MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 34569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016788	CTG	2	6	101	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247368
2	NC_016788	AAC	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247368
3	NC_016788	CGT	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247368
4	NC_016788	CAC	2	6	340	345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247368
5	NC_016788	ACT	2	6	362	367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247368
6	NC_016788	ACA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247368
7	NC_016788	CGA	2	6	435	440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
8	NC_016788	CAC	2	6	463	468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247368
9	NC_016788	CAG	2	6	508	513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
10	NC_016788	CAA	2	6	514	519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247368
11	NC_016788	TCG	3	9	540	548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247368
12	NC_016788	AGC	3	9	557	565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
13	NC_016788	GAA	2	6	583	588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247368
14	NC_016788	CGC	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247368
15	NC_016788	CAA	2	6	696	701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247368
16	NC_016788	CGG	2	6	713	718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247368
17	NC_016788	TTC	2	6	861	866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247368
18	NC_016788	TGA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247368
19	NC_016788	CGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
20	NC_016788	TTC	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247368
21	NC_016788	GCA	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
22	NC_016788	CCA	2	6	1144	1149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247368
23	NC_016788	CGG	2	6	1190	1195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247368
24	NC_016788	ATG	2	6	1354	1359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247368
25	NC_016788	CGG	2	6	1385	1390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247368
26	NC_016788	CTG	2	6	1409	1414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247368
27	NC_016788	TGG	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247368
28	NC_016788	ACG	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
29	NC_016788	CAG	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
30	NC_016788	GCA	2	6	1647	1652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
31	NC_016788	GAC	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247369
32	NC_016788	CCA	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247369
33	NC_016788	TCA	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247369
34	NC_016788	CCG	2	6	2437	2442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247369
35	NC_016788	CAT	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247369
36	NC_016788	TCG	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247369
37	NC_016788	TTC	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247369
38	NC_016788	CGA	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247369
39	NC_016788	TGC	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247369
40	NC_016788	TGC	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247369
41	NC_016788	ACG	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247369
42	NC_016788	GCT	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247369
43	NC_016788	GAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247369
44	NC_016788	ACC	2	6	3045	3050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247369
45	NC_016788	GCT	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247369
46	NC_016788	CCG	2	6	3152	3157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247369
47	NC_016788	CGA	2	6	3209	3214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247369
48	NC_016788	TGG	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247369
49	NC_016788	TTG	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247370
50	NC_016788	TTG	2	6	3657	3662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247370
51	NC_016788	GCT	2	6	3862	3867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
52	NC_016788	GTT	2	6	3872	3877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247370
53	NC_016788	TGC	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
54	NC_016788	CAG	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247370
55	NC_016788	TGC	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
56	NC_016788	CGT	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
57	NC_016788	GAT	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
58	NC_016788	TGG	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247370
59	NC_016788	ATG	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
60	NC_016788	GAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247370
61	NC_016788	TGG	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247370
62	NC_016788	TGA	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
63	NC_016788	TGT	2	6	4387	4392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247370
64	NC_016788	TGC	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
65	NC_016788	ATG	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
66	NC_016788	GAT	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
67	NC_016788	CGT	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
68	NC_016788	CGG	2	6	4641	4646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247370
69	NC_016788	CGC	2	6	4705	4710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247370
70	NC_016788	ATG	2	6	4735	4740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
71	NC_016788	CTG	2	6	4747	4752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247371
72	NC_016788	AGG	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376247371
73	NC_016788	ACG	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247371
74	NC_016788	AAC	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247371
75	NC_016788	GTC	2	6	4903	4908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247371
76	NC_016788	GGC	3	9	4909	4917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247371
77	NC_016788	GAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247371
78	NC_016788	TGG	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247371
79	NC_016788	TGC	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247371
80	NC_016788	ATG	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247371
81	NC_016788	ATT	2	6	5139	5144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376247371
82	NC_016788	ATC	2	6	5178	5183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247371
83	NC_016788	GGC	2	6	5221	5226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247371
84	NC_016788	CAC	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247372
85	NC_016788	CGA	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247372
86	NC_016788	CGG	2	6	5594	5599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247372
87	NC_016788	GGT	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247372
88	NC_016788	CGT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247372
89	NC_016788	ACC	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247372
90	NC_016788	ACC	2	6	5925	5930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247372
91	NC_016788	CTT	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247372
92	NC_016788	GAA	2	6	6051	6056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247372
93	NC_016788	CTG	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247372
94	NC_016788	CTG	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247372
95	NC_016788	AAG	2	6	6135	6140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247372
96	NC_016788	GAA	3	9	6146	6154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247372
97	NC_016788	TCT	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247372
98	NC_016788	ATC	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247372
99	NC_016788	CGA	2	6	6254	6259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247372
100	NC_016788	AAC	2	6	6288	6293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247372
101	NC_016788	CGT	2	6	6382	6387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247372
102	NC_016788	TGA	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247372
103	NC_016788	GAC	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247372
104	NC_016788	CCG	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247372
105	NC_016788	ATC	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247372
106	NC_016788	GGC	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247372
107	NC_016788	CGT	2	6	6690	6695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247372
108	NC_016788	CGG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247372
109	NC_016788	GGT	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247372
110	NC_016788	TTC	2	6	6841	6846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247372
111	NC_016788	ATC	2	6	6921	6926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247372
112	NC_016788	ATG	2	6	6949	6954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247372
113	NC_016788	AAG	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247372
114	NC_016788	TGC	2	6	7036	7041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247372
115	NC_016788	GAA	2	6	7077	7082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247372
116	NC_016788	CAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247372
117	NC_016788	GAC	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247372
118	NC_016788	CGA	2	6	7340	7345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247372
119	NC_016788	TCT	2	6	7348	7353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247372
120	NC_016788	GAC	2	6	7368	7373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247372
121	NC_016788	TTA	2	6	7393	7398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376247372
122	NC_016788	CCG	2	6	7400	7405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247372
123	NC_016788	TGC	2	6	7552	7557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247373
124	NC_016788	TGC	2	6	7661	7666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247373
125	NC_016788	AAG	2	6	7707	7712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247373
126	NC_016788	GGC	2	6	7795	7800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247373
127	NC_016788	GCT	2	6	7880	7885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247373
128	NC_016788	ATC	2	6	8247	8252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247374
129	NC_016788	GGT	2	6	8340	8345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247374
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253	NC_016788	TGG	2	6	16064	16069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247381
254	NC_016788	TGG	2	6	16097	16102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247381
255	NC_016788	GTT	2	6	16152	16157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247381
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278	NC_016788	TGG	2	6	17523	17528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247382
279	NC_016788	TTG	2	6	17583	17588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247382
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375	NC_016788	TGC	2	6	24396	24401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247388
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