MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946

Total Repeats: 3117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016784	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016784	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	375360691
3	NC_016784	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016784	AATTT	2	10	2271	2280	40 %	60 %	0 %	0 %	375360692
5	NC_016784	AGTGA	2	10	4542	4551	40 %	20 %	40 %	0 %	375360694
6	NC_016784	TTGCA	2	10	5646	5655	20 %	40 %	20 %	20 %	375360696
7	NC_016784	GGGAC	2	10	6187	6196	20 %	0 %	60 %	20 %	375360696
8	NC_016784	TTCGG	2	10	7333	7342	0 %	40 %	40 %	20 %	375360697
9	NC_016784	ACGAT	2	10	8666	8675	40 %	20 %	20 %	20 %	375360697
10	NC_016784	TCGTG	2	10	10841	10850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016784	GGACG	2	10	11716	11725	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016784	CTTCA	2	10	15397	15406	20 %	40 %	0 %	40 %	375360698
13	NC_016784	AATAA	2	10	15714	15723	80 %	20 %	0 %	0 %	375360698
14	NC_016784	CCTTT	2	10	15768	15777	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016784	CTGAA	2	10	16688	16697	40 %	20 %	20 %	20 %	375360699
16	NC_016784	AAGAG	2	10	17235	17244	60 %	0 %	40 %	0 %	375360699
17	NC_016784	AGCAC	2	10	18300	18309	40 %	0 %	20 %	40 %	375360700
18	NC_016784	CGGAA	2	10	18312	18321	40 %	0 %	40 %	20 %	375360700
19	NC_016784	AGAGA	2	10	20947	20956	60 %	0 %	40 %	0 %	375360703
20	NC_016784	CCAAG	2	10	21861	21870	40 %	0 %	20 %	40 %	375360703
21	NC_016784	ATCTG	2	10	22428	22437	20 %	40 %	20 %	20 %	375360704
22	NC_016784	GAAAT	2	10	23415	23424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016784	ACTCC	2	10	24824	24833	20 %	20 %	0 %	60 %	375360706
24	NC_016784	CCTGT	2	10	25702	25711	0 %	40 %	20 %	40 %	375360707
25	NC_016784	GTTTT	2	10	25788	25797	0 %	80 %	20 %	0 %	375360707
26	NC_016784	GTTCC	2	10	25937	25946	0 %	40 %	20 %	40 %	375360707
27	NC_016784	ATGAC	2	10	30009	30018	40 %	20 %	20 %	20 %	375360711
28	NC_016784	AGGCA	2	10	30694	30703	40 %	0 %	40 %	20 %	375360713
29	NC_016784	GAAGC	2	10	30886	30895	40 %	0 %	40 %	20 %	375360713
30	NC_016784	TTGCT	2	10	31028	31037	0 %	60 %	20 %	20 %	375360714
31	NC_016784	TCGTG	2	10	32577	32586	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016784	GGACG	2	10	33452	33461	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016784	ACAAA	2	10	36551	36560	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016784	AAGAA	2	10	37209	37218	80 %	0 %	20 %	0 %	375360716
35	NC_016784	AAAGA	2	10	37853	37862	80 %	0 %	20 %	0 %	375360717
36	NC_016784	CTGAT	2	10	37889	37898	20 %	40 %	20 %	20 %	375360717
37	NC_016784	ACAAT	2	10	40438	40447	60 %	20 %	0 %	20 %	375360719
38	NC_016784	GAAAA	2	10	41841	41850	80 %	0 %	20 %	0 %	375360722
39	NC_016784	GCAGA	2	10	43825	43834	40 %	0 %	40 %	20 %	375360724
40	NC_016784	GCGAT	2	10	46827	46836	20 %	20 %	40 %	20 %	375360729
41	NC_016784	TGACA	2	10	49003	49012	40 %	20 %	20 %	20 %	375360730
42	NC_016784	AGATC	2	10	50640	50649	40 %	20 %	20 %	20 %	375360731
43	NC_016784	TCAAA	2	10	51656	51665	60 %	20 %	0 %	20 %	375360732
44	NC_016784	TTTTG	2	10	54144	54153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016784	TGAAG	2	10	58470	58479	40 %	20 %	40 %	0 %	375360741
46	NC_016784	AAGCA	2	10	58524	58533	60 %	0 %	20 %	20 %	375360741
47	NC_016784	AACAC	2	10	61410	61419	60 %	0 %	0 %	40 %	375360745
48	NC_016784	TTTGC	2	10	63442	63451	0 %	60 %	20 %	20 %	375360746
49	NC_016784	AACGG	2	10	63671	63680	40 %	0 %	40 %	20 %	375360746
50	NC_016784	TAAAG	2	10	65109	65118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016784	CGGCG	2	10	66194	66203	0 %	0 %	60 %	40 %	375360748
52	NC_016784	ATGAT	2	10	66319	66328	40 %	40 %	20 %	0 %	375360748
53	NC_016784	GACGG	2	10	66657	66666	20 %	0 %	60 %	20 %	375360748
54	NC_016784	TGCCG	2	10	68529	68538	0 %	20 %	40 %	40 %	375360749
