MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 1435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016788	AGCGA	2	10	2150	2159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016788	CGGTG	2	10	2363	2372	0 %	20 %	60 %	20 %	376247369
3	NC_016788	CCGTG	2	10	3262	3271	0 %	20 %	40 %	40 %	376247369
4	NC_016788	CCACC	2	10	6221	6230	20 %	0 %	0 %	80 %	376247372
5	NC_016788	GAGTC	2	10	14072	14081	20 %	20 %	40 %	20 %	376247379
6	NC_016788	CCAGG	2	10	16540	16549	20 %	0 %	40 %	40 %	376247381
7	NC_016788	TGTGA	2	10	19410	19419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016788	GATTC	2	10	23104	23113	20 %	40 %	20 %	20 %	376247386
9	NC_016788	TGCGC	2	10	23418	23427	0 %	20 %	40 %	40 %	376247387
10	NC_016788	GCGCT	2	10	24445	24454	0 %	20 %	40 %	40 %	376247388
11	NC_016788	GGTGG	2	10	25828	25837	0 %	20 %	80 %	0 %	376247391
12	NC_016788	AGCGC	2	10	30202	30211	20 %	0 %	40 %	40 %	376247394
13	NC_016788	TGGGG	2	10	32186	32195	0 %	20 %	80 %	0 %	376247396
14	NC_016788	CACCT	2	10	32997	33006	20 %	20 %	0 %	60 %	376247396
15	NC_016788	CCGCA	2	10	34001	34010	20 %	0 %	20 %	60 %	376247398
16	NC_016788	AGCGC	2	10	36664	36673	20 %	0 %	40 %	40 %	376247401
17	NC_016788	AGAGG	2	10	38926	38935	40 %	0 %	60 %	0 %	376247401
18	NC_016788	CACGG	2	10	41889	41898	20 %	0 %	40 %	40 %	376247402
19	NC_016788	CAACT	2	10	45408	45417	40 %	20 %	0 %	40 %	376247407
20	NC_016788	GGTGT	2	10	45740	45749	0 %	40 %	60 %	0 %	376247407
21	NC_016788	GTGCT	2	10	46940	46949	0 %	40 %	40 %	20 %	376247410
22	NC_016788	GTTGC	2	10	47624	47633	0 %	40 %	40 %	20 %	376247410
23	NC_016788	GGGTT	2	10	47688	47697	0 %	40 %	60 %	0 %	376247410
24	NC_016788	TGGCG	2	10	49406	49415	0 %	20 %	60 %	20 %	376247411
25	NC_016788	GCGCA	2	10	49672	49681	20 %	0 %	40 %	40 %	376247411
26	NC_016788	CGCAG	2	10	52189	52198	20 %	0 %	40 %	40 %	376247413
27	NC_016788	TGAGG	2	10	54638	54647	20 %	20 %	60 %	0 %	376247414
28	NC_016788	TACGA	2	10	55239	55248	40 %	20 %	20 %	20 %	376247416
29	NC_016788	TTTGA	2	10	57826	57835	20 %	60 %	20 %	0 %	376247419
30	NC_016788	TTGTT	2	10	58295	58304	0 %	80 %	20 %	0 %	376247421
31	NC_016788	AAAAG	2	10	58618	58627	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016788	CAAGC	2	10	58712	58721	40 %	0 %	20 %	40 %	376247422
33	NC_016788	TCACC	2	10	61081	61090	20 %	20 %	0 %	60 %	376247424
34	NC_016788	AGGAG	2	10	64498	64507	40 %	0 %	60 %	0 %	376247429
35	NC_016788	ACCAA	2	10	64511	64520	60 %	0 %	0 %	40 %	376247429
36	NC_016788	CGGTG	2	10	65715	65724	0 %	20 %	60 %	20 %	376247431
37	NC_016788	GACTG	2	10	68332	68341	20 %	20 %	40 %	20 %	376247435
38	NC_016788	GGAGT	2	10	70487	70496	20 %	20 %	60 %	0 %	376247438
39	NC_016788	TGGCT	2	10	73106	73115	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016788	GCCTA	2	10	73446	73455	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016788	GCGCT	2	10	74934	74943	0 %	20 %	40 %	40 %	376247442
42	NC_016788	CGTTC	2	10	75685	75694	0 %	40 %	20 %	40 %	376247442
43	NC_016788	CCAAG	2	10	77620	77629	40 %	0 %	20 %	40 %	376247444
44	NC_016788	CTCAA	2	10	79976	79985	40 %	20 %	0 %	40 %	376247447
45	NC_016788	GCCCA	2	10	80177	80186	20 %	0 %	20 %	60 %	376247447
46	NC_016788	GAGCT	2	10	84064	84073	20 %	20 %	40 %	20 %	376247452
47	NC_016788	CATGA	2	10	85599	85608	40 %	20 %	20 %	20 %	376247452
48	NC_016788	CCGCA	2	10	85998	86007	20 %	0 %	20 %	60 %	376247453
49	NC_016788	AGCCA	2	10	86319	86328	40 %	0 %	20 %	40 %	376247453
50	NC_016788	CATCG	2	10	88700	88709	20 %	20 %	20 %	40 %	376247456
51	NC_016788	GGCCA	2	10	92655	92664	20 %	0 %	40 %	40 %	376247458
