MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC01 chromosome

Total Repeats: 1199

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016786	CCGTG	2	10	3253	3262	0 %	20 %	40 %	40 %	376244564
2	NC_016786	AAAGA	2	10	3721	3730	80 %	0 %	20 %	0 %	376244565
3	NC_016786	CCACC	2	10	6213	6222	20 %	0 %	0 %	80 %	376244567
4	NC_016786	GCCTA	2	10	8476	8485	20 %	20 %	20 %	40 %	376244570
5	NC_016786	CGCAC	2	10	10542	10551	20 %	0 %	20 %	60 %	376244571
6	NC_016786	GAGTC	2	10	14086	14095	20 %	20 %	40 %	20 %	376244574
7	NC_016786	CAGGG	2	10	16554	16563	20 %	0 %	60 %	20 %	376244576
8	NC_016786	GATTC	2	10	23138	23147	20 %	40 %	20 %	20 %	376244582
9	NC_016786	TGCGC	2	10	23452	23461	0 %	20 %	40 %	40 %	376244583
10	NC_016786	GCGCT	2	10	24479	24488	0 %	20 %	40 %	40 %	376244584
11	NC_016786	TGGGG	2	10	32220	32229	0 %	20 %	80 %	0 %	376244593
12	NC_016786	CACCT	2	10	33031	33040	20 %	20 %	0 %	60 %	376244593
13	NC_016786	AATTG	2	10	35323	35332	40 %	40 %	20 %	0 %	376244596
14	NC_016786	AGAAA	2	10	37924	37933	80 %	0 %	20 %	0 %	376244596
15	NC_016786	CATCA	2	10	38392	38401	40 %	20 %	0 %	40 %	376244597
16	NC_016786	CGGCA	2	10	38589	38598	20 %	0 %	40 %	40 %	376244597
17	NC_016786	GGTGT	2	10	39239	39248	0 %	40 %	60 %	0 %	376244598
18	NC_016786	CGGTG	2	10	41504	41513	0 %	20 %	60 %	20 %	376244601
19	NC_016786	GTGCT	2	10	42947	42956	0 %	40 %	40 %	20 %	376244604
20	NC_016786	GGGTT	2	10	43695	43704	0 %	40 %	60 %	0 %	376244604
21	NC_016786	TGGCG	2	10	45425	45434	0 %	20 %	60 %	20 %	376244605
22	NC_016786	GCGCA	2	10	45688	45697	20 %	0 %	40 %	40 %	376244605
23	NC_016786	CGCAG	2	10	48205	48214	20 %	0 %	40 %	40 %	376244607
24	NC_016786	GCCAC	2	10	48364	48373	20 %	0 %	20 %	60 %	376244607
25	NC_016786	TGCGG	2	10	49087	49096	0 %	20 %	60 %	20 %	376244607
26	NC_016786	TGAGG	2	10	50654	50663	20 %	20 %	60 %	0 %	376244608
27	NC_016786	TACGA	2	10	51255	51264	40 %	20 %	20 %	20 %	376244610
28	NC_016786	TGTGG	2	10	55657	55666	0 %	40 %	60 %	0 %	376244615
29	NC_016786	CAGTC	2	10	55977	55986	20 %	20 %	20 %	40 %	376244615
30	NC_016786	TTCCA	2	10	56352	56361	20 %	40 %	0 %	40 %	376244615
31	NC_016786	GCCTG	2	10	59049	59058	0 %	20 %	40 %	40 %	376244619
32	NC_016786	CGACG	2	10	59783	59792	20 %	0 %	40 %	40 %	376244621
33	NC_016786	CAAGC	2	10	59830	59839	40 %	0 %	20 %	40 %	376244621
34	NC_016786	TGCTT	2	10	61533	61542	0 %	60 %	20 %	20 %	376244624
35	NC_016786	CAGTT	2	10	63169	63178	20 %	40 %	20 %	20 %	376244626
36	NC_016786	GGGCT	2	10	64696	64705	0 %	20 %	60 %	20 %	376244628
37	NC_016786	TTTTG	2	10	65815	65824	0 %	80 %	20 %	0 %	376244629
38	NC_016786	AGAGC	2	10	66124	66133	40 %	0 %	40 %	20 %	376244629