55	NC_016784	GGAGA	2	10	68907	68916	40 %	0 %	60 %	0 %	375360749
56	NC_016784	AAAGG	2	10	71454	71463	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016784	GGCCT	2	10	72073	72082	0 %	20 %	40 %	40 %	375360755
58	NC_016784	TTTCA	2	10	72215	72224	20 %	60 %	0 %	20 %	375360755
59	NC_016784	GTTCG	2	10	73341	73350	0 %	40 %	40 %	20 %	375360755
60	NC_016784	AACGA	2	10	73510	73519	60 %	0 %	20 %	20 %	375360755
61	NC_016784	TTATT	2	10	78039	78048	20 %	80 %	0 %	0 %	375360760
62	NC_016784	TGAAG	2	10	82545	82554	40 %	20 %	40 %	0 %	375360763
63	NC_016784	CGGAG	2	10	83073	83082	20 %	0 %	60 %	20 %	375360764
64	NC_016784	TAAAA	2	10	83797	83806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016784	CGGAA	2	10	84098	84107	40 %	0 %	40 %	20 %	375360765
66	NC_016784	AGAGC	2	10	85548	85557	40 %	0 %	40 %	20 %	375360766
67	NC_016784	ATGCT	2	10	87535	87544	20 %	40 %	20 %	20 %	375360768
68	NC_016784	GGCCG	2	10	89285	89294	0 %	0 %	60 %	40 %	375360771
69	NC_016784	TCGTG	2	10	92606	92615	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016784	GGACG	2	10	93307	93316	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016784	TCGTG	2	10	98433	98442	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016784	GGACG	2	10	99134	99143	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016784	GGGAC	2	10	103952	103961	20 %	0 %	60 %	20 %	375360775
74	NC_016784	TCAAA	2	10	104108	104117	60 %	20 %	0 %	20 %	375360775
75	NC_016784	GAACA	2	10	104837	104846	60 %	0 %	20 %	20 %	375360776
76	NC_016784	TTTTA	2	10	108885	108894	20 %	80 %	0 %	0 %	375360778
77	NC_016784	CGGAA	2	10	109080	109089	40 %	0 %	40 %	20 %	375360778
78	NC_016784	CCGTA	2	10	109953	109962	20 %	20 %	20 %	40 %	375360779
79	NC_016784	GAAAA	2	10	114097	114106	80 %	0 %	20 %	0 %	375360783
80	NC_016784	TGAAT	2	10	119206	119215	40 %	40 %	20 %	0 %	375360791
81	NC_016784	TTACG	2	10	120883	120892	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016784	TAAAA	2	10	121523	121532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016784	TTGAA	2	10	121603	121612	40 %	40 %	20 %	0 %	375360795
84	NC_016784	GACCG	2	10	122257	122266	20 %	0 %	40 %	40 %	375360796
85	NC_016784	GTGAA	2	10	126584	126593	40 %	20 %	40 %	0 %	375360798
86	NC_016784	ACCGG	2	10	127423	127432	20 %	0 %	40 %	40 %	375360798
87	NC_016784	CCGTT	2	10	127527	127536	0 %	40 %	20 %	40 %	375360798
88	NC_016784	GAAGA	2	10	128266	128275	60 %	0 %	40 %	0 %	375360798
89	NC_016784	CAAAG	2	10	128536	128545	60 %	0 %	20 %	20 %	375360798
90	NC_016784	GTGCT	2	10	129080	129089	0 %	40 %	40 %	20 %	375360798
91	NC_016784	CTGAC	2	10	129620	129629	20 %	20 %	20 %	40 %	375360798
92	NC_016784	GTCCT	2	10	129857	129866	0 %	40 %	20 %	40 %	375360798
93	NC_016784	CAATT	2	10	132101	132110	40 %	40 %	0 %	20 %	375360802
94	NC_016784	CTGAA	2	10	132332	132341	40 %	20 %	20 %	20 %	375360802
95	NC_016784	GAGGG	2	10	135702	135711	20 %	0 %	80 %	0 %	375360804
96	NC_016784	CAAAA	2	10	136330	136339	80 %	0 %	0 %	20 %	375360805
97	NC_016784	AATCA	2	10	137657	137666	60 %	20 %	0 %	20 %	375360807
98	NC_016784	TGGTA	2	10	140019	140028	20 %	40 %	40 %	0 %	375360812
99	NC_016784	AAAGT	2	10	140934	140943	60 %	20 %	20 %	0 %	375360814
100	NC_016784	CAAAC	2	10	144930	144939	60 %	0 %	0 %	40 %	375360824
101	NC_016784	TAAAT	2	10	147778	147787	60 %	40 %	0 %	0 %	375360828
102	NC_016784	AAACA	2	10	149348	149357	80 %	0 %	0 %	20 %	375360832
103	NC_016784	TTATC	2	10	150430	150439	20 %	60 %	0 %	20 %	375360833
104	NC_016784	TAAAT	2	10	152110	152119	60 %	40 %	0 %	0 %	375360835
105	NC_016784	CGTTT	2	10	153453	153462	0 %	60 %	20 %	20 %	375360837
106	NC_016784	ATGGA	2	10	153520	153529	40 %	20 %	40 %	0 %	375360837
107	NC_016784	TCATC	2	10	154054	154063	20 %	40 %	0 %	40 %	375360838
108	NC_016784	CGAAG	2	10	154580	154589	40 %	0 %	40 %	20 %	375360838
109	NC_016784	GCACC	2	10	154609	154618	20 %	0 %	20 %	60 %	375360838
