MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 1221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016788	CGGTG	2	10	2363	2372	0 %	20 %	60 %	20 %	376247369
2	NC_016788	CCGTG	2	10	3262	3271	0 %	20 %	40 %	40 %	376247369
3	NC_016788	CCACC	2	10	6221	6230	20 %	0 %	0 %	80 %	376247372
4	NC_016788	GAGTC	2	10	14072	14081	20 %	20 %	40 %	20 %	376247379
5	NC_016788	CCAGG	2	10	16540	16549	20 %	0 %	40 %	40 %	376247381
6	NC_016788	GATTC	2	10	23104	23113	20 %	40 %	20 %	20 %	376247386
7	NC_016788	TGCGC	2	10	23418	23427	0 %	20 %	40 %	40 %	376247387
8	NC_016788	GCGCT	2	10	24445	24454	0 %	20 %	40 %	40 %	376247388
9	NC_016788	GGTGG	2	10	25828	25837	0 %	20 %	80 %	0 %	376247391
10	NC_016788	AGCGC	2	10	30202	30211	20 %	0 %	40 %	40 %	376247394
11	NC_016788	TGGGG	2	10	32186	32195	0 %	20 %	80 %	0 %	376247396
12	NC_016788	CACCT	2	10	32997	33006	20 %	20 %	0 %	60 %	376247396
13	NC_016788	CCGCA	2	10	34001	34010	20 %	0 %	20 %	60 %	376247398
14	NC_016788	AGCGC	2	10	36664	36673	20 %	0 %	40 %	40 %	376247401
15	NC_016788	AGAGG	2	10	38926	38935	40 %	0 %	60 %	0 %	376247401
16	NC_016788	CACGG	2	10	41889	41898	20 %	0 %	40 %	40 %	376247402
17	NC_016788	CAACT	2	10	45408	45417	40 %	20 %	0 %	40 %	376247407
18	NC_016788	GGTGT	2	10	45740	45749	0 %	40 %	60 %	0 %	376247407
19	NC_016788	GTGCT	2	10	46940	46949	0 %	40 %	40 %	20 %	376247410
20	NC_016788	GTTGC	2	10	47624	47633	0 %	40 %	40 %	20 %	376247410
21	NC_016788	GGGTT	2	10	47688	47697	0 %	40 %	60 %	0 %	376247410
22	NC_016788	TGGCG	2	10	49406	49415	0 %	20 %	60 %	20 %	376247411
23	NC_016788	GCGCA	2	10	49672	49681	20 %	0 %	40 %	40 %	376247411
24	NC_016788	CGCAG	2	10	52189	52198	20 %	0 %	40 %	40 %	376247413
25	NC_016788	TGAGG	2	10	54638	54647	20 %	20 %	60 %	0 %	376247414
26	NC_016788	TACGA	2	10	55239	55248	40 %	20 %	20 %	20 %	376247416
27	NC_016788	TTTGA	2	10	57826	57835	20 %	60 %	20 %	0 %	376247419
28	NC_016788	TTGTT	2	10	58295	58304	0 %	80 %	20 %	0 %	376247421
29	NC_016788	CAAGC	2	10	58712	58721	40 %	0 %	20 %	40 %	376247422
30	NC_016788	TCACC	2	10	61081	61090	20 %	20 %	0 %	60 %	376247424
31	NC_016788	AGGAG	2	10	64498	64507	40 %	0 %	60 %	0 %	376247429
32	NC_016788	ACCAA	2	10	64511	64520	60 %	0 %	0 %	40 %	376247429
33	NC_016788	CGGTG	2	10	65715	65724	0 %	20 %	60 %	20 %	376247431
34	NC_016788	GACTG	2	10	68332	68341	20 %	20 %	40 %	20 %	376247435
35	NC_016788	GGAGT	2	10	70487	70496	20 %	20 %	60 %	0 %	376247438
36	NC_016788	GCGCT	2	10	74934	74943	0 %	20 %	40 %	40 %	376247442
37	NC_016788	CGTTC	2	10	75685	75694	0 %	40 %	20 %	40 %	376247442
38	NC_016788	CCAAG	2	10	77620	77629	40 %	0 %	20 %	40 %	376247444
39	NC_016788	CTCAA	2	10	79976	79985	40 %	20 %	0 %	40 %	376247447
40	NC_016788	GCCCA	2	10	80177	80186	20 %	0 %	20 %	60 %	376247447
41	NC_016788	GAGCT	2	10	84064	84073	20 %	20 %	40 %	20 %	376247452
42	NC_016788	CATGA	2	10	85599	85608	40 %	20 %	20 %	20 %	376247452
43	NC_016788	CCGCA	2	10	85998	86007	20 %	0 %	20 %	60 %	376247453
44	NC_016788	AGCCA	2	10	86319	86328	40 %	0 %	20 %	40 %	376247453
45	NC_016788	CATCG	2	10	88700	88709	20 %	20 %	20 %	40 %	376247456
