MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae CDCE 8392 chromosome

Total Repeats: 1185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016785	CAGCA	2	10	506	515	40 %	0 %	20 %	40 %	376241701
2	NC_016785	CGGTG	2	10	2363	2372	0 %	20 %	60 %	20 %	376241702
3	NC_016785	CCACC	2	10	6221	6230	20 %	0 %	0 %	80 %	376241705
4	NC_016785	GCCTA	2	10	8484	8493	20 %	20 %	20 %	40 %	376241708
5	NC_016785	CGCAC	2	10	10550	10559	20 %	0 %	20 %	60 %	376241709
6	NC_016785	GAGTC	2	10	14079	14088	20 %	20 %	40 %	20 %	376241712
7	NC_016785	CCAGG	2	10	16545	16554	20 %	0 %	40 %	40 %	376241714
8	NC_016785	GATTC	2	10	23223	23232	20 %	40 %	20 %	20 %	376241719
9	NC_016785	TGCGC	2	10	23537	23546	0 %	20 %	40 %	40 %	376241720
10	NC_016785	GCGCT	2	10	24564	24573	0 %	20 %	40 %	40 %	376241721
11	NC_016785	CACCT	2	10	34311	34320	20 %	20 %	0 %	60 %	376241729
12	NC_016785	AGCCA	2	10	35662	35671	40 %	0 %	20 %	40 %	376241731
13	NC_016785	AGCGC	2	10	36438	36447	20 %	0 %	40 %	40 %	376241732
14	NC_016785	CTTCC	2	10	37140	37149	0 %	40 %	0 %	60 %	376241732
15	NC_016785	GTTGC	2	10	38679	38688	0 %	40 %	40 %	20 %	376241732
16	NC_016785	AGAGG	2	10	38700	38709	40 %	0 %	60 %	0 %	376241732
17	NC_016785	CACGG	2	10	41477	41486	20 %	0 %	40 %	40 %	376241733
18	NC_016785	CAACT	2	10	44996	45005	40 %	20 %	0 %	40 %	376241738
19	NC_016785	GGTGT	2	10	45328	45337	0 %	40 %	60 %	0 %	376241738
20	NC_016785	GTGCT	2	10	46554	46563	0 %	40 %	40 %	20 %	376241741
21	NC_016785	GGGTT	2	10	47302	47311	0 %	40 %	60 %	0 %	376241741
22	NC_016785	TGGCG	2	10	49041	49050	0 %	20 %	60 %	20 %	376241742
23	NC_016785	CGCAG	2	10	51836	51845	20 %	0 %	40 %	40 %	376241744
24	NC_016785	TGAGG	2	10	54285	54294	20 %	20 %	60 %	0 %	376241745
25	NC_016785	TACGA	2	10	54886	54895	40 %	20 %	20 %	20 %	376241747
26	NC_016785	TTGTT	2	10	57929	57938	0 %	80 %	20 %	0 %	376241750
27	NC_016785	AAAGG	2	10	58252	58261	60 %	0 %	40 %	0 %	376241751
28	NC_016785	CAAGC	2	10	58346	58355	40 %	0 %	20 %	40 %	376241751
29	NC_016785	TGCCG	2	10	58981	58990	0 %	20 %	40 %	40 %	376241752
30	NC_016785	TCACC	2	10	60715	60724	20 %	20 %	0 %	60 %	376241753
31	NC_016785	AGGAG	2	10	64146	64155	40 %	0 %	60 %	0 %	376241758
32	NC_016785	ACCAA	2	10	64159	64168	60 %	0 %	0 %	40 %	376241758
33	NC_016785	CGGTG	2	10	65363	65372	0 %	20 %	60 %	20 %	376241760
34	NC_016785	GACTG	2	10	67983	67992	20 %	20 %	40 %	20 %	376241764
35	NC_016785	GGAGT	2	10	70137	70146	20 %	20 %	60 %	0 %	376241767
36	NC_016785	GCGCT	2	10	74549	74558	0 %	20 %	40 %	40 %	376241771
37	NC_016785	CGTTC	2	10	75300	75309	0 %	40 %	20 %	40 %	376241771
38	NC_016785	ACACC	2	10	76611	76620	40 %	0 %	0 %	60 %	376241773
39	NC_016785	CCAAG	2	10	77253	77262	40 %	0 %	20 %	40 %	376241773
40	NC_016785	CTGGG	2	10	78716	78725	0 %	20 %	60 %	20 %	376241775
41	NC_016785	CTCAA	2	10	79609	79618	40 %	20 %	0 %	40 %	376241776
