MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016788	TAATCC	2	12	12936	12947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016788	TACTGC	2	12	19577	19588	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016788	GGGGAT	2	12	20133	20144	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016788	AACAGG	2	12	106485	106496	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016788	CACTTC	2	12	136346	136357	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016788	TAGCGT	2	12	160816	160827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016788	AAACAC	2	12	163710	163721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016788	AAAACA	2	12	174922	174933	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016788	ACCTAT	2	12	217812	217823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016788	TTATGG	2	12	322808	322819	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016788	TCGAGC	2	12	338239	338250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016788	ACAAGG	2	12	395343	395354	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016788	GGTGGG	2	12	441115	441126	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016788	CGCTAT	2	12	444306	444317	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016788	GCACCT	2	12	463363	463374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016788	AAAAAC	2	12	514713	514724	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016788	GGGGCA	2	12	548758	548769	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016788	TAAGCG	2	12	575454	575465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016788	GCGTAG	2	12	577972	577983	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016788	CTCCAA	2	12	584037	584048	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016788	TTGTGG	2	12	679839	679850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016788	GTTTGG	2	12	683432	683443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016788	CAAGCG	2	12	705613	705624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016788	AGCGAA	2	12	714398	714409	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016788	GTGTGG	2	12	717140	717151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016788	AGGTTC	2	12	749419	749430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016788	CTTCCG	2	12	793495	793506	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016788	ATGTGG	2	12	966172	966183	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016788	GGTGAA	2	12	1074514	1074525	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016788	AGCGAA	2	12	1144334	1144345	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016788	GACAGT	2	12	1174836	1174847	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016788	TTGAGG	2	12	1179312	1179323	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016788	AAAAAC	2	12	1232926	1232937	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016788	ACCAGC	2	12	1369585	1369596	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016788	ACAGAA	2	12	1376409	1376420	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016788	TCAATG	2	12	1436859	1436870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016788	TACAGA	2	12	1437405	1437416	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016788	CTGCAT	2	12	1479214	1479225	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016788	TGCAGC	2	12	1486002	1486013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016788	GACGGT	2	12	1534261	1534272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016788	GCTGTG	4	24	1764815	1764838	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016788	CGTCAC	2	12	1861273	1861284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016788	CACACC	2	12	1893303	1893314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016788	TTCGCT	2	12	1896044	1896055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016788	AACAAG	2	12	1940078	1940089	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016788	CCTTTT	2	12	2003427	2003438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016788	ACATTT	2	12	2019753	2019764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016788	TAGTTT	2	12	2021030	2021041	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016788	CCTTTT	2	12	2050445	2050456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016788	ACATTT	2	12	2066771	2066782	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016788	TAGTTT	2	12	2068048	2068059	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016788	TGCCAC	2	12	2124168	2124179	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016788	CGACTG	2	12	2147770	2147781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016788	ATGCGC	2	12	2198688	2198699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016788	GCCTAC	2	12	2198720	2198731	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016788	TTCGCT	2	12	2201443	2201454	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016788	GAGTAA	2	12	2261825	2261836	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016788	AAACCA	2	12	2291560	2291571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016788	AAAGGA	2	12	2302780	2302791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016788	TTCGCT	2	12	2375237	2375248	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016788	ATTGTT	2	12	2384133	2384144	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.