MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae CDCE 8392 chromosome

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016785	TAATCC	2	12	12943	12954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016785	AAGCTA	2	12	20123	20134	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016785	TTGACA	2	12	55884	55895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016785	TGGTTT	2	12	56159	56170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016785	AACAGG	2	12	106409	106420	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016785	CACTTC	2	12	137214	137225	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016785	CCCGCA	2	12	171386	171397	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016785	GAGTTC	2	12	175571	175582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016785	CAAGGA	2	12	184706	184717	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016785	CACGAA	2	12	205424	205435	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016785	AAAACA	2	12	206497	206508	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016785	CCTATT	2	12	245592	245603	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016785	GCCACC	2	12	299510	299521	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016785	TTATGG	2	12	347548	347559	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016785	ACAAGG	2	12	423091	423102	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016785	CGCTAT	2	12	468886	468897	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016785	GCACCT	2	12	487895	487906	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016785	AAAAAC	2	12	538308	538319	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016785	TGGTGC	2	12	568172	568183	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016785	GGGGCA	2	12	574067	574078	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016785	TAAGCG	2	12	600752	600763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016785	GTTTGG	2	12	694989	695000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016785	GAGGGC	2	12	710521	710532	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016785	TGTTTT	2	12	713054	713065	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016785	AGCGAA	2	12	714092	714103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016785	GCGCAT	2	12	716839	716850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016785	AGGTTC	2	12	745204	745215	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016785	TCACCA	2	12	804639	804650	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016785	AAAAAG	2	12	806707	806718	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016785	TCAAAG	2	12	806722	806733	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016785	TCCATC	2	12	816447	816458	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016785	CAACGC	2	12	816530	816541	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016785	TGTAAG	2	12	886389	886400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016785	AAACCA	2	12	1049917	1049928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016785	TTGGTT	2	12	1080131	1080142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016785	TGTTTT	2	12	1124069	1124080	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016785	AGCGAA	2	12	1125107	1125118	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016785	AAATAA	2	12	1137810	1137821	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016785	GACAGT	2	12	1155573	1155584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016785	TTGAGG	2	12	1160049	1160060	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016785	AAAAAC	2	12	1213561	1213572	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016785	TGCCAC	2	12	1226213	1226224	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016785	ACCAGC	2	12	1352486	1352497	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016785	ACAGAA	2	12	1357757	1357768	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016785	TCAATG	2	12	1419992	1420003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016785	TCTTAG	2	12	1420258	1420269	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016785	CTGCAT	2	12	1462264	1462275	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016785	TGCAGC	2	12	1469051	1469062	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016785	GACGGT	2	12	1511723	1511734	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016785	GCTGTG	3	18	1739550	1739567	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016785	GCAACC	2	12	1752156	1752167	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016785	ATGCGC	2	12	1855927	1855938	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016785	TTCGCT	2	12	1858675	1858686	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016785	GCAGTG	2	12	1874979	1874990	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016785	CGGTGA	2	12	1877394	1877405	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016785	CGATTG	2	12	1883894	1883905	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016785	TGCCTA	2	12	2004858	2004869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016785	ATCCAG	2	12	2054711	2054722	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016785	AACCGG	2	12	2094851	2094862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016785	CCCTAG	2	12	2140586	2140597	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016785	TTCGCT	2	12	2143423	2143434	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016785	AAAGGA	2	12	2255642	2255653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016785	AAAAAG	2	12	2313925	2313936	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016785	ATGCGC	2	12	2317879	2317890	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016785	TTCGCT	2	12	2320625	2320636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016785	ATTGTT	2	12	2329516	2329527	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016785	TCCCTT	2	12	2380337	2380348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016785	CGCCAT	2	12	2380392	2380403	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.