42	NC_016785	GCCCA	2	10	79810	79819	20 %	0 %	20 %	60 %	376241776
43	NC_016785	GAGCT	2	10	83701	83710	20 %	20 %	40 %	20 %	376241781
44	NC_016785	CATGA	2	10	85236	85245	40 %	20 %	20 %	20 %	376241781
45	NC_016785	CCGCA	2	10	85642	85651	20 %	0 %	20 %	60 %	376241782
46	NC_016785	AGCCA	2	10	86221	86230	40 %	0 %	20 %	40 %	376241783
47	NC_016785	GGCCA	2	10	92558	92567	20 %	0 %	40 %	40 %	376241788
48	NC_016785	TCCGC	2	10	95333	95342	0 %	20 %	20 %	60 %	376241792
49	NC_016785	GTGGG	2	10	98784	98793	0 %	20 %	80 %	0 %	376241795
50	NC_016785	ACACC	2	10	100855	100864	40 %	0 %	0 %	60 %	376241798
51	NC_016785	CCAGC	2	10	100991	101000	20 %	0 %	20 %	60 %	376241798
52	NC_016785	GAAAC	2	10	102456	102465	60 %	0 %	20 %	20 %	376241801
53	NC_016785	TCGAA	2	10	104619	104628	40 %	20 %	20 %	20 %	376241803
54	NC_016785	GATCT	2	10	104880	104889	20 %	40 %	20 %	20 %	376241803
55	NC_016785	TGACC	2	10	107117	107126	20 %	20 %	20 %	40 %	376241808
56	NC_016785	CTGGG	2	10	107169	107178	0 %	20 %	60 %	20 %	376241808
57	NC_016785	GGCGG	2	10	108797	108806	0 %	0 %	80 %	20 %	376241809
58	NC_016785	GAGCT	2	10	109884	109893	20 %	20 %	40 %	20 %	376241810
59	NC_016785	CCACG	2	10	111780	111789	20 %	0 %	20 %	60 %	376241811
60	NC_016785	CCAGT	2	10	115443	115452	20 %	20 %	20 %	40 %	376241816
61	NC_016785	ACCAG	2	10	117734	117743	40 %	0 %	20 %	40 %	376241816
62	NC_016785	CCTGG	2	10	120884	120893	0 %	20 %	40 %	40 %	376241818
63	NC_016785	GCTGT	2	10	124571	124580	0 %	40 %	40 %	20 %	376241823
64	NC_016785	TCTGG	2	10	124643	124652	0 %	40 %	40 %	20 %	376241823
65	NC_016785	ATGCG	2	10	125202	125211	20 %	20 %	40 %	20 %	376241824
66	NC_016785	GTCGC	2	10	125940	125949	0 %	20 %	40 %	40 %	376241825
67	NC_016785	GATGC	2	10	126286	126295	20 %	20 %	40 %	20 %	376241825
68	NC_016785	TGGTC	2	10	127250	127259	0 %	40 %	40 %	20 %	376241826
69	NC_016785	GTTTG	2	10	128739	128748	0 %	60 %	40 %	0 %	376241827
70	NC_016785	GTGAT	2	10	128881	128890	20 %	40 %	40 %	0 %	376241828
71	NC_016785	GTTCG	2	10	133936	133945	0 %	40 %	40 %	20 %	376241833
72	NC_016785	GCGTG	2	10	134757	134766	0 %	20 %	60 %	20 %	376241834
73	NC_016785	GATTC	2	10	138653	138662	20 %	40 %	20 %	20 %	376241836
74	NC_016785	TTTTG	2	10	141656	141665	0 %	80 %	20 %	0 %	376241839
75	NC_016785	CGTTT	2	10	142157	142166	0 %	60 %	20 %	20 %	376241839
76	NC_016785	TCGGA	2	10	142682	142691	20 %	20 %	40 %	20 %	376241840
77	NC_016785	GCCAT	2	10	143911	143920	20 %	20 %	20 %	40 %	376241841
78	NC_016785	TTTGC	2	10	144566	144575	0 %	60 %	20 %	20 %	376241843
79	NC_016785	CATGG	2	10	150146	150155	20 %	20 %	40 %	20 %	376241855
80	NC_016785	GGGAC	3	15	151254	151268	20 %	0 %	60 %	20 %	376241855
81	NC_016785	CGCAG	2	10	156821	156830	20 %	0 %	40 %	40 %	376241861
82	NC_016785	CCACA	2	10	158619	158628	40 %	0 %	0 %	60 %	376241863
83	NC_016785	ACGAA	2	10	159254	159263	60 %	0 %	20 %	20 %	376241865
