MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016788	GATC	2	8	2288	2295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016788	CAGG	2	8	14693	14700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016788	CCGG	2	8	14982	14989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016788	TTTG	2	8	19240	19247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016788	GCAC	2	8	20353	20360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016788	GAGG	2	8	20466	20473	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016788	TAAC	2	8	25729	25736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016788	ATAA	2	8	26532	26539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016788	AGAT	2	8	27154	27161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016788	AGTG	2	8	27412	27419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016788	GAAG	2	8	27502	27509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016788	CAAC	2	8	31154	31161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016788	TAGG	2	8	34488	34495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016788	TGAT	2	8	34912	34919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016788	GCCC	2	8	39765	39772	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_016788	TTAT	2	8	39967	39974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016788	TTCA	2	8	40286	40293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016788	AGGA	2	8	40408	40415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016788	AAAT	2	8	63302	63309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016788	TAAT	2	8	63635	63642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016788	GGTG	2	8	67619	67626	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016788	ATTG	2	8	73273	73280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016788	GGGT	2	8	81417	81424	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016788	TGCC	2	8	82351	82358	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016788	TAGC	2	8	101870	101877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016788	TACT	2	8	103304	103311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016788	ATGT	2	8	103345	103352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016788	AACA	2	8	123109	123116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016788	ACTA	2	8	132576	132583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016788	GGGT	2	8	136675	136682	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016788	TTTC	2	8	139000	139007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016788	GCGG	2	8	143951	143958	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016788	GCTC	2	8	146435	146442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016788	GCGG	2	8	146664	146671	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016788	CAGG	2	8	153372	153379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016788	GCCC	2	8	153458	153465	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_016788	GCAA	2	8	153595	153602	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016788	GCCC	2	8	154652	154659	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_016788	TCTT	2	8	155140	155147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016788	GGAG	2	8	157881	157888	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016788	TGGT	2	8	158515	158522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016788	TTGA	2	8	158696	158703	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016788	TGTT	2	8	159974	159981	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016788	AGCA	2	8	163955	163962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016788	TTGA	2	8	164944	164951	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016788	GAAA	2	8	165130	165137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016788	CCGC	2	8	166068	166075	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_016788	CATA	2	8	171059	171066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016788	GTGG	2	8	175140	175147	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016788	AGGC	2	8	188826	188833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016788	CGGG	2	8	189209	189216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016788	CTGC	2	8	189552	189559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016788	CATT	2	8	189568	189575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016788	GCCA	2	8	189890	189897	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016788	CGAG	2	8	190085	190092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016788	CCAC	2	8	192188	192195	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_016788	AAGA	2	8	198244	198251	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016788	GAAA	2	8	201752	201759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016788	CTGA	2	8	221660	221667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016788	ACGA	2	8	221768	221775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016788	TTGG	2	8	225595	225602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016788	GGTC	2	8	232500	232507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016788	ACCC	2	8	234201	234208	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_016788	GCCC	2	8	234300	234307	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_016788	TTTG	2	8	241199	241206	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016788	GCTA	2	8	241623	241630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016788	ATTG	2	8	241652	241659	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016788	GTAC	2	8	249076	249083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016788	CTAA	2	8	258284	258291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016788	CATG	2	8	261439	261446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016788	GACA	2	8	261463	261470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016788	AGCT	2	8	261575	261582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016788	TCAT	2	8	261774	261781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016788	CTGC	2	8	262671	262678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016788	TGCT	2	8	263167	263174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016788	CAGA	2	8	264129	264136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016788	TGAT	2	8	264491	264498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016788	GATT	2	8	265219	265226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016788	GACT	2	8	268859	268866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016788	CTAC	2	8	268950	268957	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016788	GCTA	2	8	269472	269479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016788	GCTG	2	8	269579	269586	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016788	TTTA	2	8	269657	269664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016788	ACTA	2	8	271371	271378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016788	GTCC	2	8	271665	271672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016788	TCAA	2	8	284435	284442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016788	CAGG	2	8	301830	301837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016788	TTGG	2	8	310951	310958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016788	CTTT	2	8	317494	317501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016788	CGTG	2	8	317669	317676	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016788	GCGG	2	8	318022	318029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016788	GTAC	2	8	318077	318084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016788	ATCA	2	8	320538	320545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016788	AGCG	2	8	320575	320582	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016788	ATGT	2	8	349456	349463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016788	AGGA	2	8	354067	354074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016788	TGGC	2	8	371833	371840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016788	ATTG	2	8	372005	372012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016788	CATT	2	8	372607	372614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016788	TTGA	2	8	373773	373780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016788	TGCG	2	8	374391	374398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016788	GTTG	2	8	375010	375017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016788	CATC	2	8	375021	375028	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016788	GCCG	2	8	387506	387513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016788	ACTA	2	8	389542	389549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016788	GATT	2	8	395314	395321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016788	TCGT	2	8	399142	399149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016788	AATT	2	8	400734	400741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016788	TAAA	2	8	400817	400824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016788	CGCT	2	8	400977	400984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016788	GATG	2	8	407150	407157	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016788	CCTG	2	8	425177	425184	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016788	ATTT	2	8	425444	425451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016788	AGGC	2	8	426367	426374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016788	TATG	2	8	439980	439987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016788	TGCA	2	8	441127	441134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016788	GGTT	2	8	444292	444299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016788	AGGA	2	8	450926	450933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016788	GTGG	2	8	456778	456785	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016788	GGGT	2	8	456856	456863	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016788	GAAA	2	8	458986	458993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016788	CGAA	2	8	463415	463422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016788	ATGT	2	8	463444	463451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016788	ATCC	2	8	465317	465324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016788	AGGG	2	8	478380	478387	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016788	ATTG	2	8	479205	479212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016788	CTGG	2	8	479427	479434	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016788	AGAC	2	8	479442	479449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016788	GAAA	2	8	484917	484924	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016788	ACCA	2	8	488532	488539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016788	AAGG	2	8	505643	505650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016788	ACTA	2	8	508442	508449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016788	AAGG	2	8	508458	508465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016788	AAGG	2	8	508488	508495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016788	ATCC	2	8	508869	508876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016788	TAGC	2	8	510153	510160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016788	GACA	2	8	510586	510593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016788	CTTC	2	8	516765	516772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016788	GATT	2	8	517146	517153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016788	GGGT	2	8	518250	518257	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016788	AGCG	2	8	527281	527288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016788	GCGG	2	8	530370	530377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016788	AATA	2	8	533375	533382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016788	ATTT	2	8	536531	536538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016788	TTTA	2	8	539283	539290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016788	TTTC	2	8	541038	541045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016788	AGAA	2	8	541222	541229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016788	TTAT	2	8	546088	546095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016788	AGGA	2	8	546157	546164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_016788	TTCC	2	8	548588	548595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_016788	TGCT	2	8	1788870	1788877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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