MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae PW8 chromosome

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016789	AAGCTA	2	12	12874	12885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016789	CCCCGG	2	12	53734	53745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016789	CAGGGC	2	12	53871	53882	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016789	GTCAGA	2	12	69012	69023	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016789	AACAGG	2	12	108164	108175	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016789	CACTTC	2	12	138933	138944	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016789	GCGAAC	2	12	144681	144692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016789	GGCCTA	2	12	144730	144741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016789	GAAACC	2	12	144760	144771	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016789	GAGTTC	2	12	214013	214024	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016789	AGTAGA	2	12	225086	225097	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016789	ACGGTT	2	12	227900	227911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016789	ACCCCG	2	12	228208	228219	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016789	GCAAGA	2	12	232727	232738	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016789	TTGCTT	2	12	233321	233332	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016789	GTTGCT	2	12	237349	237360	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016789	AATTTT	2	12	238461	238472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016789	ATATAG	2	12	238661	238672	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016789	ATTAGT	2	12	240536	240547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016789	AAAACA	2	12	262568	262579	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016789	TGGTGA	2	12	276937	276948	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016789	CCTATT	2	12	301814	301825	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016789	CTTTGC	2	12	355169	355180	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016789	TTATGG	2	12	399091	399102	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016789	ACAAGG	2	12	469197	469208	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016789	ACGAGG	2	12	498986	498997	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016789	GTCATC	2	12	502399	502410	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016789	CGCTAT	2	12	524473	524484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016789	GCACCT	2	12	543519	543530	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016789	ACCGAC	2	12	582509	582520	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016789	ATCGCC	2	12	583914	583925	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016789	AAAAAC	2	12	593940	593951	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016789	TGGTGC	2	12	621763	621774	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016789	GGGGCA	2	12	627660	627671	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016789	TAAGCG	2	12	654357	654368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016789	GTTTGG	2	12	751865	751876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016789	TGTTGG	2	12	767397	767408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016789	CATGTG	2	12	771937	771948	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016789	AGCGAA	2	12	772223	772234	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016789	CTAAGC	2	12	774466	774477	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016789	GCGCAT	2	12	774971	774982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016789	TGGGTG	2	12	775109	775120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016789	AGGTTC	2	12	803435	803446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016789	AATCCT	2	12	947621	947632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016789	AAAAGT	2	12	1018079	1018090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016789	ATGGCA	2	12	1021006	1021017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016789	CTTTTT	2	12	1116645	1116656	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016789	CTTGGG	2	12	1125580	1125591	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016789	CATGTG	2	12	1188721	1188732	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016789	AGCGAA	2	12	1189007	1189018	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016789	CTAAGC	2	12	1191250	1191261	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016789	AAATAA	2	12	1201728	1201739	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016789	GACAGT	2	12	1219490	1219501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016789	TTGAGG	2	12	1223966	1223977	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016789	AAAAAC	2	12	1277481	1277492	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016789	TGCCAC	2	12	1290130	1290141	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016789	ACCAGC	2	12	1416683	1416694	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016789	ACAGAA	2	12	1425064	1425075	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016789	TCAATG	2	12	1487317	1487328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016789	CTGCAT	2	12	1531202	1531213	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016789	TGCAGC	2	12	1537989	1538000	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016789	GACGGT	2	12	1580503	1580514	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016789	AGGCCG	2	12	1600888	1600899	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016789	CAGCGC	2	12	1602623	1602634	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016789	CCCAAC	2	12	1720616	1720627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016789	GAACCT	2	12	1821827	1821838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016789	GCTGTG	3	18	1841261	1841278	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016789	TTCGTG	2	12	1870863	1870874	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016789	CGCCGG	2	12	1898564	1898575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016789	TCTCCA	2	12	1898857	1898868	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016789	TCGCCA	2	12	1899157	1899168	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016789	ATGCGC	2	12	1961351	1961362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016789	GCTTAG	2	12	1961858	1961869	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016789	TTCGCT	2	12	1964101	1964112	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016789	CACATG	2	12	1964387	1964398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016789	AGTGAT	2	12	2095473	2095484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016789	TGCCAC	2	12	2146783	2146794	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016789	ATGCGC	2	12	2205657	2205668	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016789	GCTTAG	2	12	2206163	2206174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016789	TTCGCT	2	12	2208406	2208417	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016789	CACATG	2	12	2208692	2208703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016789	GCCACC	2	12	2288942	2288953	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016789	AAAGGA	2	12	2319469	2319480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016789	CGATGA	2	12	2321591	2321602	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016789	GACTAG	2	12	2323736	2323747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_016789	TCCACG	2	12	2396965	2396976	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016789	GCTTAG	2	12	2397555	2397566	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016789	TTCGCT	2	12	2399798	2399809	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016789	CACATG	2	12	2400084	2400095	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016789	ATTGTT	2	12	2408702	2408713	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016789	CATCGA	2	12	2460149	2460160	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016789	TCCCTT	2	12	2477227	2477238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016789	CGCCAT	2	12	2477282	2477293	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.