52	NC_016788	TCCAC	2	10	92825	92834	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016788	TCCGC	2	10	95430	95439	0 %	20 %	20 %	60 %	376247462
54	NC_016788	GTGGG	2	10	98881	98890	0 %	20 %	80 %	0 %	376247465
55	NC_016788	TGCAC	2	10	100885	100894	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016788	ACACC	2	10	100952	100961	40 %	0 %	0 %	60 %	376247468
57	NC_016788	CCAGC	2	10	101088	101097	20 %	0 %	20 %	60 %	376247468
58	NC_016788	GAGCG	2	10	102038	102047	20 %	0 %	60 %	20 %	376247470
59	NC_016788	GAAAC	2	10	102530	102539	60 %	0 %	20 %	20 %	376247471
60	NC_016788	TCGAA	2	10	104695	104704	40 %	20 %	20 %	20 %	376247473
61	NC_016788	GATCT	2	10	104956	104965	20 %	40 %	20 %	20 %	376247473
62	NC_016788	GAGGC	2	10	106411	106420	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016788	CTGTT	2	10	106556	106565	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016788	TGACC	2	10	107194	107203	20 %	20 %	20 %	40 %	376247478
65	NC_016788	CTGGG	2	10	107246	107255	0 %	20 %	60 %	20 %	376247478
66	NC_016788	GGCGG	2	10	108874	108883	0 %	0 %	80 %	20 %	376247479
67	NC_016788	CCACG	2	10	111857	111866	20 %	0 %	20 %	60 %	376247481
68	NC_016788	TGGGA	2	10	112962	112971	20 %	20 %	60 %	0 %	376247483
69	NC_016788	ATCGA	2	10	113643	113652	40 %	20 %	20 %	20 %	376247484
70	NC_016788	CCAGT	2	10	115520	115529	20 %	20 %	20 %	40 %	376247486
71	NC_016788	ACCAG	2	10	117811	117820	40 %	0 %	20 %	40 %	376247486
72	NC_016788	CCTGG	2	10	120962	120971	0 %	20 %	40 %	40 %	376247488
73	NC_016788	GCTGT	2	10	124649	124658	0 %	40 %	40 %	20 %	376247492
74	NC_016788	TCTGG	2	10	124721	124730	0 %	40 %	40 %	20 %	376247492
75	NC_016788	TAATT	2	10	124915	124924	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016788	TTAGC	2	10	125984	125993	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016788	TGGTC	2	10	126343	126352	0 %	40 %	40 %	20 %	376247494
78	NC_016788	GTTTG	2	10	127832	127841	0 %	60 %	40 %	0 %	376247495
79	NC_016788	GTGAT	2	10	127974	127983	20 %	40 %	40 %	0 %	376247496
80	NC_016788	GTTCG	2	10	133066	133075	0 %	40 %	40 %	20 %	376247501
81	NC_016788	CTGAT	2	10	133629	133638	20 %	40 %	20 %	20 %	376247501
82	NC_016788	GCGTG	2	10	133887	133896	0 %	20 %	60 %	20 %	376247502
83	NC_016788	GATTC	2	10	137748	137757	20 %	40 %	20 %	20 %	376247504
84	NC_016788	CAATT	2	10	141092	141101	40 %	40 %	0 %	20 %	376247506
85	NC_016788	AGTGC	2	10	141183	141192	20 %	20 %	40 %	20 %	376247506
86	NC_016788	TGCGG	2	10	141278	141287	0 %	20 %	60 %	20 %	376247506
87	NC_016788	ACTCC	2	10	141484	141493	20 %	20 %	0 %	60 %	376247506
88	NC_016788	TGGGG	2	10	141642	141651	0 %	20 %	80 %	0 %	376247506
89	NC_016788	GCGGG	2	10	143462	143471	0 %	0 %	80 %	20 %	376247508
90	NC_016788	GCCAA	2	10	144016	144025	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016788	TGCCC	2	10	145566	145575	0 %	20 %	20 %	60 %	376247513
92	NC_016788	GGCGG	2	10	146355	146364	0 %	0 %	80 %	20 %	376247513
93	NC_016788	CTGGG	2	10	152946	152955	0 %	20 %	60 %	20 %	376247517
94	NC_016788	ATCTG	2	10	156105	156114	20 %	40 %	20 %	20 %	376247522
95	NC_016788	AGCTG	2	10	156228	156237	20 %	20 %	40 %	20 %	376247522
96	NC_016788	AGGGG	2	10	158843	158852	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016788	ACCCC	2	10	163678	163687	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_016788	ATGTG	2	10	164790	164799	20 %	40 %	40 %	0 %	376247531
99	NC_016788	AATTA	2	10	165513	165522	60 %	40 %	0 %	0 %	376247532
100	NC_016788	TGCGG	2	10	167298	167307	0 %	20 %	60 %	20 %	376247534
101	NC_016788	GCGCT	2	10	170574	170583	0 %	20 %	40 %	40 %	376247536
102	NC_016788	GGCAG	2	10	170852	170861	20 %	0 %	60 %	20 %	376247536
