MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium diphtheriae CDCE 8392 chromosome

Total Repeats: 1411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016785	CAGCA	2	10	506	515	40 %	0 %	20 %	40 %	376241701
2	NC_016785	AGCGA	2	10	2150	2159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016785	CGGTG	2	10	2363	2372	0 %	20 %	60 %	20 %	376241702
4	NC_016785	CCACC	2	10	6221	6230	20 %	0 %	0 %	80 %	376241705
5	NC_016785	GCCTA	2	10	8484	8493	20 %	20 %	20 %	40 %	376241708
6	NC_016785	CGCAC	2	10	10550	10559	20 %	0 %	20 %	60 %	376241709
7	NC_016785	GAGTC	2	10	14079	14088	20 %	20 %	40 %	20 %	376241712
8	NC_016785	TCGAC	2	10	14721	14730	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016785	CCAGG	2	10	16545	16554	20 %	0 %	40 %	40 %	376241714
10	NC_016785	GATTC	2	10	23223	23232	20 %	40 %	20 %	20 %	376241719
11	NC_016785	TGCGC	2	10	23537	23546	0 %	20 %	40 %	40 %	376241720
12	NC_016785	GCGCT	2	10	24564	24573	0 %	20 %	40 %	40 %	376241721
13	NC_016785	CACCT	2	10	34311	34320	20 %	20 %	0 %	60 %	376241729
14	NC_016785	CCGCA	2	10	35315	35324	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_016785	AGCCA	2	10	35662	35671	40 %	0 %	20 %	40 %	376241731
16	NC_016785	AGCGC	2	10	36438	36447	20 %	0 %	40 %	40 %	376241732
17	NC_016785	CTTCC	2	10	37140	37149	0 %	40 %	0 %	60 %	376241732
18	NC_016785	GTTGC	2	10	38679	38688	0 %	40 %	40 %	20 %	376241732
19	NC_016785	AGAGG	2	10	38700	38709	40 %	0 %	60 %	0 %	376241732
20	NC_016785	CACGG	2	10	41477	41486	20 %	0 %	40 %	40 %	376241733
21	NC_016785	CAACT	2	10	44996	45005	40 %	20 %	0 %	40 %	376241738
22	NC_016785	GGTGT	2	10	45328	45337	0 %	40 %	60 %	0 %	376241738
23	NC_016785	GTGCT	2	10	46554	46563	0 %	40 %	40 %	20 %	376241741
24	NC_016785	GGGTT	2	10	47302	47311	0 %	40 %	60 %	0 %	376241741
25	NC_016785	TGGCG	2	10	49041	49050	0 %	20 %	60 %	20 %	376241742
26	NC_016785	CGCAG	2	10	51836	51845	20 %	0 %	40 %	40 %	376241744
27	NC_016785	TGAGG	2	10	54285	54294	20 %	20 %	60 %	0 %	376241745
28	NC_016785	TACGA	2	10	54886	54895	40 %	20 %	20 %	20 %	376241747
29	NC_016785	TTTTG	2	10	56113	56122	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016785	GACTA	2	10	57353	57362	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016785	TTTGA	2	10	57458	57467	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016785	TTGTT	2	10	57929	57938	0 %	80 %	20 %	0 %	376241750
33	NC_016785	AAAGG	2	10	58252	58261	60 %	0 %	40 %	0 %	376241751
34	NC_016785	CAAGC	2	10	58346	58355	40 %	0 %	20 %	40 %	376241751
35	NC_016785	TGCCG	2	10	58981	58990	0 %	20 %	40 %	40 %	376241752
36	NC_016785	TCACC	2	10	60715	60724	20 %	20 %	0 %	60 %	376241753
37	NC_016785	AGGAG	2	10	64146	64155	40 %	0 %	60 %	0 %	376241758
38	NC_016785	ACCAA	2	10	64159	64168	60 %	0 %	0 %	40 %	376241758
39	NC_016785	CGGTG	2	10	65363	65372	0 %	20 %	60 %	20 %	376241760
40	NC_016785	GACTG	2	10	67983	67992	20 %	20 %	40 %	20 %	376241764
41	NC_016785	GGAGT	2	10	70137	70146	20 %	20 %	60 %	0 %	376241767
42	NC_016785	GCCTA	2	10	73061	73070	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016785	GCGCT	2	10	74549	74558	0 %	20 %	40 %	40 %	376241771
44	NC_016785	CGTTC	2	10	75300	75309	0 %	40 %	20 %	40 %	376241771
45	NC_016785	ACACC	2	10	76611	76620	40 %	0 %	0 %	60 %	376241773
46	NC_016785	CCAAG	2	10	77253	77262	40 %	0 %	20 %	40 %	376241773
47	NC_016785	CTGGG	2	10	78716	78725	0 %	20 %	60 %	20 %	376241775
48	NC_016785	CTCAA	2	10	79609	79618	40 %	20 %	0 %	40 %	376241776
49	NC_016785	GCCCA	2	10	79810	79819	20 %	0 %	20 %	60 %	376241776
