	2	8	350828	350835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016791	AATT	2	8	350914	350921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016791	AATT	2	8	353567	353574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016791	TTTA	2	8	353583	353590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016791	AAGG	2	8	364456	364463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016791	ATTG	2	8	373229	373236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016791	AATT	2	8	373269	373276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016791	CAAA	2	8	373297	373304	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016791	ATAA	2	8	373327	373334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016791	TGAT	2	8	382165	382172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016791	TATT	3	12	382556	382567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016791	TAAA	2	8	385959	385966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016791	TAAA	2	8	390949	390956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016791	AAAG	2	8	397248	397255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016791	TGTA	2	8	398740	398747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016791	AAAG	2	8	400782	400789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016791	ATTA	2	8	405300	405307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016791	ATTT	2	8	408272	408279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016791	GAAT	2	8	415805	415812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016791	CAGG	2	8	421676	421683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016791	TTTA	2	8	431252	431259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016791	ATAA	2	8	431294	431301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016791	TTTG	2	8	433855	433862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016791	AAAT	2	8	436452	436459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016791	AATA	2	8	437644	437651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016791	AATA	2	8	437669	437676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016791	TAAA	2	8	440602	440609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016791	ATTA	2	8	442667	442674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016791	GTAT	2	8	443952	443959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016791	ATAC	2	8	443981	443988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016791	GGGT	2	8	449068	449075	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016791	AGGG	2	8	452797	452804	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016791	TGAA	2	8	452831	452838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016791	AGAA	2	8	452873	452880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016791	AGGA	2	8	452881	452888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016791	AAAT	2	8	456566	456573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016791	AAGG	2	8	458570	458577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_016791	ACAA	2	8	463383	463390	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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