MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016790	AGCG	2	8	2131	2138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016790	GATC	2	8	2264	2271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016790	CAGG	2	8	14680	14687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016790	CCGG	2	8	14968	14975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016790	GAAT	2	8	19111	19118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016790	GCAC	2	8	20339	20346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016790	GAGG	2	8	20452	20459	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016790	TAAC	2	8	25715	25722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016790	ATAA	2	8	26521	26528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016790	AGAT	2	8	27143	27150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016790	AGTG	2	8	27403	27410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016790	GAAG	2	8	27493	27500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016790	CAAC	2	8	31145	31152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016790	GGAA	2	8	34522	34529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016790	TAAT	2	8	34613	34620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016790	TTAA	2	8	34682	34689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016790	CACC	2	8	39628	39635	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_016790	AAAT	2	8	41260	41267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016790	TTGT	2	8	41639	41646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016790	CTAA	2	8	41732	41739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016790	GTAC	2	8	52278	52285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016790	TAAT	2	8	58884	58891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016790	ATTG	2	8	68524	68531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016790	GGGT	2	8	76668	76675	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016790	AAGA	2	8	99350	99357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016790	TTGA	2	8	100242	100249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016790	TCAT	2	8	106453	106460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016790	AACA	2	8	117614	117621	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016790	ACTA	2	8	127081	127088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016790	GGGT	2	8	131180	131187	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016790	AGTG	2	8	138897	138904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016790	GAAG	2	8	141207	141214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016790	CTTC	2	8	141228	141235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016790	GCTT	2	8	143075	143082	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016790	AGTA	2	8	146652	146659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016790	ATTA	2	8	146739	146746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016790	TAAA	2	8	146770	146777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016790	ACTT	2	8	149962	149969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016790	CTTG	2	8	150496	150503	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016790	CTTT	2	8	151003	151010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016790	TGTA	2	8	151656	151663	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016790	GGTC	2	8	153798	153805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016790	TTGA	2	8	153989	153996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016790	CCGC	2	8	154132	154139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_016790	CATA	2	8	159151	159158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016790	CGCT	2	8	160599	160606	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016790	GTGG	2	8	163279	163286	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016790	AGGC	2	8	177030	177037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016790	CGGG	2	8	177413	177420	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016790	CTGC	2	8	177756	177763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016790	CATT	2	8	177772	177779	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016790	CGAG	2	8	178289	178296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016790	CCAC	2	8	180392	180399	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_016790	AAGA	2	8	186448	186455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016790	GAAA	2	8	189955	189962	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016790	TTGG	2	8	213798	213805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016790	GGTC	2	8	220703	220710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016790	ACCC	2	8	222404	222411	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_016790	GCCC	2	8	222503	222510	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_016790	TTTG	2	8	229402	229409	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016790	GCTA	2	8	229826	229833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016790	ATTG	2	8	229855	229862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016790	GTAC	2	8	237279	237286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016790	CTAA	2	8	246487	246494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016790	CATG	2	8	249642	249649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016790	GACA	2	8	249666	249673	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016790	AGCT	2	8	249778	249785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016790	TCAT	2	8	249977	249984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016790	ATAG	2	8	250334	250341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016790	CTGC	2	8	250874	250881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016790	TGCT	2	8	251370	251377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016790	CAGA	2	8	252332	252339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016790	TGAT	2	8	252694	252701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016790	GATT	2	8	253422	253429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016790	GACT	2	8	257062	257069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016790	CTAC	2	8	257153	257160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016790	GCTA	2	8	257675	257682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016790	GCTG	2	8	257782	257789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016790	TTTA	2	8	257860	257867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016790	ACTA	2	8	259573	259580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016790	GTCC	2	8	259867	259874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016790	TCAA	2	8	272637	272644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016790	CAGG	2	8	290032	290039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016790	TTGG	2	8	299163	299170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016790	CTTT	2	8	305706	305713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016790	CGTG	2	8	305881	305888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016790	GCGG	2	8	306234	306241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016790	GTAC	2	8	306289	306296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016790	ATCA	2	8	308750	308757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016790	ATGT	2	8	337667	337674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016790	AGGA	2	8	342277	342284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016790	TGGC	2	8	360043	360050	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016790	ATTG	2	8	360215	360222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016790	CATT	2	8	360811	360818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016790	TTGA	2	8	361977	361984	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016790	TGCG	2	8	362595	362602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016790	GTTG	2	8	363214	363221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016790	CATC	2	8	363225	363232	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016790	GCCG	2	8	375710	375717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016790	ACTA	2	8	377746	377753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016790	GATT	2	8	383519	383526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016790	TCGT	2	8	387347	387354	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016790	AATT	2	8	388939	388946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016790	TAAA	2	8	389022	389029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016790	CGCT	2	8	389182	389189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016790	GATG	2	8	395355	395362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016790	CCAG	2	8	399030	399037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016790	CCTG	2	8	414832	414839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016790	ATTT	2	8	415098	415105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016790	AGGC	2	8	416024	416031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016790	TTAA	2	8	429612	429619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016790	CTTT	2	8	430951	430958	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016790	GGTT	2	8	433964	433971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016790	AGGA	2	8	440599	440606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016790	GTGG	2	8	446452	446459	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016790	GGGT	2	8	446530	446537	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016790	GAAA	2	8	448660	448667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016790	CGAA	2	8	453030	453037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016790	ATCC	2	8	454932	454939	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016790	AGGG	2	8	467110	467117	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016790	ATTG	2	8	467935	467942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016790	CTGG	2	8	468157	468164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016790	AGAC	2	8	468172	468179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016790	GAAA	2	8	473647	473654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016790	ACCA	2	8	477272	477279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016790	AAGG	2	8	494384	494391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016790	ACTA	2	8	497282	497289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016790	AAGG	2	8	497298	497305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016790	ATCC	2	8	497709	497716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016790	TAGC	2	8	498993	499000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016790	GACA	2	8	499426	499433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016790	CTTC	2	8	505605	505612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016790	GATT	2	8	505986	505993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016790	AGCG	2	8	516121	516128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016790	AATA	2	8	522215	522222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016790	ATTT	2	8	525371	525378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016790	TTTA	2	8	528123	528130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016790	TTTC	2	8	529878	529885	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016790	AGAA	2	8	530062	530069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016790	TTAT	2	8	534928	534935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016790	AGGA	2	8	534997	535004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016790	TTCC	2	8	536009	536016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016790	TTCC	2	8	537428	537435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016790	GCAA	2	8	537452	537459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016790	GTTG	2	8	537568	537575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016790	TTCC	2	8	537633	537640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016790	TTTA	2	8	550887	550894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016790	TGCA	2	8	551571	551578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016790	CTTT	2	8	554801	554808	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016790	CTTT	2	8	562806	562813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016790	TAGC	2	8	562860	562867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_016790	ACAA	2	8	1808886	1808893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

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