50	NC_016785	GAGCT	2	10	83701	83710	20 %	20 %	40 %	20 %	376241781
51	NC_016785	CATGA	2	10	85236	85245	40 %	20 %	20 %	20 %	376241781
52	NC_016785	CCGCA	2	10	85642	85651	20 %	0 %	20 %	60 %	376241782
53	NC_016785	AGCCA	2	10	86221	86230	40 %	0 %	20 %	40 %	376241783
54	NC_016785	GGCCA	2	10	92558	92567	20 %	0 %	40 %	40 %	376241788
55	NC_016785	TCCAC	2	10	92728	92737	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_016785	TCCGC	2	10	95333	95342	0 %	20 %	20 %	60 %	376241792
57	NC_016785	GTGGG	2	10	98784	98793	0 %	20 %	80 %	0 %	376241795
58	NC_016785	TGCAC	2	10	100788	100797	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016785	ACACC	2	10	100855	100864	40 %	0 %	0 %	60 %	376241798
60	NC_016785	CCAGC	2	10	100991	101000	20 %	0 %	20 %	60 %	376241798
61	NC_016785	GAGCG	2	10	101964	101973	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016785	GAAAC	2	10	102456	102465	60 %	0 %	20 %	20 %	376241801
63	NC_016785	TCGAA	2	10	104619	104628	40 %	20 %	20 %	20 %	376241803
64	NC_016785	GATCT	2	10	104880	104889	20 %	40 %	20 %	20 %	376241803
65	NC_016785	GAGGC	2	10	106335	106344	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016785	CTGTT	2	10	106480	106489	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016785	TGACC	2	10	107117	107126	20 %	20 %	20 %	40 %	376241808
68	NC_016785	CTGGG	2	10	107169	107178	0 %	20 %	60 %	20 %	376241808
69	NC_016785	GGCGG	2	10	108797	108806	0 %	0 %	80 %	20 %	376241809
70	NC_016785	GAGCT	2	10	109884	109893	20 %	20 %	40 %	20 %	376241810
71	NC_016785	CCACG	2	10	111780	111789	20 %	0 %	20 %	60 %	376241811
72	NC_016785	CCAGT	2	10	115443	115452	20 %	20 %	20 %	40 %	376241816
73	NC_016785	ACCAG	2	10	117734	117743	40 %	0 %	20 %	40 %	376241816
74	NC_016785	CCTGG	2	10	120884	120893	0 %	20 %	40 %	40 %	376241818
75	NC_016785	GCTGT	2	10	124571	124580	0 %	40 %	40 %	20 %	376241823
76	NC_016785	TCTGG	2	10	124643	124652	0 %	40 %	40 %	20 %	376241823
77	NC_016785	TAATT	2	10	124838	124847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016785	ATGCG	2	10	125202	125211	20 %	20 %	40 %	20 %	376241824
79	NC_016785	GTCGC	2	10	125940	125949	0 %	20 %	40 %	40 %	376241825
80	NC_016785	GATGC	2	10	126286	126295	20 %	20 %	40 %	20 %	376241825
81	NC_016785	TTAGC	2	10	126891	126900	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016785	TGGTC	2	10	127250	127259	0 %	40 %	40 %	20 %	376241826
83	NC_016785	GTTTG	2	10	128739	128748	0 %	60 %	40 %	0 %	376241827
84	NC_016785	GTGAT	2	10	128881	128890	20 %	40 %	40 %	0 %	376241828
85	NC_016785	GTTCG	2	10	133936	133945	0 %	40 %	40 %	20 %	376241833
86	NC_016785	GCGTG	2	10	134757	134766	0 %	20 %	60 %	20 %	376241834
87	NC_016785	GATTC	2	10	138653	138662	20 %	40 %	20 %	20 %	376241836
88	NC_016785	TTTTG	2	10	141656	141665	0 %	80 %	20 %	0 %	376241839
89	NC_016785	CGTTT	2	10	142157	142166	0 %	60 %	20 %	20 %	376241839
90	NC_016785	TCGGA	2	10	142682	142691	20 %	20 %	40 %	20 %	376241840
91	NC_016785	GCCAT	2	10	143911	143920	20 %	20 %	20 %	40 %	376241841
92	NC_016785	TTTGC	2	10	144566	144575	0 %	60 %	20 %	20 %	376241843
93	NC_016785	GAACA	2	10	149000	149009	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016785	CATGG	2	10	150146	150155	20 %	20 %	40 %	20 %	376241855
95	NC_016785	GGGAC	3	15	151254	151268	20 %	0 %	60 %	20 %	376241855
96	NC_016785	CGCAG	2	10	156821	156830	20 %	0 %	40 %	40 %	376241861
97	NC_016785	CCACA	2	10	158619	158628	40 %	0 %	0 %	60 %	376241863