46	NC_016788	GGCCA	2	10	92655	92664	20 %	0 %	40 %	40 %	376247458
47	NC_016788	TCCGC	2	10	95430	95439	0 %	20 %	20 %	60 %	376247462
48	NC_016788	GTGGG	2	10	98881	98890	0 %	20 %	80 %	0 %	376247465
49	NC_016788	ACACC	2	10	100952	100961	40 %	0 %	0 %	60 %	376247468
50	NC_016788	CCAGC	2	10	101088	101097	20 %	0 %	20 %	60 %	376247468
51	NC_016788	GAGCG	2	10	102038	102047	20 %	0 %	60 %	20 %	376247470
52	NC_016788	GAAAC	2	10	102530	102539	60 %	0 %	20 %	20 %	376247471
53	NC_016788	TCGAA	2	10	104695	104704	40 %	20 %	20 %	20 %	376247473
54	NC_016788	GATCT	2	10	104956	104965	20 %	40 %	20 %	20 %	376247473
55	NC_016788	TGACC	2	10	107194	107203	20 %	20 %	20 %	40 %	376247478
56	NC_016788	CTGGG	2	10	107246	107255	0 %	20 %	60 %	20 %	376247478
57	NC_016788	GGCGG	2	10	108874	108883	0 %	0 %	80 %	20 %	376247479
58	NC_016788	CCACG	2	10	111857	111866	20 %	0 %	20 %	60 %	376247481
59	NC_016788	TGGGA	2	10	112962	112971	20 %	20 %	60 %	0 %	376247483
60	NC_016788	ATCGA	2	10	113643	113652	40 %	20 %	20 %	20 %	376247484
61	NC_016788	CCAGT	2	10	115520	115529	20 %	20 %	20 %	40 %	376247486
62	NC_016788	ACCAG	2	10	117811	117820	40 %	0 %	20 %	40 %	376247486
63	NC_016788	CCTGG	2	10	120962	120971	0 %	20 %	40 %	40 %	376247488
64	NC_016788	GCTGT	2	10	124649	124658	0 %	40 %	40 %	20 %	376247492
65	NC_016788	TCTGG	2	10	124721	124730	0 %	40 %	40 %	20 %	376247492
66	NC_016788	TGGTC	2	10	126343	126352	0 %	40 %	40 %	20 %	376247494
67	NC_016788	GTTTG	2	10	127832	127841	0 %	60 %	40 %	0 %	376247495
68	NC_016788	GTGAT	2	10	127974	127983	20 %	40 %	40 %	0 %	376247496
69	NC_016788	GTTCG	2	10	133066	133075	0 %	40 %	40 %	20 %	376247501
70	NC_016788	CTGAT	2	10	133629	133638	20 %	40 %	20 %	20 %	376247501
71	NC_016788	GCGTG	2	10	133887	133896	0 %	20 %	60 %	20 %	376247502
72	NC_016788	GATTC	2	10	137748	137757	20 %	40 %	20 %	20 %	376247504
73	NC_016788	CAATT	2	10	141092	141101	40 %	40 %	0 %	20 %	376247506
74	NC_016788	AGTGC	2	10	141183	141192	20 %	20 %	40 %	20 %	376247506
75	NC_016788	TGCGG	2	10	141278	141287	0 %	20 %	60 %	20 %	376247506
76	NC_016788	ACTCC	2	10	141484	141493	20 %	20 %	0 %	60 %	376247506
77	NC_016788	TGGGG	2	10	141642	141651	0 %	20 %	80 %	0 %	376247506
78	NC_016788	GCGGG	2	10	143462	143471	0 %	0 %	80 %	20 %	376247508
79	NC_016788	TGCCC	2	10	145566	145575	0 %	20 %	20 %	60 %	376247513
80	NC_016788	GGCGG	2	10	146355	146364	0 %	0 %	80 %	20 %	376247513
81	NC_016788	CTGGG	2	10	152946	152955	0 %	20 %	60 %	20 %	376247517
82	NC_016788	ATCTG	2	10	156105	156114	20 %	40 %	20 %	20 %	376247522
83	NC_016788	AGCTG	2	10	156228	156237	20 %	20 %	40 %	20 %	376247522
84	NC_016788	ATGTG	2	10	164790	164799	20 %	40 %	40 %	0 %	376247531
85	NC_016788	AATTA	2	10	165513	165522	60 %	40 %	0 %	0 %	376247532
86	NC_016788	TGCGG	2	10	167298	167307	0 %	20 %	60 %	20 %	376247534
87	NC_016788	GCGCT	2	10	170574	170583	0 %	20 %	40 %	40 %	376247536
88	NC_016788	GGCAG	2	10	170852	170861	20 %	0 %	60 %	20 %	376247536
89	NC_016788	AGCCA	2	10	178616	178625	40 %	0 %	20 %	40 %	376247543
90	NC_016788	GCAGA	2	10	179636	179645	40 %	0 %	40 %	20 %	376247544
91	NC_016788	TTGCC	2	10	182493	182502	0 %	40 %	20 %	40 %	376247548