110	NC_016784	TTGTG	2	10	154754	154763	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016784	TGCTT	2	10	155533	155542	0 %	60 %	20 %	20 %	375360840
112	NC_016784	ATTCC	2	10	156356	156365	20 %	40 %	0 %	40 %	375360841
113	NC_016784	CGGCC	2	10	159564	159573	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_016784	TTTTC	2	10	160266	160275	0 %	80 %	0 %	20 %	375360847
115	NC_016784	TCGTG	2	10	163019	163028	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_016784	GGACG	2	10	163720	163729	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016784	TTTTA	2	10	166764	166773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016784	TCGTG	2	10	168910	168919	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016784	GGACG	2	10	169611	169620	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016784	TCGTG	2	10	174735	174744	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016784	GGACG	2	10	175436	175445	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016784	ATGAC	2	10	179830	179839	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016784	ATTAT	2	10	180993	181002	40 %	60 %	0 %	0 %	375360850
124	NC_016784	TTGAA	2	10	181643	181652	40 %	40 %	20 %	0 %	375360851
125	NC_016784	CGGAC	2	10	182407	182416	20 %	0 %	40 %	40 %	375360852
126	NC_016784	AATGG	2	10	182611	182620	40 %	20 %	40 %	0 %	375360852
127	NC_016784	TTTTC	2	10	183278	183287	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016784	TTCCT	2	10	183346	183355	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_016784	TGGCT	2	10	185752	185761	0 %	40 %	40 %	20 %	375360854
130	NC_016784	TGAAT	2	10	186036	186045	40 %	40 %	20 %	0 %	375360855
131	NC_016784	TGCCG	2	10	186226	186235	0 %	20 %	40 %	40 %	375360855
132	NC_016784	GCGGA	2	10	186247	186256	20 %	0 %	60 %	20 %	375360855
133	NC_016784	CTTTT	2	10	187778	187787	0 %	80 %	0 %	20 %	375360857
134	NC_016784	TCCGA	2	10	187939	187948	20 %	20 %	20 %	40 %	375360857
135	NC_016784	TTTTG	2	10	193424	193433	0 %	80 %	20 %	0 %	375360861
136	NC_016784	CTGAA	2	10	194162	194171	40 %	20 %	20 %	20 %	375360861
137	NC_016784	ATCAG	2	10	196628	196637	40 %	20 %	20 %	20 %	375360863
138	NC_016784	TAAAA	2	10	198897	198906	80 %	20 %	0 %	0 %	375360865
139	NC_016784	CCGTT	2	10	199355	199364	0 %	40 %	20 %	40 %	375360866
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141	NC_016784	CTGAG	2	10	201989	201998	20 %	20 %	40 %	20 %	375360869
142	NC_016784	AGTGA	2	10	202372	202381	40 %	20 %	40 %	0 %	375360869
143	NC_016784	CATTG	2	10	202594	202603	20 %	40 %	20 %	20 %	375360870
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146	NC_016784	ATGAA	2	10	205103	205112	60 %	20 %	20 %	0 %	375360871
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148	NC_016784	CTGCA	2	10	207526	207535	20 %	20 %	20 %	40 %	375360872
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152	NC_016784	AATTT	2	10	213130	213139	40 %	60 %	0 %	0 %	375360879
153	NC_016784	CTTTG	2	10	213324	213333	0 %	60 %	20 %	20 %	375360879
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156	NC_016784	TCCGC	2	10	219051	219060	0 %	20 %	20 %	60 %	375360885
157	NC_016784	ATTGG	2	10	221458	221467	20 %	40 %	40 %	0 %	375360889
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160	NC_016784	CATGG	2	10	226205	226214	20 %	20 %	40 %	20 %	375360893
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172	NC_016784	AGATT	2	10	235692	235701	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016784	ATAGT	2	10	238040	238049	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_016784	GAATA	2	10	243312	243321	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_016784	GTTTT	2	10	252396	252405	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_016784	GATCT	2	10	652717	652726	20 %	40 %	20 %	20 %	375361315
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