39	NC_016786	AAACG	2	10	66840	66849	60 %	0 %	20 %	20 %	376244630
40	NC_016786	GGCGA	2	10	68891	68900	20 %	0 %	60 %	20 %	376244634
41	NC_016786	ACGCA	2	10	69954	69963	40 %	0 %	20 %	40 %	376244635
42	NC_016786	GCTGT	2	10	71015	71024	0 %	40 %	40 %	20 %	376244635
43	NC_016786	TCAGC	2	10	71646	71655	20 %	20 %	20 %	40 %	376244637
44	NC_016786	GCTTG	2	10	72984	72993	0 %	40 %	40 %	20 %	376244640
45	NC_016786	CGTCG	2	10	73031	73040	0 %	20 %	40 %	40 %	376244640
46	NC_016786	TGCTG	2	10	77130	77139	0 %	40 %	40 %	20 %	376244649
47	NC_016786	TCACC	2	10	78864	78873	20 %	20 %	0 %	60 %	376244650
48	NC_016786	AGGAG	2	10	82327	82336	40 %	0 %	60 %	0 %	376244654
49	NC_016786	ACCAA	2	10	82340	82349	60 %	0 %	0 %	40 %	376244654
50	NC_016786	CGGTG	2	10	83544	83553	0 %	20 %	60 %	20 %	376244656
51	NC_016786	GACTG	2	10	86152	86161	20 %	20 %	40 %	20 %	376244660
52	NC_016786	TGGCT	2	10	90926	90935	0 %	40 %	40 %	20 %	376244666
53	NC_016786	GCGCT	2	10	92799	92808	0 %	20 %	40 %	40 %	376244669
54	NC_016786	CGTTC	2	10	93550	93559	0 %	40 %	20 %	40 %	376244669
55	NC_016786	CCAAG	2	10	95500	95509	40 %	0 %	20 %	40 %	376244671
56	NC_016786	GCGTG	2	10	96599	96608	0 %	20 %	60 %	20 %	376244673
57	NC_016786	CTCAA	2	10	97856	97865	40 %	20 %	0 %	40 %	376244674
58	NC_016786	GCCCA	2	10	98057	98066	20 %	0 %	20 %	60 %	376244674
59	NC_016786	CCGCA	2	10	101841	101850	20 %	0 %	20 %	60 %	376244679
60	NC_016786	CATCG	2	10	104473	104482	20 %	20 %	20 %	40 %	376244683
61	NC_016786	GGCCA	2	10	108454	108463	20 %	0 %	40 %	40 %	376244685
62	NC_016786	TCCGC	2	10	111229	111238	0 %	20 %	20 %	60 %	376244689
63	NC_016786	GTGGG	2	10	114458	114467	0 %	20 %	80 %	0 %	376244692
64	NC_016786	ACACC	2	10	116552	116561	40 %	0 %	0 %	60 %	376244696
65	NC_016786	CCTCA	2	10	117792	117801	20 %	20 %	0 %	60 %	376244698
66	NC_016786	CCGCA	2	10	119170	119179	20 %	0 %	20 %	60 %	376244700
67	NC_016786	AACCG	2	10	122118	122127	40 %	0 %	20 %	40 %	376244705
68	NC_016786	ACTGA	2	10	122969	122978	40 %	20 %	20 %	20 %	376244707
69	NC_016786	ACGGT	2	10	124939	124948	20 %	20 %	40 %	20 %	376244710
70	NC_016786	TGACC	2	10	126398	126407	20 %	20 %	20 %	40 %	376244713
71	NC_016786	CTGGG	2	10	126450	126459	0 %	20 %	60 %	20 %	376244713
72	NC_016786	GGCGG	2	10	128078	128087	0 %	0 %	80 %	20 %	376244714
73	NC_016786	CCACG	2	10	131061	131070	20 %	0 %	20 %	60 %	376244716
74	NC_016786	CCAGT	2	10	134722	134731	20 %	20 %	20 %	40 %	376244721
75	NC_016786	TGCCT	2	10	134950	134959	0 %	40 %	20 %	40 %	376244721
76	NC_016786	ACCAG	2	10	136983	136992	40 %	0 %	20 %	40 %	376244721
77	NC_016786	CCTGG	2	10	140133	140142	0 %	20 %	40 %	40 %	376244723
78	NC_016786	GCTGT	2	10	143820	143829	0 %	40 %	40 %	20 %	376244728