103	NC_016788	AGCCA	2	10	178616	178625	40 %	0 %	20 %	40 %	376247543
104	NC_016788	GCAGA	2	10	179636	179645	40 %	0 %	40 %	20 %	376247544
105	NC_016788	TTGCC	2	10	182493	182502	0 %	40 %	20 %	40 %	376247548
106	NC_016788	GTTGC	2	10	182910	182919	0 %	40 %	40 %	20 %	376247548
107	NC_016788	CCGCC	2	10	184168	184177	0 %	0 %	20 %	80 %	376247549
108	NC_016788	AGAAA	2	10	188598	188607	80 %	0 %	20 %	0 %	376247552
109	NC_016788	TTGGG	2	10	189605	189614	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016788	AGCCA	2	10	189903	189912	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_016788	ACCCC	2	10	193260	193269	20 %	0 %	0 %	80 %	376247557
112	NC_016788	GGTGC	2	10	193862	193871	0 %	20 %	60 %	20 %	376247557
113	NC_016788	CCACG	2	10	195632	195641	20 %	0 %	20 %	60 %	376247559
114	NC_016788	GCCCA	2	10	196148	196157	20 %	0 %	20 %	60 %	376247559
115	NC_016788	CGAGG	2	10	196414	196423	20 %	0 %	60 %	20 %	376247559
116	NC_016788	GCACC	2	10	200362	200371	20 %	0 %	20 %	60 %	376247561
117	NC_016788	AAGAC	2	10	200971	200980	60 %	0 %	20 %	20 %	376247561
118	NC_016788	CGCTG	2	10	210802	210811	0 %	20 %	40 %	40 %	376247569
119	NC_016788	ACTGA	2	10	214101	214110	40 %	20 %	20 %	20 %	376247574
120	NC_016788	GCCAC	2	10	214129	214138	20 %	0 %	20 %	60 %	376247574
121	NC_016788	CGCCA	2	10	214603	214612	20 %	0 %	20 %	60 %	376247575
122	NC_016788	CAAAC	2	10	215309	215318	60 %	0 %	0 %	40 %	376247576
123	NC_016788	CACAA	2	10	217919	217928	60 %	0 %	0 %	40 %	376247577
124	NC_016788	AAACC	2	10	218618	218627	60 %	0 %	0 %	40 %	376247577
125	NC_016788	TGACC	2	10	223370	223379	20 %	20 %	20 %	40 %	376247580
126	NC_016788	GTGCC	2	10	224774	224783	0 %	20 %	40 %	40 %	376247581
127	NC_016788	GATCA	2	10	226307	226316	40 %	20 %	20 %	20 %	376247584
128	NC_016788	GCGCT	2	10	226430	226439	0 %	20 %	40 %	40 %	376247584
129	NC_016788	GACCT	2	10	227715	227724	20 %	20 %	20 %	40 %	376247587
130	NC_016788	TGGTC	2	10	229586	229595	0 %	40 %	40 %	20 %	376247589
131	NC_016788	CACGA	2	10	229767	229776	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_016788	GGCGA	2	10	231236	231245	20 %	0 %	60 %	20 %	376247591
133	NC_016788	GGCGC	2	10	231428	231437	0 %	0 %	60 %	40 %	376247591
134	NC_016788	AGGGG	2	10	231875	231884	20 %	0 %	80 %	0 %	376247591
135	NC_016788	ATAAC	2	10	231931	231940	60 %	20 %	0 %	20 %	376247591
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249	NC_016788	AACGC	2	10	420292	420301	40 %	0 %	20 %	40 %	376247775
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251	NC_016788	TGCGG	2	10	422116	422125	0 %	20 %	60 %	20 %	376247778
252	NC_016788	TGATG	2	10	425627	425636	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
253	NC_016788	ACCTG	2	10	428638	428647	20 %	20 %	20 %	40 %	376247784
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255	NC_016788	TTTCC	2	10	433166	433175	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
256	NC_016788	CCATT	2	10	433296	433305	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
257	NC_016788	ACGCG	2	10	434385	434394	20 %	0 %	40 %	40 %	376247788
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259	NC_016788	AATGC	2	10	436531	436540	40 %	20 %	20 %	20 %	376247790
260	NC_016788	TTGCG	2	10	441171	441180	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
261	NC_016788	CAGGA	2	10	443504	443513	40 %	0 %	40 %	20 %	376247797
262	NC_016788	TCATC	2	10	446658	446667	20 %	40 %	0 %	40 %	376247802
263	NC_016788	CAGTG	2	10	449406	449415	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
264	NC_016788	TTGTC	2	10	452275	452284	0 %	60 %	20 %	20 %	376247805
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