MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946

Total Repeats: 1381

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016784	AAAAGA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	375360694
2	NC_016784	TGAAGA	2	12	8490	8501	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375360697
3	NC_016784	TTTGAA	2	12	17427	17438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016784	ACTGGC	2	12	17537	17548	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360700
5	NC_016784	TTCGGC	2	12	24618	24629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360706
6	NC_016784	GAAGGT	2	12	28951	28962	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	375360710
7	NC_016784	TTAAAT	2	12	29457	29468	50 %	50 %	0 %	0 %	375360710
8	NC_016784	CAGGCG	2	12	37801	37812	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375360717
9	NC_016784	AATGTG	2	12	42705	42716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360722
10	NC_016784	AAGAAA	2	12	48081	48092	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	375360729
11	NC_016784	TTGTCG	2	12	48897	48908	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375360730
12	NC_016784	AGCGGA	2	12	55346	55357	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360737
13	NC_016784	TTGCCA	2	12	58757	58768	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375360741
14	NC_016784	GAATCG	2	12	60962	60973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360744
15	NC_016784	CGCTTA	2	12	64297	64308	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375360746
16	NC_016784	TCATAT	2	12	65776	65787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016784	ATGATC	2	12	75465	75476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375360757
18	NC_016784	AGCTGC	2	12	76962	76973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360758
19	NC_016784	TGTCGG	2	12	78703	78714	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375360760
20	NC_016784	AACACC	2	12	80094	80105	50 %	0 %	0 %	50 %	375360761
21	NC_016784	CAGTCT	2	12	84519	84530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375360765
22	NC_016784	AGGATC	2	12	88072	88083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360770
23	NC_016784	TCAAAT	2	12	89970	89981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	375360772
24	NC_016784	GTATCG	2	12	91112	91123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375360772
25	NC_016784	AGTCAA	2	12	102376	102387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016784	TGGCAC	2	12	104567	104578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360776
27	NC_016784	ACTCGG	2	12	104682	104693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360776
28	NC_016784	TGCCGA	2	12	109343	109354	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360778
29	NC_016784	GTCATT	2	12	110205	110216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375360779
30	NC_016784	CCAAGC	2	12	110701	110712	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	375360779
31	NC_016784	GAAGAG	2	12	118958	118969	50 %	0 %	50 %	0 %	375360791
32	NC_016784	CATTTA	2	12	119729	119740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	375360792
33	NC_016784	TCTGGT	2	12	119794	119805	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375360792
34	NC_016784	GAAGCT	2	12	120311	120322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360793
35	NC_016784	CTTGCA	2	12	121456	121467	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375360794
36	NC_016784	CTGTAG	2	12	121663	121674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375360795
37	NC_016784	AGTTGA	2	12	131886	131897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360802
38	NC_016784	TAAAGG	2	12	137015	137026	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375360806
39	NC_016784	GTCGGT	2	12	143634	143645	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375360821
40	NC_016784	ATCGAA	2	12	143727	143738	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	375360821
41	NC_016784	AATAAA	2	12	145014	145025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	375360824
42	NC_016784	CATTAA	2	12	147167	147178	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	375360827
43	NC_016784	GAAAAG	2	12	148866	148877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360830
44	NC_016784	AAACAA	2	12	148907	148918	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	375360830
45	NC_016784	AAAAAG	2	12	150635	150646	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	375360833
46	NC_016784	TTAACT	2	12	155432	155443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	375360840
47	NC_016784	CGGTTG	2	12	155876	155887	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375360841
48	NC_016784	ACGGAT	2	12	184215	184226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360853
49	NC_016784	ATAAAT	2	12	189118	189129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375360858
50	NC_016784	TCTGAT	2	12	189139	189150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375360858
51	NC_016784	ATCGTC	2	12	192082	192093	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375360860
52	NC_016784	TGTTGA	2	12	203203	203214	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	375360870
53	NC_016784	AGACAA	2	12	203869	203880	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	375360870
54	NC_016784	GAAATG	2	12	207132	207143	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375360872
55	NC_016784	TGCGGA	2	12	210774	210785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375360876
56	NC_016784	GATAAT	2	12	211165	211176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	375360876
57	NC_016784	TATCTT	2	12	212874	212885	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	375360879
58	NC_016784	CGGAAT	2	12	213216	213227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360879
59	NC_016784	TTCGGT	2	12	213235	213246	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375360879
60	NC_016784	GATTTT	2	12	213444	213455	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	375360879
61	NC_016784	AAACCG	2	12	216189	216200	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	375360882
62	NC_016784	CTTTTC	2	12	219077	219088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360885
63	NC_016784	GGCTGC	2	12	221518	221529	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375360889
64	NC_016784	AAGCGA	2	12	223850	223861	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375360891
65	NC_016784	ACAATA	2	12	229360	229371	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	375360897
66	NC_016784	TTTTAT	2	12	236809	236820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	375360903