84	NC_016785	AACGA	2	10	159884	159893	60 %	0 %	20 %	20 %	376241866
85	NC_016785	CAATG	2	10	159990	159999	40 %	20 %	20 %	20 %	376241866
86	NC_016785	GCGAT	2	10	161904	161913	20 %	20 %	40 %	20 %	376241869
87	NC_016785	GATGC	2	10	162350	162359	20 %	20 %	40 %	20 %	376241869
88	NC_016785	TTCCT	2	10	163065	163074	0 %	60 %	0 %	40 %	376241869
89	NC_016785	CGCTG	2	10	163195	163204	0 %	20 %	40 %	40 %	376241869
90	NC_016785	GCAAG	2	10	166261	166270	40 %	0 %	40 %	20 %	376241869
91	NC_016785	CAGGT	2	10	166404	166413	20 %	20 %	40 %	20 %	376241869
92	NC_016785	CCACG	2	10	167703	167712	20 %	0 %	20 %	60 %	376241870
93	NC_016785	CGGAA	2	10	174018	174027	40 %	0 %	40 %	20 %	376241879
94	NC_016785	CCTTC	2	10	174075	174084	0 %	40 %	0 %	60 %	376241879
95	NC_016785	AAAAT	2	10	174344	174353	80 %	20 %	0 %	0 %	376241879
96	NC_016785	CAATT	2	10	178197	178206	40 %	40 %	0 %	20 %	376241881
97	NC_016785	GGTGG	2	10	178220	178229	0 %	20 %	80 %	0 %	376241881
98	NC_016785	AGTGC	2	10	178288	178297	20 %	20 %	40 %	20 %	376241881
99	NC_016785	TGCGG	2	10	178383	178392	0 %	20 %	60 %	20 %	376241881
100	NC_016785	ACTCC	2	10	178589	178598	20 %	20 %	0 %	60 %	376241881
101	NC_016785	TGGGG	2	10	178747	178756	0 %	20 %	80 %	0 %	376241881
102	NC_016785	GCGGG	2	10	180567	180576	0 %	0 %	80 %	20 %	376241883
103	NC_016785	GGCGG	2	10	182964	182973	0 %	0 %	80 %	20 %	376241889
104	NC_016785	TCTTG	2	10	183433	183442	0 %	60 %	20 %	20 %	376241889
105	NC_016785	GCGGG	2	10	183443	183452	0 %	0 %	80 %	20 %	376241889
106	NC_016785	CTGGG	2	10	190219	190228	0 %	20 %	60 %	20 %	376241892
107	NC_016785	ATCTG	2	10	193380	193389	20 %	40 %	20 %	20 %	376241897
108	NC_016785	AATTA	2	10	196542	196551	60 %	40 %	0 %	0 %	376241901
109	NC_016785	ATTCC	2	10	198666	198675	20 %	40 %	0 %	40 %	376241903
110	NC_016785	TGCGG	2	10	198779	198788	0 %	20 %	60 %	20 %	376241903
111	NC_016785	GGCAG	2	10	203101	203110	20 %	0 %	60 %	20 %	376241906
112	NC_016785	AGCCA	2	10	210160	210169	40 %	0 %	20 %	40 %	376241913
113	NC_016785	GCAGA	2	10	211228	211237	40 %	0 %	40 %	20 %	376241914
114	NC_016785	TTGCC	2	10	214085	214094	0 %	40 %	20 %	40 %	376241918
115	NC_016785	GTTGC	2	10	214502	214511	0 %	40 %	40 %	20 %	376241918
116	NC_016785	CCGCC	2	10	215760	215769	0 %	0 %	20 %	80 %	376241919
117	NC_016785	AGAAA	2	10	220203	220212	80 %	0 %	20 %	0 %	376241922
118	NC_016785	ACCCC	2	10	224864	224873	20 %	0 %	0 %	80 %	376241927
119	NC_016785	GGTGC	2	10	225466	225475	0 %	20 %	60 %	20 %	376241927
120	NC_016785	CCGCT	2	10	225803	225812	0 %	20 %	20 %	60 %	376241927
121	NC_016785	GCCCA	2	10	227752	227761	20 %	0 %	20 %	60 %	376241929
122	NC_016785	CGAGG	2	10	228018	228027	20 %	0 %	60 %	20 %	376241929
123	NC_016785	CAGCA	2	10	237651	237660	40 %	0 %	20 %	40 %	376241937
124	NC_016785	ACTGA	2	10	241880	241889	40 %	20 %	20 %	20 %	376241943
