MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946

Total Repeats: 52925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016784	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016784	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016784	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016784	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016784	AGG	2	6	393	398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016784	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360691
7	NC_016784	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360691
8	NC_016784	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360691
9	NC_016784	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360691
10	NC_016784	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375360691
11	NC_016784	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360691
12	NC_016784	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360691
13	NC_016784	ATA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375360691
14	NC_016784	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360691
15	NC_016784	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360691
16	NC_016784	CCG	2	6	1159	1164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360691
17	NC_016784	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360691
18	NC_016784	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360691
19	NC_016784	TCT	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360691
20	NC_016784	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360691
21	NC_016784	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360691
22	NC_016784	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360691
23	NC_016784	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360691
24	NC_016784	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360691
25	NC_016784	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360691
26	NC_016784	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360691
27	NC_016784	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375360691
28	NC_016784	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016784	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016784	AGG	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016784	TCG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360692
32	NC_016784	AGA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360692
33	NC_016784	TGA	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360692
34	NC_016784	TGC	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360692
35	NC_016784	TTC	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360692
36	NC_016784	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360692
37	NC_016784	CGT	2	6	2536	2541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360692
38	NC_016784	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360692
39	NC_016784	TGG	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375360692
40	NC_016784	TTC	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360692
41	NC_016784	TCG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360692
42	NC_016784	CTT	2	6	2769	2774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360692
43	NC_016784	CAA	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375360692
44	NC_016784	TCA	2	6	2843	2848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360692
45	NC_016784	ATG	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360692
46	NC_016784	TGC	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016784	TCA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016784	CGG	2	6	3285	3290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360693
49	NC_016784	CAA	2	6	3330	3335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375360693
50	NC_016784	CGC	2	6	3349	3354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360693
51	NC_016784	GTC	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360693
52	NC_016784	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360694
53	NC_016784	TGA	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360694
54	NC_016784	AGC	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360694
55	NC_016784	GAG	2	6	3828	3833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375360694
56	NC_016784	AGC	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360694
57	NC_016784	GAA	2	6	4093	4098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360694
58	NC_016784	ATT	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360694
59	NC_016784	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360694
60	NC_016784	CAG	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360694
61	NC_016784	ACG	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360694
62	NC_016784	GAA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360694
63	NC_016784	GAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360694
64	NC_016784	GAT	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360694
65	NC_016784	CAC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375360694
66	NC_016784	GAC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360695
67	NC_016784	TCG	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360695
68	NC_016784	GAA	2	6	4659	4664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360695
69	NC_016784	AGT	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360695
70	NC_016784	GAA	2	6	4775	4780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360695
71	NC_016784	CAG	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360696
72	NC_016784	ATG	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360696
73	NC_016784	TCG	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360696
74	NC_016784	ACA	2	6	5013	5018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375360696
75	NC_016784	GCC	2	6	5139	5144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360696
76	NC_016784	TCA	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360696
77	NC_016784	CGG	2	6	5179	5184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360696
78	NC_016784	CGG	2	6	5215	5220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360696
79	NC_016784	CGT	2	6	5242	5247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360696
80	NC_016784	AAC	2	6	5413	5418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375360696
81	NC_016784	AAG	2	6	5583	5588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360696
82	NC_016784	ATA	2	6	5697	5702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375360696
83	NC_016784	GGC	2	6	5717	5722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360696
84	NC_016784	AAG	2	6	5776	5781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360696
85	NC_016784	GAT	2	6	5822	5827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360696
86	NC_016784	ATT	2	6	5849	5854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360696
87	NC_016784	TCT	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360696
88	NC_016784	CTT	2	6	5966	5971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360696
89	NC_016784	GGC	2	6	6034	6039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360696
90	NC_016784	TTC	2	6	6115	6120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360696
91	NC_016784	TCA	2	6	6363	6368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360696
92	NC_016784	TTA	2	6	6410	6415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360696
93	NC_016784	TTC	2	6	6419	6424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360696
94	NC_016784	ATC	2	6	6443	6448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360696
95	NC_016784	GCC	2	6	6475	6480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360696
96	NC_016784	GCA	2	6	6493	6498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360696
