MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946

Total Repeats: 1241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016784	AAAAGA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	375360694
2	NC_016784	TGAAGA	2	12	8490	8501	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375360697
3	NC_016784	ACTGGC	2	12	17537	17548	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360700
4	NC_016784	TTCGGC	2	12	24618	24629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360706
5	NC_016784	GAAGGT	2	12	28951	28962	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	375360710
6	NC_016784	TTAAAT	2	12	29457	29468	50 %	50 %	0 %	0 %	375360710
7	NC_016784	CAGGCG	2	12	37801	37812	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375360717
8	NC_016784	AATGTG	2	12	42705	42716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360722
9	NC_016784	AAGAAA	2	12	48081	48092	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	375360729
10	NC_016784	TTGTCG	2	12	48897	48908	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375360730
11	NC_016784	AGCGGA	2	12	55346	55357	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360737
12	NC_016784	TTGCCA	2	12	58757	58768	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375360741
13	NC_016784	GAATCG	2	12	60962	60973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360744
14	NC_016784	CGCTTA	2	12	64297	64308	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375360746
15	NC_016784	ATGATC	2	12	75465	75476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375360757
16	NC_016784	AGCTGC	2	12	76962	76973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360758
17	NC_016784	TGTCGG	2	12	78703	78714	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375360760
18	NC_016784	AACACC	2	12	80094	80105	50 %	0 %	0 %	50 %	375360761
19	NC_016784	CAGTCT	2	12	84519	84530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375360765
20	NC_016784	AGGATC	2	12	88072	88083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360770
21	NC_016784	TCAAAT	2	12	89970	89981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	375360772
22	NC_016784	GTATCG	2	12	91112	91123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375360772
23	NC_016784	TGGCAC	2	12	104567	104578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360776
24	NC_016784	ACTCGG	2	12	104682	104693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360776
25	NC_016784	TGCCGA	2	12	109343	109354	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360778
26	NC_016784	GTCATT	2	12	110205	110216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375360779
27	NC_016784	CCAAGC	2	12	110701	110712	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	375360779
28	NC_016784	GAAGAG	2	12	118958	118969	50 %	0 %	50 %	0 %	375360791
29	NC_016784	CATTTA	2	12	119729	119740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	375360792
30	NC_016784	TCTGGT	2	12	119794	119805	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375360792
31	NC_016784	GAAGCT	2	12	120311	120322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360793
32	NC_016784	CTTGCA	2	12	121456	121467	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375360794
33	NC_016784	CTGTAG	2	12	121663	121674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375360795
34	NC_016784	AGTTGA	2	12	131886	131897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360802
35	NC_016784	TAAAGG	2	12	137015	137026	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375360806
36	NC_016784	GTCGGT	2	12	143634	143645	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375360821
37	NC_016784	ATCGAA	2	12	143727	143738	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	375360821
38	NC_016784	AATAAA	2	12	145014	145025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	375360824
39	NC_016784	CATTAA	2	12	147167	147178	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	375360827
40	NC_016784	GAAAAG	2	12	148866	148877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360830
41	NC_016784	AAACAA	2	12	148907	148918	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	375360830
42	NC_016784	AAAAAG	2	12	150635	150646	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	375360833
43	NC_016784	TTAACT	2	12	155432	155443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	375360840
44	NC_016784	CGGTTG	2	12	155876	155887	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375360841
45	NC_016784	ACGGAT	2	12	184215	184226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360853
46	NC_016784	ATAAAT	2	12	189118	189129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375360858
47	NC_016784	TCTGAT	2	12	189139	189150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375360858
48	NC_016784	ATCGTC	2	12	192082	192093	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	375360860
49	NC_016784	TGTTGA	2	12	203203	203214	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	375360870
50	NC_016784	AGACAA	2	12	203869	203880	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	375360870
51	NC_016784	GAAATG	2	12	207132	207143	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375360872
52	NC_016784	TGCGGA	2	12	210774	210785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375360876
53	NC_016784	GATAAT	2	12	211165	211176	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	375360876
54	NC_016784	TATCTT	2	12	212874	212885	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	375360879
55	NC_016784	CGGAAT	2	12	213216	213227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360879
56	NC_016784	TTCGGT	2	12	213235	213246	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375360879
57	NC_016784	GATTTT	2	12	213444	213455	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	375360879
58	NC_016784	AAACCG	2	12	216189	216200	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	375360882
59	NC_016784	CTTTTC	2	12	219077	219088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360885
60	NC_016784	GGCTGC	2	12	221518	221529	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	375360889
61	NC_016784	AAGCGA	2	12	223850	223861	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375360891
62	NC_016784	ACAATA	2	12	229360	229371	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	375360897
63	NC_016784	TTTTAT	2	12	236809	236820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	375360903
