MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016784	TTTGAA	2	12	17427	17438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016784	TCATAT	2	12	65776	65787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016784	AGTCAA	2	12	102376	102387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016784	GAGAAT	2	12	265260	265271	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016784	GATAAA	2	12	315014	315025	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016784	ATTGAT	2	12	316421	316432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016784	ACGATT	2	12	322111	322122	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016784	ATATCA	2	12	325519	325530	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016784	TGATAA	2	12	387487	387498	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016784	TTTTTC	2	12	419795	419806	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016784	TTTATT	2	12	442754	442765	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016784	GAGGAT	2	12	443967	443978	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016784	AAAGAA	2	12	444348	444359	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016784	CAAACT	2	12	444938	444949	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016784	TTTCTT	2	12	449910	449921	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016784	AAACGA	2	12	450149	450160	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016784	ATAAGT	2	12	492448	492459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016784	AATCTA	2	12	499623	499634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016784	ATCAAT	2	12	499637	499648	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016784	AAAGAC	2	12	503934	503945	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016784	GTTTCT	2	12	529111	529122	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016784	ATGTGA	2	12	546415	546426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016784	TATATT	2	12	563740	563751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016784	TTTCAA	2	12	571897	571908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016784	ATAGCT	2	12	662393	662404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016784	AAAAGG	2	12	664078	664089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016784	TCAATC	2	12	679455	679466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016784	CTTTCT	2	12	691699	691710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016784	TTTCTC	2	12	711645	711656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016784	AAATGA	2	12	734009	734020	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016784	GTTTAC	2	12	771149	771160	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016784	AGGGCC	2	12	777475	777486	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016784	TTTTTC	2	12	843559	843570	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016784	AATTAA	2	12	854128	854139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016784	CTTTTT	2	12	860272	860283	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016784	GGATTT	2	12	860783	860794	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016784	TTATCT	2	12	871026	871037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016784	CTTTTT	2	12	900293	900304	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016784	AAAAAG	2	12	911912	911923	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016784	TTATAT	2	12	922594	922605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016784	GTGCTG	2	12	924394	924405	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016784	CATCTT	2	12	926245	926256	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016784	TCTTTT	2	12	1065574	1065585	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016784	ATGCTC	2	12	1065700	1065711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016784	ATAATG	2	12	1076300	1076311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016784	GAAAAG	2	12	1090557	1090568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016784	TTACTA	2	12	1095721	1095732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016784	CTTTTT	2	12	1195635	1195646	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016784	GGCTGC	2	12	1197663	1197674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016784	TTTTGT	2	12	1227183	1227194	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016784	GTATGG	2	12	1228497	1228508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016784	GTTAAC	2	12	1242813	1242824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016784	TTTCAT	2	12	1327240	1327251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016784	TTACAT	2	12	1345528	1345539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016784	CGGACT	2	12	1373245	1373256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016784	TAATTG	2	12	1392712	1392723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016784	ATCATT	2	12	1406165	1406176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016784	AGAAAA	2	12	1408371	1408382	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016784	ATCATT	2	12	1409405	1409416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016784	TCAAAC	2	12	1521633	1521644	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016784	CAAAAA	2	12	1534387	1534398	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016784	CTTTTT	2	12	1566009	1566020	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016784	TCCGGT	2	12	1643961	1643972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016784	TTTGTT	2	12	1718217	1718228	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016784	AAAATA	2	12	1839232	1839243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016784	TAAAAA	2	12	1863486	1863497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016784	TGTTCT	2	12	1863803	1863814	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016784	AAAATG	2	12	1869398	1869409	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016784	TAAAAA	2	12	1883058	1883069	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016784	GTCATT	2	12	1916896	1916907	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016784	ATAAAA	2	12	2022597	2022608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016784	AAGAGA	2	12	2022674	2022685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016784	TTTTGA	2	12	2025576	2025587	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016784	ATTTTT	2	12	2043048	2043059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016784	GAAAAA	2	12	2098688	2098699	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016784	CTTTTT	2	12	2103093	2103104	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016784	ATCCGT	2	12	2160704	2160715	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016784	TTTGTT	2	12	2168685	2168696	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016784	TTTTTA	2	12	2177840	2177851	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016784	TTTATA	2	12	2182695	2182706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016784	TTTAGT	2	12	2184191	2184202	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016784	AAATAA	2	12	2214645	2214656	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016784	AAGTAA	2	12	2218506	2218517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016784	ATCAAA	2	12	2286040	2286051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016784	ATTGTA	2	12	2308154	2308165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016784	ATAAAA	2	12	2438123	2438134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016784	CGTCAT	2	12	2453268	2453279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016784	ATATTT	2	12	2457360	2457371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016784	AACGGA	2	12	2478202	2478213	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016784	CAATCT	2	12	2501426	2501437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016784	TGAAAA	2	12	2509931	2509942	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016784	TTCTAA	2	12	2559814	2559825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016784	TGACTT	2	12	2585931	2585942	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016784	GAAGCA	2	12	2607778	2607789	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016784	GAATCA	2	12	2740800	2740811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016784	CCCTCT	2	12	2760088	2760099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016784	CGGCAG	2	12	2790426	2790437	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016784	CTCTTT	2	12	2806890	2806901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016784	CTTATA	2	12	2819990	2820001	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016784	TTTAAG	2	12	2833695	2833706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016784	GGAAAA	2	12	2849395	2849406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016784	CCAAAA	2	12	2860791	2860802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016784	CGCGGC	2	12	2884216	2884227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016784	CTTATC	2	12	2900264	2900275	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016784	CTAAAA	2	12	2940637	2940648	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016784	TTAAGA	2	12	3006780	3006791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016784	AGTAAA	2	12	3012673	3012684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016784	TAATGG	2	12	3024807	3024818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016784	TAGAGA	2	12	3047180	3047191	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016784	ATTTTA	2	12	3048400	3048411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016784	ATTATC	2	12	3148699	3148710	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016784	ATTTTA	2	12	3159101	3159112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016784	AGAAAA	2	12	3173201	3173212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016784	TAAATG	2	12	3230370	3230381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016784	TAATGA	2	12	3268292	3268303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016784	GAAAAA	2	12	3286590	3286601	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016784	AAAACA	2	12	3317796	3317807	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016784	TAATAC	2	12	3409051	3409062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016784	CTTTTT	2	12	3409256	3409267	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016784	TTTCTT	2	12	3424370	3424381	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016784	TTTCAT	2	12	3459842	3459853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016784	TCTTAT	2	12	3487426	3487437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016784	CAATCA	2	12	3523957	3523968	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016784	GATGAA	2	12	3557344	3557355	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016784	GCATAA	2	12	3584229	3584240	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016784	ATTCCC	2	12	3586557	3586568	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016784	AAAATA	2	12	3616081	3616092	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.