97	NC_016784	AGC	2	6	6531	6536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360696
98	NC_016784	TGA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360696
99	NC_016784	CTA	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016784	ATT	2	6	6971	6976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016784	TCG	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375360697
102	NC_016784	ACC	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375360697
103	NC_016784	TTG	2	6	7313	7318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375360697
104	NC_016784	CCG	2	6	7926	7931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360697
105	NC_016784	TTG	2	6	8345	8350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375360697
106	NC_016784	GAA	2	6	8386	8391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360697
107	NC_016784	ATC	2	6	8404	8409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360697
108	NC_016784	GAA	2	6	8413	8418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360697
109	NC_016784	ATG	2	6	8444	8449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360697
110	NC_016784	TCA	2	6	8525	8530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360697
111	NC_016784	TTC	2	6	8680	8685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360697
112	NC_016784	TAA	2	6	8688	8693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375360697
113	NC_016784	ATT	2	6	8761	8766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360697
114	NC_016784	ATT	2	6	8806	8811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360697
115	NC_016784	TGA	2	6	8826	8831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360697
116	NC_016784	CTT	2	6	8844	8849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375360697
117	NC_016784	ATC	3	9	8986	8994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375360697
118	NC_016784	GAA	2	6	9000	9005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360697
119	NC_016784	GAA	2	6	9028	9033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360697
120	NC_016784	GAT	2	6	9091	9096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360697
121	NC_016784	GAA	2	6	9121	9126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360697
122	NC_016784	CAA	2	6	9269	9274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375360697
123	NC_016784	ATT	2	6	9295	9300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360697
124	NC_016784	GCG	2	6	9308	9313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360697
125	NC_016784	GAA	2	6	9433	9438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360697
126	NC_016784	GAA	2	6	9445	9450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360697
127	NC_016784	GAA	2	6	9454	9459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360697
128	NC_016784	TGA	2	6	9537	9542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016784	TGT	2	6	9561	9566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016784	ACT	2	6	9758	9763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016784	GGC	2	6	9801	9806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016784	GCG	2	6	9861	9866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016784	CGA	2	6	10046	10051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016784	GCA	2	6	10120	10125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016784	CGC	2	6	10167	10172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016784	TGT	2	6	10206	10211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_016784	GGC	2	6	10240	10245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016784	CAG	2	6	10289	10294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016784	ATT	2	6	10330	10335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_016784	GGA	2	6	10480	10485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016784	GAG	2	6	10528	10533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016784	TGC	2	6	10625	10630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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146	NC_016784	GGT	2	6	10818	10823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_016784	GGA	2	6	10944	10949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016784	ATC	2	6	10968	10973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016784	CAC	2	6	11179	11184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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152	NC_016784	CCT	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_016784	GGT	2	6	11463	11468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016784	CCA	2	6	11485	11490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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156	NC_016784	CCA	2	6	11575	11580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_016784	CAC	2	6	11791	11796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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159	NC_016784	GCG	2	6	11910	11915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_016784	AGG	2	6	12028	12033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016784	CGG	2	6	12084	12089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_016784	GGA	2	6	12116	12121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016784	AGT	2	6	12237	12242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016784	AGA	2	6	12318	12323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016784	AGC	2	6	12779	12784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_016784	AGG	2	6	13140	13145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_016784	GAG	2	6	14333	14338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_016784	AAT	2	6	19018	19023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375360701
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248	NC_016784	TGA	2	6	20302	20307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360702
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251	NC_016784	GTG	2	6	20626	20631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
252	NC_016784	GTT	2	6	20828	20833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_016784	AGA	2	6	20972	20977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360703
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257	NC_016784	AAG	2	6	21087	21092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360703
258	NC_016784	TGA	2	6	21095	21100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360703
259	NC_016784	ACG	2	6	21120	21125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375360703
260	NC_016784	GAT	2	6	21192	21197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360703
261	NC_016784	TCC	2	6	21422	21427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375360703
262	NC_016784	AGA	2	6	21503	21508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375360703
263	NC_016784	ATT	2	6	21511	21516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375360703
264	NC_016784	CGG	2	6	21529	21534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360703
265	NC_016784	CCG	2	6	21637	21642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375360703
266	NC_016784	CAA	2	6	21680	21685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375360703
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282	NC_016784	GCG	2	6	23046	23051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375360704
283	NC_016784	GAT	2	6	23090	23095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375360704
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382	NC_016784	TCT	2	6	30946	30951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_016784	TGG	2	6	31118	31123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375360714
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