MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016790	TAATCC	2	12	12923	12934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016790	TACTGC	2	12	19563	19574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016790	GGGGAT	2	12	20119	20130	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016790	TGGTTT	2	12	51774	51785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016790	CACTTC	2	12	130851	130862	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016790	GAGTTC	2	12	133312	133323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016790	AAGGGC	2	12	138993	139004	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016790	GGCCTT	2	12	141294	141305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016790	AAAACA	2	12	163061	163072	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016790	ACCTAT	2	12	206015	206026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016790	TTATGG	2	12	311020	311031	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016790	TCGAGC	2	12	326450	326461	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016790	ACAAGG	2	12	383548	383559	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016790	CGCTAT	2	12	433978	433989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016790	GCACCT	2	12	452978	452989	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016790	AAAAAC	2	12	503553	503564	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016790	GGGGCA	2	12	537597	537608	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016790	TAAGCG	2	12	564294	564305	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016790	GCGTAG	2	12	566812	566823	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016790	AACAAA	2	12	647081	647092	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016790	TTGTGG	2	12	648530	648541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016790	GTTTGG	2	12	651118	651129	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016790	CAAGCG	2	12	674745	674756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016790	AGCGAA	2	12	683540	683551	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016790	GCGTAG	2	12	686263	686274	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016790	GCGCAT	2	12	686297	686308	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016790	AGGTTC	2	12	718517	718528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016790	CTTCCG	2	12	760893	760904	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016790	ATGTGG	2	12	933558	933569	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016790	GGTGAA	2	12	1041903	1041914	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016790	AGCGAA	2	12	1111730	1111741	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016790	GACAGT	2	12	1142226	1142237	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016790	TTGAGG	2	12	1146702	1146713	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016790	AAAAAC	2	12	1200316	1200327	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016790	ACCAGC	2	12	1342149	1342160	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016790	ACAGAA	2	12	1349014	1349025	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016790	TCAATG	2	12	1409464	1409475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016790	TACAGA	2	12	1410010	1410021	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016790	CTGCAT	2	12	1451711	1451722	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016790	TGCAGC	2	12	1458498	1458509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016790	GACGGT	2	12	1506585	1506596	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016790	GCTGTG	2	12	1737211	1737222	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016790	AAGCAG	2	12	1768956	1768967	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016790	ATCACC	2	12	1832531	1832542	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016790	CCGCAG	2	12	1846848	1846859	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016790	ATGCGC	2	12	1859361	1859372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016790	GCCTAC	2	12	1859393	1859404	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016790	TTCGCT	2	12	1862117	1862128	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016790	TAACCC	2	12	1878224	1878235	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016790	ACAAGT	2	12	1910057	1910068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016790	TAGTTT	2	12	1993718	1993729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016790	TCAGGT	2	12	2004424	2004435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016790	ACACCC	2	12	2095896	2095907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016790	TTCGCT	2	12	2098641	2098652	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016790	AAACCA	2	12	2188736	2188747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016790	AAAGGA	2	12	2199956	2199967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016790	CAACAC	2	12	2211146	2211157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016790	TTCGCT	2	12	2272097	2272108	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016790	ATTGTT	2	12	2281004	2281015	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016790	CATCGA	2	12	2328821	2328832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.