98	NC_016785	ACGAA	2	10	159254	159263	60 %	0 %	20 %	20 %	376241865
99	NC_016785	AACGA	2	10	159884	159893	60 %	0 %	20 %	20 %	376241866
100	NC_016785	CAATG	2	10	159990	159999	40 %	20 %	20 %	20 %	376241866
101	NC_016785	GCGAT	2	10	161904	161913	20 %	20 %	40 %	20 %	376241869
102	NC_016785	GATGC	2	10	162350	162359	20 %	20 %	40 %	20 %	376241869
103	NC_016785	TTCCT	2	10	163065	163074	0 %	60 %	0 %	40 %	376241869
104	NC_016785	CGCTG	2	10	163195	163204	0 %	20 %	40 %	40 %	376241869
105	NC_016785	GCAAG	2	10	166261	166270	40 %	0 %	40 %	20 %	376241869
106	NC_016785	CAGGT	2	10	166404	166413	20 %	20 %	40 %	20 %	376241869
107	NC_016785	CCACG	2	10	167703	167712	20 %	0 %	20 %	60 %	376241870
108	NC_016785	CGGAA	2	10	174018	174027	40 %	0 %	40 %	20 %	376241879
109	NC_016785	CCTTC	2	10	174075	174084	0 %	40 %	0 %	60 %	376241879
110	NC_016785	AAAAT	2	10	174344	174353	80 %	20 %	0 %	0 %	376241879
111	NC_016785	CAATT	2	10	178197	178206	40 %	40 %	0 %	20 %	376241881
112	NC_016785	GGTGG	2	10	178220	178229	0 %	20 %	80 %	0 %	376241881
113	NC_016785	AGTGC	2	10	178288	178297	20 %	20 %	40 %	20 %	376241881
114	NC_016785	TGCGG	2	10	178383	178392	0 %	20 %	60 %	20 %	376241881
115	NC_016785	ACTCC	2	10	178589	178598	20 %	20 %	0 %	60 %	376241881
116	NC_016785	TGGGG	2	10	178747	178756	0 %	20 %	80 %	0 %	376241881
117	NC_016785	GCGGG	2	10	180567	180576	0 %	0 %	80 %	20 %	376241883
118	NC_016785	GGCGG	2	10	182964	182973	0 %	0 %	80 %	20 %	376241889
119	NC_016785	TCTTG	2	10	183433	183442	0 %	60 %	20 %	20 %	376241889
120	NC_016785	GCGGG	2	10	183443	183452	0 %	0 %	80 %	20 %	376241889
121	NC_016785	CTGGG	2	10	190219	190228	0 %	20 %	60 %	20 %	376241892
122	NC_016785	ATCTG	2	10	193380	193389	20 %	40 %	20 %	20 %	376241897
123	NC_016785	AATTA	2	10	196542	196551	60 %	40 %	0 %	0 %	376241901
124	NC_016785	ATTCC	2	10	198666	198675	20 %	40 %	0 %	40 %	376241903
125	NC_016785	TGCGG	2	10	198779	198788	0 %	20 %	60 %	20 %	376241903
126	NC_016785	GGCAG	2	10	203101	203110	20 %	0 %	60 %	20 %	376241906
127	NC_016785	TGGGG	2	10	205356	205365	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016785	TCCTG	2	10	205465	205474	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_016785	TCCTG	2	10	206422	206431	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_016785	AGCCA	2	10	210160	210169	40 %	0 %	20 %	40 %	376241913
131	NC_016785	GCAGA	2	10	211228	211237	40 %	0 %	40 %	20 %	376241914
132	NC_016785	TTGCC	2	10	214085	214094	0 %	40 %	20 %	40 %	376241918
133	NC_016785	GTTGC	2	10	214502	214511	0 %	40 %	40 %	20 %	376241918
134	NC_016785	CCGCC	2	10	215760	215769	0 %	0 %	20 %	80 %	376241919
135	NC_016785	AGAAA	2	10	220203	220212	80 %	0 %	20 %	0 %	376241922
136	NC_016785	TTGGG	2	10	221209	221218	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016785	AGCCA	2	10	221507	221516	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016785	ACCCC	2	10	224864	224873	20 %	0 %	0 %	80 %	376241927
139	NC_016785	GGTGC	2	10	225466	225475	0 %	20 %	60 %	20 %	376241927
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149	NC_016785	TGACC	2	10	251140	251149	20 %	20 %	20 %	40 %	376241951
150	NC_016785	GTGCC	2	10	252544	252553	0 %	20 %	40 %	40 %	376241952
151	NC_016785	GATCA	2	10	254077	254086	40 %	20 %	20 %	20 %	376241955
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153	NC_016785	GACCT	2	10	255485	255494	20 %	20 %	20 %	40 %	376241958
154	NC_016785	GCCGA	2	10	256485	256494	20 %	0 %	40 %	40 %	376241959
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157	NC_016785	GGCGA	2	10	259007	259016	20 %	0 %	60 %	20 %	376241962