79	NC_016786	TCTGG	2	10	143892	143901	0 %	40 %	40 %	20 %	376244728
80	NC_016786	ATGCG	2	10	144450	144459	20 %	20 %	40 %	20 %	376244729
81	NC_016786	GTCGC	2	10	145188	145197	0 %	20 %	40 %	40 %	376244730
82	NC_016786	GATGC	2	10	145534	145543	20 %	20 %	40 %	20 %	376244730
83	NC_016786	TGGTC	2	10	146498	146507	0 %	40 %	40 %	20 %	376244731
84	NC_016786	GGGTG	2	10	147600	147609	0 %	20 %	80 %	0 %	376244732
85	NC_016786	GTTTG	2	10	147988	147997	0 %	60 %	40 %	0 %	376244732
86	NC_016786	GTGAT	2	10	148130	148139	20 %	40 %	40 %	0 %	376244733
87	NC_016786	GTTCG	2	10	153185	153194	0 %	40 %	40 %	20 %	376244738
88	NC_016786	GCGTG	2	10	154006	154015	0 %	20 %	60 %	20 %	376244739
89	NC_016786	TCGGG	2	10	160745	160754	0 %	20 %	60 %	20 %	376244744
90	NC_016786	CAATT	2	10	160960	160969	40 %	40 %	0 %	20 %	376244744
91	NC_016786	TGCGG	2	10	161146	161155	0 %	20 %	60 %	20 %	376244744
92	NC_016786	ACTCC	2	10	161352	161361	20 %	20 %	0 %	60 %	376244744
93	NC_016786	TGGGG	2	10	161510	161519	0 %	20 %	80 %	0 %	376244744
94	NC_016786	GCCAA	2	10	163866	163875	40 %	0 %	20 %	40 %	376244748
95	NC_016786	TCTTG	2	10	166209	166218	0 %	60 %	20 %	20 %	376244752
96	NC_016786	GCGGG	2	10	166219	166228	0 %	0 %	80 %	20 %	376244752
97	NC_016786	TGACC	2	10	167100	167109	20 %	20 %	20 %	40 %	376244753
98	NC_016786	CTGGG	2	10	172914	172923	0 %	20 %	60 %	20 %	376244756
99	NC_016786	ATCTG	2	10	176076	176085	20 %	40 %	20 %	20 %	376244761
100	NC_016786	AGCTG	2	10	176199	176208	20 %	20 %	40 %	20 %	376244761
101	NC_016786	ACCAC	2	10	178070	178079	40 %	0 %	0 %	60 %	376244764
102	NC_016786	AATTA	2	10	179251	179260	60 %	40 %	0 %	0 %	376244765
103	NC_016786	TGCGG	2	10	181428	181437	0 %	20 %	60 %	20 %	376244767
104	NC_016786	GCGCT	2	10	184732	184741	0 %	20 %	40 %	40 %	376244769
105	NC_016786	GCGCC	2	10	184930	184939	0 %	0 %	40 %	60 %	376244769
106	NC_016786	TGGGG	2	10	188909	188918	0 %	20 %	80 %	0 %	376244773
107	NC_016786	TCCTG	2	10	189018	189027	0 %	40 %	20 %	40 %	376244773
108	NC_016786	CTCGT	2	10	189605	189614	0 %	40 %	20 %	40 %	376244774
109	NC_016786	GCAGA	2	10	193866	193875	40 %	0 %	40 %	20 %	376244777
110	NC_016786	TTGCC	2	10	196723	196732	0 %	40 %	20 %	40 %	376244781
111	NC_016786	GTTGC	2	10	197140	197149	0 %	40 %	40 %	20 %	376244781
112	NC_016786	AGAAA	2	10	202841	202850	80 %	0 %	20 %	0 %	376244785
113	NC_016786	CAGCT	2	10	206012	206021	20 %	20 %	20 %	40 %	376244789
114	NC_016786	ACCCC	2	10	206205	206214	20 %	0 %	0 %	80 %	376244789
115	NC_016786	GGTGC	2	10	206807	206816	0 %	20 %	60 %	20 %	376244789
116	NC_016786	CCGCT	2	10	207144	207153	0 %	20 %	20 %	60 %	376244789
117	NC_016786	GCCCA	2	10	209093	209102	20 %	0 %	20 %	60 %	376244791
