MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC03 chromosome

Total Repeats: 1423

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016787	CAGCA	2	10	488	497	40 %	0 %	20 %	40 %	376250169
2	NC_016787	AGCGA	2	10	2132	2141	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016787	CGGTG	2	10	2345	2354	0 %	20 %	60 %	20 %	376250170
4	NC_016787	CCACC	2	10	6203	6212	20 %	0 %	0 %	80 %	376250173
5	NC_016787	GAGTC	2	10	14063	14072	20 %	20 %	40 %	20 %	376250180
6	NC_016787	TCGAC	2	10	14705	14714	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016787	CCAGG	2	10	16530	16539	20 %	0 %	40 %	40 %	376250182
8	NC_016787	TGTGA	2	10	19402	19411	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016787	GATTC	2	10	23201	23210	20 %	40 %	20 %	20 %	376250188
10	NC_016787	TGCGC	2	10	23515	23524	0 %	20 %	40 %	40 %	376250189
11	NC_016787	GCGCT	2	10	24542	24551	0 %	20 %	40 %	40 %	376250190
12	NC_016787	TGAGG	2	10	26466	26475	20 %	20 %	60 %	0 %	376250193
13	NC_016787	GGTAA	2	10	28041	28050	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016787	AGCGC	2	10	33084	33093	20 %	0 %	40 %	40 %	376250199
15	NC_016787	TGGGG	2	10	35068	35077	0 %	20 %	80 %	0 %	376250201
16	NC_016787	CACCT	2	10	35879	35888	20 %	20 %	0 %	60 %	376250201
17	NC_016787	CCGCA	2	10	36883	36892	20 %	0 %	20 %	60 %	376250203
18	NC_016787	AGCGC	2	10	39545	39554	20 %	0 %	40 %	40 %	376250206
19	NC_016787	AGAGG	2	10	41807	41816	40 %	0 %	60 %	0 %	376250206
20	NC_016787	CACGG	2	10	46419	46428	20 %	0 %	40 %	40 %	376250207
21	NC_016787	CAACT	2	10	49938	49947	40 %	20 %	0 %	40 %	376250212
22	NC_016787	GGTGT	2	10	50270	50279	0 %	40 %	60 %	0 %	376250212
23	NC_016787	GTGCT	2	10	51470	51479	0 %	40 %	40 %	20 %	376250215
24	NC_016787	GTTGC	2	10	52154	52163	0 %	40 %	40 %	20 %	376250215
25	NC_016787	GGGTT	2	10	52218	52227	0 %	40 %	60 %	0 %	376250215
26	NC_016787	TGGCG	2	10	53957	53966	0 %	20 %	60 %	20 %	376250216
27	NC_016787	GCGCA	2	10	54223	54232	20 %	0 %	40 %	40 %	376250216
28	NC_016787	CGCAG	2	10	56740	56749	20 %	0 %	40 %	40 %	376250218
29	NC_016787	TGAGG	2	10	59189	59198	20 %	20 %	60 %	0 %	376250219
30	NC_016787	TACGA	2	10	59790	59799	40 %	20 %	20 %	20 %	376250221
31	NC_016787	TTTGA	2	10	62377	62386	20 %	60 %	20 %	0 %	376250224
32	NC_016787	TTGTT	2	10	62846	62855	0 %	80 %	20 %	0 %	376250226
33	NC_016787	AAAAG	2	10	63169	63178	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016787	CAAGC	2	10	63263	63272	40 %	0 %	20 %	40 %	376250227
35	NC_016787	TCACC	2	10	65632	65641	20 %	20 %	0 %	60 %	376250229
36	NC_016787	AGGAG	2	10	69049	69058	40 %	0 %	60 %	0 %	376250234
37	NC_016787	ACCAA	2	10	69062	69071	60 %	0 %	0 %	40 %	376250234
38	NC_016787	CGGTG	2	10	70266	70275	0 %	20 %	60 %	20 %	376250236
39	NC_016787	GACTG	2	10	72883	72892	20 %	20 %	40 %	20 %	376250240
40	NC_016787	GGAGT	2	10	75038	75047	20 %	20 %	60 %	0 %	376250243
41	NC_016787	GCCTA	2	10	77962	77971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016787	GCGCT	2	10	79450	79459	0 %	20 %	40 %	40 %	376250247
43	NC_016787	CGTTC	2	10	80201	80210	0 %	40 %	20 %	40 %	376250247
44	NC_016787	CCAAG	2	10	82136	82145	40 %	0 %	20 %	40 %	376250249
45	NC_016787	GCGTG	2	10	83235	83244	0 %	20 %	60 %	20 %	376250251
46	NC_016787	CTCAA	2	10	84492	84501	40 %	20 %	0 %	40 %	376250252
47	NC_016787	GCCCA	2	10	84693	84702	20 %	0 %	20 %	60 %	376250252
48	NC_016787	GAGCT	2	10	88584	88593	20 %	20 %	40 %	20 %	376250257
49	NC_016787	CATGA	2	10	90119	90128	40 %	20 %	20 %	20 %	376250257
50	NC_016787	CCGCA	2	10	90518	90527	20 %	0 %	20 %	60 %	376250258