67	NC_016784	ACCATC	2	12	239780	239791	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	375360907
68	NC_016784	CTGCCG	2	12	240161	240172	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	375360907
69	NC_016784	GAGACG	2	12	242122	242133	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360909
70	NC_016784	ATGCCG	2	12	245959	245970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360912
71	NC_016784	GAGGAC	2	12	248446	248457	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360914
72	NC_016784	GCGGAA	2	12	255807	255818	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360923
73	NC_016784	AGCGGG	2	12	257682	257693	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	375360924
74	NC_016784	GCAGCC	2	12	263393	263404	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	375360931
75	NC_016784	GAGAAT	2	12	265260	265271	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016784	TGAGAT	2	12	272501	272512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360939
77	NC_016784	TTTTCA	2	12	275182	275193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	375360941
78	NC_016784	TCATTG	2	12	277280	277291	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375360944
79	NC_016784	GAAGAG	2	12	277645	277656	50 %	0 %	50 %	0 %	375360944
80	NC_016784	TTCTGC	2	12	279685	279696	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	375360946
81	NC_016784	TGATTT	2	12	281812	281823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	375360949
82	NC_016784	AGGGCG	2	12	281949	281960	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	375360949
83	NC_016784	GAAGCG	2	12	282038	282049	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360949
84	NC_016784	GAGGGA	2	12	282563	282574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375360950
85	NC_016784	TTTATC	2	12	283165	283176	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	375360951
86	NC_016784	AAAATC	2	12	285413	285424	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	375360953
87	NC_016784	CATTGA	2	12	286335	286346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375360953
88	NC_016784	AAACAG	2	12	289141	289152	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	375360955
89	NC_016784	TTTCGG	2	12	291559	291570	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375360958
90	NC_016784	AGAGTG	2	12	294036	294047	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	375360960
91	NC_016784	GAAAGA	2	12	294049	294060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360960
92	NC_016784	ACGCTG	2	12	296538	296549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360961
93	NC_016784	GGAAAA	2	12	300417	300428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360965
94	NC_016784	AGAATG	2	12	304172	304183	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375360969
95	NC_016784	CGGATG	2	12	304811	304822	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375360970
96	NC_016784	ATTGAT	2	12	308284	308295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	375360974
97	NC_016784	AGCGAC	2	12	309999	310010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360976
98	NC_016784	GATAAA	2	12	315014	315025	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016784	ATGGGG	2	12	315639	315650	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	375360980
100	NC_016784	ATTGAT	2	12	316421	316432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016784	GCCTCT	2	12	318674	318685	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	375360982
102	NC_016784	ACGATT	2	12	322111	322122	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016784	TTTGAG	2	12	322887	322898	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	375360985
104	NC_016784	GAGCAG	2	12	323190	323201	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360985
105	NC_016784	CAAATC	2	12	323789	323800	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	375360986
106	NC_016784	ATATCA	2	12	325519	325530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016784	GCCTGA	2	12	327435	327446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360992
108	NC_016784	AAATGC	2	12	336832	336843	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	375360995
109	NC_016784	CGGCGA	2	12	338104	338115	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375360995
110	NC_016784	GATGAC	2	12	340072	340083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360995
111	NC_016784	ATGAAA	2	12	342978	342989	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	375360996
112	NC_016784	GATACG	2	12	344132	344143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360996
113	NC_016784	ACTGGA	2	12	347617	347628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360996
114	NC_016784	CGGCGA	2	12	348871	348882	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375360996
115	NC_016784	AATGTC	2	12	353175	353186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375360997
116	NC_016784	TCAGGC	2	12	353960	353971	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360997
117	NC_016784	ATGAAA	2	12	362937	362948	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	375361007
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119	NC_016784	TGCTCG	2	12	372402	372413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375361015
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229	NC_016784	AAAAGG	2	12	664078	664089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
230	NC_016784	CGTGAT	2	12	668826	668837	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375361331
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232	NC_016784	TTCAAT	2	12	671869	671880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	375361333
233	NC_016784	GGGTGC	2	12	672639	672650	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	375361334
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340	NC_016784	TTAAGC	2	12	1006225	1006236	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375361631
341	NC_016784	TTTTGA	2	12	1007152	1007163	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	375361632
342	NC_016784	CGGACT	2	12	1010333	1010344	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375361636
343	NC_016784	ACAAAA	2	12	1018710	1018721	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	375361644
344	NC_016784	TGATCG	2	12	1024107	1024118	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375361651
345	NC_016784	TGCAGC	2	12	1025446	1025457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375361652
346	NC_016784	TATCGG	2	12	1029523	1029534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375361655