118	NC_016786	GAGCA	2	10	209236	209245	40 %	0 %	40 %	20 %	376244791
119	NC_016786	CGAGG	2	10	209359	209368	20 %	0 %	60 %	20 %	376244791
120	NC_016786	GGACA	2	10	211672	211681	40 %	0 %	40 %	20 %	376244793
121	NC_016786	CCCAA	2	10	212479	212488	40 %	0 %	0 %	60 %	376244793
122	NC_016786	GCACC	2	10	213312	213321	20 %	0 %	20 %	60 %	376244793
123	NC_016786	AAGAC	2	10	213921	213930	60 %	0 %	20 %	20 %	376244793
124	NC_016786	AACGC	2	10	218687	218696	40 %	0 %	20 %	40 %	376244797
125	NC_016786	CCGCA	2	10	223193	223202	20 %	0 %	20 %	60 %	376244801
126	NC_016786	ACTGA	2	10	227027	227036	40 %	20 %	20 %	20 %	376244806
127	NC_016786	GCCAC	2	10	227055	227064	20 %	0 %	20 %	60 %	376244806
128	NC_016786	CGCCA	2	10	227529	227538	20 %	0 %	20 %	60 %	376244807
129	NC_016786	CAAAC	2	10	228235	228244	60 %	0 %	0 %	40 %	376244808
130	NC_016786	CACAA	2	10	230845	230854	60 %	0 %	0 %	40 %	376244809
131	NC_016786	AAACC	2	10	231544	231553	60 %	0 %	0 %	40 %	376244809
132	NC_016786	TGACC	2	10	236294	236303	20 %	20 %	20 %	40 %	376244813
133	NC_016786	GTGCC	2	10	237698	237707	0 %	20 %	40 %	40 %	376244814
134	NC_016786	GATCA	2	10	239231	239240	40 %	20 %	20 %	20 %	376244817
135	NC_016786	GCGCT	2	10	239354	239363	0 %	20 %	40 %	40 %	376244817
136	NC_016786	GACCT	2	10	240639	240648	20 %	20 %	20 %	40 %	376244820
137	NC_016786	GCCGA	2	10	241639	241648	20 %	0 %	40 %	40 %	376244821
138	NC_016786	TGGTC	2	10	242510	242519	0 %	40 %	40 %	20 %	376244822
139	NC_016786	GGCGA	2	10	244160	244169	20 %	0 %	60 %	20 %	376244824
140	NC_016786	GGCGC	2	10	244352	244361	0 %	0 %	60 %	40 %	376244824
141	NC_016786	TCCGT	2	10	248251	248260	0 %	40 %	20 %	40 %	376244828
142	NC_016786	GCGCA	2	10	253083	253092	20 %	0 %	40 %	40 %	376244835
143	NC_016786	CGCAG	2	10	259815	259824	20 %	0 %	40 %	40 %	376244841
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145	NC_016786	GGTGA	2	10	261445	261454	20 %	20 %	60 %	0 %	376244842
146	NC_016786	CAACC	2	10	262799	262808	40 %	0 %	0 %	60 %	376244843
147	NC_016786	AAAAG	2	10	264428	264437	80 %	0 %	20 %	0 %	376244843
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149	NC_016786	TGGTG	2	10	267011	267020	0 %	40 %	60 %	0 %	376244847
150	NC_016786	CACCG	2	10	268508	268517	20 %	0 %	20 %	60 %	376244848
151	NC_016786	GTTGG	2	10	269009	269018	0 %	40 %	60 %	0 %	376244848
152	NC_016786	GCCAC	2	10	269691	269700	20 %	0 %	20 %	60 %	376244848
153	NC_016786	GTGGG	2	10	269845	269854	0 %	20 %	80 %	0 %	376244848
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155	NC_016786	GCCTC	2	10	270541	270550	0 %	20 %	20 %	60 %	376244849
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157	NC_016786	CTTTT	2	10	277564	277573	0 %	80 %	0 %	20 %	376244854