125	NC_016785	GCCAC	2	10	241908	241917	20 %	0 %	20 %	60 %	376241943
126	NC_016785	CGCCA	2	10	242382	242391	20 %	0 %	20 %	60 %	376241944
127	NC_016785	CACAA	2	10	245698	245707	60 %	0 %	0 %	40 %	376241946
128	NC_016785	AAACC	2	10	246396	246405	60 %	0 %	0 %	40 %	376241946
129	NC_016785	TGACC	2	10	251140	251149	20 %	20 %	20 %	40 %	376241951
130	NC_016785	GTGCC	2	10	252544	252553	0 %	20 %	40 %	40 %	376241952
131	NC_016785	GATCA	2	10	254077	254086	40 %	20 %	20 %	20 %	376241955
132	NC_016785	GCGCT	2	10	254200	254209	0 %	20 %	40 %	40 %	376241955
133	NC_016785	GACCT	2	10	255485	255494	20 %	20 %	20 %	40 %	376241958
134	NC_016785	GCCGA	2	10	256485	256494	20 %	0 %	40 %	40 %	376241959
135	NC_016785	TGGTC	2	10	257356	257365	0 %	40 %	40 %	20 %	376241960
136	NC_016785	GGCGA	2	10	259007	259016	20 %	0 %	60 %	20 %	376241962
137	NC_016785	GGCGC	2	10	259199	259208	0 %	0 %	60 %	40 %	376241962
138	NC_016785	CTGCG	2	10	264732	264741	0 %	20 %	40 %	40 %	376241968
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140	NC_016785	GCGCA	2	10	267960	267969	20 %	0 %	40 %	40 %	376241973
141	NC_016785	CGCAG	2	10	274692	274701	20 %	0 %	40 %	40 %	376241979
142	NC_016785	ATGGA	2	10	276587	276596	40 %	20 %	40 %	0 %	376241980
143	NC_016785	CAACC	2	10	277675	277684	40 %	0 %	0 %	60 %	376241981
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145	NC_016785	TGGTG	2	10	281875	281884	0 %	40 %	60 %	0 %	376241983
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148	NC_016785	GTTGG	2	10	283873	283882	0 %	40 %	60 %	0 %	376241984
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151	NC_016785	GTGGG	2	10	284709	284718	0 %	20 %	80 %	0 %	376241984
152	NC_016785	ACACC	2	10	285165	285174	40 %	0 %	0 %	60 %	376241985
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252	NC_016785	ATGTC	2	10	496018	496027	20 %	40 %	20 %	20 %	376242196
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255	NC_016785	CAGCG	2	10	498056	498065	20 %	0 %	40 %	40 %	376242198
256	NC_016785	ATCCA	2	10	502450	502459	40 %	20 %	0 %	40 %	376242201
257	NC_016785	CGTGG	2	10	504464	504473	0 %	20 %	60 %	20 %	376242204
258	NC_016785	GCTCA	2	10	508693	508702	20 %	20 %	20 %	40 %	376242209
259	NC_016785	TGGGG	2	10	510136	510145	0 %	20 %	80 %	0 %	376242210
260	NC_016785	GATCG	2	10	511014	511023	20 %	20 %	40 %	20 %	376242211
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262	NC_016785	TGGGT	2	10	514510	514519	0 %	40 %	60 %	0 %	376242215
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376	NC_016785	GGATC	2	10	771133	771142	20 %	20 %	40 %	20 %	376242444
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387	NC_016785	ATGAG	2	10	789317	789326	40 %	20 %	40 %	0 %	376242471
388	NC_016785	GGCGC	2	10	793182	793191	0 %	0 %	60 %	40 %	376242473
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