MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC03 chromosome

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016787	AGCGA	2	10	2132	2141	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016787	TCGAC	2	10	14705	14714	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016787	TGTGA	2	10	19402	19411	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016787	GGTAA	2	10	28041	28050	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016787	AAAAG	2	10	63169	63178	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016787	GCCTA	2	10	77962	77971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016787	TCCAC	2	10	97345	97354	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_016787	TGCAC	2	10	105187	105196	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016787	TAATT	2	10	131757	131766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016787	TTAGC	2	10	133811	133820	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016787	CTGAC	2	10	146346	146355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016787	GAAGA	2	10	152410	152419	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016787	AGGGG	2	10	166549	166558	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016787	ACCCC	2	10	171384	171393	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
15	NC_016787	TTGGG	2	10	199083	199092	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016787	CACGA	2	10	239245	239254	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016787	CCAGT	2	10	273560	273569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016787	GATTT	2	10	273698	273707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016787	TTTGG	2	10	274016	274025	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016787	ATGTT	2	10	274100	274109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016787	GTCTG	2	10	278480	278489	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016787	TCGCT	2	10	281095	281104	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016787	TCCTT	2	10	299754	299763	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016787	TGATG	2	10	301339	301348	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016787	TTTTC	2	10	349145	349154	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016787	GTGCT	2	10	361475	361484	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016787	CACAC	2	10	363959	363968	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_016787	TGCGG	2	10	383580	383589	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016787	TTCGA	2	10	384659	384668	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016787	TCTGC	2	10	386490	386499	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016787	TATAA	2	10	419455	419464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016787	TGATG	2	10	437995	438004	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016787	TTTCC	2	10	445534	445543	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016787	CCATT	2	10	445664	445673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016787	TTGCG	2	10	453539	453548	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016787	CAGTG	2	10	461774	461783	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016787	CGCTA	2	10	472343	472352	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016787	AGGAA	2	10	477035	477044	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016787	ACGAT	2	10	520803	520812	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016787	TGGGG	2	10	529469	529478	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016787	TGATG	2	10	537750	537759	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016787	TTTTG	2	10	549376	549385	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016787	GTCTA	2	10	551950	551959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016787	GCCTT	2	10	557622	557631	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016787	CTTTC	2	10	574151	574160	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_016787	TGAGC	2	10	585473	585482	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016787	AGCCA	2	10	593044	593053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016787	GCTGC	2	10	606003	606012	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_016787	GGGAA	2	10	638910	638919	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016787	GCACC	2	10	645617	645626	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_016787	TTTTG	2	10	687822	687831	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016787	TCGAC	2	10	694060	694069	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016787	TGCGC	2	10	702320	702329	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016787	TCGTG	2	10	704672	704681	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016787	CGTCA	2	10	705008	705017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016787	TGTTT	2	10	705185	705194	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016787	GGGAG	2	10	706083	706092	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016787	TGGCA	2	10	708692	708701	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016787	TAGTT	2	10	717155	717164	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016787	ATGCG	2	10	718277	718286	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016787	GGGGC	2	10	741561	741570	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016787	ATCCT	2	10	741725	741734	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016787	GTGAA	2	10	749053	749062	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016787	TTCAA	3	15	749084	749098	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016787	AATTT	2	10	749440	749449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016787	CCGGG	2	10	756360	756369	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016787	TAGTG	2	10	763622	763631	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016787	CCTGT	2	10	773900	773909	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016787	CTTTC	2	10	787186	787195	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016787	TGCTG	2	10	811651	811660	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016787	TTTCC	2	10	825415	825424	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016787	GGAGG	2	10	827427	827436	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016787	TGCAA	2	10	858355	858364	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016787	ATTCG	2	10	858507	858516	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016787	GAAAG	2	10	859761	859770	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016787	GTGTC	2	10	970130	970139	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016787	GAGAA	2	10	988121	988130	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016787	GCACT	2	10	1024231	1024240	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_016787	GCCTC	2	10	1048376	1048385	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
80	NC_016787	GATCG	2	10	1066940	1066949	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016787	AACCT	2	10	1067681	1067690	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016787	GATTC	2	10	1073390	1073399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016787	CACTA	2	10	1081578	1081587	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_016787	ACACT	2	10	1103539	1103548	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016787	CATTT	2	10	1126168	1126177	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016787	TCGTG	2	10	1132758	1132767	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016787	CGTCA	2	10	1133094	1133103	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016787	TGTTT	2	10	1133271	1133280	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016787	GGGAG	2	10	1134169	1134178	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016787	TGGCA	2	10	1136778	1136787	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016787	TTTTC	2	10	1136981	1136990	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016787	TTCGT	2	10	1188131	1188140	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016787	CCTAC	2	10	1191809	1191818	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_016787	CCTTA	2	10	1215734	1215743	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_016787	TCAAG	2	10	1253238	1253247	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016787	AAAAG	2	10	1261840	1261849	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016787	GCCAT	2	10	1274444	1274453	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_016787	ACCGT	2	10	1274545	1274554	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016787	CGACG	2	10	1295635	1295644	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_016787	CAAAT	2	10	1298630	1298639	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016787	AAAAT	2	