51	NC_016787	AGCCA	2	10	90839	90848	40 %	0 %	20 %	40 %	376250258
52	NC_016787	TACGG	2	10	91897	91906	20 %	20 %	40 %	20 %	376250260
53	NC_016787	GCGAT	2	10	96095	96104	20 %	20 %	40 %	20 %	376250263
54	NC_016787	GGCCA	2	10	97175	97184	20 %	0 %	40 %	40 %	376250263
55	NC_016787	TCCAC	2	10	97345	97354	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_016787	TCCGC	2	10	99950	99959	0 %	20 %	20 %	60 %	376250267
57	NC_016787	GTGGG	2	10	103180	103189	0 %	20 %	80 %	0 %	376250270
58	NC_016787	GGCAC	2	10	103541	103550	20 %	0 %	40 %	40 %	376250270
59	NC_016787	TGCAC	2	10	105187	105196	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016787	ACACC	2	10	105254	105263	40 %	0 %	0 %	60 %	376250273
61	NC_016787	CCAGC	2	10	105390	105399	20 %	0 %	20 %	60 %	376250273
62	NC_016787	CCTCA	2	10	106494	106503	20 %	20 %	0 %	60 %	376250275
63	NC_016787	CCGCA	2	10	107870	107879	20 %	0 %	20 %	60 %	376250278
64	NC_016787	AACCG	2	10	110820	110829	40 %	0 %	20 %	40 %	376250285
65	NC_016787	GTTTC	2	10	112201	112210	0 %	60 %	20 %	20 %	376250287
66	NC_016787	ACGGT	2	10	112561	112570	20 %	20 %	40 %	20 %	376250287
67	NC_016787	TGACC	2	10	114038	114047	20 %	20 %	20 %	40 %	376250290
68	NC_016787	CTGGG	2	10	114090	114099	0 %	20 %	60 %	20 %	376250290
69	NC_016787	GGCGG	2	10	115718	115727	0 %	0 %	80 %	20 %	376250292
70	NC_016787	CCACG	2	10	118701	118710	20 %	0 %	20 %	60 %	376250294
71	NC_016787	CCAGT	2	10	122361	122370	20 %	20 %	20 %	40 %	376250299
72	NC_016787	TGCCT	2	10	122589	122598	0 %	40 %	20 %	40 %	376250299
73	NC_016787	ACCAG	2	10	124652	124661	40 %	0 %	20 %	40 %	376250299
74	NC_016787	ACCTG	2	10	127802	127811	20 %	20 %	20 %	40 %	376250301
75	NC_016787	TGGTG	2	10	130417	130426	0 %	40 %	60 %	0 %	376250304
76	NC_016787	GCTGT	2	10	131490	131499	0 %	40 %	40 %	20 %	376250306
77	NC_016787	TCTGG	2	10	131562	131571	0 %	40 %	40 %	20 %	376250306
78	NC_016787	TAATT	2	10	131757	131766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016787	ATGCG	2	10	132121	132130	20 %	20 %	40 %	20 %	376250307
80	NC_016787	GTCGC	2	10	132860	132869	0 %	20 %	40 %	40 %	376250308
81	NC_016787	TTAGC	2	10	133811	133820	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016787	TGGTC	2	10	134170	134179	0 %	40 %	40 %	20 %	376250309
83	NC_016787	GTTTG	2	10	135659	135668	0 %	60 %	40 %	0 %	376250310
84	NC_016787	GTGAT	2	10	135801	135810	20 %	40 %	40 %	0 %	376250311
85	NC_016787	GTTCG	2	10	140902	140911	0 %	40 %	40 %	20 %	376250316
86	NC_016787	GCGTG	2	10	141723	141732	0 %	20 %	60 %	20 %	376250317
87	NC_016787	GATTC	2	10	145604	145613	20 %	40 %	20 %	20 %	376250320
88	NC_016787	CTGAC	2	10	146346	146355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016787	CAATT	2	10	148949	148958	40 %	40 %	0 %	20 %	376250322
90	NC_016787	AGTGC	2	10	149040	149049	20 %	20 %	40 %	20 %	376250322
91	NC_016787	TGCGG	2	10	149135	149144	0 %	20 %	60 %	20 %	376250322
92	NC_016787	ACTCC	2	10	149341	149350	20 %	20 %	0 %	60 %	376250322
93	NC_016787	GTCCG	2	10	149360	149369	0 %	20 %	40 %	40 %	376250322
94	NC_016787	GCGGG	2	10	151319	151328	0 %	0 %	80 %	20 %	376250324
95	NC_016787	TGATC	2	10	151733	151742	20 %	40 %	20 %	20 %	376250325
96	NC_016787	GAAGA	2	10	152410	152419	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016787	CGATG	2	10	155388	155397	20 %	20 %	40 %	20 %	376250327
98	NC_016787	CTCCG	2	10	155686	155695	0 %	20 %	20 %	60 %	376250327
99	NC_016787	AAATA	2	10	157537	157546	80 %	20 %	0 %	0 %	376250329
100	NC_016787	GAACG	2	10	160564	160573	40 %	0 %	40 %	20 %	376250329
101	NC_016787	ATCTG	2	10	163879	163888	20 %	40 %	20 %	20 %	376250337