64	NC_016784	ACCATC	2	12	239780	239791	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	375360907
65	NC_016784	CTGCCG	2	12	240161	240172	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	375360907
66	NC_016784	GAGACG	2	12	242122	242133	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360909
67	NC_016784	ATGCCG	2	12	245959	245970	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360912
68	NC_016784	GAGGAC	2	12	248446	248457	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360914
69	NC_016784	GCGGAA	2	12	255807	255818	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360923
70	NC_016784	AGCGGG	2	12	257682	257693	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	375360924
71	NC_016784	GCAGCC	2	12	263393	263404	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	375360931
72	NC_016784	TGAGAT	2	12	272501	272512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360939
73	NC_016784	TTTTCA	2	12	275182	275193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	375360941
74	NC_016784	TCATTG	2	12	277280	277291	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375360944
75	NC_016784	GAAGAG	2	12	277645	277656	50 %	0 %	50 %	0 %	375360944
76	NC_016784	TTCTGC	2	12	279685	279696	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	375360946
77	NC_016784	TGATTT	2	12	281812	281823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	375360949
78	NC_016784	AGGGCG	2	12	281949	281960	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	375360949
79	NC_016784	GAAGCG	2	12	282038	282049	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360949
80	NC_016784	GAGGGA	2	12	282563	282574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375360950
81	NC_016784	TTTATC	2	12	283165	283176	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	375360951
82	NC_016784	AAAATC	2	12	285413	285424	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	375360953
83	NC_016784	CATTGA	2	12	286335	286346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375360953
84	NC_016784	AAACAG	2	12	289141	289152	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	375360955
85	NC_016784	TTTCGG	2	12	291559	291570	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	375360958
86	NC_016784	AGAGTG	2	12	294036	294047	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	375360960
87	NC_016784	GAAAGA	2	12	294049	294060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360960
88	NC_016784	ACGCTG	2	12	296538	296549	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360961
89	NC_016784	GGAAAA	2	12	300417	300428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360965
90	NC_016784	AGAATG	2	12	304172	304183	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	375360969
91	NC_016784	CGGATG	2	12	304811	304822	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375360970
92	NC_016784	ATTGAT	2	12	308284	308295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	375360974
93	NC_016784	AGCGAC	2	12	309999	310010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360976
94	NC_016784	ATGGGG	2	12	315639	315650	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	375360980
95	NC_016784	GCCTCT	2	12	318674	318685	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	375360982
96	NC_016784	TTTGAG	2	12	322887	322898	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	375360985
97	NC_016784	GAGCAG	2	12	323190	323201	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	375360985
98	NC_016784	CAAATC	2	12	323789	323800	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	375360986
99	NC_016784	GCCTGA	2	12	327435	327446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360992
100	NC_016784	AAATGC	2	12	336832	336843	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	375360995
101	NC_016784	CGGCGA	2	12	338104	338115	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375360995
102	NC_016784	GATGAC	2	12	340072	340083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360995
103	NC_016784	ATGAAA	2	12	342978	342989	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	375360996
104	NC_016784	GATACG	2	12	344132	344143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360996
105	NC_016784	ACTGGA	2	12	347617	347628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	375360996
106	NC_016784	CGGCGA	2	12	348871	348882	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375360996
107	NC_016784	AATGTC	2	12	353175	353186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	375360997
108	NC_016784	TCAGGC	2	12	353960	353971	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375360997
109	NC_016784	ATGAAA	2	12	362937	362948	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	375361007
110	NC_016784	ATCAAA	2	12	363461	363472	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	375361007
111	NC_016784	TGCTCG	2	12	372402	372413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375361015
112	NC_016784	GGATGC	2	12	373845	373856	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375361016
113	NC_016784	CGGAAA	2	12	374795	374806	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	375361018
114	NC_016784	ATTTTG	2	12	382665	382676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	375361026
115	NC_016784	TGAAAT	2	12	385336	385347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	375361027
116	NC_016784	ACAATC	2	12	390333	390344	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	375361034
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221	NC_016784	TGAAAA	2	12	711956	711967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	375361368
222	NC_016784	CTGACG	2	12	714514	714525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	375361370
223	NC_016784	ATGCTG	2	12	718838	718849	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375361372
224	NC_016784	CATTGG	2	12	719007	719018	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375361372
225	NC_016784	ATGAAA	2	12	720388	720399	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	375361374
226	NC_016784	GTCATT	2	12	724510	724521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375361376
227	NC_016784	TCTTCA	2	12	726991	727002	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	375361378
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229	NC_016784	CCATCA	2	12	729578	729589	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	375361381
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