10	1323213	1323222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016787	AAACA	2	10	1362771	1362780	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016787	TTTAT	2	10	1363768	1363777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016787	AATGT	2	10	1375335	1375344	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016787	AGCAA	2	10	1389732	1389741	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016787	GAACG	2	10	1389841	1389850	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016787	TGTTT	2	10	1402654	1402663	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016787	GCATT	2	10	1405375	1405384	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016787	AGAAT	2	10	1434351	1434360	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016787	AGTGG	2	10	1443971	1443980	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016787	AATTG	2	10	1444035	1444044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016787	GCGCC	2	10	1444058	1444067	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_016787	CAGTA	2	10	1451303	1451312	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016787	CAAAA	2	10	1455844	1455853	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016787	AAGTT	2	10	1512710	1512719	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016787	AAACC	2	10	1521468	1521477	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016787	TAACC	2	10	1524031	1524040	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_016787	GCAGC	2	10	1532600	1532609	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_016787	AGACA	2	10	1541177	1541186	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016787	CCCCA	2	10	1551319	1551328	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
121	NC_016787	AGCAC	2	10	1577032	1577041	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016787	TTCGT	2	10	1580483	1580492	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016787	CTTTA	2	10	1602142	1602151	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016787	ACCAA	2	10	1617629	1617638	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_016787	TTTAT	2	10	1649365	1649374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016787	CGTTT	2	10	1651582	1651591	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016787	CATCT	2	10	1664011	1664020	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016787	TTAGG	2	10	1665934	1665943	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016787	ATCAC	2	10	1675145	1675154	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_016787	AGAAA	2	10	1683824	1683833	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016787	TTCAA	2	10	1708852	1708861	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016787	GTGTG	2	10	1767990	1767999	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016787	CAGCG	2	10	1795004	1795013	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_016787	TGCAC	2	10	1812292	1812301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016787	GAATC	2	10	1812467	1812476	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016787	TTTCT	2	10	1815191	1815200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016787	TCCCC	2	10	1823162	1823171	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
138	NC_016787	GCAAA	2	10	1834626	1834635	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016787	GGTTG	2	10	1847078	1847087	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016787	TTTTC	2	10	1848215	1848224	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_016787	TCCCC	2	10	1864940	1864949	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
142	NC_016787	ACCCC	2	10	1883318	1883327	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
143	NC_016787	TGCCA	2	10	1883680	1883689	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_016787	CTCCC	2	10	1886289	1886298	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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147	NC_016787	CACGA	2	10	1887700	1887709	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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158	NC_016787	GATGT	2	10	2060228	2060237	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016787	TTGAG	2	10	2090794	2090803	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016787	TATTT	2	10	2090956	2090965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016787	AATTT	2	10	2091061	2091070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016787	ACTTC	2	10	2092555	2092564	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
163	NC_016787	TCACA	2	10	2099581	2099590	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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166	NC_016787	CAGTG	2	10	2125684	2125693	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
167	NC_016787	TTTTA	2	10	2133075	2133084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016787	CTACA	2	10	2136004	2136013	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_016787	TGTGG	2	10	2172549	2172558	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016787	ACCCC	2	10	2174823	2174832	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
174	NC_016787	TGCCA	2	10	2175183	2175192	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
175	NC_016787	CTCCC	2	10	2177792	2177801	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
176	NC_016787	CACAC	2	10	2178631	2178640	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
177	NC_016787	TGACG	2	10	2178867	2178876	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
178	NC_016787	CACGA	2	10	2179203	2179212	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
179	NC_016787	CCACC	2	10	2221224	2221233	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
180	NC_016787	GCGGG	2	10	2225978	2225987	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
181	NC_016787	AATCG	2	10	2238197	2238206	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
182	NC_016787	TACCC	2	10	2244931	2244940	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
183	NC_016787	CCGCA	2	10	2250259	2250268	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
184	NC_016787	CCGCC	2	10	2250368	2250377	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
185	NC_016787	AGCCA	2	10	2251003	2251012	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
186	NC_016787	CACAT	2	10	2284738	2284747	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
187	NC_016787	GCACA	2	10	2303715	2303724	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
188	NC_016787	AAACC	2	10	2329288	2329297	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
189	NC_016787	CCCAG	2	10	2350501	2350510	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
190	NC_016787	TGCCA	2	10	2352242	2352251	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
191	NC_016787	CTCCC	2	10	2354851	2354860	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
192	NC_016787	CACAC	2	10	2355690	2355699	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
193	NC_016787	TGACG	2	10	2355926	2355935	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
194	NC_016787	CACGA	2	10	2356262	2356271	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
195	NC_016787	AAAAG	2	10	2360211	2360220	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_016787	TGGGT	2	10	2362575	2362584	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
197	NC_016787	GCAGC	2	10	2387967	2387976	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
198	NC_016787	TCTAA	2	10	2390015	2390024	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_016787	CACTT	2	10	2411123	2411132	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
200	NC_016787	GAACT	2	10	2412308	2412317	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
201	NC_016787	CACAA	2	10	2417001	2417010	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
202	NC_016787	TCCTT	2	10	2420109	2420118	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
203	NC_016787	AAAAC	2	10	2429523	2429532	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
204	NC_016787	TGGTC	2	10	2430860	2430869	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
205	NC_016787	CGTGG	2	10	2434827	2434836	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
206	NC_016787	GCTTT	2	10	2437492	2437501	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
207	NC_016787	AAGGA	2	10	2471334	2471343	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
208	NC_016787	GCACA	2	10	2472544	2472553	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
209	NC_016787	ACCGC	2	10	2476831	2476840	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
210	NC_016787	ATTAC	2	10	2478004	2478013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
211	NC_016787	AAAAT	2	10	2478063	2478072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.