MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 7624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016791	TTA	2	6	100	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016791	TTG	2	6	110	115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016791	GTT	2	6	143	148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016791	ATT	2	6	284	289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016791	TTA	2	6	1766	1771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016791	CTA	3	9	1831	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016791	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016791	ACG	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016791	TAA	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016791	GGA	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016791	AAT	2	6	9256	9261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016791	GTA	2	6	9269	9274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016791	TAT	2	6	10093	10098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016791	CTT	2	6	10376	10381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016791	CTT	2	6	10535	10540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016791	TTA	2	6	10602	10607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016791	ATA	2	6	10616	10621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016791	AAT	2	6	10707	10712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016791	ATT	2	6	11277	11282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016791	TAT	2	6	11404	11409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016791	ACT	2	6	12158	12163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016791	TAT	2	6	12750	12755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016791	AAT	2	6	13416	13421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016791	TAG	2	6	13425	13430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016791	TGT	2	6	13542	13547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016791	TTA	2	6	13631	13636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016791	AGG	2	6	13637	13642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016791	TGC	2	6	18599	18604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016791	TTA	2	6	18615	18620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016791	ATA	2	6	19730	19735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016791	ACT	2	6	19744	19749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016791	ATT	2	6	19914	19919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016791	TCT	2	6	19975	19980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016791	TAC	2	6	19986	19991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016791	TAT	2	6	20054	20059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016791	CTG	2	6	20078	20083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016791	TAA	2	6	20112	20117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016791	CAT	2	6	20120	20125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016791	ATA	2	6	20168	20173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016791	TAT	2	6	21974	21979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016791	ATT	2	6	21991	21996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016791	AAT	2	6	22019	22024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016791	TAT	2	6	22152	22157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016791	TAA	2	6	22163	22168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016791	GAA	2	6	22204	22209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016791	TAA	2	6	22548	22553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016791	TGA	3	9	22561	22569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016791	TTA	2	6	22861	22866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016791	TAA	2	6	22904	22909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016791	AAT	2	6	23007	23012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016791	GTT	2	6	23049	23054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016791	TAA	2	6	24756	24761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016791	TAA	2	6	24775	24780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016791	TTG	2	6	24807	24812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016791	GAT	2	6	26499	26504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016791	AAT	2	6	28134	28139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016791	ATT	2	6	28160	28165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016791	TAT	2	6	28182	28187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016791	AGG	2	6	28263	28268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016791	GCA	2	6	32049	32054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016791	TTG	2	6	32063	32068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016791	GGT	2	6	34010	34015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016791	AAT	2	6	34433	34438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016791	TTA	2	6	39774	39779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016791	AGG	2	6	39882	39887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016791	ATT	2	6	42119	42124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016791	ATG	2	6	42138	42143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016791	AAT	2	6	43228	43233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016791	GGA	2	6	43275	43280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016791	ATT	2	6	43281	43286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016791	AGG	2	6	44428	44433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016791	ATA	2	6	44669	44674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016791	GAT	2	6	44694	44699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016791	AAT	2	6	45718	45723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016791	ATT	2	6	45746	45751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016791	ATA	2	6	45828	45833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016791	GGA	2	6	45878	45883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016791	ATA	3	9	49010	49018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016791	TTA	2	6	49019	49024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016791	TAA	2	6	49060	49065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016791	AGA	2	6	49169	49174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016791	TAA	2	6	49455	49460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016791	AGT	2	6	51191	51196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016791	TAA	2	6	51338	51343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016791	AGG	2	6	51401	51406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016791	TAT	2	6	53627	53632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016791	AAT	2	6	55840	55845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016791	ATT	2	6	55910	55915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016791	CCT	2	6	57866	57871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016791	TAA	2	6	57910	57915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016791	GAC	2	6	58003	58008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016791	AAT	2	6	58106	58111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016791	TAA	2	6	58228	58233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016791	ATA	2	6	58243	58248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016791	TAG	2	6	58281	58286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016791	ATA	2	6	58309	58314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016791	TAG	2	6	58383	58388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016791	CTA	2	6	58406	58411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016791	TTA	2	6	60176	60181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016791	ATA	2	6	60363	60368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016791	ATA	2	6	60576	60581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016791	ATA	2	6	60584	60589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016791	TAA	2	6	60615	60620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016791	AAT	2	6	60622	60627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016791	TAA	2	6	60672	60677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016791	ATA	2	6	60733	60738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016791	AGG	2	6	60748	60753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016791	ATA	2	6	68331	68336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016791	TAT	2	6	69512	69517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016791	CCT	2	6	70222	70227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016791	TCC	2	6	71025	71030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016791	ATA	2	6	71071	71076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016791	AAT	2	6	71098	71103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016791	TAG	2	6	71109	71114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016791	TAT	2	6	71999	72004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016791	AGG	2	6	72067	72072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016791	TAA	2	6	72448	72453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016791	CAA	2	6	73214	73219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016791	AGT	2	6	73229	73234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016791	TAT	2	6	76155	76160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016791	TAA	2	6	76178	76183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016791	ATA	2	6	77122	77127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016791	AGG	2	6	79556	79561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016791	AAC	3	9	80027	80035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016791	TTA	2	6	83422	83427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016791	AAT	2	6	83494	83499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016791	TGT	2	6	83515	83520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016791	ATA	2	6	83581	83586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016791	AGG	2	6	83649	83654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016791	TCC	2	6	86141	86146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_016791	GTA	2	6	86263	86268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016791	AGT	2	6	87508	87513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016791	GCT	2	6	87517	87522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016791	AGG	2	6	87605	87610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016791	CTT	2	6	87980	87985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016791	ATA	2	6	90487	90492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016791	TTG	2	6	90500	90505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016791	ATG	2	6	90520	90525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016791	GGA	2	6	90566	90571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016791	TAA	2	6	91735	91740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016791	ATA	2	6	91843	91848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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