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161	NC_016786	TCCGC	2	10	284207	284216	0 %	20 %	20 %	60 %	376244862
162	NC_016786	CTTGC	2	10	284577	284586	0 %	40 %	20 %	40 %	376244863
163	NC_016786	CGTAC	2	10	286984	286993	20 %	20 %	20 %	40 %	376244865
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165	NC_016786	TTGAG	2	10	294645	294654	20 %	40 %	40 %	0 %	376244871
166	NC_016786	CGATC	2	10	295114	295123	20 %	20 %	20 %	40 %	376244871
167	NC_016786	CTTGG	2	10	296810	296819	0 %	40 %	40 %	20 %	376244872
168	NC_016786	GATGA	2	10	298586	298595	40 %	20 %	40 %	0 %	376244873
169	NC_016786	CCGAT	2	10	300813	300822	20 %	20 %	20 %	40 %	376244877
170	NC_016786	CCAGA	2	10	304362	304371	40 %	0 %	20 %	40 %	376244883
171	NC_016786	TTGCC	2	10	304539	304548	0 %	40 %	20 %	40 %	376244883
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174	NC_016786	TGCAG	2	10	308771	308780	20 %	20 %	40 %	20 %	376244886
175	NC_016786	CGCAG	2	10	313219	313228	20 %	0 %	40 %	40 %	376244889
176	NC_016786	CATGG	2	10	314461	314470	20 %	20 %	40 %	20 %	376244890
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178	NC_016786	GCTGA	2	10	318663	318672	20 %	20 %	40 %	20 %	376244895
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252	NC_016786	GGTTG	2	10	470240	470249	0 %	40 %	60 %	0 %	376245042
253	NC_016786	CATGG	2	10	472533	472542	20 %	20 %	40 %	20 %	376245043
254	NC_016786	GGTGC	2	10	473830	473839	0 %	20 %	60 %	20 %	376245044
255	NC_016786	GCATG	2	10	479440	479449	20 %	20 %	40 %	20 %	376245052
256	NC_016786	GGGTC	2	10	481587	481596	0 %	20 %	60 %	20 %	376245054
257	NC_016786	GTAAG	2	10	483146	483155	40 %	20 %	40 %	0 %	376245055
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259	NC_016786	CAGCG	2	10	484439	484448	20 %	0 %	40 %	40 %	376245057
260	NC_016786	ATCCA	2	10	488832	488841	40 %	20 %	0 %	40 %	376245060
261	NC_016786	CGTGG	2	10	490845	490854	0 %	20 %	60 %	20 %	376245063
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263	NC_016786	GCTCA	2	10	495072	495081	20 %	20 %	20 %	40 %	376245068
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382	NC_016786	ATGGC	2	10	752237	752246	20 %	20 %	40 %	20 %	376245302
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384	NC_016786	CATTG	2	10	758535	758544	20 %	40 %	20 %	20 %	376245307
385	NC_016786	CGCAG	2	10	759585	759594	20 %	0 %	40 %	40 %	376245308
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389	NC_016786	TGTGG	2	10	768636	768645	0 %	40 %	60 %	0 %	376245317
390	NC_016786	GGATC	2	10	769170	769179	20 %	20 %	40 %	20 %	376245318
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