92	NC_016788	GTTGC	2	10	182910	182919	0 %	40 %	40 %	20 %	376247548
93	NC_016788	CCGCC	2	10	184168	184177	0 %	0 %	20 %	80 %	376247549
94	NC_016788	AGAAA	2	10	188598	188607	80 %	0 %	20 %	0 %	376247552
95	NC_016788	ACCCC	2	10	193260	193269	20 %	0 %	0 %	80 %	376247557
96	NC_016788	GGTGC	2	10	193862	193871	0 %	20 %	60 %	20 %	376247557
97	NC_016788	CCACG	2	10	195632	195641	20 %	0 %	20 %	60 %	376247559
98	NC_016788	GCCCA	2	10	196148	196157	20 %	0 %	20 %	60 %	376247559
99	NC_016788	CGAGG	2	10	196414	196423	20 %	0 %	60 %	20 %	376247559
100	NC_016788	GCACC	2	10	200362	200371	20 %	0 %	20 %	60 %	376247561
101	NC_016788	AAGAC	2	10	200971	200980	60 %	0 %	20 %	20 %	376247561
102	NC_016788	CGCTG	2	10	210802	210811	0 %	20 %	40 %	40 %	376247569
103	NC_016788	ACTGA	2	10	214101	214110	40 %	20 %	20 %	20 %	376247574
104	NC_016788	GCCAC	2	10	214129	214138	20 %	0 %	20 %	60 %	376247574
105	NC_016788	CGCCA	2	10	214603	214612	20 %	0 %	20 %	60 %	376247575
106	NC_016788	CAAAC	2	10	215309	215318	60 %	0 %	0 %	40 %	376247576
107	NC_016788	CACAA	2	10	217919	217928	60 %	0 %	0 %	40 %	376247577
108	NC_016788	AAACC	2	10	218618	218627	60 %	0 %	0 %	40 %	376247577
109	NC_016788	TGACC	2	10	223370	223379	20 %	20 %	20 %	40 %	376247580
110	NC_016788	GTGCC	2	10	224774	224783	0 %	20 %	40 %	40 %	376247581
111	NC_016788	GATCA	2	10	226307	226316	40 %	20 %	20 %	20 %	376247584
112	NC_016788	GCGCT	2	10	226430	226439	0 %	20 %	40 %	40 %	376247584
113	NC_016788	GACCT	2	10	227715	227724	20 %	20 %	20 %	40 %	376247587
114	NC_016788	TGGTC	2	10	229586	229595	0 %	40 %	40 %	20 %	376247589
115	NC_016788	GGCGA	2	10	231236	231245	20 %	0 %	60 %	20 %	376247591
116	NC_016788	GGCGC	2	10	231428	231437	0 %	0 %	60 %	40 %	376247591
117	NC_016788	AGGGG	2	10	231875	231884	20 %	0 %	80 %	0 %	376247591
118	NC_016788	ATAAC	2	10	231931	231940	60 %	20 %	0 %	20 %	376247591
119	NC_016788	GCAAC	2	10	238508	238517	40 %	0 %	20 %	40 %	376247600
120	NC_016788	GCGCA	2	10	240159	240168	20 %	0 %	40 %	40 %	376247601
121	NC_016788	CGCAG	2	10	246892	246901	20 %	0 %	40 %	40 %	376247608
122	NC_016788	GGTGA	2	10	248522	248531	20 %	20 %	60 %	0 %	376247609
123	NC_016788	CAACC	2	10	249876	249885	40 %	0 %	0 %	60 %	376247610
124	NC_016788	AAAAG	2	10	251505	251514	80 %	0 %	20 %	0 %	376247610
125	NC_016788	TGGTG	2	10	254090	254099	0 %	40 %	60 %	0 %	376247612
126	NC_016788	CACCG	2	10	255587	255596	20 %	0 %	20 %	60 %	376247613
127	NC_016788	GTTGG	2	10	256088	256097	0 %	40 %	60 %	0 %	376247613
128	NC_016788	GCCAC	2	10	256770	256779	20 %	0 %	20 %	60 %	376247613
129	NC_016788	GTGGG	2	10	256924	256933	0 %	20 %	80 %	0 %	376247613
130	NC_016788	ACACC	2	10	257380	257389	40 %	0 %	0 %	60 %	376247614
131	NC_016788	GCCTC	2	10	257620	257629	0 %	20 %	20 %	60 %	376247614
132	NC_016788	AACAA	2	10	260641	260650	80 %	0 %	0 %	20 %	376247616
133	NC_016788	GCTTC	2	10	263914	263923	0 %	40 %	20 %	40 %	376247622
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167	NC_016788	GCCAG	2	10	319593	319602	20 %	0 %	40 %	40 %	376247676
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