MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946

Total Repeats: 6007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016784	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016784	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016784	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016784	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016784	AGG	2	6	393	398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016784	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016784	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016784	AGG	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016784	TGC	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016784	TCA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016784	CTA	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016784	ATT	2	6	6971	6976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016784	TGA	2	6	9537	9542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016784	TGT	2	6	9561	9566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016784	ACT	2	6	9758	9763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016784	GGC	2	6	9801	9806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016784	GCG	2	6	9861	9866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016784	CGA	2	6	10046	10051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016784	GCA	2	6	10120	10125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016784	CGC	2	6	10167	10172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016784	TGT	2	6	10206	10211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016784	GAA	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016784	GGC	2	6	10240	10245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016784	CAG	2	6	10289	10294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016784	ATT	2	6	10330	10335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016784	AGA	2	6	10430	10435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016784	GGA	2	6	10480	10485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016784	GAG	2	6	10528	10533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016784	TGC	2	6	10625	10630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016784	GAA	2	6	10744	10749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016784	GGT	2	6	10818	10823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016784	GTC	2	6	10832	10837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016784	GGA	2	6	10944	10949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016784	ATC	2	6	10968	10973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016784	CAC	2	6	11179	11184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016784	GAT	2	6	11250	11255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016784	CCT	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016784	GGT	2	6	11463	11468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016784	CCA	2	6	11485	11490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016784	AGG	2	6	11545	11550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016784	CCA	2	6	11575	11580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016784	CAC	2	6	11791	11796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016784	GGA	2	6	11876	11881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016784	GCG	2	6	11910	11915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016784	AGG	2	6	12028	12033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016784	CGG	2	6	12084	12089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016784	GGA	2	6	12116	12121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016784	AGT	2	6	12237	12242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016784	AGA	2	6	12318	12323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016784	AGC	2	6	12779	12784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016784	TTC	2	6	12877	12882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016784	ACC	2	6	13105	13110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016784	AGG	2	6	13140	13145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016784	TAG	2	6	13248	13253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016784	GAG	2	6	13335	13340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016784	CGG	2	6	13595	13600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016784	TAC	2	6	13865	13870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016784	CGC	2	6	13895	13900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016784	CCT	2	6	13953	13958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016784	GGT	2	6	14089	14094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016784	CGT	2	6	14284	14289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016784	GAG	2	6	14333	14338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016784	GTT	2	6	14387	14392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016784	GAT	2	6	14511	14516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016784	TGG	2	6	14645	14650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016784	CGC	2	6	14748	14753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016784	TCA	2	6	14780	14785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016784	ATA	2	6	15841	15846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016784	TGT	2	6	17419	17424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016784	TGA	2	6	18842	18847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016784	ATT	2	6	18887	18892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016784	GTG	2	6	20626	20631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016784	GTT	2	6	20828	20833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016784	TAT	2	6	23470	23475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016784	GGA	2	6	23489	23494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016784	TCC	2	6	23572	23577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016784	TCC	2	6	24992	24997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016784	CCT	2	6	26385	26390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016784	CTG	2	6	27004	27009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016784	AAG	2	6	27051	27056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016784	CAT	2	6	27595	27600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016784	GCA	2	6	27803	27808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016784	TAA	2	6	27997	28002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016784	ATG	2	6	28005	28010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016784	AGG	2	6	28019	28024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016784	TCT	2	6	30946	30951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016784	ATT	2	6	31259	31264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016784	GGT	2	6	31284	31289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016784	TGA	2	6	31307	31312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016784	GAC	2	6	31352	31357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016784	TAA	2	6	31376	31381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016784	GGC	2	6	31537	31542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016784	GCG	2	6	31597	31602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016784	CGA	2	6	31782	31787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016784	GCA	2	6	31856	31861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016784	CGC	2	6	31903	31908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016784	TGT	2	6	31942	31947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016784	GAA	2	6	31952	31957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016784	GGC	2	6	31976	31981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016784	CAG	2	6	32025	32030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016784	ATT	2	6	32066	32071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016784	AGA	2	6	32166	32171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016784	GGA	2	6	32216	32221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016784	GAG	2	6	32264	32269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016784	TGC	2	6	32361	32366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016784	GAA	2	6	32480	32485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016784	GGT	2	6	32554	32559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016784	GTC	2	6	32568	32573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016784	GGA	2	6	32680	32685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016784	ATC	2	6	32704	32709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016784	CAC	2	6	32915	32920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016784	GAT	2	6	32986	32991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016784	CCT	2	6	33042	33047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_016784	GGT	2	6	33199	33204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016784	CCA	2	6	33221	33226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016784	AGG	2	6	33281	33286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016784	CCA	2	6	33311	33316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016784	CAC	2	6	33527	33532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016784	GGA	2	6	33612	33617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016784	GCG	2	6	33646	33651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016784	AGG	2	6	33764	33769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016784	CGG	2	6	33820	33825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016784	GGA	2	6	33852	33857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016784	AGT	2	6	33973	33978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016784	AGA	2	6	34054	34059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016784	AGC	2	6	34515	34520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016784	TTC	2	6	34613	34618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016784	ACC	2	6	34841	34846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016784	AGG	2	6	34876	34881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016784	TAG	2	6	34984	34989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016784	GAG	2	6	35071	35076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016784	CGG	2	6	35331	35336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016784	TAC	2	6	35601	35606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016784	CGC	2	6	35631	35636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_016784	CCT	2	6	35689	35694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016784	GGT	2	6	35825	35830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016784	CGT	2	6	36020	36025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016784	GAG	2	6	36069	36074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016784	GTT	2	6	36123	36128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016784	GAT	2	6	36247	36252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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