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159	NC_016785	ATAAC	2	10	259702	259711	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_016785	CTGCG	2	10	264732	264741	0 %	20 %	40 %	40 %	376241968
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163	NC_016785	CGCAG	2	10	274692	274701	20 %	0 %	40 %	40 %	376241979
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166	NC_016785	AAAAG	2	10	279304	279313	80 %	0 %	20 %	0 %	376241981
167	NC_016785	GCGGT	2	10	280578	280587	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
168	NC_016785	TGGTG	2	10	281875	281884	0 %	40 %	60 %	0 %	376241983
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174	NC_016785	GTGGG	2	10	284709	284718	0 %	20 %	80 %	0 %	376241984
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176	NC_016785	GCCTC	2	10	285405	285414	0 %	20 %	20 %	60 %	376241985
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183	NC_016785	ATGTT	2	10	292247	292256	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_016785	GATTA	2	10	293565	293574	40 %	40 %	20 %	0 %	376241994
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233	NC_016785	CACAC	2	10	377770	377779	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
234	NC_016785	CAGAT	2	10	378156	378165	40 %	20 %	20 %	20 %	376242080
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243	NC_016785	GACCA	2	10	394271	394280	40 %	0 %	20 %	40 %	376242094
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247	NC_016785	CGGCA	2	10	401177	401186	20 %	0 %	40 %	40 %	376242099
248	NC_016785	TCTGC	2	10	403310	403319	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
249	NC_016785	CGTGA	2	10	404231	404240	20 %	20 %	40 %	20 %	376242104
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251	NC_016785	GCTTT	2	10	406808	406817	0 %	60 %	20 %	20 %	376242107
252	NC_016785	CCAAT	2	10	408981	408990	40 %	20 %	0 %	40 %	376242110
253	NC_016785	CAGAT	2	10	409337	409346	40 %	20 %	20 %	20 %	376242111
254	NC_016785	ATCGG	2	10	411398	411407	20 %	20 %	40 %	20 %	376242112
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256	NC_016785	CGTGG	2	10	424157	424166	0 %	20 %	60 %	20 %	376242129
257	NC_016785	GGGGT	2	10	426797	426806	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
258	NC_016785	AACCC	2	10	427588	427597	40 %	0 %	0 %	60 %	376242133
259	NC_016785	CCGAA	2	10	430631	430640	40 %	0 %	20 %	40 %	376242136
260	NC_016785	GCAAT	2	10	431485	431494	40 %	20 %	20 %	20 %	376242136
261	NC_016785	GGTGC	2	10	431811	431820	0 %	20 %	60 %	20 %	376242137
262	NC_016785	TATAA	2	10	434835	434844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_016785	GGCAA	2	10	437332	437341	40 %	0 %	40 %	20 %	376242142
264	NC_016785	TTATG	2	10	438556	438565	20 %	60 %	20 %	0 %	376242144
265	NC_016785	AGGGG	2	10	439377	439386	20 %	0 %	80 %	0 %	376242145
266	NC_016785	TCATC	2	10	442766	442775	20 %	40 %	0 %	40 %	376242147
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387	NC_016785	GGGAA	2	10	652533	652542	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
388	NC_016785	AGATC	2	10	653706	653715	40 %	20 %	20 %	20 %	376242346
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392	NC_016785	AAGCG	2	10	659373	659382	40 %	0 %	40 %	20 %	376242352
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395	NC_016785	CGCAA	2	10	670146	670155	40 %	0 %	20 %	40 %	376242362
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