102	NC_016787	AGCTG	2	10	163960	163969	20 %	20 %	40 %	20 %	376250337
103	NC_016787	AGGGG	2	10	166549	166558	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016787	ACCCC	2	10	171384	171393	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
105	NC_016787	ATGTG	2	10	172496	172505	20 %	40 %	40 %	0 %	376250347
106	NC_016787	AATTA	2	10	173219	173228	60 %	40 %	0 %	0 %	376250348
107	NC_016787	TGCGG	2	10	175005	175014	0 %	20 %	60 %	20 %	376250350
108	NC_016787	GCGCT	2	10	178245	178254	0 %	20 %	40 %	40 %	376250352
109	NC_016787	TGGGG	2	10	182410	182419	0 %	20 %	80 %	0 %	376250356
110	NC_016787	TCCTG	2	10	182519	182528	0 %	40 %	20 %	40 %	376250356
111	NC_016787	GCAGA	2	10	187367	187376	40 %	0 %	40 %	20 %	376250360
112	NC_016787	GTTGC	2	10	188947	188956	0 %	40 %	40 %	20 %	376250362
113	NC_016787	TTGCC	2	10	191947	191956	0 %	40 %	20 %	40 %	376250365
114	NC_016787	GTTGC	2	10	192364	192373	0 %	40 %	40 %	20 %	376250365
115	NC_016787	CCGCC	2	10	193622	193631	0 %	0 %	20 %	80 %	376250366
116	NC_016787	AGAAA	2	10	198076	198085	80 %	0 %	20 %	0 %	376250369
117	NC_016787	TTGGG	2	10	199083	199092	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016787	AGCCA	2	10	199381	199390	40 %	0 %	20 %	40 %	376250371
119	NC_016787	ACCCC	2	10	202738	202747	20 %	0 %	0 %	80 %	376250375
120	NC_016787	GGTGC	2	10	203340	203349	0 %	20 %	60 %	20 %	376250375
121	NC_016787	CCACG	2	10	205110	205119	20 %	0 %	20 %	60 %	376250377
122	NC_016787	GCCCA	2	10	205626	205635	20 %	0 %	20 %	60 %	376250377
123	NC_016787	CGAGG	2	10	205892	205901	20 %	0 %	60 %	20 %	376250377
124	NC_016787	GCACC	2	10	209840	209849	20 %	0 %	20 %	60 %	376250379
125	NC_016787	AAGAC	2	10	210449	210458	60 %	0 %	20 %	20 %	376250379
126	NC_016787	CGCTG	2	10	220280	220289	0 %	20 %	40 %	40 %	376250387
127	NC_016787	ACTGA	2	10	223579	223588	40 %	20 %	20 %	20 %	376250392
128	NC_016787	GCCAC	2	10	223607	223616	20 %	0 %	20 %	60 %	376250392
129	NC_016787	CGCCA	2	10	224081	224090	20 %	0 %	20 %	60 %	376250393
130	NC_016787	CAAAC	2	10	224787	224796	60 %	0 %	0 %	40 %	376250394
131	NC_016787	CACAA	2	10	227397	227406	60 %	0 %	0 %	40 %	376250395
132	NC_016787	AAACC	2	10	228096	228105	60 %	0 %	0 %	40 %	376250395
133	NC_016787	TGACC	2	10	232848	232857	20 %	20 %	20 %	40 %	376250399
134	NC_016787	GTGCC	2	10	234252	234261	0 %	20 %	40 %	40 %	376250400
135	NC_016787	GATCA	2	10	235785	235794	40 %	20 %	20 %	20 %	376250403
136	NC_016787	GCGCT	2	10	235908	235917	0 %	20 %	40 %	40 %	376250403
137	NC_016787	GACCT	2	10	237193	237202	20 %	20 %	20 %	40 %	376250405
138	NC_016787	TGGTC	2	10	239064	239073	0 %	40 %	40 %	20 %	376250407
139	NC_016787	CACGA	2	10	239245	239254	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_016787	GGCGA	2	10	240714	240723	20 %	0 %	60 %	20 %	376250409
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142	NC_016787	AGGGG	2	10	241353	241362	20 %	0 %	80 %	0 %	376250409
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150	NC_016787	AAAAG	2	10	260983	260992	80 %	0 %	20 %	0 %	376250428
151	NC_016787	TGGTG	2	10	263568	263577	0 %	40 %	60 %	0 %	376250430
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154	NC_016787	GTTGG	2	10	265566	265575	0 %	40 %	60 %	0 %	376250431
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162	NC_016787	GATTT	2	10	273698	273707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016787	TTTGG	2	10	274016	274025	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016787	ATGTT	2	10	274100	274109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016787	CTTTT	2	10	276374	276383	0 %	80 %	0 %	20 %	376250445
