MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC01 chromosome

Total Repeats: 718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016786	AGCG	2	8	2146	2153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016786	GATC	2	8	2279	2286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016786	CAGG	2	8	14707	14714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016786	CCGG	2	8	14995	15002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016786	CCAG	2	8	19230	19237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016786	CCAG	2	8	20296	20303	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016786	GCAC	2	8	20378	20385	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016786	TAAC	2	8	25764	25771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016786	ATAA	2	8	26569	26576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016786	AGAT	2	8	27189	27196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016786	AGTG	2	8	27446	27453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016786	GAAG	2	8	27536	27543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016786	CAAC	2	8	31188	31195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016786	TAAT	2	8	34879	34886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016786	TTAA	2	8	34948	34955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016786	GCAG	3	12	39694	39705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016786	AAAT	2	8	42038	42045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016786	TTGT	2	8	42417	42424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016786	CTAA	2	8	42510	42517	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016786	CGGA	2	8	52544	52551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016786	TTGA	2	8	56513	56520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016786	AGAA	2	8	56728	56735	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016786	TTTC	2	8	57658	57665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016786	ATAG	2	8	57701	57708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016786	CTTA	2	8	57935	57942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016786	GCAC	2	8	57978	57985	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016786	CGGA	2	8	71118	71125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016786	CTGA	2	8	72050	72057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016786	TCTG	2	8	72094	72101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016786	ATGG	2	8	72215	72222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016786	ATTC	2	8	72233	72240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016786	GCGG	2	8	72581	72588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016786	GCGT	2	8	73362	73369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016786	TAAG	2	8	73407	73414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016786	CTAT	2	8	73641	73648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016786	TGGA	2	8	75156	75163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016786	CCGA	2	8	75486	75493	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016786	TAAT	2	8	81418	81425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016786	ATGG	2	8	81451	81458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016786	GGTG	2	8	85439	85446	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016786	GGGA	2	8	94442	94449	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016786	CTGA	2	8	101745	101752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016786	GTTA	2	8	118565	118572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016786	GAAG	2	8	119319	119326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016786	GATG	2	8	119798	119805	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016786	CAAC	2	8	119809	119816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016786	AAGA	2	8	124381	124388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016786	CCTG	2	8	124758	124765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016786	TTGA	2	8	125222	125229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016786	CTTT	2	8	140719	140726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016786	AACA	2	8	142280	142287	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016786	CCCG	2	8	143570	143577	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_016786	ACTA	2	8	152694	152701	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016786	CCGC	2	8	158826	158833	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_016786	GCTC	2	8	166298	166305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016786	CAGG	2	8	173340	173347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016786	GGGC	2	8	173401	173408	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016786	GCCC	2	8	173426	173433	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_016786	GCAA	2	8	173563	173570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016786	AGCG	2	8	174262	174269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016786	GCCC	2	8	174619	174626	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_016786	CTTG	2	8	175142	175149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016786	AGAT	2	8	176429	176436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016786	TTGA	2	8	178654	178661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016786	GAAA	2	8	178868	178875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016786	CCGC	2	8	180211	180218	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_016786	AACC	2	8	180230	180237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016786	GCTG	2	8	182701	182708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016786	ATGC	2	8	185214	185221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016786	ACAT	2	8	185226	185233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016786	CGCT	2	8	186665	186672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016786	GTGG	2	8	189311	189318	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016786	CGAG	2	8	203030	203037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016786	CCAC	2	8	205133	205140	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_016786	GAAA	2	8	214702	214709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016786	TTGG	2	8	238519	238526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016786	GGTC	2	8	245424	245431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016786	ACCC	2	8	247125	247132	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_016786	GCCC	2	8	247224	247231	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_016786	TTTG	2	8	254123	254130	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016786	GCTA	2	8	254546	254553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016786	ATTG	2	8	254575	254582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016786	GTAC	2	8	261999	262006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016786	CTAA	2	8	271205	271212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016786	CATG	2	8	274361	274368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016786	GACA	2	8	274385	274392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016786	AGCT	2	8	274497	274504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016786	TCAT	2	8	274696	274703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016786	AGCG	2	8	276355	276362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016786	GACT	2	8	279527	279534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016786	GCTA	2	8	279681	279688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016786	GCTG	2	8	279788	279795	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016786	TTTA	2	8	279866	279873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016786	AGGC	2	8	281535	281542	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016786	CTAA	2	8	281856	281863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016786	TCAA	2	8	286570	286577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016786	CAGG	2	8	303964	303971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016786	TTGG	2	8	312758	312765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016786	CTTT	2	8	320031	320038	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016786	CGTG	2	8	320206	320213	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016786	GCGG	2	8	320559	320566	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016786	GTAC	2	8	320614	320621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016786	ATCA	2	8	323075	323082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016786	ATGT	2	8	351993	352000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016786	ATTA	2	8	355595	355602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016786	AGGA	2	8	356604	356611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016786	CTTC	2	8	376916	376923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016786	GGTT	2	8	376954	376961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016786	ACTG	2	8	377880	377887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016786	TAAA	2	8	378263	378270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016786	AAAT	2	8	384049	384056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016786	GCTA	2	8	384778	384785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016786	TTCC	2	8	385891	385898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016786	GCCG	2	8	398396	398403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016786	ACTA	2	8	400432	400439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016786	GATT	2	8	406205	406212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016786	TCGT	2	8	410033	410040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016786	AATT	2	8	411625	411632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016786	TAAA	2	8	411708	411715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016786	CGCT	2	8	411868	411875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016786	GATG	2	8	418041	418048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016786	TGAG	2	8	421667	421674	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016786	CCTG	2	8	436068	436075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016786	ATTT	2	8	436334	436341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016786	AGGC	2	8	437261	437268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016786	TTAA	2	8	450849	450856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016786	CTTT	2	8	452188	452195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016786	GGTT	2	8	455202	455209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016786	AGGA	2	8	461836	461843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016786	GTGG	2	8	467689	467696	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016786	GGGT	2	8	467767	467774	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016786	GAAA	2	8	469897	469904	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016786	TCTA	2	8	470978	470985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016786	GTTT	2	8	473248	473255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016786	CGAA	2	8	474327	474334	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016786	ATGT	2	8	474356	474363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016786	ATCC	2	8	476229	476236	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016786	AGGG	2	8	488407	488414	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016786	ATTG	2	8	489232	489239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016786	CTGG	2	8	489454	489461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016786	AGAC	2	8	489469	489476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016786	GAAA	2	8	494935	494942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016786	ACCA	2	8	498561	498568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016786	CTGC	2	8	508489	508496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016786	AAGG	2	8	515670	515677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016786	ACTA	2	8	518569	518576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016786	AAGG	2	8	518585	518592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016786	ATCC	2	8	518996	519003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016786	TAGC	2	8	520280	520287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016786	GACA	2	8	520683	520690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016786	GTTT	2	8	526810	526817	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_016786	CTGG	2	8	1651917	1651924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_016786	AGGC	2	8	1665577	1665584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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