347	NC_016784	TTTCGA	2	12	1032774	1032785	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375361658
348	NC_016784	CATCGG	2	12	1033787	1033798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375361660
349	NC_016784	CGCCTC	2	12	1034286	1034297	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	375361661
350	NC_016784	TATTAG	2	12	1035455	1035466	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	375361663
351	NC_016784	TCGGCA	2	12	1036367	1036378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375361663
352	NC_016784	TATGAA	2	12	1039061	1039072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	375361665
353	NC_016784	GCTGGA	2	12	1039156	1039167	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375361665
354	NC_016784	TAAAAT	2	12	1043642	1043653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375361670
355	NC_016784	TGGATA	2	12	1044688	1044699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375361672
356	NC_016784	ATAATG	2	12	1046534	1046545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	375361676
357	NC_016784	CGTTTT	2	12	1047549	1047560	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	375361677
358	NC_016784	GAAAAA	2	12	1055378	1055389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	375361685
359	NC_016784	CATTAT	2	12	1055450	1055461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	375361685
360	NC_016784	GTTGTC	2	12	1062116	1062127	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375361690
361	NC_016784	TCTTTT	2	12	1065574	1065585	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
362	NC_016784	ATGCTC	2	12	1065700	1065711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
363	NC_016784	CGCTGC	2	12	1071656	1071667	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	375361697
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365	NC_016784	ATAATG	2	12	1076300	1076311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
366	NC_016784	CTCCGC	2	12	1077928	1077939	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	375361703
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369	NC_016784	GAAAAG	2	12	1090557	1090568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
370	NC_016784	ATTTTA	2	12	1090730	1090741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375361718
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372	NC_016784	TTACTA	2	12	1095721	1095732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
373	NC_016784	CGGCAT	2	12	1100199	1100210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375361728
374	NC_016784	AAGCGA	2	12	1104491	1104502	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375361729
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376	NC_016784	TAGCCG	2	12	1106982	1106993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375361730
377	NC_016784	AGCGAA	2	12	1109175	1109186	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375361731
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383	NC_016784	TGGCGA	2	12	1126008	1126019	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375361752
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389	NC_016784	CGGAAG	2	12	1151833	1151844	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375361780
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397	NC_016784	ATTTCT	2	12	1181539	1181550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	375361810
398	NC_016784	CTTTTT	2	12	1195635	1195646	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
399	NC_016784	TTTCTT	2	12	1196408	1196419	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	375361829
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407	NC_016784	GTATGG	2	12	1228497	1228508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_016784	GTTAAC	2	12	1242813	1242824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
413	NC_016784	GTCATC	2	12	1244806	1244817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375361881
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423	NC_016784	GTCAGG	2	12	1293178	1293189	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375361940
424	NC_016784	TGATAT	2	12	1294734	1294745	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	375361941
425	NC_016784	ATCCGA	2	12	1296549	1296560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375361942
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435	NC_016784	CGGAAT	2	12	1329799	1329810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375361975
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440	NC_016784	TTACAT	2	12	1345528	1345539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
441	NC_016784	TTTTAT	2	12	1347482	1347493	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	375361994
442	NC_016784	ATTATC	2	12	1347995	1348006	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	375361994
443	NC_016784	AATCAA	2	12	1349417	1349428	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	375361997
444	NC_016784	TGCTTT	2	12	1355408	1355419	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	375362001
445	NC_016784	GCGAAA	2	12	1357141	1357152	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375362003
446	NC_016784	AGGCCG	2	12	1362059	1362070	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375362009
447	NC_016784	CCGGAG	2	12	1368698	1368709	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375362014
448	NC_016784	TTTCTT	2	12	1368842	1368853	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	375362014
449	NC_016784	TATTCG	2	12	1369147	1369158	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375362014
450	NC_016784	CGGACT	2	12	1373245	1373256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_016784	ATCGGC	2	12	1376583	1376594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375362024
452	NC_016784	GCAAAA	2	12	1377820	1377831	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	375362026
453	NC_016784	AAACGG	2	12	1378245	1378256	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375362026
454	NC_016784	GCTGGA	2	12	1378445	1378456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375362026
455	NC_016784	CATATT	2	12	1382348	1382359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	375362029
456	NC_016784	ATTGCG	2	12	1385635	1385646	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375362032
457	NC_016784	CGATTC	2	12	1387130	1387141	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375362032
458	NC_016784	GGCTTA	2	12	1387147	1387158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375362032
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