166	NC_016787	CAATC	2	10	277576	277585	40 %	20 %	0 %	40 %	376250447
167	NC_016787	GTCTG	2	10	278480	278489	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
168	NC_016787	TCGCT	2	10	281095	281104	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
169	NC_016787	CAACC	2	10	281448	281457	40 %	0 %	0 %	60 %	376250452
170	NC_016787	CATCG	2	10	281747	281756	20 %	20 %	20 %	40 %	376250452
171	NC_016787	CACTG	2	10	282040	282049	20 %	20 %	20 %	40 %	376250452
172	NC_016787	ACTGA	2	10	283949	283958	40 %	20 %	20 %	20 %	376250452
173	NC_016787	CAAGC	2	10	284694	284703	40 %	0 %	20 %	40 %	376250452
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177	NC_016787	CGCAG	2	10	292755	292764	20 %	0 %	40 %	40 %	376250457
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180	NC_016787	CGTAC	2	10	295774	295783	20 %	20 %	20 %	40 %	376250460
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183	NC_016787	TGATG	2	10	301339	301348	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
184	NC_016787	TGAAA	2	10	303355	303364	60 %	20 %	20 %	0 %	376250466
185	NC_016787	TTGAG	2	10	303435	303444	20 %	40 %	40 %	0 %	376250466
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187	NC_016787	CTTGG	2	10	305600	305609	0 %	40 %	40 %	20 %	376250467
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239	NC_016787	TCTGC	2	10	386490	386499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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249	NC_016787	ACCCG	2	10	410771	410780	20 %	0 %	20 %	60 %	376250579
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251	NC_016787	CCGAA	2	10	415251	415260	40 %	0 %	20 %	40 %	376250585
252	NC_016787	GCAAT	2	10	416105	416114	40 %	20 %	20 %	20 %	376250585
253	NC_016787	GGTGC	2	10	416431	416440	0 %	20 %	60 %	20 %	376250586
254	NC_016787	TATAA	2	10	419455	419464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_016787	GGCAA	2	10	421952	421961	40 %	0 %	40 %	20 %	376250590
256	NC_016787	TTATG	2	10	423176	423185	20 %	60 %	20 %	0 %	376250592
257	NC_016787	AGGGG	2	10	423997	424006	20 %	0 %	80 %	0 %	376250593
258	NC_016787	TCATC	2	10	427386	427395	20 %	40 %	0 %	40 %	376250595
259	NC_016787	AACGC	2	10	432660	432669	40 %	0 %	20 %	40 %	376250597
260	NC_016787	GCTCA	2	10	433757	433766	20 %	20 %	20 %	40 %	376250599
261	NC_016787	TGCGG	2	10	434484	434493	0 %	20 %	60 %	20 %	376250600
262	NC_016787	TGATG	2	10	437995	438004	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
263	NC_016787	ACCTG	2	10	441006	441015	20 %	20 %	20 %	40 %	376250606
264	NC_016787	GGCTG	2	10	443560	443569	0 %	20 %	60 %	20 %	376250607
265	NC_016787	TTTCC	2	10	445534	445543	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
266	NC_016787	CCATT	2	10	445664	445673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
267	NC_016787	ACGCG	2	10	446753	446762	20 %	0 %	40 %	40 %	376250610
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270	NC_016787	TTGCG	2	10	453539	453548	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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381	NC_016787	AGATC	2	10	640083	640092	40 %	20 %	20 %	20 %	376250797
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385	NC_016787	AAGCG	2	10	645749	645758	40 %	0 %	40 %	20 %	376250803
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394	NC_016787	CGTTA	2	10	669358	669367	20 %	40 %	20 %	20 %	376250823
395	NC_016787	CAAGG	2	10	670786	670795	40 %	0 %	40 %	20 %	376250823
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